MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain Ia20-97 genome

Total Repeats: 2088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022120	AG	3	6	2149	2154	50 %	0 %	50 %	0 %	532427124
2	NC_022120	GA	3	6	2817	2822	50 %	0 %	50 %	0 %	532427124
3	NC_022120	AT	3	6	4510	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	532427125
4	NC_022120	TC	3	6	5260	5265	0 %	50 %	0 %	50 %	532427126
5	NC_022120	GA	3	6	5271	5276	50 %	0 %	50 %	0 %	532427126
6	NC_022120	AT	3	6	5375	5380	50 %	50 %	0 %	0 %	532427126
7	NC_022120	TG	3	6	5528	5533	0 %	50 %	50 %	0 %	532427126
8	NC_022120	AG	3	6	5936	5941	50 %	0 %	50 %	0 %	532427126
9	NC_022120	AC	3	6	7644	7649	50 %	0 %	0 %	50 %	532427128
10	NC_022120	AG	3	6	8387	8392	50 %	0 %	50 %	0 %	532427129
11	NC_022120	CT	4	8	8506	8513	0 %	50 %	0 %	50 %	532427129
12	NC_022120	GT	3	6	8588	8593	0 %	50 %	50 %	0 %	532427129
13	NC_022120	GA	3	6	9862	9867	50 %	0 %	50 %	0 %	532427131
14	NC_022120	AG	3	6	10079	10084	50 %	0 %	50 %	0 %	532427131
15	NC_022120	AG	3	6	11305	11310	50 %	0 %	50 %	0 %	532427132
16	NC_022120	TA	3	6	11865	11870	50 %	50 %	0 %	0 %	532427132
17	NC_022120	TG	3	6	12768	12773	0 %	50 %	50 %	0 %	532427133
18	NC_022120	AG	3	6	12917	12922	50 %	0 %	50 %	0 %	532427133
19	NC_022120	AG	4	8	13073	13080	50 %	0 %	50 %	0 %	532427133
20	NC_022120	TA	3	6	13335	13340	50 %	50 %	0 %	0 %	532427133
21	NC_022120	AC	3	6	14401	14406	50 %	0 %	0 %	50 %	532427134
22	NC_022120	AG	3	6	15740	15745	50 %	0 %	50 %	0 %	532427135
23	NC_022120	TC	3	6	15780	15785	0 %	50 %	0 %	50 %	532427135
24	NC_022120	GA	3	6	16309	16314	50 %	0 %	50 %	0 %	532427136
25	NC_022120	AG	3	6	16380	16385	50 %	0 %	50 %	0 %	532427136
26	NC_022120	GA	3	6	17163	17168	50 %	0 %	50 %	0 %	532427136
27	NC_022120	GA	3	6	17766	17771	50 %	0 %	50 %	0 %	532427137
28	NC_022120	TC	3	6	18216	18221	0 %	50 %	0 %	50 %	532427137
29	NC_022120	CT	3	6	18444	18449	0 %	50 %	0 %	50 %	532427138
30	NC_022120	TC	3	6	18644	18649	0 %	50 %	0 %	50 %	532427138
31	NC_022120	GA	3	6	18659	18664	50 %	0 %	50 %	0 %	532427138
32	NC_022120	GA	3	6	18758	18763	50 %	0 %	50 %	0 %	532427138
33	NC_022120	AG	3	6	19224	19229	50 %	0 %	50 %	0 %	532427138
34	NC_022120	AG	4	8	19510	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	532427138
35	NC_022120	GT	3	6	19773	19778	0 %	50 %	50 %	0 %	532427138
36	NC_022120	AG	3	6	20001	20006	50 %	0 %	50 %	0 %	532427139
37	NC_022120	TG	3	6	20114	20119	0 %	50 %	50 %	0 %	532427139
38	NC_022120	CT	4	8	21911	21918	0 %	50 %	0 %	50 %	532427140
39	NC_022120	AT	3	6	22181	22186	50 %	50 %	0 %	0 %	532427140
40	NC_022120	AT	3	6	22505	22510	50 %	50 %	0 %	0 %	532427140
41	NC_022120	GA	3	6	23824	23829	50 %	0 %	50 %	0 %	532427140
42	NC_022120	GA	3	6	23916	23921	50 %	0 %	50 %	0 %	532427140
