MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	TGTGA	2	10	3279	3288	20 %	40 %	40 %	0 %	532431174
2	NC_022121	TTGAA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	532431175
3	NC_022121	GAGAA	2	10	3929	3938	60 %	0 %	40 %	0 %	532431175
4	NC_022121	GAAAA	2	10	4366	4375	80 %	0 %	20 %	0 %	532431175
5	NC_022121	TTACA	2	10	4521	4530	40 %	40 %	0 %	20 %	532431175
6	NC_022121	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532431176
7	NC_022121	TGGTA	2	10	7689	7698	20 %	40 %	40 %	0 %	532431178
8	NC_022121	CGAAA	2	10	9097	9106	60 %	0 %	20 %	20 %	532431179
9	NC_022121	GGCTG	2	10	9731	9740	0 %	20 %	60 %	20 %	532431180
10	NC_022121	CCTCT	2	10	10523	10532	0 %	40 %	0 %	60 %	532431181
11	NC_022121	AAAGG	2	10	10682	10691	60 %	0 %	40 %	0 %	532431181
12	NC_022121	AAGAA	2	10	11802	11811	80 %	0 %	20 %	0 %	532431182
13	NC_022121	AAAGA	2	10	13200	13209	80 %	0 %	20 %	0 %	532431183
14	NC_022121	GGTGT	2	10	13304	13313	0 %	40 %	60 %	0 %	532431183
15	NC_022121	GATTT	2	10	15046	15055	20 %	60 %	20 %	0 %	532431185
16	NC_022121	CGTTC	2	10	16157	16166	0 %	40 %	20 %	40 %	532431186
17	NC_022121	GCTTC	2	10	16530	16539	0 %	40 %	20 %	40 %	532431186
18	NC_022121	GAAGG	2	10	16901	16910	40 %	0 %	60 %	0 %	532431186
19	NC_022121	GTTGT	2	10	20327	20336	0 %	60 %	40 %	0 %	532431189
20	NC_022121	AAGAT	2	10	21439	21448	60 %	20 %	20 %	0 %	532431190
21	NC_022121	TTTGC	2	10	22050	22059	0 %	60 %	20 %	20 %	532431190
22	NC_022121	GGAAA	2	10	23804	23813	60 %	0 %	40 %	0 %	532431190
23	NC_022121	AGAGG	2	10	25529	25538	40 %	0 %	60 %	0 %	532431191
24	NC_022121	GGAGA	2	10	27308	27317	40 %	0 %	60 %	0 %	532431192
25	NC_022121	ATCCG	2	10	28059	28068	20 %	20 %	20 %	40 %	532431194
26	NC_022121	AGGGT	2	10	28577	28586	20 %	20 %	60 %	0 %	532431194
27	NC_022121	CCTAT	2	10	29617	29626	20 %	40 %	0 %	40 %	532431195
28	NC_022121	GAAGG	2	10	30416	30425	40 %	0 %	60 %	0 %	532431196
29	NC_022121	GAGCT	2	10	31456	31465	20 %	20 %	40 %	20 %	532431197
30	NC_022121	CTATT	2	10	36130	36139	20 %	60 %	0 %	20 %	532431203
31	NC_022121	TCCTA	2	10	36177	36186	20 %	40 %	0 %	40 %	532431203
32	NC_022121	ACGAT	2	10	38092	38101	40 %	20 %	20 %	20 %	532431204
33	NC_022121	TTTGA	2	10	38457	38466	20 %	60 %	20 %	0 %	532431204
34	NC_022121	AGCAA	2	10	42108	42117	60 %	0 %	20 %	20 %	532431207
35	NC_022121	CGATG	2	10	42165	42174	20 %	20 %	40 %	20 %	532431207
36	NC_022121	TGCAA	2	10	42323	42332	40 %	20 %	20 %	20 %	532432011
37	NC_022121	CAAAA	2	10	42642	42651	80 %	0 %	0 %	20 %	532432011
38	NC_022121	TTTAT	2	10	44237	44246	20 %	80 %	0 %	0 %	532431211
39	NC_022121	CTTTC	2	10	46333	46342	0 %	60 %	0 %	40 %	532431213
40	NC_022121	AGTTT	2	10	46872	46881	20 %	60 %	20 %	0 %	532431213
41	NC_022121	CTTTT	2	10	50058	50067	0 %	80 %	0 %	20 %	532431216
42	NC_022121	CCGTA	2	10	53833	53842	20 %	20 %	20 %	40 %	532431219
43	NC_022121	TCAGA	2	10	54725	54734	40 %	20 %	20 %	20 %	532431220
44	NC_022121	TTATC	2	10	55252	55261	20 %	60 %	0 %	20 %	532431220
