MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	GTAT	2	8	3587	3594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022123	CTTT	2	8	3942	3949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022123	GGTT	2	8	4013	4020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022123	GATT	2	8	4380	4387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022123	CTAA	2	8	8187	8194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022123	GGCA	2	8	9235	9242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_022123	TACC	2	8	11850	11857	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022123	AGCA	2	8	14202	14209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_022123	TACT	2	8	14434	14441	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022123	TAAA	2	8	16109	16116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022123	TTTG	2	8	16289	16296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022123	TGGA	2	8	17839	17846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022123	TTTG	2	8	17935	17942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022123	TCAT	2	8	24541	24548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022123	TTCC	2	8	27964	27971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022123	CTTA	2	8	28116	28123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022123	TCAA	2	8	32024	32031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_022123	AGGG	2	8	32322	32329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022123	GTAC	2	8	34945	34952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022123	AATA	2	8	35053	35060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022123	CAAA	2	8	35073	35080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_022123	TCAA	2	8	37699	37706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022123	GTTG	2	8	41368	41375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022123	CTTT	2	8	42368	42375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022123	GCAT	2	8	42383	42390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_022123	GAAC	2	8	42446	42453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022123	TGAT	2	8	42948	42955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022123	GTTT	2	8	43117	43124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022123	TAAA	2	8	46646	46653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022123	CAAG	2	8	47081	47088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_022123	AAGC	2	8	49647	49654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022123	TCCT	2	8	52083	52090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022123	TGAC	2	8	52202	52209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022123	AAAC	2	8	52239	52246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022123	TCCT	2	8	52307	52314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022123	ACCA	2	8	52383	52390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022123	TGCT	2	8	52824	52831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022123	AGTA	2	8	53375	53382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022123	TCTG	2	8	55515	55522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022123	TTCC	2	8	59068	59075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022123	AGAA	2	8	59646	59653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022123	AGTA	2	8	59834	59841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022123	CAAG	2	8	59891	59898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022123	TAAA	2	8	61705	61712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.