MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 12942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022119	ATG	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423943
2	NC_022119	GTG	2	6	1341	1346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423943
3	NC_022119	TCC	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423943
4	NC_022119	AGC	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423943
5	NC_022119	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423943
6	NC_022119	AAG	2	6	1402	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423943
7	NC_022119	TAC	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423943
8	NC_022119	GCT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423943
9	NC_022119	AAC	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423943
10	NC_022119	AGA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423943
11	NC_022119	AGA	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
12	NC_022119	ATC	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423944
13	NC_022119	TGC	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423944
14	NC_022119	CAT	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423944
15	NC_022119	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
16	NC_022119	AAG	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423944
17	NC_022119	GGA	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423944
18	NC_022119	ATC	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423945
19	NC_022119	ATA	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
20	NC_022119	AAC	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423945
21	NC_022119	GGT	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423945
22	NC_022119	AAT	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
23	NC_022119	TTC	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423945
24	NC_022119	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
25	NC_022119	GGA	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423945
26	NC_022119	CAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
27	NC_022119	GTT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423945
28	NC_022119	GGT	2	6	2754	2759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423945
29	NC_022119	AAG	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
30	NC_022119	ATT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423945
31	NC_022119	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423945
32	NC_022119	AAG	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
33	NC_022119	AAG	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
34	NC_022119	CAG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
35	NC_022119	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423945
36	NC_022119	AAG	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423945
37	NC_022119	CAG	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423945
38	NC_022119	GGA	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423945
39	NC_022119	AAT	2	6	3578	3583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423945
40	NC_022119	ATT	2	6	3658	3663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423946
41	NC_022119	TGA	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
42	NC_022119	GTA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
43	NC_022119	AGA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
44	NC_022119	GAA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
45	NC_022119	CGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423946
46	NC_022119	GTT	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
47	NC_022119	TGA	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423946
48	NC_022119	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
49	NC_022119	TTC	2	6	4707	4712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423946
50	NC_022119	TCT	2	6	4799	4804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423946
51	NC_022119	AGA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423946
52	NC_022119	GTT	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423946
53	NC_022119	GGT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423946
54	NC_022119	CTC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423946
55	NC_022119	AGC	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423946
56	NC_022119	ATT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423947
57	NC_022119	TCT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423947
58	NC_022119	GCT	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
59	NC_022119	GAT	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423947
60	NC_022119	ACG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
61	NC_022119	GAA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
62	NC_022119	AGA	3	9	5384	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
63	NC_022119	GCT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
64	NC_022119	AGA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
65	NC_022119	TGG	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423947
66	NC_022119	AGA	3	9	5456	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423947
67	NC_022119	GGA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423947
68	NC_022119	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423947
69	NC_022119	GGA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423947
70	NC_022119	CTT	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423947
71	NC_022119	CTG	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423947
72	NC_022119	CAG	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
73	NC_022119	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423947
74	NC_022119	AGG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423948
75	NC_022119	GAA	2	6	6481	6486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423948
76	NC_022119	GCA	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423948
77	NC_022119	AAG	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423948
78	NC_022119	TGC	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423948
79	NC_022119	TTA	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532424783
80	NC_022119	GAA	2	6	7200	7205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532424783
81	NC_022119	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423949
82	NC_022119	TCC	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532423949
83	NC_022119	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423949
84	NC_022119	TTA	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423949
85	NC_022119	TTC	2	6	8157	8162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423949
86	NC_022119	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423950
87	NC_022119	ACC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532423950
88	NC_022119	CTT	2	6	8482	8487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423950
89	NC_022119	GAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
90	NC_022119	ATA	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423950
91	NC_022119	AGG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
92	NC_022119	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423950
93	NC_022119	CAG	2	6	8799	8804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423950
94	NC_022119	TGT	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423950
95	NC_022119	GAG	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
96	NC_022119	TAC	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423950
97	NC_022119	GTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423950
98	NC_022119	AAG	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423950
99	NC_022119	GAG	2	6	9107	9112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423950
100	NC_022119	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423951
101	NC_022119	AGA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423951
102	NC_022119	TGC	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423951
103	NC_022119	GAA	2	6	9689	9694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423951
104	NC_022119	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423951
105	NC_022119	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423951
106	NC_022119	GTA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423952
107	NC_022119	AGC	2	6	9983	9988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423952
108	NC_022119	CTT	2	6	9997	10002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423952
109	NC_022119	ATG	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423952
110	NC_022119	CGT	2	6	10185	10190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532423952
111	NC_022119	GAC	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423952
112	NC_022119	GGT	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532423952
113	NC_022119	GAA	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423952
114	NC_022119	CAA	2	6	10510	10515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532423952
115	NC_022119	GGA	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423952
116	NC_022119	CGA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423952
117	NC_022119	CTT	2	6	10735	10740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423952
118	NC_022119	TTG	2	6	10775	10780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423952
119	NC_022119	CTT	2	6	10789	10794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532423952
120	NC_022119	ATC	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532423952
121	NC_022119	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532423952
122	NC_022119	AGA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532423952
123	NC_022119	AGG	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423952
124	NC_022119	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532423952
125	NC_022119	CGA	2	6	11116	11121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532423952
126	NC_022119	AAT	2	6	11329	11334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423953
127	NC_022119	AGG	2	6	11572	11577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532423953
128	NC_022119	ATA	3	9	11582	11590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532423953
129	NC_022119	TAT	2	6	11601	11606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532423953
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