MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/31-98

Total Repeats: 2057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022121	AG	3	6	2151	2156	50 %	0 %	50 %	0 %	532431174
2	NC_022121	GA	3	6	2819	2824	50 %	0 %	50 %	0 %	532431174
3	NC_022121	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	532431175
4	NC_022121	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532431176
5	NC_022121	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532431176
6	NC_022121	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532431176
7	NC_022121	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532431176
8	NC_022121	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532431176
9	NC_022121	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532431178
10	NC_022121	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532431179
11	NC_022121	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532431179
12	NC_022121	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	532431179
13	NC_022121	GA	3	6	9864	9869	50 %	0 %	50 %	0 %	532431181
14	NC_022121	AG	3	6	10081	10086	50 %	0 %	50 %	0 %	532431181
15	NC_022121	AG	3	6	11307	11312	50 %	0 %	50 %	0 %	532431182
16	NC_022121	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	532431182
17	NC_022121	TG	3	6	12770	12775	0 %	50 %	50 %	0 %	532431183
18	NC_022121	AG	3	6	12919	12924	50 %	0 %	50 %	0 %	532431183
19	NC_022121	AG	4	8	13075	13082	50 %	0 %	50 %	0 %	532431183
20	NC_022121	AC	3	6	14403	14408	50 %	0 %	0 %	50 %	532431184
21	NC_022121	AG	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	532431185
22	NC_022121	TC	3	6	15782	15787	0 %	50 %	0 %	50 %	532431185
23	NC_022121	GA	3	6	16311	16316	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
24	NC_022121	AG	3	6	16382	16387	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
25	NC_022121	GA	3	6	17166	17171	50 %	0 %	50 %	0 %	532431186
26	NC_022121	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	532431187
27	NC_022121	TC	3	6	18219	18224	0 %	50 %	0 %	50 %	532431187
28	NC_022121	CT	3	6	18447	18452	0 %	50 %	0 %	50 %	532431188
29	NC_022121	TC	3	6	18647	18652	0 %	50 %	0 %	50 %	532431188
30	NC_022121	GA	3	6	18662	18667	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
31	NC_022121	GA	3	6	18761	18766	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
32	NC_022121	AG	3	6	19227	19232	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
33	NC_022121	AG	4	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	532431188
34	NC_022121	GT	3	6	19776	19781	0 %	50 %	50 %	0 %	532431188
35	NC_022121	AG	3	6	20004	20009	50 %	0 %	50 %	0 %	532431189
36	NC_022121	TG	3	6	20117	20122	0 %	50 %	50 %	0 %	532431189
37	NC_022121	CT	4	8	21914	21921	0 %	50 %	0 %	50 %	532431190
38	NC_022121	AT	3	6	22184	22189	50 %	50 %	0 %	0 %	532431190
39	NC_022121	AT	3	6	22508	22513	50 %	50 %	0 %	0 %	532431190
40	NC_022121	GA	3	6	23827	23832	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
41	NC_022121	GA	3	6	23919	23924	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
42	NC_022121	AG	3	6	24300	24305	50 %	0 %	50 %	0 %	532431190
43	NC_022121	GA	3	6	25717	25722	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
44	NC_022121	GT	3	6	25737	25742	0 %	50 %	50 %	0 %	532431191
45	NC_022121	TA	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	532431191
46	NC_022121	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	532431191