43	NC_022120	AG	3	6	24297	24302	50 %	0 %	50 %	0 %	532427140
44	NC_022120	GA	3	6	25714	25719	50 %	0 %	50 %	0 %	532427141
45	NC_022120	GT	3	6	25734	25739	0 %	50 %	50 %	0 %	532427141
46	NC_022120	TA	3	6	25936	25941	50 %	50 %	0 %	0 %	532427141
47	NC_022120	GA	3	6	26382	26387	50 %	0 %	50 %	0 %	532427141
48	NC_022120	AT	3	6	26799	26804	50 %	50 %	0 %	0 %	532427142
49	NC_022120	GA	3	6	27013	27018	50 %	0 %	50 %	0 %	532427142
50	NC_022120	TG	3	6	28387	28392	0 %	50 %	50 %	0 %	532427144
51	NC_022120	TC	3	6	28440	28445	0 %	50 %	0 %	50 %	532427144
52	NC_022120	GC	4	8	28854	28861	0 %	0 %	50 %	50 %	532427144
53	NC_022120	TA	3	6	28976	28981	50 %	50 %	0 %	0 %	532427144
54	NC_022120	GA	3	6	29927	29932	50 %	0 %	50 %	0 %	532427145
55	NC_022120	AG	3	6	30025	30030	50 %	0 %	50 %	0 %	532427146
56	NC_022120	TC	3	6	30134	30139	0 %	50 %	0 %	50 %	532427146
57	NC_022120	GA	3	6	30755	30760	50 %	0 %	50 %	0 %	532427146
58	NC_022120	GA	3	6	31223	31228	50 %	0 %	50 %	0 %	532427146
59	NC_022120	AT	3	6	31364	31369	50 %	50 %	0 %	0 %	532427147
60	NC_022120	TC	3	6	31649	31654	0 %	50 %	0 %	50 %	532427148
61	NC_022120	GC	3	6	32079	32084	0 %	0 %	50 %	50 %	532427148
62	NC_022120	CT	3	6	32129	32134	0 %	50 %	0 %	50 %	532427148
63	NC_022120	AG	3	6	32261	32266	50 %	0 %	50 %	0 %	532427148
64	NC_022120	TC	3	6	33758	33763	0 %	50 %	0 %	50 %	532427150
65	NC_022120	AG	3	6	33771	33776	50 %	0 %	50 %	0 %	532427150
66	NC_022120	AG	3	6	33909	33914	50 %	0 %	50 %	0 %	532427151
67	NC_022120	GA	4	8	34601	34608	50 %	0 %	50 %	0 %	532427152
68	NC_022120	GA	4	8	34625	34632	50 %	0 %	50 %	0 %	532427152
69	NC_022120	GA	3	6	36527	36532	50 %	0 %	50 %	0 %	532427154
70	NC_022120	CT	3	6	37011	37016	0 %	50 %	0 %	50 %	532427154
71	NC_022120	AG	3	6	37522	37527	50 %	0 %	50 %	0 %	532427154
72	NC_022120	AG	3	6	38067	38072	50 %	0 %	50 %	0 %	532427154
73	NC_022120	AG	3	6	38594	38599	50 %	0 %	50 %	0 %	532427154
74	NC_022120	GA	3	6	39378	39383	50 %	0 %	50 %	0 %	532427155
75	NC_022120	AG	3	6	39515	39520	50 %	0 %	50 %	0 %	532427155
76	NC_022120	AG	3	6	39615	39620	50 %	0 %	50 %	0 %	532427155
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79	NC_022120	GC	3	6	40641	40646	0 %	0 %	50 %	50 %	532427156
80	NC_022120	GA	3	6	40806	40811	50 %	0 %	50 %	0 %	532427156
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82	NC_022120	GC	3	6	40880	40885	0 %	0 %	50 %	50 %	532427156
83	NC_022120	GA	3	6	41020	41025	50 %	0 %	50 %	0 %	532427156
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87	NC_022120	AG	3	6	42242	42247	50 %	0 %	50 %	0 %	532427157
88	NC_022120	CT	3	6	42308	42313	0 %	50 %	0 %	50 %	532427961
89	NC_022120	GA	5	10	42584	42593	50 %	0 %	50 %	0 %	532427961
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91	NC_022120	TC	3	6	43632	43637	0 %	50 %	0 %	50 %	532427159
