MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 12905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	ATG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431172
2	NC_022121	GTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431172
3	NC_022121	TCC	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431172
4	NC_022121	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431172
5	NC_022121	AGC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431172
6	NC_022121	AAG	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431172
7	NC_022121	TAC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431172
8	NC_022121	GCT	2	6	1449	1454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431172
9	NC_022121	AAC	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431172
10	NC_022121	AGA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431172
11	NC_022121	AGA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431173
12	NC_022121	ATC	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431173
13	NC_022121	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431173
14	NC_022121	CAT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431173
15	NC_022121	AGA	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431173
16	NC_022121	AAG	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431173
17	NC_022121	GGA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431173
18	NC_022121	ATC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431174
19	NC_022121	ATA	2	6	2338	2343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431174
20	NC_022121	AAC	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431174
21	NC_022121	GGT	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431174
22	NC_022121	AAT	2	6	2523	2528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431174
23	NC_022121	TTC	2	6	2558	2563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431174
24	NC_022121	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431174
25	NC_022121	GGA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431174
26	NC_022121	CAG	2	6	2644	2649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431174
27	NC_022121	GTT	2	6	2661	2666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431174
28	NC_022121	GGT	2	6	2753	2758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431174
29	NC_022121	AAG	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431174
30	NC_022121	ATT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431174
31	NC_022121	TTG	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431174
32	NC_022121	AAG	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431174
33	NC_022121	AAG	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431174
34	NC_022121	CAG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431174
35	NC_022121	GCT	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431174
36	NC_022121	AAG	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431174
37	NC_022121	CAG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431174
38	NC_022121	GGA	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431174
39	NC_022121	AAT	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431174
40	NC_022121	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431175
41	NC_022121	TGA	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431175
42	NC_022121	GTA	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431175
43	NC_022121	AGA	2	6	3966	3971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431175
44	NC_022121	GAA	2	6	4150	4155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431175
45	NC_022121	CGT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431175
46	NC_022121	GTT	2	6	4333	4338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431175
47	NC_022121	TGA	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431175
48	NC_022121	TTG	2	6	4565	4570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431175
49	NC_022121	TTC	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431175
50	NC_022121	TCT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431175
51	NC_022121	AGA	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431175
52	NC_022121	GTT	2	6	4845	4850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431175
53	NC_022121	GGT	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431175
54	NC_022121	CTC	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431175
55	NC_022121	AGC	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431175
56	NC_022121	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431176
57	NC_022121	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431176
58	NC_022121	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431176
59	NC_022121	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431176
60	NC_022121	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431176
61	NC_022121	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431176
62	NC_022121	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431176
63	NC_022121	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431176
64	NC_022121	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431176
65	NC_022121	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431176
66	NC_022121	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431176
67	NC_022121	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431176
68	NC_022121	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431176
69	NC_022121	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431176
70	NC_022121	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431176
71	NC_022121	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431176
72	NC_022121	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431176
73	NC_022121	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431177
74	NC_022121	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431177
75	NC_022121	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431177
76	NC_022121	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431177
77	NC_022121	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431177
78	NC_022121	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532432010
79	NC_022121	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532432010
80	NC_022121	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431178
81	NC_022121	TCC	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431178
82	NC_022121	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431178
83	NC_022121	TTA	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431178
84	NC_022121	TTC	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431178
85	NC_022121	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431179
86	NC_022121	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431179
87	NC_022121	CTT	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431179
88	NC_022121	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431179
89	NC_022121	ATA	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431179
90	NC_022121	AGG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431179
91	NC_022121	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431179
92	NC_022121	CAG	2	6	8799	8804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431179
93	NC_022121	TGT	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431179
94	NC_022121	GAG	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431179
95	NC_022121	TAC	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431179
96	NC_022121	GTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431179
97	NC_022121	AAG	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431179
98	NC_022121	GAG	2	6	9107	9112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431179
99	NC_022121	TTA	2	6	9395	9400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431180
100	NC_022121	AGA	2	6	9430	9435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431180
