MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	AGTA	2	8	1487	1494	50 %	25 %	25 %	0 %	532431172
2	NC_022121	ATGA	2	8	1891	1898	50 %	25 %	25 %	0 %	532431173
3	NC_022121	GATA	2	8	1929	1936	50 %	25 %	25 %	0 %	532431173
4	NC_022121	TTTC	2	8	2226	2233	0 %	75 %	0 %	25 %	532431174
5	NC_022121	CATG	2	8	3107	3114	25 %	25 %	25 %	25 %	532431174
6	NC_022121	TTCC	2	8	3412	3419	0 %	50 %	0 %	50 %	532431174
7	NC_022121	TTTA	2	8	3810	3817	25 %	75 %	0 %	0 %	532431175
8	NC_022121	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	532431175
9	NC_022121	GACG	2	8	4857	4864	25 %	0 %	50 %	25 %	532431175
10	NC_022121	TTGG	2	8	4960	4967	0 %	50 %	50 %	0 %	532431175
11	NC_022121	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532431176
12	NC_022121	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532431176
13	NC_022121	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532431176
14	NC_022121	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532431177
15	NC_022121	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532431177
16	NC_022121	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532432010
17	NC_022121	TTTG	2	8	7186	7193	0 %	75 %	25 %	0 %	532432010
18	NC_022121	AAGC	2	8	7819	7826	50 %	0 %	25 %	25 %	532431178
19	NC_022121	ATTG	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	532431179
20	NC_022121	AGCG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	532431179
21	NC_022121	AAAG	2	8	8705	8712	75 %	0 %	25 %	0 %	532431179
22	NC_022121	CTTT	2	8	9045	9052	0 %	75 %	0 %	25 %	532431179
23	NC_022121	TTCG	2	8	9417	9424	0 %	50 %	25 %	25 %	532431180
24	NC_022121	AATT	2	8	9522	9529	50 %	50 %	0 %	0 %	532431180
25	NC_022121	ATGG	2	8	9581	9588	25 %	25 %	50 %	0 %	532431180
26	NC_022121	CTTT	2	8	10206	10213	0 %	75 %	0 %	25 %	532431181
27	NC_022121	GCAA	2	8	10423	10430	50 %	0 %	25 %	25 %	532431181
28	NC_022121	AGCC	2	8	10653	10660	25 %	0 %	25 %	50 %	532431181
29	NC_022121	GAAA	2	8	10796	10803	75 %	0 %	25 %	0 %	532431181
30	NC_022121	AATG	2	8	11539	11546	50 %	25 %	25 %	0 %	532431182
31	NC_022121	GTTT	2	8	12571	12578	0 %	75 %	25 %	0 %	532431183
32	NC_022121	ATGC	2	8	13001	13008	25 %	25 %	25 %	25 %	532431183
33	NC_022121	TTGT	2	8	14036	14043	0 %	75 %	25 %	0 %	532431184
34	NC_022121	TTCT	2	8	14207	14214	0 %	75 %	0 %	25 %	532431184
35	NC_022121	ATTT	2	8	14413	14420	25 %	75 %	0 %	0 %	532431184
36	NC_022121	TTTC	2	8	15075	15082	0 %	75 %	0 %	25 %	532431185
37	NC_022121	AAAT	2	8	15557	15564	75 %	25 %	0 %	0 %	532431185
38	NC_022121	GTAA	2	8	16399	16406	50 %	25 %	25 %	0 %	532431186
39	NC_022121	CTAA	2	8	16592	16599	50 %	25 %	0 %	25 %	532431186
40	NC_022121	AGAA	2	8	16855	16862	75 %	0 %	25 %	0 %	532431186
41	NC_022121	ATTT	2	8	17001	17008	25 %	75 %	0 %	0 %	532431186
42	NC_022121	TGCG	2	8	18523	18530	0 %	25 %	50 %	25 %	532431188
43	NC_022121	GAAG	2	8	19507	19514	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
44	NC_022121	TTTG	2	8	19533	19540	0 %	75 %	25 %	0 %	532431188
45	NC_022121	TGTA	2	8	20225	20232	25 %	50 %	25 %	0 %	532431189
46	NC_022121	GATG	2	8	21641	21648	25 %	25 %	50 %	0 %	532431190
47	NC_022121	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	532431190
48	NC_022121	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	532431190
