MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	ATTC	2	8	84	91	25 %	50 %	0 %	25 %	532433693
2	NC_022123	CGAC	2	8	1476	1483	25 %	0 %	25 %	50 %	532433694
3	NC_022123	GCTG	2	8	2843	2850	0 %	25 %	50 %	25 %	532433695
4	NC_022123	TTGT	2	8	3163	3170	0 %	75 %	25 %	0 %	532433696
5	NC_022123	GATT	2	8	3213	3220	25 %	50 %	25 %	0 %	532433696
6	NC_022123	GTAT	2	8	3587	3594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022123	CTTT	2	8	3942	3949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022123	GGTT	2	8	4013	4020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022123	GATT	2	8	4380	4387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022123	TCAT	2	8	4497	4504	25 %	50 %	0 %	25 %	532433697
11	NC_022123	AAAG	2	8	4865	4872	75 %	0 %	25 %	0 %	532433698
12	NC_022123	TGAC	2	8	4879	4886	25 %	25 %	25 %	25 %	532433698
13	NC_022123	TCAG	2	8	5346	5353	25 %	25 %	25 %	25 %	532433699
14	NC_022123	CAAC	2	8	6450	6457	50 %	0 %	0 %	50 %	532433700
15	NC_022123	GTCA	2	8	6949	6956	25 %	25 %	25 %	25 %	532433701
16	NC_022123	TTTC	2	8	7119	7126	0 %	75 %	0 %	25 %	532433701
17	NC_022123	AACA	2	8	7502	7509	75 %	0 %	0 %	25 %	532433701
18	NC_022123	TGAT	2	8	7664	7671	25 %	50 %	25 %	0 %	532433701
19	NC_022123	CTAA	2	8	8187	8194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022123	GCCA	2	8	8279	8286	25 %	0 %	25 %	50 %	532433702
21	NC_022123	AACT	2	8	8594	8601	50 %	25 %	0 %	25 %	532433702
22	NC_022123	ATCA	2	8	8853	8860	50 %	25 %	0 %	25 %	532433702
23	NC_022123	AAAC	2	8	9063	9070	75 %	0 %	0 %	25 %	532433702
24	NC_022123	GGCA	2	8	9235	9242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022123	GTAG	2	8	10121	10128	25 %	25 %	50 %	0 %	532433704
26	NC_022123	ATCA	2	8	11019	11026	50 %	25 %	0 %	25 %	532433707
27	NC_022123	TGGT	2	8	11085	11092	0 %	50 %	50 %	0 %	532433708
28	NC_022123	GTTG	2	8	11300	11307	0 %	50 %	50 %	0 %	532433708
29	NC_022123	CTCA	2	8	11382	11389	25 %	25 %	0 %	50 %	532433708
30	NC_022123	TACC	2	8	11850	11857	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022123	TCAA	2	8	12077	12084	50 %	25 %	0 %	25 %	532433710
32	NC_022123	ACTT	2	8	12291	12298	25 %	50 %	0 %	25 %	532433710
33	NC_022123	ATTT	2	8	13097	13104	25 %	75 %	0 %	0 %	532433711
34	NC_022123	AGCA	2	8	14202	14209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022123	TACT	2	8	14434	14441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022123	CTGA	2	8	15115	15122	25 %	25 %	25 %	25 %	532433714
37	NC_022123	AACT	2	8	15152	15159	50 %	25 %	0 %	25 %	532433714
38	NC_022123	GTCG	2	8	15250	15257	0 %	25 %	50 %	25 %	532433714
39	NC_022123	TAAA	2	8	16109	16116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022123	TTTG	2	8	16289	16296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022123	TTGT	2	8	17596	17603	0 %	75 %	25 %	0 %	532433716
42	NC_022123	TGGA	2	8	17839	17846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022123	TTTG	2	8	17935	17942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022123	CAGG	2	8	18387	18394	25 %	0 %	50 %	25 %	532433717
45	NC_022123	CGAC	2	8	18704	18711	25 %	0 %	25 %	50 %	532433717
46	NC_022123	TGAG	2	8	18844	18851	25 %	25 %	50 %	0 %	532433717
47	NC_022123	ACGA	2	8	18853	18860	50 %	0 %	25 %	25 %	532433717
48	NC_022123	TGAC	2	8	19315	19322	25 %	25 %	25 %	25 %	532433718
49	NC_022123	CAGG	2	8	19845	19852	25 %	0 %	50 %	25 %	532433718
50	NC_022123	ATTC	2	8	20066	20073	25 %	50 %	0 %	25 %	532433718
51	NC_022123	CATT	2	8	20269	20276	25 %	50 %	0 %	25 %	532433718
52	NC_022123	CAAA	2	8	20474	20481	75 %	0 %	0 %	25 %	532433718
53	NC_022123	AAAC	2	8	20546	20553	75 %	0 %	0 %	25 %	532433718