45	NC_022121	TGAGT	2	10	55273	55282	20 %	40 %	40 %	0 %	532431220
46	NC_022121	GTTGT	2	10	56320	56329	0 %	60 %	40 %	0 %	532432012
47	NC_022121	ATTTT	2	10	58493	58502	20 %	80 %	0 %	0 %	532432013
48	NC_022121	GAGCA	2	10	59836	59845	40 %	0 %	40 %	20 %	532431221
49	NC_022121	TGTGA	2	10	62285	62294	20 %	40 %	40 %	0 %	532431223
50	NC_022121	CCTTC	2	10	64086	64095	0 %	40 %	0 %	60 %	532431224
51	NC_022121	AGGAG	2	10	66314	66323	40 %	0 %	60 %	0 %	532431226
52	NC_022121	GTTAA	2	10	66444	66453	40 %	40 %	20 %	0 %	532431226
53	NC_022121	CAAGC	2	10	68822	68831	40 %	0 %	20 %	40 %	532431228
54	NC_022121	GCGAT	2	10	69882	69891	20 %	20 %	40 %	20 %	532431229
55	NC_022121	CTCTT	2	10	70236	70245	0 %	60 %	0 %	40 %	532431229
56	NC_022121	AGGGG	2	10	70882	70891	20 %	0 %	80 %	0 %	532431229
57	NC_022121	AAGAA	2	10	70924	70933	80 %	0 %	20 %	0 %	532431229
58	NC_022121	ATTGG	2	10	72214	72223	20 %	40 %	40 %	0 %	532431231
59	NC_022121	GAAAA	2	10	73286	73295	80 %	0 %	20 %	0 %	532431231
60	NC_022121	TGGGA	2	10	73703	73712	20 %	20 %	60 %	0 %	532431232
61	NC_022121	TATTT	2	10	76230	76239	20 %	80 %	0 %	0 %	532431233
62	NC_022121	TGTCT	2	10	80023	80032	0 %	60 %	20 %	20 %	532431236
63	NC_022121	TTACT	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	532431236
64	NC_022121	AGAAA	2	10	81920	81929	80 %	0 %	20 %	0 %	532431238
65	NC_022121	GGAAG	2	10	82433	82442	40 %	0 %	60 %	0 %	532431238
66	NC_022121	GATCC	2	10	85984	85993	20 %	20 %	20 %	40 %	532431241
67	NC_022121	AGAGC	2	10	87319	87328	40 %	0 %	40 %	20 %	532432016
68	NC_022121	TTTTC	2	10	91051	91060	0 %	80 %	0 %	20 %	532431244
69	NC_022121	GGATG	2	10	91311	91320	20 %	20 %	60 %	0 %	532431245
70	NC_022121	CAACA	2	10	92850	92859	60 %	0 %	0 %	40 %	532431246
71	NC_022121	ACAGC	2	10	93895	93904	40 %	0 %	20 %	40 %	532431248
72	NC_022121	GGAAC	2	10	94607	94616	40 %	0 %	40 %	20 %	532431249
73	NC_022121	GGATT	2	10	95507	95516	20 %	40 %	40 %	0 %	532431249
74	NC_022121	CAATC	2	10	96609	96618	40 %	20 %	0 %	40 %	532431251
75	NC_022121	TTTGC	2	10	96743	96752	0 %	60 %	20 %	20 %	532431251
76	NC_022121	ATTCA	2	10	97007	97016	40 %	40 %	0 %	20 %	532431251
77	NC_022121	GATCC	2	10	97266	97275	20 %	20 %	20 %	40 %	532431251
78	NC_022121	GTTTT	2	10	97687	97696	0 %	80 %	20 %	0 %	532431251
79	NC_022121	AAGCT	2	10	98890	98899	40 %	20 %	20 %	20 %	532431252
80	NC_022121	AGGGG	2	10	99249	99258	20 %	0 %	80 %	0 %	532431252
81	NC_022121	ATAGC	2	10	99948	99957	40 %	20 %	20 %	20 %	532431253
82	NC_022121	AGCGA	2	10	102876	102885	40 %	0 %	40 %	20 %	532431256
83	NC_022121	TTTCT	2	10	103234	103243	0 %	80 %	0 %	20 %	532431256
84	NC_022121	CTTCT	2	10	103288	103297	0 %	60 %	0 %	40 %	532431256
85	NC_022121	ATCAT	2	10	104440	104449	40 %	40 %	0 %	20 %	532431257
86	NC_022121	GGCAT	2	10	105148	105157	20 %	20 %	40 %	20 %	532431257
87	NC_022121	AAAGC	2	10	108874	108883	60 %	0 %	20 %	20 %	532431260
88	NC_022121	GCATT	2	10	110034	110043	20 %	40 %	20 %	20 %	532431261
89	NC_022121	TGTTT	2	10	114711	114720	0 %	80 %	20 %	0 %	532431263