49	NC_022121	GGTT	2	8	23091	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	532431190
50	NC_022121	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	532431190
51	NC_022121	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	532431190
52	NC_022121	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	532431190
53	NC_022121	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	532431190
54	NC_022121	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
55	NC_022121	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
56	NC_022121	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	532431191
57	NC_022121	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	532431191
58	NC_022121	GCTT	2	8	26285	26292	0 %	50 %	25 %	25 %	532431191
59	NC_022121	GGAA	2	8	26868	26875	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
60	NC_022121	TTAA	2	8	26941	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
61	NC_022121	AAAG	2	8	26991	26998	75 %	0 %	25 %	0 %	532431192
62	NC_022121	GGGC	2	8	27271	27278	0 %	0 %	75 %	25 %	532431192
63	NC_022121	GTTT	2	8	27554	27561	0 %	75 %	25 %	0 %	532431193
64	NC_022121	CAGA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	25 %	25 %	532431193
65	NC_022121	CTTT	2	8	29548	29555	0 %	75 %	0 %	25 %	532431195
66	NC_022121	TTTG	2	8	29563	29570	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
67	NC_022121	TTGT	2	8	29598	29605	0 %	75 %	25 %	0 %	532431195
68	NC_022121	TGGC	2	8	29761	29768	0 %	25 %	50 %	25 %	532431195
69	NC_022121	AAAG	2	8	30321	30328	75 %	0 %	25 %	0 %	532431196
70	NC_022121	AAAC	2	8	30391	30398	75 %	0 %	0 %	25 %	532431196
71	NC_022121	GATG	2	8	30534	30541	25 %	25 %	50 %	0 %	532431196
72	NC_022121	GATA	2	8	31643	31650	50 %	25 %	25 %	0 %	532431198
73	NC_022121	TGAT	2	8	34138	34145	25 %	50 %	25 %	0 %	532431201
74	NC_022121	AAGA	3	12	34266	34277	75 %	0 %	25 %	0 %	532431201
75	NC_022121	AAGC	2	8	34486	34493	50 %	0 %	25 %	25 %	532431202
76	NC_022121	GTTC	2	8	34519	34526	0 %	50 %	25 %	25 %	532431202
77	NC_022121	GGCA	2	8	34898	34905	25 %	0 %	50 %	25 %	532431203
78	NC_022121	TCGA	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	532431203
79	NC_022121	TGCT	2	8	35308	35315	0 %	50 %	25 %	25 %	532431203
80	NC_022121	TATG	2	8	35451	35458	25 %	50 %	25 %	0 %	532431203
81	NC_022121	TTGG	2	8	35540	35547	0 %	50 %	50 %	0 %	532431203
82	NC_022121	AGAT	2	8	36260	36267	50 %	25 %	25 %	0 %	532431203
83	NC_022121	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	532431204
84	NC_022121	ATGA	2	8	37122	37129	50 %	25 %	25 %	0 %	532431204
85	NC_022121	TAGG	2	8	37281	37288	25 %	25 %	50 %	0 %	532431204
86	NC_022121	CAAT	2	8	37465	37472	50 %	25 %	0 %	25 %	532431204
87	NC_022121	AATG	2	8	38252	38259	50 %	25 %	25 %	0 %	532431204
88	NC_022121	AGAA	2	8	39089	39096	75 %	0 %	25 %	0 %	532431205
89	NC_022121	AAGA	2	8	39141	39148	75 %	0 %	25 %	0 %	532431205
90	NC_022121	ATCC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	532431205
91	NC_022121	TAAT	2	8	39360	39367	50 %	50 %	0 %	0 %	532431205
92	NC_022121	GTGC	2	8	41449	41456	0 %	25 %	50 %	25 %	532431207
93	NC_022121	AGAA	2	8	41868	41875	75 %	0 %	25 %	0 %	532431207
94	NC_022121	GGAT	2	8	42020	42027	25 %	25 %	50 %	0 %	532431207