54	NC_022123	AAAG	2	8	21959	21966	75 %	0 %	25 %	0 %	532433719
55	NC_022123	GATT	2	8	22015	22022	25 %	50 %	25 %	0 %	532433719
56	NC_022123	CAAA	2	8	22186	22193	75 %	0 %	0 %	25 %	532433719
57	NC_022123	TGAG	2	8	22215	22222	25 %	25 %	50 %	0 %	532433719
58	NC_022123	TGGT	2	8	22317	22324	0 %	50 %	50 %	0 %	532433720
59	NC_022123	TGCA	2	8	22368	22375	25 %	25 %	25 %	25 %	532433720
60	NC_022123	CAAC	2	8	22456	22463	50 %	0 %	0 %	50 %	532433720
61	NC_022123	ATGG	2	8	24052	24059	25 %	25 %	50 %	0 %	532433721
62	NC_022123	TCAT	2	8	24541	24548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022123	TTTG	2	8	25133	25140	0 %	75 %	25 %	0 %	532433722
64	NC_022123	TTCG	2	8	25322	25329	0 %	50 %	25 %	25 %	532433722
65	NC_022123	AATG	2	8	25376	25383	50 %	25 %	25 %	0 %	532433722
66	NC_022123	TGAA	2	8	25573	25580	50 %	25 %	25 %	0 %	532433722
67	NC_022123	CAAC	2	8	25645	25652	50 %	0 %	0 %	50 %	532433722
68	NC_022123	CTTT	2	8	25822	25829	0 %	75 %	0 %	25 %	532433722
69	NC_022123	TTGC	2	8	25888	25895	0 %	50 %	25 %	25 %	532433722
70	NC_022123	GCAT	2	8	25898	25905	25 %	25 %	25 %	25 %	532433722
71	NC_022123	AATT	2	8	26428	26435	50 %	50 %	0 %	0 %	532433722
72	NC_022123	TGGT	2	8	26608	26615	0 %	50 %	50 %	0 %	532433722
73	NC_022123	TTCC	2	8	27964	27971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022123	CTTA	2	8	28116	28123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_022123	TCCT	2	8	28476	28483	0 %	50 %	0 %	50 %	532433726
76	NC_022123	TGCT	2	8	29126	29133	0 %	50 %	25 %	25 %	532433726
77	NC_022123	CCAT	2	8	29254	29261	25 %	25 %	0 %	50 %	532433726
78	NC_022123	TGCT	2	8	29605	29612	0 %	50 %	25 %	25 %	532433727
79	NC_022123	CCAT	2	8	29733	29740	25 %	25 %	0 %	50 %	532433727
80	NC_022123	TCAG	2	8	30915	30922	25 %	25 %	25 %	25 %	532433728
81	NC_022123	TTGA	2	8	31708	31715	25 %	50 %	25 %	0 %	532433729
82	NC_022123	TCAA	2	8	32024	32031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022123	AGGG	2	8	32322	32329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022123	AAAG	2	8	33481	33488	75 %	0 %	25 %	0 %	532433731
85	NC_022123	GAGT	2	8	34218	34225	25 %	25 %	50 %	0 %	532433732
86	NC_022123	GTAC	2	8	34945	34952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_022123	AATA	2	8	35053	35060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022123	CAAA	2	8	35073	35080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_022123	GTTG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532433735
90	NC_022123	TCCT	2	8	36423	36430	0 %	50 %	0 %	50 %	532433735
91	NC_022123	CCTA	2	8	36431	36438	25 %	25 %	0 %	50 %	532433735
92	NC_022123	TGAA	2	8	36453	36460	50 %	25 %	25 %	0 %	532433735
93	NC_022123	AGTC	2	8	37032	37039	25 %	25 %	25 %	25 %	532433735
94	NC_022123	CAAT	2	8	37330	37337	50 %	25 %	0 %	25 %	532433735
95	NC_022123	TCAA	2	8	37699	37706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022123	TTCA	2	8	38137	38144	25 %	50 %	0 %	25 %	532433736
97	NC_022123	AAAG	2	8	38181	38188	75 %	0 %	25 %	0 %	532433736
98	NC_022123	CAAG	2	8	38433	38440	50 %	0 %	25 %	25 %	532433736
99	NC_022123	ATTT	2	8	38446	38453	25 %	75 %	0 %	0 %	532433736
100	NC_022123	AAGC	2	8	38638	38645	50 %	0 %	25 %	25 %	532433736
101	NC_022123	AAAG	2	8	40046	40053	75 %	0 %	25 %	0 %	532433737
102	NC_022123	ATCA	2	8	40530	40537	50 %	25 %	0 %	25 %	532433737
103	NC_022123	GTTG	2	8	41368	41375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022123	ATTT	2	8	41876	41883	25 %	75 %	0 %	0 %	532433738