90	NC_022121	CATGT	2	10	115089	115098	20 %	40 %	20 %	20 %	532431263
91	NC_022121	TATCG	2	10	115793	115802	20 %	40 %	20 %	20 %	532431263
92	NC_022121	TTTCT	2	10	116309	116318	0 %	80 %	0 %	20 %	532431264
93	NC_022121	ATGCT	2	10	118232	118241	20 %	40 %	20 %	20 %	532431266
94	NC_022121	AAAGA	2	10	118553	118562	80 %	0 %	20 %	0 %	532431266
95	NC_022121	GCTTC	2	10	122543	122552	0 %	40 %	20 %	40 %	532431269
96	NC_022121	TACAA	2	10	126332	126341	60 %	20 %	0 %	20 %	532431272
97	NC_022121	ATCCA	2	10	128737	128746	40 %	20 %	0 %	40 %	532431275
98	NC_022121	GAAGA	2	10	130287	130296	60 %	0 %	40 %	0 %	532431275
99	NC_022121	AAAAG	2	10	132200	132209	80 %	0 %	20 %	0 %	532431276
100	NC_022121	GATTC	2	10	132531	132540	20 %	40 %	20 %	20 %	532431276
101	NC_022121	GGATA	2	10	135151	135160	40 %	20 %	40 %	0 %	532431278
102	NC_022121	ATTGG	2	10	135816	135825	20 %	40 %	40 %	0 %	532431279
103	NC_022121	ATTGT	2	10	135849	135858	20 %	60 %	20 %	0 %	532431279
104	NC_022121	TGTTT	2	10	136275	136284	0 %	80 %	20 %	0 %	532431280
105	NC_022121	TCCAG	2	10	140020	140029	20 %	20 %	20 %	40 %	532431285
106	NC_022121	GTACA	2	10	140751	140760	40 %	20 %	20 %	20 %	532431286
107	NC_022121	TAGAT	2	10	141124	141133	40 %	40 %	20 %	0 %	532431286
108	NC_022121	AAAAG	2	10	141536	141545	80 %	0 %	20 %	0 %	532432024
109	NC_022121	AAAAC	2	10	142016	142025	80 %	0 %	0 %	20 %	532431287
110	NC_022121	TGCTA	2	10	143102	143111	20 %	40 %	20 %	20 %	532431289
111	NC_022121	GGAGC	2	10	143149	143158	20 %	0 %	60 %	20 %	532431289
112	NC_022121	CTGGG	2	10	144563	144572	0 %	20 %	60 %	20 %	532431291
113	NC_022121	GTTTT	2	10	145310	145319	0 %	80 %	20 %	0 %	532431292
114	NC_022121	GAACC	2	10	149044	149053	40 %	0 %	20 %	40 %	532431293
115	NC_022121	ATTCT	2	10	152540	152549	20 %	60 %	0 %	20 %	532431297
116	NC_022121	CTGTG	2	10	152744	152753	0 %	40 %	40 %	20 %	532431297
117	NC_022121	TTCTT	2	10	155217	155226	0 %	80 %	0 %	20 %	532431300
118	NC_022121	AGGAA	2	10	159774	159783	60 %	0 %	40 %	0 %	532431304
119	NC_022121	AGAGA	2	10	163005	163014	60 %	0 %	40 %	0 %	532431307
120	NC_022121	AGCAA	2	10	163440	163449	60 %	0 %	20 %	20 %	532431307
121	NC_022121	CAAAA	2	10	166943	166952	80 %	0 %	0 %	20 %	532431309
122	NC_022121	AAGAG	2	10	167776	167785	60 %	0 %	40 %	0 %	532431309
123	NC_022121	GTTTT	2	10	174600	174609	0 %	80 %	20 %	0 %	532431313
124	NC_022121	TATTG	2	10	174623	174632	20 %	60 %	20 %	0 %	532431313
125	NC_022121	CAGCA	2	10	174982	174991	40 %	0 %	20 %	40 %	532431313
126	NC_022121	TAGGA	2	10	175289	175298	40 %	20 %	40 %	0 %	532431314
127	NC_022121	TGATT	2	10	177216	177225	20 %	60 %	20 %	0 %	532431315
128	NC_022121	TCAAT	2	10	177857	177866	40 %	40 %	0 %	20 %	532431315
129	NC_022121	TTTTC	2	10	177896	177905	0 %	80 %	0 %	20 %	532431315
130	NC_022121	GGAAT	2	10	179451	179460	40 %	20 %	40 %	0 %	532432026
131	NC_022121	AGAGT	2	10	180839	180848	40 %	20 %	40 %	0 %	532431316
132	NC_022121	TTGAA	2	10	181372	181381	40 %	40 %	20 %	0 %	532431317
