MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	GCTG	2	8	470	477	0 %	25 %	50 %	25 %	532437243
2	NC_022125	CCGG	2	8	1566	1573	0 %	0 %	50 %	50 %	532437244
3	NC_022125	GCGA	2	8	2201	2208	25 %	0 %	50 %	25 %	532437244
4	NC_022125	TCTG	2	8	2355	2362	0 %	50 %	25 %	25 %	532437245
5	NC_022125	CGTT	2	8	3841	3848	0 %	50 %	25 %	25 %	532437246
6	NC_022125	CTTG	2	8	4030	4037	0 %	50 %	25 %	25 %	532437246
7	NC_022125	CACC	2	8	5428	5435	25 %	0 %	0 %	75 %	532437248
8	NC_022125	GGGT	2	8	5458	5465	0 %	25 %	75 %	0 %	532437248
9	NC_022125	TCGT	2	8	6017	6024	0 %	50 %	25 %	25 %	532437249
10	NC_022125	CCGA	2	8	6180	6187	25 %	0 %	25 %	50 %	532437249
11	NC_022125	CCGA	2	8	7103	7110	25 %	0 %	25 %	50 %	532437250
12	NC_022125	ACCC	2	8	7303	7310	25 %	0 %	0 %	75 %	532437250
13	NC_022125	GCTG	2	8	7615	7622	0 %	25 %	50 %	25 %	532437250
14	NC_022125	CCTC	2	8	7683	7690	0 %	25 %	0 %	75 %	532437250
15	NC_022125	CGTG	2	8	8086	8093	0 %	25 %	50 %	25 %	532437250
16	NC_022125	CTGG	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	532437251
17	NC_022125	TCAC	2	8	8568	8575	25 %	25 %	0 %	50 %	532437251
18	NC_022125	GTCG	2	8	8661	8668	0 %	25 %	50 %	25 %	532437251
19	NC_022125	GTCC	2	8	8791	8798	0 %	25 %	25 %	50 %	532437251
20	NC_022125	AACA	2	8	8997	9004	75 %	0 %	0 %	25 %	532437251
21	NC_022125	ACCA	2	8	9171	9178	50 %	0 %	0 %	50 %	532437252
22	NC_022125	GCCG	2	8	9702	9709	0 %	0 %	50 %	50 %	532437252
23	NC_022125	TGGG	2	8	9856	9863	0 %	25 %	75 %	0 %	532437252
24	NC_022125	GTCG	2	8	10421	10428	0 %	25 %	50 %	25 %	532437252
25	NC_022125	CCGC	2	8	10623	10630	0 %	0 %	25 %	75 %	532437252
26	NC_022125	CGGT	2	8	11437	11444	0 %	25 %	50 %	25 %	532437253
27	NC_022125	CATC	2	8	11875	11882	25 %	25 %	0 %	50 %	532437253
28	NC_022125	CCGA	2	8	12318	12325	25 %	0 %	25 %	50 %	532437253
29	NC_022125	CTGA	2	8	12434	12441	25 %	25 %	25 %	25 %	532437254
30	NC_022125	GATG	2	8	12535	12542	25 %	25 %	50 %	0 %	532437254
31	NC_022125	CCCA	2	8	12551	12558	25 %	0 %	0 %	75 %	532437254
32	NC_022125	ACCA	2	8	12683	12690	50 %	0 %	0 %	50 %	532437254
33	NC_022125	GGAA	2	8	13374	13381	50 %	0 %	50 %	0 %	532437255
34	NC_022125	GGCC	2	8	13482	13489	0 %	0 %	50 %	50 %	532437255
35	NC_022125	GCCG	2	8	13572	13579	0 %	0 %	50 %	50 %	532437255
36	NC_022125	GAGT	2	8	14035	14042	25 %	25 %	50 %	0 %	532437256
37	NC_022125	TGGC	2	8	14820	14827	0 %	25 %	50 %	25 %	532437258
38	NC_022125	CTCG	2	8	14963	14970	0 %	25 %	25 %	50 %	532437258
39	NC_022125	AAGG	2	8	15379	15386	50 %	0 %	50 %	0 %	532437259
40	NC_022125	TCGC	2	8	15500	15507	0 %	25 %	25 %	50 %	532437259
41	NC_022125	GTCT	2	8	15889	15896	0 %	50 %	25 %	25 %	532437260
42	NC_022125	CGGC	2	8	16120	16127	0 %	0 %	50 %	50 %	532437260
43	NC_022125	TCGG	2	8	16332	16339	0 %	25 %	50 %	25 %	532437260
44	NC_022125	ACCG	2	8	17087	17094	25 %	0 %	25 %	50 %	532437260
45	NC_022125	GTCC	2	8	17164	17171	0 %	25 %	25 %	50 %	532437260
46	NC_022125	GCCC	2	8	17497	17504	0 %	0 %	25 %	75 %	532437261
47	NC_022125	CGCT	2	8	17675	17682	0 %	25 %	25 %	50 %	532437261
48	NC_022125	AGCA	2	8	17737	17744	50 %	0 %	25 %	25 %	532437261