101	NC_022121	TGC	2	6	9660	9665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431180
102	NC_022121	GAA	2	6	9687	9692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431180
103	NC_022121	TCG	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431180
104	NC_022121	TGG	2	6	9770	9775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431180
105	NC_022121	GTA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431181
106	NC_022121	AGC	2	6	9981	9986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431181
107	NC_022121	CTT	2	6	9995	10000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431181
108	NC_022121	ATG	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431181
109	NC_022121	CGT	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431181
110	NC_022121	GAC	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431181
111	NC_022121	GGT	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532431181
112	NC_022121	GAA	2	6	10486	10491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431181
113	NC_022121	CAA	2	6	10508	10513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431181
114	NC_022121	GGA	2	6	10570	10575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431181
115	NC_022121	CGA	2	6	10627	10632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431181
116	NC_022121	CTT	2	6	10733	10738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431181
117	NC_022121	TTG	2	6	10773	10778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431181
118	NC_022121	CTT	2	6	10787	10792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431181
119	NC_022121	ATC	2	6	10897	10902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431181
120	NC_022121	TGT	2	6	10903	10908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431181
121	NC_022121	AGA	2	6	11009	11014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431181
122	NC_022121	AGG	2	6	11048	11053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431181
123	NC_022121	GAT	2	6	11108	11113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431181
124	NC_022121	CGA	2	6	11114	11119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431181
125	NC_022121	AAT	2	6	11327	11332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431182
126	NC_022121	AGG	2	6	11570	11575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431182
127	NC_022121	ATA	3	9	11580	11588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431182
128	NC_022121	TAT	2	6	11599	11604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431182
129	NC_022121	ACA	2	6	11610	11615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431182
130	NC_022121	TAC	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431182
131	NC_022121	TCA	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431182
132	NC_022121	TTC	2	6	11948	11953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431182
133	NC_022121	TTA	2	6	11964	11969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431182
134	NC_022121	AGA	2	6	12005	12010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431182
135	NC_022121	CAA	2	6	12307	12312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431182
136	NC_022121	ATC	2	6	12330	12335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431182
137	NC_022121	ATA	2	6	12471	12476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431182
138	NC_022121	ATA	2	6	12563	12568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431183
139	NC_022121	TAC	2	6	12691	12696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431183
140	NC_022121	TGC	2	6	12733	12738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431183
141	NC_022121	GAA	2	6	12792	12797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431183
142	NC_022121	CAT	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431183
143	NC_022121	GAG	2	6	12857	12862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431183
144	NC_022121	TTC	2	6	12886	12891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431183
145	NC_022121	TGA	2	6	13041	13046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431183
146	NC_022121	ATA	2	6	13106	13111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431183
147	NC_022121	CAA	2	6	13210	13215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532431183
148	NC_022121	AAT	2	6	13263	13268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431183
149	NC_022121	ACC	2	6	13274	13279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532431183
150	NC_022121	GTT	2	6	13644	13649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431184
151	NC_022121	ATG	2	6	13696	13701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431184
152	NC_022121	TGT	2	6	13794	13799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431184
153	NC_022121	TCT	2	6	13916	13921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431184
154	NC_022121	CTT	2	6	14117	14122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431184
155	NC_022121	TGT	2	6	14169	14174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431184
156	NC_022121	CAG	2	6	14321	14326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532431184
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158	NC_022121	CTT	2	6	14485	14490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431184
159	NC_022121	AAG	2	6	14665	14670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431184
160	NC_022121	GTT	2	6	14764	14769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431184
161	NC_022121	TTA	2	6	14776	14781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431184
162	NC_022121	ATT	2	6	14851	14856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431184
163	NC_022121	TTA	2	6	14866	14871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431184
164	NC_022121	CTT	2	6	14887	14892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431184
165	NC_022121	TTC	2	6	14983	14988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532431185
166	NC_022121	TGT	2	6	14990	14995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431185
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170	NC_022121	TAT	2	6	15463	15468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431185
171	NC_022121	TCA	2	6	15694	15699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532431185
172	NC_022121	TTA	2	6	15702	15707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532431185
173	NC_022121	GTA	2	6	15711	15716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431185
174	NC_022121	TTG	2	6	15798	15803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532431185
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212	NC_022121	AAG	2	6	19238	19243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431188
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222	NC_022121	GAG	2	6	19960	19965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532431189
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224	NC_022121	TCC	2	6	20201	20206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532431189
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237	NC_022121	TCG	2	6	22538	22543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431190
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241	NC_022121	TGA	2	6	22910	22915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532431190
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245	NC_022121	TGC	2	6	23117	23122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431190
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249	NC_022121	TGC	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532431190
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251	NC_022121	AGA	2	6	23705	23710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532431190
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381	NC_022121	ATA	2	6	35584	35589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532431203
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