133	NC_022121	TTGAG	2	10	182932	182941	20 %	40 %	40 %	0 %	532432027
134	NC_022121	GAATG	2	10	182957	182966	40 %	20 %	40 %	0 %	532432027
135	NC_022121	AGAGA	2	10	185000	185009	60 %	0 %	40 %	0 %	532431319
136	NC_022121	ACGAT	2	10	187061	187070	40 %	20 %	20 %	20 %	532431321
137	NC_022121	GGATC	2	10	190166	190175	20 %	20 %	40 %	20 %	532432031
138	NC_022121	CAGAT	2	10	190281	190290	40 %	20 %	20 %	20 %	532432031
139	NC_022121	ACGAT	2	10	191200	191209	40 %	20 %	20 %	20 %	532432032
140	NC_022121	TTGTA	2	10	192177	192186	20 %	60 %	20 %	0 %	532432033
141	NC_022121	TATGC	2	10	192582	192591	20 %	40 %	20 %	20 %	532432034
142	NC_022121	AAGAA	2	10	192748	192757	80 %	0 %	20 %	0 %	532432034
143	NC_022121	AAAAG	2	10	192877	192886	80 %	0 %	20 %	0 %	532431322
144	NC_022121	TATCA	2	10	192950	192959	40 %	40 %	0 %	20 %	532431322
145	NC_022121	GATCT	2	10	193096	193105	20 %	40 %	20 %	20 %	532431322
146	NC_022121	GATTA	2	10	194349	194358	40 %	40 %	20 %	0 %	532431323
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148	NC_022121	CTCTA	2	10	201420	201429	20 %	40 %	0 %	40 %	532431329
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150	NC_022121	CTTTA	2	10	204699	204708	20 %	60 %	0 %	20 %	532431333
151	NC_022121	AAACC	2	10	205524	205533	60 %	0 %	0 %	40 %	532431334
152	NC_022121	GGGAA	2	10	206037	206046	40 %	0 %	60 %	0 %	532431334
153	NC_022121	CTCTG	2	10	207451	207460	0 %	40 %	20 %	40 %	532431336
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157	NC_022121	CTTGT	2	10	215014	215023	0 %	60 %	20 %	20 %	532431341
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247	NC_022121	ATCAC	2	10	374686	374695	40 %	20 %	0 %	40 %	532431482
248	NC_022121	CCCTC	2	10	376508	376517	0 %	20 %	0 %	80 %	532431484
249	NC_022121	TACAC	2	10	376707	376716	40 %	20 %	0 %	40 %	532431484
250	NC_022121	CCAAT	2	10	380337	380346	40 %	20 %	0 %	40 %	532431484
251	NC_022121	ACAGC	2	10	382626	382635	40 %	0 %	20 %	40 %	532431485
252	NC_022121	AAATC	2	10	383070	383079	60 %	20 %	0 %	20 %	532431485
253	NC_022121	TATTC	2	10	387462	387471	20 %	60 %	0 %	20 %	532431490
254	NC_022121	ATTTT	2	10	387601	387610	20 %	80 %	0 %	0 %	532431490
255	NC_022121	GTCTT	2	10	392978	392987	0 %	60 %	20 %	20 %	532431495
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263	NC_022121	AAAGT	2	10	401232	401241	60 %	20 %	20 %	0 %	532431501
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388	NC_022121	AAACC	2	10	602598	602607	60 %	0 %	0 %	40 %	532431677
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391	NC_022121	ACTTC	2	10	607537	607546	20 %	40 %	0 %	40 %	532431684
392	NC_022121	ATTTT	2	10	608620	608629	20 %	80 %	0 %	0 %	532431685
393	NC_022121	TGCCA	2	10	611976	611985	20 %	20 %	20 %	40 %	532431687
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499	NC_022121	CGATG	2	10	776593	776602	20 %	20 %	40 %	20 %	532431819
500	NC_022121	CCATT	2	10	777221	777230	20 %	40 %	0 %	40 %	532431820

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