47	NC_022121	AT	3	6	26802	26807	50 %	50 %	0 %	0 %	532431192
48	NC_022121	GA	3	6	27016	27021	50 %	0 %	50 %	0 %	532431192
49	NC_022121	TG	3	6	28390	28395	0 %	50 %	50 %	0 %	532431194
50	NC_022121	TC	3	6	28443	28448	0 %	50 %	0 %	50 %	532431194
51	NC_022121	GC	4	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	532431194
52	NC_022121	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	532431194
53	NC_022121	GA	3	6	29930	29935	50 %	0 %	50 %	0 %	532431195
54	NC_022121	AG	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
55	NC_022121	TC	3	6	30137	30142	0 %	50 %	0 %	50 %	532431196
56	NC_022121	GA	3	6	30758	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
57	NC_022121	GA	3	6	31226	31231	50 %	0 %	50 %	0 %	532431196
58	NC_022121	AT	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	532431197
59	NC_022121	TC	3	6	31652	31657	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
60	NC_022121	GC	3	6	32082	32087	0 %	0 %	50 %	50 %	532431198
61	NC_022121	CT	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	532431198
62	NC_022121	AG	3	6	32264	32269	50 %	0 %	50 %	0 %	532431198
63	NC_022121	TC	3	6	33761	33766	0 %	50 %	0 %	50 %	532431200
64	NC_022121	AG	3	6	33774	33779	50 %	0 %	50 %	0 %	532431200
65	NC_022121	AG	3	6	33912	33917	50 %	0 %	50 %	0 %	532431201
66	NC_022121	GA	4	8	34604	34611	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
67	NC_022121	GA	4	8	34628	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	532431202
68	NC_022121	GA	3	6	36530	36535	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
69	NC_022121	CT	3	6	37014	37019	0 %	50 %	0 %	50 %	532431204
70	NC_022121	AG	3	6	37525	37530	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
71	NC_022121	AG	3	6	38071	38076	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
72	NC_022121	AG	3	6	38598	38603	50 %	0 %	50 %	0 %	532431204
73	NC_022121	GA	3	6	39382	39387	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
74	NC_022121	AG	3	6	39519	39524	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
75	NC_022121	AG	3	6	39619	39624	50 %	0 %	50 %	0 %	532431205
76	NC_022121	GC	3	6	40575	40580	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
77	NC_022121	AG	3	6	40596	40601	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
78	NC_022121	GC	3	6	40645	40650	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
79	NC_022121	GA	3	6	40810	40815	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
80	NC_022121	TC	3	6	40819	40824	0 %	50 %	0 %	50 %	532431206
81	NC_022121	GC	3	6	40884	40889	0 %	0 %	50 %	50 %	532431206
82	NC_022121	GA	3	6	41024	41029	50 %	0 %	50 %	0 %	532431206
83	NC_022121	GT	3	6	41462	41467	0 %	50 %	50 %	0 %	532431207
84	NC_022121	GA	3	6	42000	42005	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
85	NC_022121	GA	4	8	42010	42017	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
86	NC_022121	AG	3	6	42246	42251	50 %	0 %	50 %	0 %	532431207
87	NC_022121	CT	3	6	42312	42317	0 %	50 %	0 %	50 %	532432011
88	NC_022121	GA	5	10	42588	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	532432011
89	NC_022121	AC	3	6	43469	43474	50 %	0 %	0 %	50 %	532431209
90	NC_022121	TC	3	6	43638	43643	0 %	50 %	0 %	50 %	532431209
91	NC_022121	TA	3	6	43955	43960	50 %	50 %	0 %	0 %	532431210
92	NC_022121	TC	3	6	44867	44872	0 %	50 %	0 %	50 %	532431211
93	NC_022121	GA	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	532431212