95	NC_022121	AAAC	2	8	43228	43235	75 %	0 %	0 %	25 %	532431209
96	NC_022121	CAAT	2	8	43432	43439	50 %	25 %	0 %	25 %	532431209
97	NC_022121	ATTT	2	8	44188	44195	25 %	75 %	0 %	0 %	532431211
98	NC_022121	GGAA	2	8	44215	44222	50 %	0 %	50 %	0 %	532431211
99	NC_022121	GCTC	2	8	44496	44503	0 %	25 %	25 %	50 %	532431211
100	NC_022121	TTCT	2	8	44638	44645	0 %	75 %	0 %	25 %	532431211
101	NC_022121	TTGA	2	8	45238	45245	25 %	50 %	25 %	0 %	532431212
102	NC_022121	TGTT	2	8	45410	45417	0 %	75 %	25 %	0 %	532431212
103	NC_022121	CTAT	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	532431212
104	NC_022121	TGTT	2	8	45469	45476	0 %	75 %	25 %	0 %	532431212
105	NC_022121	CTAT	2	8	45765	45772	25 %	50 %	0 %	25 %	532431212
106	NC_022121	AAGA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
107	NC_022121	AAGA	2	8	46317	46324	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
108	NC_022121	AAAG	2	8	46357	46364	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
109	NC_022121	AAGA	2	8	46472	46479	75 %	0 %	25 %	0 %	532431213
110	NC_022121	ACTT	2	8	46733	46740	25 %	50 %	0 %	25 %	532431213
111	NC_022121	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	532431213
112	NC_022121	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
113	NC_022121	GAAC	2	8	47936	47943	50 %	0 %	25 %	25 %	532431213
114	NC_022121	AACA	2	8	48181	48188	75 %	0 %	0 %	25 %	532431214
115	NC_022121	CTTT	2	8	48377	48384	0 %	75 %	0 %	25 %	532431214
116	NC_022121	CTTT	2	8	49262	49269	0 %	75 %	0 %	25 %	532431215
117	NC_022121	GTAG	2	8	49280	49287	25 %	25 %	50 %	0 %	532431215
118	NC_022121	ATCA	2	8	49507	49514	50 %	25 %	0 %	25 %	532431215
119	NC_022121	GAAG	2	8	50731	50738	50 %	0 %	50 %	0 %	532431216
120	NC_022121	TTCA	2	8	51153	51160	25 %	50 %	0 %	25 %	532431216
121	NC_022121	GGAA	2	8	52428	52435	50 %	0 %	50 %	0 %	532431218
122	NC_022121	TTAA	2	8	53169	53176	50 %	50 %	0 %	0 %	532431218
123	NC_022121	CCTT	2	8	53376	53383	0 %	50 %	0 %	50 %	532431219
124	NC_022121	TTTA	2	8	53543	53550	25 %	75 %	0 %	0 %	532431219
125	NC_022121	AAAG	2	8	53767	53774	75 %	0 %	25 %	0 %	532431219
126	NC_022121	GATT	2	8	53904	53911	25 %	50 %	25 %	0 %	532431219
127	NC_022121	AATC	2	8	53959	53966	50 %	25 %	0 %	25 %	532431219
128	NC_022121	GGAT	2	8	54280	54287	25 %	25 %	50 %	0 %	532431220
129	NC_022121	TCGA	2	8	54442	54449	25 %	25 %	25 %	25 %	532431220
130	NC_022121	CTTC	2	8	54527	54534	0 %	50 %	0 %	50 %	532431220
131	NC_022121	GAAT	2	8	54562	54569	50 %	25 %	25 %	0 %	532431220
132	NC_022121	TTGA	2	8	54632	54639	25 %	50 %	25 %	0 %	532431220
133	NC_022121	GGAA	2	8	54991	54998	50 %	0 %	50 %	0 %	532431220
134	NC_022121	CTGG	3	12	55890	55901	0 %	25 %	50 %	25 %	532432012
135	NC_022121	TTGC	2	8	56027	56034	0 %	50 %	25 %	25 %	532432012
136	NC_022121	AGCG	2	8	56067	56074	25 %	0 %	50 %	25 %	532432012
137	NC_022121	AGCT	2	8	56526	56533	25 %	25 %	25 %	25 %	532432012
138	NC_022121	TTTG	2	8	56838	56845	0 %	75 %	25 %	0 %	532432012
139	NC_022121	GGTT	2	8	57298	57305	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
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141	NC_022121	AGGT	2	8	58199	58206	25 %	25 %	50 %	0 %	532432013
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