MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	CACC	2	8	268	275	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_022125	CCCG	2	8	3743	3750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_022125	CCCG	2	8	3815	3822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_022125	AAGA	2	8	4775	4782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022125	CAGG	2	8	4974	4981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022125	CGGC	2	8	5714	5721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_022125	TCGG	2	8	10638	10645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022125	CGAA	2	8	25379	25386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022125	ACCC	2	8	33906	33913	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_022125	ACGG	2	8	33968	33975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022125	CGGC	2	8	36770	36777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022125	GGCC	2	8	36904	36911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022125	CGGG	2	8	37609	37616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022125	ACAA	2	8	38800	38807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022125	GGCC	2	8	38868	38875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022125	GGCC	2	8	38969	38976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022125	CTCG	2	8	39042	39049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022125	AGAA	2	8	39273	39280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022125	TCTG	2	8	39805	39812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022125	AACT	2	8	40016	40023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022125	ACCA	2	8	40141	40148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022125	AGCG	2	8	40161	40168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022125	TGTT	2	8	40182	40189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022125	GGAT	2	8	41116	41123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022125	TAAC	2	8	44429	44436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022125	TCGG	2	8	46768	46775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022125	GGTC	2	8	46784	46791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022125	TGGG	2	8	46819	46826	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022125	TTCG	2	8	47403	47410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022125	GTGG	2	8	47724	47731	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022125	CCGA	2	8	47733	47740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022125	GTTG	2	8	47955	47962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022125	CAAC	2	8	57244	57251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022125	CAAT	2	8	58154	58161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022125	TGAA	2	8	58697	58704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022125	CGGC	2	8	58834	58841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022125	CCGG	2	8	62517	62524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022125	CGGG	2	8	68241	68248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022125	GAGC	2	8	68260	68267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022125	CGAT	2	8	68361	68368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022125	CCAC	2	8	69972	69979	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_022125	CAAT	2	8	70182	70189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022125	GAAC	2	8	70743	70750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022125	GATC	2	8	76934	76941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_022125	GAAG	2	8	79595	79602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022125	CGAC	2	8	79609	79616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022125	ACAT	2	8	79662	79669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022125	TTTG	2	8	82684	82691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022125	CGGC	2	8	85027	85034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022125	TTCC	2	8	88577	88584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.