MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022121	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022121	TC	3	6	1668	1673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022121	AG	3	6	2151	2156	50 %	0 %	50 %	0 %	532431174
5	NC_022121	GA	3	6	2819	2824	50 %	0 %	50 %	0 %	532431174
6	NC_022121	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	532431175
7	NC_022121	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532431176
8	NC_022121	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532431176
9	NC_022121	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532431176
10	NC_022121	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532431176
11	NC_022121	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532431176
12	NC_022121	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022121	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532431178
14	NC_022121	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532431179
15	NC_022121	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532431179
16	NC_022121	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	532431179
17	NC_022121	GA	3	6	9864	9869	50 %	0 %	50 %	0 %	532431181
18	NC_022121	AG	3	6	10081	10086	50 %	0 %	50 %	0 %	532431181
19	NC_022121	TA	3	6	11246	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022121	AG	3	6	11307	11312	50 %	0 %	50 %	0 %	532431182
21	NC_022121	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	532431182
22	NC_022121	TG	3	6	12770	12775	0 %	50 %	50 %	0 %	532431183
23	NC_022121	AG	3	6	12919	12924	50 %	0 %	50 %	0 %	532431183
24	NC_022121	AG	4	8	13075	13082	50 %	0 %	50 %	0 %	532431183
25	NC_022121	TA	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022121	TA	4	8	13560	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022121	AC	3	6	14403	14408	50 %	0 %	0 %	50 %	532431184
28	NC_022121	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	532431185
29	NC_022121	TC	3	6	15782	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	532431185
30	NC_022121	GA	3	6	16311	16316	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
31	NC_022121	AG	3	6	16382	16387	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
32	NC_022121	GA	3	6	17166	17171	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
33	NC_022121	AG	3	6	17512	17517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022121	GA	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022121	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	532431187
36	NC_022121	TC	3	6	18219	18224	0 %	50 %	0 %	50 %	532431187
37	NC_022121	CT	3	6	18447	18452	0 %	50 %	0 %	50 %	532431188
38	NC_022121	TC	3	6	18647	18652	0 %	50 %	0 %	50 %	532431188
39	NC_022121	GA	3	6	18662	18667	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
40	NC_022121	GA	3	6	18761	18766	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
41	NC_022121	AG	3	6	19227	19232	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
42	NC_022121	AG	4	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
43	NC_022121	GT	3	6	19776	19781	0 %	50 %	50 %	0 %	532431188
44	NC_022121	AG	3	6	20004	20009	50 %	0 %	50 %	0 %	532431189
45	NC_022121	TG	3	6	20117	20122	0 %	50 %	50 %	0 %	532431189
46	NC_022121	AG	3	6	20513	20518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022121	GA	3	6	20671	20676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022121	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022121	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022121	CT	4	8	21914	21921	0 %	50 %	0 %	50 %	532431190
51	NC_022121	AT	3	6	22184	22189	50 %	50 %	0 %	0 %	532431190
52	NC_022121	AT	3	6	22508	22513	50 %	50 %	0 %	0 %	532431190
53	NC_022121	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
54	NC_022121	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
55	NC_022121	AG	3	6	24300	24305	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
56	NC_022121	GA	3	6	25717	25722	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
57	NC_022121	GT	3	6	25737	25742	0 %	50 %	50 %	0 %	532431191
58	NC_022121	TA	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	532431191
59	NC_022121	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
60	NC_022121	GA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022121	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022121	AT	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
63	NC_022121	GA	3	6	27016	27021	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
64	NC_022121	TC	3	6	27884	27889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022121	AG	3	6	27967	27972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022121	TG	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	532431194
67	NC_022121	TC	3	6	28443	28448	0 %	50 %	0 %	50 %	532431194
68	NC_022121	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	532431194
69	NC_022121	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	532431194
70	NC_022121	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	532431195
71	NC_022121	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
72	NC_022121	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	532431196
73	NC_022121	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
74	NC_022121	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
