MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022125	TG	3	6	876	881	0 %	50 %	50 %	0 %	532437243
2	NC_022125	CG	3	6	2306	2311	0 %	0 %	50 %	50 %	532437245
3	NC_022125	GC	4	8	2321	2328	0 %	0 %	50 %	50 %	532437245
4	NC_022125	CT	3	6	2863	2868	0 %	50 %	0 %	50 %	532437245
5	NC_022125	CG	4	8	4214	4221	0 %	0 %	50 %	50 %	532437247
6	NC_022125	GC	3	6	4407	4412	0 %	0 %	50 %	50 %	532437247
7	NC_022125	GC	3	6	4592	4597	0 %	0 %	50 %	50 %	532437247
8	NC_022125	TG	3	6	5541	5546	0 %	50 %	50 %	0 %	532437248
9	NC_022125	AC	3	6	5588	5593	50 %	0 %	0 %	50 %	532437248
10	NC_022125	CA	3	6	8753	8758	50 %	0 %	0 %	50 %	532437251
11	NC_022125	GC	3	6	9427	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	532437252
12	NC_022125	GT	3	6	12978	12983	0 %	50 %	50 %	0 %	532437254
13	NC_022125	CA	3	6	13382	13387	50 %	0 %	0 %	50 %	532437255
14	NC_022125	GC	3	6	13471	13476	0 %	0 %	50 %	50 %	532437255
15	NC_022125	GC	3	6	14165	14170	0 %	0 %	50 %	50 %	532437257
16	NC_022125	GC	3	6	15140	15145	0 %	0 %	50 %	50 %	532437259
17	NC_022125	GT	3	6	16489	16494	0 %	50 %	50 %	0 %	532437260
18	NC_022125	GA	3	6	16516	16521	50 %	0 %	50 %	0 %	532437260
19	NC_022125	GT	3	6	17552	17557	0 %	50 %	50 %	0 %	532437261
20	NC_022125	GC	3	6	17769	17774	0 %	0 %	50 %	50 %	532437261
21	NC_022125	TC	4	8	17779	17786	0 %	50 %	0 %	50 %	532437261
22	NC_022125	GC	3	6	18065	18070	0 %	0 %	50 %	50 %	532437261
23	NC_022125	GA	3	6	18404	18409	50 %	0 %	50 %	0 %	532437261
24	NC_022125	TC	3	6	18900	18905	0 %	50 %	0 %	50 %	532437261
25	NC_022125	GT	3	6	20074	20079	0 %	50 %	50 %	0 %	532437262
26	NC_022125	CA	3	6	21171	21176	50 %	0 %	0 %	50 %	532437264
27	NC_022125	GT	3	6	21428	21433	0 %	50 %	50 %	0 %	532437265
28	NC_022125	CA	3	6	22236	22241	50 %	0 %	0 %	50 %	532437265
29	NC_022125	CG	3	6	23450	23455	0 %	0 %	50 %	50 %	532437266
30	NC_022125	GC	3	6	23699	23704	0 %	0 %	50 %	50 %	532437266
31	NC_022125	GT	3	6	23743	23748	0 %	50 %	50 %	0 %	532437266
32	NC_022125	TC	3	6	23906	23911	0 %	50 %	0 %	50 %	532437266
33	NC_022125	AC	3	6	24760	24765	50 %	0 %	0 %	50 %	532437267
34	NC_022125	CG	3	6	25756	25761	0 %	0 %	50 %	50 %	532437269
35	NC_022125	CG	3	6	25938	25943	0 %	0 %	50 %	50 %	532437269
36	NC_022125	AT	3	6	27218	27223	50 %	50 %	0 %	0 %	532437270
37	NC_022125	AT	3	6	27238	27243	50 %	50 %	0 %	0 %	532437270
38	NC_022125	GC	3	6	28185	28190	0 %	0 %	50 %	50 %	532437271
39	NC_022125	GC	3	6	28302	28307	0 %	0 %	50 %	50 %	532437271
40	NC_022125	CG	3	6	29236	29241	0 %	0 %	50 %	50 %	532437272
41	NC_022125	GC	3	6	29273	29278	0 %	0 %	50 %	50 %	532437272
42	NC_022125	CG	3	6	30001	30006	0 %	0 %	50 %	50 %	532437272
43	NC_022125	CT	3	6	31443	31448	0 %	50 %	0 %	50 %	532437274
44	NC_022125	CG	3	6	31554	31559	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
45	NC_022125	CT	3	6	31735	31740	0 %	50 %	0 %	50 %	532437274
46	NC_022125	CG	3	6	31992	31997	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
47	NC_022125	CG	3	6	32352	32357	0 %	0 %	50 %	50 %	532437274
48	NC_022125	GC	3	6	33265	33270	0 %	0 %	50 %	50 %	532437275
49	NC_022125	AC	3	6	34018	34023	50 %	0 %	0 %	50 %	532437276
50	NC_022125	TC	3	6	34558	34563	0 %	50 %	0 %	50 %	532437277
51	NC_022125	CA	3	6	35229	35234	50 %	0 %	0 %	50 %	532437278
52	NC_022125	CA	3	6	35948	35953	50 %	0 %	0 %	50 %	532437279
53	NC_022125	GC	3	6	37078	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	532437280
54	NC_022125	GC	3	6	37545	37550	0 %	0 %	50 %	50 %	532437281
55	NC_022125	AC	3	6	40595	40600	50 %	0 %	0 %	50 %	532437284
56	NC_022125	GT	3	6	41647	41652	0 %	50 %	50 %	0 %	532437287
