MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022120	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022120	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022120	TC	3	6	1666	1671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022120	GA	3	6	6994	6999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022120	TA	3	6	11244	11249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022120	TA	4	8	13558	13565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022120	AG	3	6	17509	17514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022120	GA	3	6	17522	17527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022120	AG	3	6	20510	20515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022120	GA	3	6	20668	20673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022120	AG	3	6	21185	21190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022120	CT	3	6	21254	21259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022120	GA	3	6	26506	26511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022120	CT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022120	TC	3	6	27881	27886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022120	AG	3	6	27964	27969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022120	GA	3	6	36378	36383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022120	AT	3	6	36479	36484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022120	CT	3	6	38745	38750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022120	CT	3	6	40116	40121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022120	AG	3	6	48032	48037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022120	TG	4	8	51380	51387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022120	GA	3	6	55606	55611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022120	AG	4	8	64847	64854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022120	TA	3	6	69178	69183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022120	CT	3	6	71914	71919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022120	TA	3	6	85275	85280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022120	TC	3	6	90496	90501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022120	GA	3	6	90628	90633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022120	CT	3	6	92978	92983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022120	GA	3	6	93506	93511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022120	TA	3	6	94123	94128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022120	TC	3	6	100003	100008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022120	AT	3	6	100054	100059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022120	TA	3	6	106730	106735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022120	TG	3	6	115972	115977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022120	AG	4	8	118557	118564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022120	GA	3	6	120379	120384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022120	TA	3	6	122614	122619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022120	GT	3	6	123603	123608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022120	GA	3	6	123725	123730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022120	AG	3	6	124137	124142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022120	GA	3	6	124507	124512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022120	CT	3	6	128137	128142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022120	GA	3	6	138285	138290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022120	AT	3	6	142517	142522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022120	GA	3	6	151754	151759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022120	AG	3	6	157319	157324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022120	TC	3	6	171782	171787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022120	AG	3	6	171914	171919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022120	CT	3	6	171932	171937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022120	TG	3	6	178423	178428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022120	GA	3	6	184278	184283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022120	AG	3	6	197202	197207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022120	CT	3	6	203951	203956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022120	GA	4	8	207010	207017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022120	CT	4	8	207058	207065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022120	TA	3	6	217150	217155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022120	AG	4	8	218329	218336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022120	TA	3	6	219883	219888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022120	CT	3	6	221524	221529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022120	TC	3	6	224525	224530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022120	AG	3	6	224556	224561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022120	TC	3	6	238756	238761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022120	AG	3	6	238782	238787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022120	CA	3	6	243706	243711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022120	GT	3	6	243923	243928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022120	GA	3	6	250789	250794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022120	TG	3	6	250899	250904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022120	AG	3	6	251701	251706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022120	AG	3	6	252710	252715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022120	TA	3	6	254516	254521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022120	AG	3	6	256796	256801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022120	TC	3	6	256822	256827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022120	AG	3	6	258300	258305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022120	TA	3	6	264663	264668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022120	TC	3	6	268370	268375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022120	TA	3	6	273923	273928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022120	AT	4	8	284483	284490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022120	TC	4	8	285426	285433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022120	TC	3	6	287115	287120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022120	TC	3	6	287172	287177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022120	CT	3	6	287645	287650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022120	AT	3	6	299654	299659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022120	CA	3	6	301983	301988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022120	GA	3	6	306714	306719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022120	AG	3	6	315920	315925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022120	CA	3	6	331184	331189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022120	CT	3	6	347875	347880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022120	CT	3	6	350946	350951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022120	TC	3	6	359002	359007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022120	CT	3	6	359088	359093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022120	AC	3	6	362421	362426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022120	GA	3	6	364331	364336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022120	TC	3	6	364409	364414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022120	TA	3	6	364610	364615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022120	AC	3	6	367250	367255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022120	CT	4	8	367422	367429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022120	CT	3	6	367655	367660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022120	CA	3	6	367664	367669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022120	CT	4	8	381748	381755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022120	CG	3	6	391585	391590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022120	CA	3	6	392635	392640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022120	TC	3	6	395182	395187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022120	GA	3	6	395802	395807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022120	GA	3	6	395933	395938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022120	CT	3	6	411025	411030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022120	AG	3	6	431124	431129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022120	GA	3	6	432819	432824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022120	AC	3	6	436817	436822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022120	CT	3	6	441088	441093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022120	AC	3	6	441126	441131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022120	CT	3	6	454281	454286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022120	AG	3	6	460422	460427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022120	TC	3	6	466960	466965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022120	AT	3	6	467029	467034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022120	TA	3	6	468446	468451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022120	GA	3	6	468544	468549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022120	TC	3	6	480275	480280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022120	AC	3	6	485806	485811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022120	GA	4	8	485851	485858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022120	CA	3	6	485888	485893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022120	TC	3	6	485929	485934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022120	AC	3	6	490364	490369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022120	AG	3	6	490526	490531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022120	CT	3	6	490545	490550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022120	GA	3	6	490837	490842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022120	TA	3	6	492681	492686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022120	CT	3	6	493823	493828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022120	TG	3	6	494374	494379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022120	TA	3	6	494487	494492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022120	CT	4	8	500144	500151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022120	TG	3	6	512580	512585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022120	TA	3	6	514952	514957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022120	AG	3	6	516850	516855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022120	TC	3	6	517696	517701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022120	GA	3	6	517851	517856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022120	AG	3	6	517887	517892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022120	AT	3	6	524119	524124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022120	AC	3	6	535371	535376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022120	CT	3	6	535494	535499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022120	CT	3	6	537287	537292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022120	AT	3	6	540864	540869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022120	TC	3	6	541580	541585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022120	CT	3	6	558384	558389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022120	TC	3	6	558616	558621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022120	GA	3	6	562175	562180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022120	CT	3	6	565455	565460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022120	AG	3	6	575508	575513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022120	CT	3	6	589505	589510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022120	CA	3	6	597131	597136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022120	AG	3	6	598321	598326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022120	GA	3	6	603322	603327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022120	TA	3	6	606234	606239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022120	TC	3	6	606336	606341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_022120	TC	3	6	611462	611467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.