92	NC_022120	TC	3	6	43797	43802	0 %	50 %	0 %	50 %	532427159
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95	NC_022120	GA	3	6	45344	45349	50 %	0 %	50 %	0 %	532427162
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97	NC_022120	AG	3	6	45573	45578	50 %	0 %	50 %	0 %	532427162
98	NC_022120	AG	4	8	46014	46021	50 %	0 %	50 %	0 %	532427163
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100	NC_022120	TG	3	6	46406	46411	0 %	50 %	50 %	0 %	532427163
101	NC_022120	AG	3	6	46459	46464	50 %	0 %	50 %	0 %	532427163
102	NC_022120	AG	3	6	49384	49389	50 %	0 %	50 %	0 %	532427165
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105	NC_022120	CA	3	6	52944	52949	50 %	0 %	0 %	50 %	532427168
106	NC_022120	GA	3	6	53365	53370	50 %	0 %	50 %	0 %	532427169
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108	NC_022120	CT	3	6	54379	54384	0 %	50 %	0 %	50 %	532427170
109	NC_022120	AT	3	6	55569	55574	50 %	50 %	0 %	0 %	532427170
110	NC_022120	CT	3	6	56504	56509	0 %	50 %	0 %	50 %	532427962
111	NC_022120	GT	3	6	56554	56559	0 %	50 %	50 %	0 %	532427962
112	NC_022120	TG	3	6	57261	57266	0 %	50 %	50 %	0 %	532427962
113	NC_022120	CT	3	6	58142	58147	0 %	50 %	0 %	50 %	532427963
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118	NC_022120	CA	3	6	61220	61225	50 %	0 %	0 %	50 %	532427173
119	NC_022120	AT	3	6	61470	61475	50 %	50 %	0 %	0 %	532427173
120	NC_022120	GA	3	6	61493	61498	50 %	0 %	50 %	0 %	532427173
121	NC_022120	GA	3	6	61619	61624	50 %	0 %	50 %	0 %	532427173
122	NC_022120	GA	3	6	62434	62439	50 %	0 %	50 %	0 %	532427173
123	NC_022120	TC	3	6	62855	62860	0 %	50 %	0 %	50 %	532427173
124	NC_022120	AT	3	6	63036	63041	50 %	50 %	0 %	0 %	532427173
125	NC_022120	AG	3	6	63236	63241	50 %	0 %	50 %	0 %	532427173
126	NC_022120	CT	4	8	63244	63251	0 %	50 %	0 %	50 %	532427173
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128	NC_022120	AG	3	6	63730	63735	50 %	0 %	50 %	0 %	532427173
129	NC_022120	AG	3	6	63858	63863	50 %	0 %	50 %	0 %	532427174
130	NC_022120	AG	3	6	65154	65159	50 %	0 %	50 %	0 %	532427175
131	NC_022120	GA	3	6	65340	65345	50 %	0 %	50 %	0 %	532427175
132	NC_022120	CT	3	6	65380	65385	0 %	50 %	0 %	50 %	532427175
133	NC_022120	AG	3	6	65962	65967	50 %	0 %	50 %	0 %	532427176
134	NC_022120	AC	3	6	66094	66099	50 %	0 %	0 %	50 %	532427176
135	NC_022120	AG	3	6	66196	66201	50 %	0 %	50 %	0 %	532427176
136	NC_022120	AG	3	6	66602	66607	50 %	0 %	50 %	0 %	532427176
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139	NC_022120	AT	3	6	69240	69245	50 %	50 %	0 %	0 %	532427179
140	NC_022120	TC	3	6	69475	69480	0 %	50 %	0 %	50 %	532427179
141	NC_022120	CT	3	6	69792	69797	0 %	50 %	0 %	50 %	532427179
142	NC_022120	GA	3	6	70202	70207	50 %	0 %	50 %	0 %	532427179
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