49	NC_022125	CCCG	2	8	18359	18366	0 %	0 %	25 %	75 %	532437261
50	NC_022125	AACG	2	8	18529	18536	50 %	0 %	25 %	25 %	532437261
51	NC_022125	GGTC	2	8	18689	18696	0 %	25 %	50 %	25 %	532437261
52	NC_022125	ACCG	2	8	19227	19234	25 %	0 %	25 %	50 %	532437262
53	NC_022125	CGAC	2	8	20064	20071	25 %	0 %	25 %	50 %	532437262
54	NC_022125	GGAA	2	8	22176	22183	50 %	0 %	50 %	0 %	532437265
55	NC_022125	ACAA	2	8	22352	22359	75 %	0 %	0 %	25 %	532437265
56	NC_022125	CGCT	2	8	22396	22403	0 %	25 %	25 %	50 %	532437265
57	NC_022125	TTCG	2	8	22480	22487	0 %	50 %	25 %	25 %	532437265
58	NC_022125	CGGC	2	8	22532	22539	0 %	0 %	50 %	50 %	532437265
59	NC_022125	GGTC	2	8	22892	22899	0 %	25 %	50 %	25 %	532437265
60	NC_022125	ACGG	2	8	23031	23038	25 %	0 %	50 %	25 %	532437265
61	NC_022125	GGCC	2	8	23049	23056	0 %	0 %	50 %	50 %	532437265
62	NC_022125	GAAG	2	8	23390	23397	50 %	0 %	50 %	0 %	532437266
63	NC_022125	AAGG	2	8	23946	23953	50 %	0 %	50 %	0 %	532437266
64	NC_022125	TCAA	2	8	23991	23998	50 %	25 %	0 %	25 %	532437267
65	NC_022125	GCCG	2	8	24502	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	532437267
66	NC_022125	CCGC	2	8	24707	24714	0 %	0 %	25 %	75 %	532437267
67	NC_022125	CGAG	2	8	25106	25113	25 %	0 %	50 %	25 %	532437268
68	NC_022125	CGCC	2	8	25796	25803	0 %	0 %	25 %	75 %	532437269
69	NC_022125	GGGA	2	8	26825	26832	25 %	0 %	75 %	0 %	532437270
70	NC_022125	CTTT	2	8	28257	28264	0 %	75 %	0 %	25 %	532437271
71	NC_022125	CTAC	2	8	28281	28288	25 %	25 %	0 %	50 %	532437271
72	NC_022125	CGGC	2	8	28826	28833	0 %	0 %	50 %	50 %	532437272
73	NC_022125	GCGA	2	8	29034	29041	25 %	0 %	50 %	25 %	532437272
74	NC_022125	TCGG	2	8	29190	29197	0 %	25 %	50 %	25 %	532437272
75	NC_022125	CAAA	2	8	29595	29602	75 %	0 %	0 %	25 %	532437272
76	NC_022125	ATCA	2	8	29887	29894	50 %	25 %	0 %	25 %	532437272
77	NC_022125	GACG	2	8	29913	29920	25 %	0 %	50 %	25 %	532437272
78	NC_022125	TCAT	2	8	29956	29963	25 %	50 %	0 %	25 %	532437272
79	NC_022125	TTTC	2	8	30227	30234	0 %	75 %	0 %	25 %	532437272
80	NC_022125	TCTG	2	8	30475	30482	0 %	50 %	25 %	25 %	532437273
81	NC_022125	ACCT	2	8	30502	30509	25 %	25 %	0 %	50 %	532437273
82	NC_022125	GCGG	2	8	30591	30598	0 %	0 %	75 %	25 %	532437273
83	NC_022125	GGCA	2	8	30711	30718	25 %	0 %	50 %	25 %	532437273
84	NC_022125	CCGA	2	8	30856	30863	25 %	0 %	25 %	50 %	532437273
85	NC_022125	GAAG	2	8	31006	31013	50 %	0 %	50 %	0 %	532437273
86	NC_022125	GCCG	2	8	31455	31462	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
87	NC_022125	GTGC	2	8	31744	31751	0 %	25 %	50 %	25 %	532437274
88	NC_022125	CGAG	2	8	31776	31783	25 %	0 %	50 %	25 %	532437274
89	NC_022125	CCGT	2	8	31855	31862	0 %	25 %	25 %	50 %	532437274
90	NC_022125	TCGG	2	8	31886	31893	0 %	25 %	50 %	25 %	532437274
91	NC_022125	CGGC	2	8	31938	31945	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
92	NC_022125	GCGG	2	8	32438	32445	0 %	0 %	75 %	25 %	532437274
93	NC_022125	CGTC	2	8	32650	32657	0 %	25 %	25 %	50 %	532437274
94	NC_022125	GTAG	2	8	32782	32789	25 %	25 %	50 %	0 %	532437274
95	NC_022125	GCCG	2	8	34307	34314	0 %	0 %	50 %	50 %	532437276