75	NC_022121	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	532431197
76	NC_022121	TC	3	6	31652	31657	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
77	NC_022121	GC	3	6	32082	32087	0 %	0 %	50 %	50 %	532431198
78	NC_022121	CT	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
79	NC_022121	AG	3	6	32264	32269	50 %	0 %	50 %	0 %	532431198
80	NC_022121	TC	3	6	33761	33766	0 %	50 %	0 %	50 %	532431200
81	NC_022121	AG	3	6	33774	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	532431200
82	NC_022121	AG	3	6	33912	33917	50 %	0 %	50 %	0 %	532431201
83	NC_022121	GA	4	8	34604	34611	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
84	NC_022121	GA	4	8	34628	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
85	NC_022121	GA	3	6	36381	36386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022121	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022121	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
88	NC_022121	CT	3	6	37014	37019	0 %	50 %	0 %	50 %	532431204
89	NC_022121	AG	3	6	37525	37530	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
90	NC_022121	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
91	NC_022121	AG	3	6	38598	38603	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
92	NC_022121	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022121	GA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
94	NC_022121	AG	3	6	39519	39524	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
95	NC_022121	AG	3	6	39619	39624	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
96	NC_022121	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022121	GC	3	6	40575	40580	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
98	NC_022121	AG	3	6	40596	40601	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
99	NC_022121	GC	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
100	NC_022121	GA	3	6	40810	40815	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
101	NC_022121	TC	3	6	40819	40824	0 %	50 %	0 %	50 %	532431206
102	NC_022121	GC	3	6	40884	40889	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
103	NC_022121	GA	3	6	41024	41029	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
104	NC_022121	GT	3	6	41462	41467	0 %	50 %	50 %	0 %	532431207
105	NC_022121	GA	3	6	42000	42005	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
106	NC_022121	GA	4	8	42010	42017	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
107	NC_022121	AG	3	6	42246	42251	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
108	NC_022121	CT	3	6	42312	42317	0 %	50 %	0 %	50 %	532432011
109	NC_022121	GA	5	10	42588	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	532432011
110	NC_022121	AC	3	6	43469	43474	50 %	0 %	0 %	50 %	532431209
111	NC_022121	TC	3	6	43638	43643	0 %	50 %	0 %	50 %	532431209
112	NC_022121	TC	3	6	43803	43808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022121	TA	3	6	43955	43960	50 %	50 %	0 %	0 %	532431210
114	NC_022121	TC	3	6	44867	44872	0 %	50 %	0 %	50 %	532431211
115	NC_022121	GA	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	532431212
116	NC_022121	TG	3	6	45568	45573	0 %	50 %	50 %	0 %	532431212
117	NC_022121	AG	3	6	45579	45584	50 %	0 %	50 %	0 %	532431212
118	NC_022121	AG	4	8	46020	46027	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
119	NC_022121	CT	3	6	46211	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	532431213
120	NC_022121	TG	3	6	46412	46417	0 %	50 %	50 %	0 %	532431213
121	NC_022121	AG	3	6	46465	46470	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
122	NC_022121	AG	3	6	48037	48042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022121	AG	3	6	49389	49394	50 %	0 %	50 %	0 %	532431215
124	NC_022121	CA	3	6	50078	50083	50 %	0 %	0 %	50 %	532431216
125	NC_022121	TG	4	8	51408	51415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022121	TC	3	6	52921	52926	0 %	50 %	0 %	50 %	532431218
127	NC_022121	CA	3	6	52972	52977	50 %	0 %	0 %	50 %	532431218
128	NC_022121	GA	3	6	53393	53398	50 %	0 %	50 %	0 %	532431219
129	NC_022121	CT	3	6	53710	53715	0 %	50 %	0 %	50 %	532431219
130	NC_022121	CT	3	6	54407	54412	0 %	50 %	0 %	50 %	532431220
131	NC_022121	AT	3	6	55597	55602	50 %	50 %	0 %	0 %	532431220
132	NC_022121	GA	3	6	55634	55639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022121	CT	3	6	56532	56537	0 %	50 %	0 %	50 %	532432012
134	NC_022121	GT	3	6	56582	56587	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
135	NC_022121	TG	3	6	57289	57294	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
136	NC_022121	CT	3	6	58170	58175	0 %	50 %	0 %	50 %	532432013
137	NC_022121	GA	3	6	59736	59741	50 %	0 %	50 %	0 %	532431221
138	NC_022121	GT	3	6	59874	59879	0 %	50 %	50 %	0 %	532431221
139	NC_022121	TC	3	6	60622	60627	0 %	50 %	0 %	50 %	532431222
140	NC_022121	GA	3	6	60850	60855	50 %	0 %	50 %	0 %	532432014
141	NC_022121	CA	3	6	61248	61253	50 %	0 %	0 %	50 %	532431223
142	NC_022121	AT	3	6	61498	61503	50 %	50 %	0 %	0 %	532431223
143	NC_022121	GA	3	6	61521	61526	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
144	NC_022121	GA	3	6	61647	61652	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
145	NC_022121	GA	3	6	62462	62467	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
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