MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	CGTCA	2	10	1410	1419	20 %	20 %	20 %	40 %	532433694
2	NC_022123	ACAAG	2	10	3477	3486	60 %	0 %	20 %	20 %	532433696
3	NC_022123	TACCG	2	10	6115	6124	20 %	20 %	20 %	40 %	532433699
4	NC_022123	ACGAA	2	10	7799	7808	60 %	0 %	20 %	20 %	532433701
5	NC_022123	CCGTT	2	10	9191	9200	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022123	CAGTA	2	10	12017	12026	40 %	20 %	20 %	20 %	532433710
7	NC_022123	AGTCA	2	10	14383	14392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022123	AATTT	2	10	14644	14653	40 %	60 %	0 %	0 %	532433714
9	NC_022123	ATTAT	2	10	15189	15198	40 %	60 %	0 %	0 %	532433714
10	NC_022123	CGTGT	2	10	16220	16229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022123	ATAAA	2	10	17895	17904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022123	CAAAT	2	10	19348	19357	60 %	20 %	0 %	20 %	532433718
13	NC_022123	CCATG	2	10	20155	20164	20 %	20 %	20 %	40 %	532433718
14	NC_022123	GAAGT	2	10	21269	21278	40 %	20 %	40 %	0 %	532433719
15	NC_022123	ACTTT	2	10	25148	25157	20 %	60 %	0 %	20 %	532433722
16	NC_022123	TGGCC	2	10	27821	27830	0 %	20 %	40 %	40 %	532433725
17	NC_022123	TGTTT	2	10	27920	27929	0 %	80 %	20 %	0 %	532433725
18	NC_022123	ACGGC	2	10	28182	28191	20 %	0 %	40 %	40 %	532433726
19	NC_022123	GATTT	2	10	29270	29279	20 %	60 %	20 %	0 %	532433726
20	NC_022123	GATTT	2	10	29749	29758	20 %	60 %	20 %	0 %	532433727
21	NC_022123	GATCG	2	10	30779	30788	20 %	20 %	40 %	20 %	532433728
22	NC_022123	TTCGT	2	10	31091	31100	0 %	60 %	20 %	20 %	532433728
23	NC_022123	AAAAG	2	10	32264	32273	80 %	0 %	20 %	0 %	532433730
24	NC_022123	GATCT	2	10	32567	32576	20 %	40 %	20 %	20 %	532433731
25	NC_022123	AAAAG	2	10	33513	33522	80 %	0 %	20 %	0 %	532433732
26	NC_022123	TGAAG	2	10	33978	33987	40 %	20 %	40 %	0 %	532433732
27	NC_022123	CAAAA	2	10	34892	34901	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022123	AGCAA	2	10	37735	37744	60 %	0 %	20 %	20 %	532433736
29	NC_022123	TCACG	2	10	38388	38397	20 %	20 %	20 %	40 %	532433736
30	NC_022123	AAAAG	2	10	38989	38998	80 %	0 %	20 %	0 %	532433736
31	NC_022123	ACGAG	2	10	39129	39138	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022123	CTTTT	2	10	39603	39612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022123	AAAGA	2	10	41129	41138	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022123	ACCAC	2	10	41584	41593	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_022123	GATCT	2	10	43469	43478	20 %	40 %	20 %	20 %	532433739
36	NC_022123	ATTAA	2	10	44144	44153	60 %	40 %	0 %	0 %	532433739
37	NC_022123	TTTTG	2	10	44817	44826	0 %	80 %	20 %	0 %	532433740
38	NC_022123	TCCAA	2	10	44968	44977	40 %	20 %	0 %	40 %	532433740
39	NC_022123	ATCAA	2	10	45235	45244	60 %	20 %	0 %	20 %	532433740
40	NC_022123	CCAGA	2	10	45967	45976	40 %	0 %	20 %	40 %	532433740
41	NC_022123	CCAGA	2	10	46264	46273	40 %	0 %	20 %	40 %	532433740
42	NC_022123	GTTGC	2	10	48100	48109	0 %	40 %	40 %	20 %	532433742
43	NC_022123	CTTCT	2	10	48530	48539	0 %	60 %	0 %	40 %	532433742
44	NC_022123	ACCGT	2	10	48759	48768	20 %	20 %	20 %	40 %	532433742
45	NC_022123	ATGCT	2	10	49619	49628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022123	CAACC	2	10	49981	49990	40 %	0 %	0 %	60 %	532433743
47	NC_022123	GTTTG	2	10	50553	50562	0 %	60 %	40 %	0 %	532433743
48	NC_022123	TTGGC	2	10	51730	51739	0 %	40 %	40 %	20 %	532433744
49	NC_022123	TTCTG	2	10	53394	53403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022123	AGATT	2	10	53834	53843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022123	CAGAA	2	10	57109	57118	60 %	0 %	20 %	20 %	532433751
52	NC_022123	TTGCT	2	10	59176	59185	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022123	CAAAG	2	10	60227	60236	60 %	0 %	20 %	20 %	532433752
54	NC_022123	CTTCT	2	10	60696	60705	0 %	60 %	0 %	40 %	532433753
55	NC_022123	TGTCA	2	10	60940	60949	20 %	40 %	20 %	20 %	532433754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.