94	NC_022121	TG	3	6	45568	45573	0 %	50 %	50 %	0 %	532431212
95	NC_022121	AG	3	6	45579	45584	50 %	0 %	50 %	0 %	532431212
96	NC_022121	AG	4	8	46020	46027	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
97	NC_022121	CT	3	6	46211	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	532431213
98	NC_022121	TG	3	6	46412	46417	0 %	50 %	50 %	0 %	532431213
99	NC_022121	AG	3	6	46465	46470	50 %	0 %	50 %	0 %	532431213
100	NC_022121	AG	3	6	49389	49394	50 %	0 %	50 %	0 %	532431215
101	NC_022121	CA	3	6	50078	50083	50 %	0 %	0 %	50 %	532431216
102	NC_022121	TC	3	6	52921	52926	0 %	50 %	0 %	50 %	532431218
103	NC_022121	CA	3	6	52972	52977	50 %	0 %	0 %	50 %	532431218
104	NC_022121	GA	3	6	53393	53398	50 %	0 %	50 %	0 %	532431219
105	NC_022121	CT	3	6	53710	53715	0 %	50 %	0 %	50 %	532431219
106	NC_022121	CT	3	6	54407	54412	0 %	50 %	0 %	50 %	532431220
107	NC_022121	AT	3	6	55597	55602	50 %	50 %	0 %	0 %	532431220
108	NC_022121	CT	3	6	56532	56537	0 %	50 %	0 %	50 %	532432012
109	NC_022121	GT	3	6	56582	56587	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
110	NC_022121	TG	3	6	57289	57294	0 %	50 %	50 %	0 %	532432012
111	NC_022121	CT	3	6	58170	58175	0 %	50 %	0 %	50 %	532432013
112	NC_022121	GA	3	6	59736	59741	50 %	0 %	50 %	0 %	532431221
113	NC_022121	GT	3	6	59874	59879	0 %	50 %	50 %	0 %	532431221
114	NC_022121	TC	3	6	60622	60627	0 %	50 %	0 %	50 %	532431222
115	NC_022121	GA	3	6	60850	60855	50 %	0 %	50 %	0 %	532432014
116	NC_022121	CA	3	6	61248	61253	50 %	0 %	0 %	50 %	532431223
117	NC_022121	AT	3	6	61498	61503	50 %	50 %	0 %	0 %	532431223
118	NC_022121	GA	3	6	61521	61526	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
119	NC_022121	GA	3	6	61647	61652	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
120	NC_022121	GA	3	6	62462	62467	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
121	NC_022121	GA	3	6	62727	62732	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
122	NC_022121	TC	3	6	62883	62888	0 %	50 %	0 %	50 %	532431223
123	NC_022121	AT	3	6	63064	63069	50 %	50 %	0 %	0 %	532431223
124	NC_022121	AG	3	6	63264	63269	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
125	NC_022121	CT	4	8	63272	63279	0 %	50 %	0 %	50 %	532431223
126	NC_022121	AG	3	6	63499	63504	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
127	NC_022121	AG	3	6	63758	63763	50 %	0 %	50 %	0 %	532431223
128	NC_022121	AG	3	6	63886	63891	50 %	0 %	50 %	0 %	532431224
129	NC_022121	AG	3	6	65182	65187	50 %	0 %	50 %	0 %	532431225
130	NC_022121	GA	3	6	65368	65373	50 %	0 %	50 %	0 %	532431225
131	NC_022121	CT	3	6	65408	65413	0 %	50 %	0 %	50 %	532431225
132	NC_022121	AG	3	6	65990	65995	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
133	NC_022121	AC	3	6	66122	66127	50 %	0 %	0 %	50 %	532431226
134	NC_022121	AG	3	6	66224	66229	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
135	NC_022121	AG	3	6	66630	66635	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
136	NC_022121	GA	3	6	67003	67008	50 %	0 %	50 %	0 %	532431226
137	NC_022121	CT	3	6	68087	68092	0 %	50 %	0 %	50 %	532431227
138	NC_022121	AT	3	6	69268	69273	50 %	50 %	0 %	0 %	532431229
139	NC_022121	TC	3	6	69503	69508	0 %	50 %	0 %	50 %	532431229
140	NC_022121	CT	3	6	69820	69825	0 %	50 %	0 %	50 %	532431229
141	NC_022121	GA	3	6	70230	70235	50 %	0 %	50 %	0 %	532431229
142	NC_022121	GA	3	6	70429	70434	50 %	0 %	50 %	0 %	532431229
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