MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022121	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022121	TC	3	6	1668	1673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022121	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022121	TA	3	6	11246	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022121	TA	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022121	TA	4	8	13560	13567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022121	AG	3	6	17512	17517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022121	GA	3	6	17525	17530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022121	AG	3	6	20513	20518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022121	GA	3	6	20671	20676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022121	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022121	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022121	GA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022121	CT	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022121	TC	3	6	27884	27889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022121	AG	3	6	27967	27972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022121	GA	3	6	36381	36386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022121	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022121	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022121	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022121	TC	3	6	43803	43808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022121	AG	3	6	48037	48042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022121	TG	4	8	51408	51415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022121	GA	3	6	55634	55639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022121	AG	4	8	64875	64882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022121	TA	3	6	69206	69211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022121	CT	3	6	71942	71947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022121	TA	3	6	85304	85309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022121	TC	3	6	90525	90530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022121	GA	3	6	90657	90662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022121	CT	3	6	93007	93012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022121	GA	3	6	93493	93498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022121	GA	3	6	93535	93540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022121	TA	3	6	94152	94157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022121	TC	3	6	100033	100038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022121	AT	3	6	100084	100089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022121	TA	3	6	106760	106765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022121	TG	3	6	116002	116007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022121	AG	4	8	118587	118594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022121	GA	3	6	120409	120414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022121	TA	3	6	122644	122649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022121	GT	3	6	123633	123638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022121	GA	3	6	123755	123760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022121	AG	3	6	124167	124172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022121	GA	3	6	124537	124542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022121	CT	3	6	128167	128172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022121	TC	3	6	130489	130494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022121	AT	3	6	142547	142552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022121	GA	3	6	151784	151789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022121	AG	3	6	157349	157354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022121	TC	3	6	171813	171818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022121	AG	3	6	171945	171950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022121	CT	3	6	171963	171968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022121	TG	3	6	178454	178459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022121	GA	3	6	184309	184314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022121	AT	3	6	192769	192774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022121	AG	3	6	197235	197240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022121	CT	3	6	203984	203989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022121	GA	4	8	207043	207050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022121	CT	4	8	207091	207098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022121	AG	4	8	218364	218371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022121	TA	3	6	219918	219923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022121	CT	3	6	221559	221564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022121	TC	3	6	224560	224565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022121	AG	3	6	224591	224596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022121	TC	3	6	238791	238796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022121	AG	3	6	238817	238822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022121	CA	3	6	243741	243746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022121	GT	3	6	243958	243963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022121	GA	3	6	250825	250830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022121	TG	3	6	250935	250940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022121	AG	3	6	251737	251742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022121	AG	3	6	252746	252751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022121	TA	3	6	254552	254557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022121	AG	3	6	256833	256838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022121	TC	3	6	256859	256864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022121	AG	3	6	258337	258342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022121	TA	3	6	264700	264705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022121	CT	3	6	268338	268343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022121	TC	3	6	268407	268412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022121	TA	3	6	273960	273965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022121	AT	4	8	284520	284527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022121	CT	3	6	285372	285377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022121	TC	4	8	285463	285470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022121	TC	3	6	287153	287158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022121	TC	3	6	287210	287215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022121	CT	3	6	287683	287688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022121	AT	3	6	299694	299699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022121	CA	3	6	302023	302028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022121	GA	3	6	306754	306759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022121	AG	3	6	315960	315965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022121	CT	3	6	347917	347922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022121	CT	3	6	350988	350993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022121	TC	3	6	355214	355219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022121	TC	3	6	359044	359049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022121	CT	3	6	359130	359135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022121	AC	3	6	362463	362468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022121	GA	3	6	364373	364378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022121	TC	3	6	364451	364456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022121	TA	3	6	364652	364657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022121	CT	4	8	381791	381798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022121	CG	3	6	391629	391634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022121	CA	3	6	392679	392684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022121	TC	3	6	395226	395231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022121	GA	3	6	395846	395851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022121	GA	3	6	395977	395982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022121	CT	3	6	411069	411074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022121	CT	3	6	429799	429804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022121	CT	3	6	430822	430827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022121	AG	3	6	431169	431174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022121	GA	3	6	432864	432869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022121	AC	3	6	436862	436867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022121	CT	3	6	441133	441138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022121	AC	3	6	441171	441176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022121	CA	3	6	443640	443645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022121	CT	3	6	445044	445049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022121	CT	3	6	454326	454331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022121	AG	3	6	460467	460472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022121	TC	3	6	467005	467010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022121	AT	3	6	467074	467079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022121	GA	4	8	468448	468455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022121	TA	3	6	468491	468496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022121	GA	3	6	468589	468594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022121	TC	3	6	480321	480326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022121	AC	3	6	485852	485857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022121	GA	4	8	485897	485904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022121	CA	3	6	485934	485939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022121	TC	3	6	485975	485980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022121	AC	3	6	490410	490415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022121	AG	3	6	490572	490577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022121	CT	3	6	490591	490596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022121	CT	3	6	493870	493875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022121	CT	3	6	494388	494393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022121	TG	3	6	494421	494426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022121	TA	3	6	494534	494539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022121	CA	4	8	508261	508268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022121	CT	3	6	509199	509204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022121	TA	3	6	515002	515007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022121	AG	3	6	516900	516905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022121	TC	3	6	517746	517751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022121	GA	3	6	517901	517906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022121	AG	3	6	517937	517942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022121	AT	3	6	524169	524174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022121	AC	3	6	535420	535425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022121	CT	3	6	537337	537342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022121	TC	4	8	540861	540868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022121	AT	3	6	540914	540919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022121	TC	3	6	541630	541635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022121	CT	3	6	558434	558439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022121	TC	3	6	558666	558671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022121	AG	3	6	560727	560732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022121	GA	3	6	562225	562230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022121	CT	3	6	565505	565510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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308	NC_022121	CA	3	6	1039160	1039165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_022121	AG	4	8	1039637	1039644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_022121	GA	3	6	1042816	1042821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.