105	NC_022123	CTTT	2	8	42368	42375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_022123	GCAT	2	8	42383	42390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_022123	GAAC	2	8	42446	42453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022123	TGAT	2	8	42948	42955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022123	GTTT	2	8	43117	43124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022123	GAAT	2	8	43928	43935	50 %	25 %	25 %	0 %	532433739
111	NC_022123	TAAT	2	8	44747	44754	50 %	50 %	0 %	0 %	532433740
112	NC_022123	GTTA	2	8	45589	45596	25 %	50 %	25 %	0 %	532433740
113	NC_022123	TTAT	2	8	45731	45738	25 %	75 %	0 %	0 %	532433740
114	NC_022123	TAAA	2	8	46646	46653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022123	CAAG	2	8	47081	47088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022123	TTTC	2	8	47212	47219	0 %	75 %	0 %	25 %	532433741
117	NC_022123	GCCA	2	8	47579	47586	25 %	0 %	25 %	50 %	532433741
118	NC_022123	TTGA	2	8	47917	47924	25 %	50 %	25 %	0 %	532433741
119	NC_022123	GACC	2	8	47929	47936	25 %	0 %	25 %	50 %	532433741
120	NC_022123	GTTG	2	8	48595	48602	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
121	NC_022123	TCAC	2	8	49017	49024	25 %	25 %	0 %	50 %	532433742
122	NC_022123	GCTG	2	8	49420	49427	0 %	25 %	50 %	25 %	532433742
123	NC_022123	AAGC	2	8	49647	49654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022123	GTCC	2	8	49692	49699	0 %	25 %	25 %	50 %	532433743
125	NC_022123	TGAT	2	8	49784	49791	25 %	50 %	25 %	0 %	532433743
126	NC_022123	CTTG	2	8	50232	50239	0 %	50 %	25 %	25 %	532433743
127	NC_022123	CGTT	2	8	51320	51327	0 %	50 %	25 %	25 %	532433744
128	NC_022123	TCCT	2	8	52083	52090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022123	TGAC	2	8	52202	52209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022123	AAAC	2	8	52239	52246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_022123	TCCT	2	8	52307	52314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022123	ACCA	2	8	52383	52390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022123	TGCT	2	8	52824	52831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022123	AGTA	2	8	53375	53382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022123	TTAG	2	8	53479	53486	25 %	50 %	25 %	0 %	532433746
136	NC_022123	AACT	2	8	54029	54036	50 %	25 %	0 %	25 %	532433747
137	NC_022123	GATT	2	8	54095	54102	25 %	50 %	25 %	0 %	532433747
138	NC_022123	ATTT	2	8	54239	54246	25 %	75 %	0 %	0 %	532433747
139	NC_022123	ACCA	2	8	54530	54537	50 %	0 %	0 %	50 %	532433748
140	NC_022123	TCTT	2	8	54803	54810	0 %	75 %	0 %	25 %	532433749
141	NC_022123	GTCA	2	8	55102	55109	25 %	25 %	25 %	25 %	532433749
142	NC_022123	TCTG	2	8	55515	55522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_022123	ACGA	2	8	56406	56413	50 %	0 %	25 %	25 %	532433750
144	NC_022123	AGTT	2	8	57424	57431	25 %	50 %	25 %	0 %	532433751
145	NC_022123	ATTG	2	8	57465	57472	25 %	50 %	25 %	0 %	532433751
146	NC_022123	ATAA	2	8	58390	58397	75 %	25 %	0 %	0 %	532433751
147	NC_022123	CAAT	2	8	58611	58618	50 %	25 %	0 %	25 %	532433751
148	NC_022123	TTCC	2	8	59068	59075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022123	AGAA	2	8	59646	59653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022123	AGTA	2	8	59834	59841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022123	CAAG	2	8	59891	59898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_022123	TTGG	2	8	60161	60168	0 %	50 %	50 %	0 %	532433752
153	NC_022123	CCCA	2	8	60909	60916	25 %	0 %	0 %	75 %	532433754
154	NC_022123	ATTG	2	8	61031	61038	25 %	50 %	25 %	0 %	532433754
155	NC_022123	GTCC	2	8	61332	61339	0 %	25 %	25 %	50 %	532433754
156	NC_022123	TAAA	2	8	61705	61712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.