MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	ATTC	2	8	84	91	25 %	50 %	0 %	25 %	532433693
2	NC_022123	CGAC	2	8	1476	1483	25 %	0 %	25 %	50 %	532433694
3	NC_022123	GCTG	2	8	2843	2850	0 %	25 %	50 %	25 %	532433695
4	NC_022123	TTGT	2	8	3163	3170	0 %	75 %	25 %	0 %	532433696
5	NC_022123	GATT	2	8	3213	3220	25 %	50 %	25 %	0 %	532433696
6	NC_022123	TCAT	2	8	4497	4504	25 %	50 %	0 %	25 %	532433697
7	NC_022123	AAAG	2	8	4865	4872	75 %	0 %	25 %	0 %	532433698
8	NC_022123	TGAC	2	8	4879	4886	25 %	25 %	25 %	25 %	532433698
9	NC_022123	TCAG	2	8	5346	5353	25 %	25 %	25 %	25 %	532433699
10	NC_022123	CAAC	2	8	6450	6457	50 %	0 %	0 %	50 %	532433700
11	NC_022123	GTCA	2	8	6949	6956	25 %	25 %	25 %	25 %	532433701
12	NC_022123	TTTC	2	8	7119	7126	0 %	75 %	0 %	25 %	532433701
13	NC_022123	AACA	2	8	7502	7509	75 %	0 %	0 %	25 %	532433701
14	NC_022123	TGAT	2	8	7664	7671	25 %	50 %	25 %	0 %	532433701
15	NC_022123	GCCA	2	8	8279	8286	25 %	0 %	25 %	50 %	532433702
16	NC_022123	AACT	2	8	8594	8601	50 %	25 %	0 %	25 %	532433702
17	NC_022123	ATCA	2	8	8853	8860	50 %	25 %	0 %	25 %	532433702
18	NC_022123	AAAC	2	8	9063	9070	75 %	0 %	0 %	25 %	532433702
19	NC_022123	GTAG	2	8	10121	10128	25 %	25 %	50 %	0 %	532433704
20	NC_022123	ATCA	2	8	11019	11026	50 %	25 %	0 %	25 %	532433707
21	NC_022123	TGGT	2	8	11085	11092	0 %	50 %	50 %	0 %	532433708
22	NC_022123	GTTG	2	8	11300	11307	0 %	50 %	50 %	0 %	532433708
23	NC_022123	CTCA	2	8	11382	11389	25 %	25 %	0 %	50 %	532433708
24	NC_022123	TCAA	2	8	12077	12084	50 %	25 %	0 %	25 %	532433710
25	NC_022123	ACTT	2	8	12291	12298	25 %	50 %	0 %	25 %	532433710
26	NC_022123	ATTT	2	8	13097	13104	25 %	75 %	0 %	0 %	532433711
27	NC_022123	CTGA	2	8	15115	15122	25 %	25 %	25 %	25 %	532433714
28	NC_022123	AACT	2	8	15152	15159	50 %	25 %	0 %	25 %	532433714
29	NC_022123	GTCG	2	8	15250	15257	0 %	25 %	50 %	25 %	532433714
30	NC_022123	TTGT	2	8	17596	17603	0 %	75 %	25 %	0 %	532433716
31	NC_022123	CAGG	2	8	18387	18394	25 %	0 %	50 %	25 %	532433717
32	NC_022123	CGAC	2	8	18704	18711	25 %	0 %	25 %	50 %	532433717
33	NC_022123	TGAG	2	8	18844	18851	25 %	25 %	50 %	0 %	532433717
34	NC_022123	ACGA	2	8	18853	18860	50 %	0 %	25 %	25 %	532433717
35	NC_022123	TGAC	2	8	19315	19322	25 %	25 %	25 %	25 %	532433718
36	NC_022123	CAGG	2	8	19845	19852	25 %	0 %	50 %	25 %	532433718
37	NC_022123	ATTC	2	8	20066	20073	25 %	50 %	0 %	25 %	532433718
38	NC_022123	CATT	2	8	20269	20276	25 %	50 %	0 %	25 %	532433718