96	NC_022125	TCGC	2	8	34402	34409	0 %	25 %	25 %	50 %	532437277
97	NC_022125	TGGT	2	8	34574	34581	0 %	50 %	50 %	0 %	532437277
98	NC_022125	GACT	2	8	35363	35370	25 %	25 %	25 %	25 %	532437278
99	NC_022125	GGCG	2	8	35855	35862	0 %	0 %	75 %	25 %	532437279
100	NC_022125	CGAA	2	8	36031	36038	50 %	0 %	25 %	25 %	532437279
101	NC_022125	CAGC	2	8	37002	37009	25 %	0 %	25 %	50 %	532437280
102	NC_022125	GCGG	2	8	37741	37748	0 %	0 %	75 %	25 %	532437282
103	NC_022125	CGTT	2	8	38022	38029	0 %	50 %	25 %	25 %	532437282
104	NC_022125	CTGG	2	8	39562	39569	0 %	25 %	50 %	25 %	532437283
105	NC_022125	TGGT	2	8	39707	39714	0 %	50 %	50 %	0 %	532437283
106	NC_022125	GGTG	2	8	39717	39724	0 %	25 %	75 %	0 %	532437283
107	NC_022125	GGCC	2	8	41599	41606	0 %	0 %	50 %	50 %	532437287
108	NC_022125	GTCG	2	8	42048	42055	0 %	25 %	50 %	25 %	532437287
109	NC_022125	GCGT	2	8	43873	43880	0 %	25 %	50 %	25 %	532437291
110	NC_022125	GGTA	2	8	45445	45452	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
111	NC_022125	GATG	2	8	46011	46018	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
112	NC_022125	GGAT	2	8	46283	46290	25 %	25 %	50 %	0 %	532437293
113	NC_022125	GGTT	2	8	48510	48517	0 %	50 %	50 %	0 %	532437299
114	NC_022125	GCCC	2	8	49066	49073	0 %	0 %	25 %	75 %	532437300
115	NC_022125	CGAG	2	8	49488	49495	25 %	0 %	50 %	25 %	532437300
116	NC_022125	GGTT	2	8	49925	49932	0 %	50 %	50 %	0 %	532437301
117	NC_022125	GGTG	2	8	50875	50882	0 %	25 %	75 %	0 %	532437301
118	NC_022125	CGGC	2	8	51631	51638	0 %	0 %	50 %	50 %	532437302
119	NC_022125	GCGG	2	8	52834	52841	0 %	0 %	75 %	25 %	532437303
120	NC_022125	TTCG	2	8	53194	53201	0 %	50 %	25 %	25 %	532437304
121	NC_022125	GATC	2	8	53329	53336	25 %	25 %	25 %	25 %	532437304
122	NC_022125	GCCG	2	8	53423	53430	0 %	0 %	50 %	50 %	532437304
123	NC_022125	GCCA	2	8	53628	53635	25 %	0 %	25 %	50 %	532437305
124	NC_022125	CGAG	2	8	54035	54042	25 %	0 %	50 %	25 %	532437305
125	NC_022125	GCCG	2	8	54494	54501	0 %	0 %	50 %	50 %	532437305
126	NC_022125	CGGC	2	8	54959	54966	0 %	0 %	50 %	50 %	532437306
127	NC_022125	GGTC	2	8	55044	55051	0 %	25 %	50 %	25 %	532437307
128	NC_022125	GATC	2	8	55283	55290	25 %	25 %	25 %	25 %	532437307
129	NC_022125	GGTG	2	8	55740	55747	0 %	25 %	75 %	0 %	532437308
130	NC_022125	AACC	2	8	56317	56324	50 %	0 %	0 %	50 %	532437308
131	NC_022125	AGCG	2	8	56435	56442	25 %	0 %	50 %	25 %	532437308
132	NC_022125	CCAA	2	8	56713	56720	50 %	0 %	0 %	50 %	532437308
133	NC_022125	CGGT	2	8	57975	57982	0 %	25 %	50 %	25 %	532437311
134	NC_022125	CTGA	2	8	58053	58060	25 %	25 %	25 %	25 %	532437311
135	NC_022125	GTTT	2	8	58274	58281	0 %	75 %	25 %	0 %	532437312
136	NC_022125	CCGG	2	8	59193	59200	0 %	0 %	50 %	50 %	532437313
137	NC_022125	GTGA	2	8	59300	59307	25 %	25 %	50 %	0 %	532437313
138	NC_022125	GATC	2	8	59925	59932	25 %	25 %	25 %	25 %	532437314
139	NC_022125	CTCG	2	8	60434	60441	0 %	25 %	25 %	50 %	532437314
140	NC_022125	GGGC	2	8	60501	60508	0 %	0 %	75 %	25 %	532437314
141	NC_022125	CCGT	2	8	60660	60667	0 %	25 %	25 %	50 %	532437314
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.