57	NC_022125	TG	3	6	41984	41989	0 %	50 %	50 %	0 %	532437287
58	NC_022125	GT	3	6	42745	42750	0 %	50 %	50 %	0 %	532437289
59	NC_022125	CA	3	6	44256	44261	50 %	0 %	0 %	50 %	532437292
60	NC_022125	GT	3	6	44924	44929	0 %	50 %	50 %	0 %	532437293
61	NC_022125	GT	4	8	46399	46406	0 %	50 %	50 %	0 %	532437293
62	NC_022125	TG	3	6	46573	46578	0 %	50 %	50 %	0 %	532437294
63	NC_022125	GC	3	6	48687	48692	0 %	0 %	50 %	50 %	532437299
64	NC_022125	CG	3	6	50297	50302	0 %	0 %	50 %	50 %	532437301
65	NC_022125	GC	3	6	50913	50918	0 %	0 %	50 %	50 %	532437301
66	NC_022125	CG	3	6	52696	52701	0 %	0 %	50 %	50 %	532437303
67	NC_022125	GC	3	6	53976	53981	0 %	0 %	50 %	50 %	532437305
68	NC_022125	GC	4	8	54465	54472	0 %	0 %	50 %	50 %	532437305
69	NC_022125	CA	4	8	55428	55435	50 %	0 %	0 %	50 %	532437307
70	NC_022125	GA	3	6	55651	55656	50 %	0 %	50 %	0 %	532437307
71	NC_022125	GC	3	6	57655	57660	0 %	0 %	50 %	50 %	532437310
72	NC_022125	CA	3	6	58209	58214	50 %	0 %	0 %	50 %	532437312
73	NC_022125	TC	3	6	58399	58404	0 %	50 %	0 %	50 %	532437312
74	NC_022125	TC	3	6	59010	59015	0 %	50 %	0 %	50 %	532437313
75	NC_022125	GC	3	6	60416	60421	0 %	0 %	50 %	50 %	532437314
76	NC_022125	CG	3	6	60440	60445	0 %	0 %	50 %	50 %	532437314
77	NC_022125	GC	3	6	60631	60636	0 %	0 %	50 %	50 %	532437314
78	NC_022125	CG	3	6	61021	61026	0 %	0 %	50 %	50 %	532437314
79	NC_022125	CG	3	6	61187	61192	0 %	0 %	50 %	50 %	532437314
80	NC_022125	GC	3	6	61357	61362	0 %	0 %	50 %	50 %	532437315
81	NC_022125	TG	3	6	62800	62805	0 %	50 %	50 %	0 %	532437317
82	NC_022125	GA	3	6	63292	63297	50 %	0 %	50 %	0 %	532437317
83	NC_022125	GT	3	6	63506	63511	0 %	50 %	50 %	0 %	532437317
84	NC_022125	TG	3	6	63608	63613	0 %	50 %	50 %	0 %	532437317
85	NC_022125	GC	4	8	63935	63942	0 %	0 %	50 %	50 %	532437317
86	NC_022125	GC	3	6	66686	66691	0 %	0 %	50 %	50 %	532437322
87	NC_022125	GT	3	6	66791	66796	0 %	50 %	50 %	0 %	532437322
88	NC_022125	GC	3	6	66908	66913	0 %	0 %	50 %	50 %	532437322
89	NC_022125	GC	3	6	68771	68776	0 %	0 %	50 %	50 %	532437323
90	NC_022125	CA	3	6	69310	69315	50 %	0 %	0 %	50 %	532437323
91	NC_022125	CA	3	6	69342	69347	50 %	0 %	0 %	50 %	532437323
92	NC_022125	AC	3	6	70455	70460	50 %	0 %	0 %	50 %	532437325
93	NC_022125	CG	3	6	70599	70604	0 %	0 %	50 %	50 %	532437325
94	NC_022125	GC	3	6	71809	71814	0 %	0 %	50 %	50 %	532437327
95	NC_022125	GT	3	6	72213	72218	0 %	50 %	50 %	0 %	532437328
96	NC_022125	AC	3	6	72512	72517	50 %	0 %	0 %	50 %	532437328
97	NC_022125	TC	5	10	73205	73214	0 %	50 %	0 %	50 %	532437329
98	NC_022125	GC	3	6	73252	73257	0 %	0 %	50 %	50 %	532437329
99	NC_022125	GA	3	6	74203	74208	50 %	0 %	50 %	0 %	532437329
100	NC_022125	CG	3	6	74429	74434	0 %	0 %	50 %	50 %	532437329
101	NC_022125	CA	3	6	76867	76872	50 %	0 %	0 %	50 %	532437331
102	NC_022125	CT	3	6	77344	77349	0 %	50 %	0 %	50 %	532437332
103	NC_022125	AC	3	6	80437	80442	50 %	0 %	0 %	50 %	532437334
104	NC_022125	CG	3	6	80448	80453	0 %	0 %	50 %	50 %	532437334
105	NC_022125	CT	3	6	80638	80643	0 %	50 %	0 %	50 %	532437334
106	NC_022125	GC	3	6	81659	81664	0 %	0 %	50 %	50 %	532437336
107	NC_022125	TG	3	6	85538	85543	0 %	50 %	50 %	0 %	532437342
108	NC_022125	GT	3	6	85614	85619	0 %	50 %	50 %	0 %	532437342
109	NC_022125	GT	3	6	86179	86184	0 %	50 %	50 %	0 %	532437343
110	NC_022125	GC	3	6	86309	86314	0 %	0 %	50 %	50 %	532437343
111	NC_022125	GT	3	6	86873	86878	0 %	50 %	50 %	0 %	532437344
112	NC_022125	GA	3	6	86991	86996	50 %	0 %	50 %	0 %	532437344
113	NC_022125	CT	3	6	89026	89031	0 %	50 %	0 %	50 %	532437347

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.