39	NC_022123	CAAA	2	8	20474	20481	75 %	0 %	0 %	25 %	532433718
40	NC_022123	AAAC	2	8	20546	20553	75 %	0 %	0 %	25 %	532433718
41	NC_022123	AAAG	2	8	21959	21966	75 %	0 %	25 %	0 %	532433719
42	NC_022123	GATT	2	8	22015	22022	25 %	50 %	25 %	0 %	532433719
43	NC_022123	CAAA	2	8	22186	22193	75 %	0 %	0 %	25 %	532433719
44	NC_022123	TGAG	2	8	22215	22222	25 %	25 %	50 %	0 %	532433719
45	NC_022123	TGGT	2	8	22317	22324	0 %	50 %	50 %	0 %	532433720
46	NC_022123	TGCA	2	8	22368	22375	25 %	25 %	25 %	25 %	532433720
47	NC_022123	CAAC	2	8	22456	22463	50 %	0 %	0 %	50 %	532433720
48	NC_022123	ATGG	2	8	24052	24059	25 %	25 %	50 %	0 %	532433721
49	NC_022123	TTTG	2	8	25133	25140	0 %	75 %	25 %	0 %	532433722
50	NC_022123	TTCG	2	8	25322	25329	0 %	50 %	25 %	25 %	532433722
51	NC_022123	AATG	2	8	25376	25383	50 %	25 %	25 %	0 %	532433722
52	NC_022123	TGAA	2	8	25573	25580	50 %	25 %	25 %	0 %	532433722
53	NC_022123	CAAC	2	8	25645	25652	50 %	0 %	0 %	50 %	532433722
54	NC_022123	CTTT	2	8	25822	25829	0 %	75 %	0 %	25 %	532433722
55	NC_022123	TTGC	2	8	25888	25895	0 %	50 %	25 %	25 %	532433722
56	NC_022123	GCAT	2	8	25898	25905	25 %	25 %	25 %	25 %	532433722
57	NC_022123	AATT	2	8	26428	26435	50 %	50 %	0 %	0 %	532433722
58	NC_022123	TGGT	2	8	26608	26615	0 %	50 %	50 %	0 %	532433722
59	NC_022123	TCCT	2	8	28476	28483	0 %	50 %	0 %	50 %	532433726
60	NC_022123	TGCT	2	8	29126	29133	0 %	50 %	25 %	25 %	532433726
61	NC_022123	CCAT	2	8	29254	29261	25 %	25 %	0 %	50 %	532433726
62	NC_022123	TGCT	2	8	29605	29612	0 %	50 %	25 %	25 %	532433727
63	NC_022123	CCAT	2	8	29733	29740	25 %	25 %	0 %	50 %	532433727
64	NC_022123	TCAG	2	8	30915	30922	25 %	25 %	25 %	25 %	532433728
65	NC_022123	TTGA	2	8	31708	31715	25 %	50 %	25 %	0 %	532433729
66	NC_022123	AAAG	2	8	33481	33488	75 %	0 %	25 %	0 %	532433731
67	NC_022123	GAGT	2	8	34218	34225	25 %	25 %	50 %	0 %	532433732
68	NC_022123	GTTG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532433735
69	NC_022123	TCCT	2	8	36423	36430	0 %	50 %	0 %	50 %	532433735
70	NC_022123	CCTA	2	8	36431	36438	25 %	25 %	0 %	50 %	532433735
71	NC_022123	TGAA	2	8	36453	36460	50 %	25 %	25 %	0 %	532433735
72	NC_022123	AGTC	2	8	37032	37039	25 %	25 %	25 %	25 %	532433735
73	NC_022123	CAAT	2	8	37330	37337	50 %	25 %	0 %	25 %	532433735
74	NC_022123	TTCA	2	8	38137	38144	25 %	50 %	0 %	25 %	532433736
75	NC_022123	AAAG	2	8	38181	38188	75 %	0 %	25 %	0 %	532433736
76	NC_022123	CAAG	2	8	38433	38440	50 %	0 %	25 %	25 %	532433736
