MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 2

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022123	TG	3	6	30	35	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022123	CT	3	6	229	234	0 %	50 %	0 %	50 %	532433693
3	NC_022123	GC	3	6	503	508	0 %	0 %	50 %	50 %	532433693
4	NC_022123	GC	3	6	557	562	0 %	0 %	50 %	50 %	532433693
5	NC_022123	AC	3	6	2519	2524	50 %	0 %	0 %	50 %	532433695
6	NC_022123	GT	3	6	3958	3963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022123	AT	3	6	4715	4720	50 %	50 %	0 %	0 %	532433698
8	NC_022123	AT	3	6	6104	6109	50 %	50 %	0 %	0 %	532433699
9	NC_022123	TA	3	6	6339	6344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022123	GC	3	6	6662	6667	0 %	0 %	50 %	50 %	532433701
11	NC_022123	AC	3	6	8758	8763	50 %	0 %	0 %	50 %	532433702
12	NC_022123	TC	3	6	10963	10968	0 %	50 %	0 %	50 %	532433707
13	NC_022123	TC	4	8	11317	11324	0 %	50 %	0 %	50 %	532433708
14	NC_022123	GT	3	6	11397	11402	0 %	50 %	50 %	0 %	532433708
15	NC_022123	CA	3	6	12752	12757	50 %	0 %	0 %	50 %	532433710
16	NC_022123	AT	3	6	19115	19120	50 %	50 %	0 %	0 %	532433718
17	NC_022123	TG	3	6	20503	20508	0 %	50 %	50 %	0 %	532433718
18	NC_022123	TA	3	6	21423	21428	50 %	50 %	0 %	0 %	532433719
19	NC_022123	CG	3	6	21793	21798	0 %	0 %	50 %	50 %	532433719
20	NC_022123	TG	3	6	24285	24290	0 %	50 %	50 %	0 %	532433721
21	NC_022123	CA	3	6	24625	24630	50 %	0 %	0 %	50 %	532433722
22	NC_022123	GT	3	6	26839	26844	0 %	50 %	50 %	0 %	532433722
23	NC_022123	TA	3	6	27905	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	532433725
24	NC_022123	GA	3	6	27976	27981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022123	CT	3	6	28000	28005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022123	TA	5	10	28122	28131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022123	AT	3	6	28452	28457	50 %	50 %	0 %	0 %	532433726
28	NC_022123	GC	3	6	31210	31215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022123	TC	3	6	31936	31941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022123	GT	3	6	34192	34197	0 %	50 %	50 %	0 %	532433732
31	NC_022123	GC	3	6	34883	34888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022123	CG	3	6	36071	36076	0 %	0 %	50 %	50 %	532433735
33	NC_022123	TG	3	6	36300	36305	0 %	50 %	50 %	0 %	532433735
34	NC_022123	AT	3	6	37126	37131	50 %	50 %	0 %	0 %	532433735
35	NC_022123	GC	3	6	37183	37188	0 %	0 %	50 %	50 %	532433735
36	NC_022123	TA	3	6	37933	37938	50 %	50 %	0 %	0 %	532433736
37	NC_022123	TG	3	6	42849	42854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022123	AT	3	6	43274	43279	50 %	50 %	0 %	0 %	532433739
39	NC_022123	GC	3	6	43917	43922	0 %	0 %	50 %	50 %	532433739
40	NC_022123	GT	3	6	46742	46747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022123	TG	3	6	48146	48151	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
42	NC_022123	TG	3	6	48205	48210	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
43	NC_022123	TG	3	6	48250	48255	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
44	NC_022123	TG	3	6	48268	48273	0 %	50 %	50 %	0 %	532433742
45	NC_022123	AT	3	6	49486	49491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022123	AC	3	6	49507	49512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022123	TG	3	6	49826	49831	0 %	50 %	50 %	0 %	532433743
48	NC_022123	CA	3	6	49951	49956	50 %	0 %	0 %	50 %	532433743
49	NC_022123	TA	3	6	52862	52867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022123	GA	3	6	53146	53151	50 %	0 %	50 %	0 %	532433745
51	NC_022123	AC	3	6	53698	53703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022123	GT	3	6	53871	53876	0 %	50 %	50 %	0 %	532433747
53	NC_022123	TA	3	6	54981	54986	50 %	50 %	0 %	0 %	532433749
54	NC_022123	TC	3	6	55377	55382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022123	AT	3	6	55458	55463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022123	AT	3	6	55486	55491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022123	AG	3	6	55652	55657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022123	AC	3	6	55961	55966	50 %	0 %	0 %	50 %	532433750
59	NC_022123	AT	3	6	57071	57076	50 %	50 %	0 %	0 %	532433751
60	NC_022123	TA	3	6	59424	59429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022123	TA	3	6	59558	59563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022123	CA	3	6	59792	59797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022123	AC	3	6	60339	60344	50 %	0 %	0 %	50 %	532433752
64	NC_022123	GA	3	6	61061	61066	50 %	0 %	50 %	0 %	532433754
65	NC_022123	TA	4	8	61795	61802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022123	AG	3	6	62098	62103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.