77	NC_022123	ATTT	2	8	38446	38453	25 %	75 %	0 %	0 %	532433736
78	NC_022123	AAGC	2	8	38638	38645	50 %	0 %	25 %	25 %	532433736
79	NC_022123	AAAG	2	8	40046	40053	75 %	0 %	25 %	0 %	532433737
80	NC_022123	ATCA	2	8	40530	40537	50 %	25 %	0 %	25 %	532433737
81	NC_022123	ATTT	2	8	41876	41883	25 %	75 %	0 %	0 %	532433738
82	NC_022123	GAAT	2	8	43928	43935	50 %	25 %	25 %	0 %	532433739
83	NC_022123	TAAT	2	8	44747	44754	50 %	50 %	0 %	0 %	532433740
84	NC_022123	GTTA	2	8	45589	45596	25 %	50 %	25 %	0 %	532433740
85	NC_022123	TTAT	2	8	45731	45738	25 %	75 %	0 %	0 %	532433740
86	NC_022123	TTTC	2	8	47212	47219	0 %	75 %	0 %	25 %	532433741
87	NC_022123	GCCA	2	8	47579	47586	25 %	0 %	25 %	50 %	532433741
88	NC_022123	TTGA	2	8	47917	47924	25 %	50 %	25 %	0 %	532433741
89	NC_022123	GACC	2	8	47929	47936	25 %	0 %	25 %	50 %	532433741
90	NC_022123	GTTG	2	8	48595	48602	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
91	NC_022123	TCAC	2	8	49017	49024	25 %	25 %	0 %	50 %	532433742
92	NC_022123	GCTG	2	8	49420	49427	0 %	25 %	50 %	25 %	532433742
93	NC_022123	GTCC	2	8	49692	49699	0 %	25 %	25 %	50 %	532433743
94	NC_022123	TGAT	2	8	49784	49791	25 %	50 %	25 %	0 %	532433743
95	NC_022123	CTTG	2	8	50232	50239	0 %	50 %	25 %	25 %	532433743
96	NC_022123	CGTT	2	8	51320	51327	0 %	50 %	25 %	25 %	532433744
97	NC_022123	TTAG	2	8	53479	53486	25 %	50 %	25 %	0 %	532433746
98	NC_022123	AACT	2	8	54029	54036	50 %	25 %	0 %	25 %	532433747
99	NC_022123	GATT	2	8	54095	54102	25 %	50 %	25 %	0 %	532433747
100	NC_022123	ATTT	2	8	54239	54246	25 %	75 %	0 %	0 %	532433747
101	NC_022123	ACCA	2	8	54530	54537	50 %	0 %	0 %	50 %	532433748
102	NC_022123	TCTT	2	8	54803	54810	0 %	75 %	0 %	25 %	532433749
103	NC_022123	GTCA	2	8	55102	55109	25 %	25 %	25 %	25 %	532433749
104	NC_022123	ACGA	2	8	56406	56413	50 %	0 %	25 %	25 %	532433750
105	NC_022123	AGTT	2	8	57424	57431	25 %	50 %	25 %	0 %	532433751
106	NC_022123	ATTG	2	8	57465	57472	25 %	50 %	25 %	0 %	532433751
107	NC_022123	ATAA	2	8	58390	58397	75 %	25 %	0 %	0 %	532433751
108	NC_022123	CAAT	2	8	58611	58618	50 %	25 %	0 %	25 %	532433751
109	NC_022123	TTGG	2	8	60161	60168	0 %	50 %	50 %	0 %	532433752
110	NC_022123	CCCA	2	8	60909	60916	25 %	0 %	0 %	75 %	532433754
111	NC_022123	ATTG	2	8	61031	61038	25 %	50 %	25 %	0 %	532433754
112	NC_022123	GTCC	2	8	61332	61339	0 %	25 %	25 %	50 %	532433754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.