MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/13-96

Total Repeats: 2379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022119	TC	3	6	224	229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022119	AG	3	6	246	251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022119	TC	3	6	1669	1674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022119	AG	3	6	2152	2157	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
5	NC_022119	GA	3	6	2820	2825	50 %	0 %	50 %	0 %	532423945
6	NC_022119	AT	3	6	4513	4518	50 %	50 %	0 %	0 %	532423946
7	NC_022119	TC	3	6	5261	5266	0 %	50 %	0 %	50 %	532423947
8	NC_022119	GA	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
9	NC_022119	AT	3	6	5376	5381	50 %	50 %	0 %	0 %	532423947
10	NC_022119	TG	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	532423947
11	NC_022119	AG	3	6	5937	5942	50 %	0 %	50 %	0 %	532423947
12	NC_022119	AG	3	6	6411	6416	50 %	0 %	50 %	0 %	532423948
13	NC_022119	GA	3	6	6995	7000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022119	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532423949
15	NC_022119	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532423950
16	NC_022119	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532423950
17	NC_022119	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	532423950
18	NC_022119	AG	3	6	9350	9355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022119	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	532423952
20	NC_022119	AG	3	6	10083	10088	50 %	0 %	50 %	0 %	532423952
21	NC_022119	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022119	AG	3	6	11309	11314	50 %	0 %	50 %	0 %	532423953
23	NC_022119	TA	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	532423953
24	NC_022119	TG	3	6	12772	12777	0 %	50 %	50 %	0 %	532423954
25	NC_022119	AG	3	6	12921	12926	50 %	0 %	50 %	0 %	532423954
26	NC_022119	TC	3	6	13055	13060	0 %	50 %	0 %	50 %	532423954
27	NC_022119	AG	4	8	13077	13084	50 %	0 %	50 %	0 %	532423954
28	NC_022119	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022119	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022119	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	532423955
31	NC_022119	AG	3	6	15745	15750	50 %	0 %	50 %	0 %	532423956
32	NC_022119	TC	3	6	15785	15790	0 %	50 %	0 %	50 %	532423956
33	NC_022119	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
34	NC_022119	AG	3	6	16385	16390	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
35	NC_022119	GA	3	6	17169	17174	50 %	0 %	50 %	0 %	532423957
36	NC_022119	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022119	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022119	GA	3	6	17772	17777	50 %	0 %	50 %	0 %	532423958
39	NC_022119	TC	3	6	18222	18227	0 %	50 %	0 %	50 %	532423958
40	NC_022119	CT	3	6	18387	18392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022119	CT	3	6	18435	18440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022119	TC	3	6	18635	18640	0 %	50 %	0 %	50 %	532423959
43	NC_022119	GA	3	6	18650	18655	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
44	NC_022119	GA	3	6	18749	18754	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
45	NC_022119	AG	3	6	19215	19220	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
46	NC_022119	AG	4	8	19501	19508	50 %	0 %	50 %	0 %	532423959
47	NC_022119	GT	3	6	19764	19769	0 %	50 %	50 %	0 %	532423959
48	NC_022119	TG	3	6	20105	20110	0 %	50 %	50 %	0 %	532423960
49	NC_022119	AG	3	6	20501	20506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022119	GA	3	6	20659	20664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022119	AG	3	6	21176	21181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022119	CT	3	6	21245	21250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022119	CT	4	8	21902	21909	0 %	50 %	0 %	50 %	532423961
54	NC_022119	AT	3	6	22172	22177	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
55	NC_022119	AT	3	6	22496	22501	50 %	50 %	0 %	0 %	532423961
56	NC_022119	GA	3	6	23815	23820	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
57	NC_022119	GA	3	6	23907	23912	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
58	NC_022119	AG	3	6	24288	24293	50 %	0 %	50 %	0 %	532423961
59	NC_022119	GA	3	6	25705	25710	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
60	NC_022119	GT	3	6	25725	25730	0 %	50 %	50 %	0 %	532423962
61	NC_022119	GA	3	6	26373	26378	50 %	0 %	50 %	0 %	532423962
62	NC_022119	GA	3	6	26497	26502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022119	CT	3	6	26504	26509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022119	AT	3	6	26790	26795	50 %	50 %	0 %	0 %	532423963
65	NC_022119	GA	3	6	27004	27009	50 %	0 %	50 %	0 %	532423963
66	NC_022119	TC	3	6	27872	27877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022119	AG	3	6	27955	27960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022119	TG	3	6	28378	28383	0 %	50 %	50 %	0 %	532423965
69	NC_022119	TC	3	6	28431	28436	0 %	50 %	0 %	50 %	532423965
70	NC_022119	GC	4	8	28845	28852	0 %	0 %	50 %	50 %	532423965
71	NC_022119	TA	3	6	28967	28972	50 %	50 %	0 %	0 %	532423965
72	NC_022119	GA	3	6	29918	29923	50 %	0 %	50 %	0 %	532423966
73	NC_022119	AG	3	6	30016	30021	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
74	NC_022119	TC	3	6	30125	30130	0 %	50 %	0 %	50 %	532423967
75	NC_022119	GA	3	6	30746	30751	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
76	NC_022119	GA	3	6	31214	31219	50 %	0 %	50 %	0 %	532423967
77	NC_022119	TC	3	6	31640	31645	0 %	50 %	0 %	50 %	532423969
78	NC_022119	CT	3	6	32120	32125	0 %	50 %	0 %	50 %	532423969
79	NC_022119	AG	3	6	32252	32257	50 %	0 %	50 %	0 %	532423969
80	NC_022119	TC	3	6	33749	33754	0 %	50 %	0 %	50 %	532423971
81	NC_022119	AG	3	6	33762	33767	50 %	0 %	50 %	0 %	532423971
82	NC_022119	AG	3	6	33900	33905	50 %	0 %	50 %	0 %	532423972
83	NC_022119	AG	3	6	34593	34598	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
84	NC_022119	GA	4	8	34616	34623	50 %	0 %	50 %	0 %	532423973
85	NC_022119	TG	3	6	35441	35446	0 %	50 %	50 %	0 %	532423974
86	NC_022119	GA	3	6	36369	36374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022119	AT	3	6	36471	36476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022119	GA	3	6	36519	36524	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
89	NC_022119	CT	3	6	37003	37008	0 %	50 %	0 %	50 %	532423975
90	NC_022119	AG	3	6	37514	37519	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
91	NC_022119	AG	3	6	38060	38065	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
92	NC_022119	AG	3	6	38587	38592	50 %	0 %	50 %	0 %	532423975
93	NC_022119	CT	3	6	38738	38743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022119	GA	3	6	39371	39376	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
95	NC_022119	AG	3	6	39508	39513	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
96	NC_022119	AG	3	6	39608	39613	50 %	0 %	50 %	0 %	532423976
97	NC_022119	CT	3	6	40109	40114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022119	AG	3	6	40585	40590	50 %	0 %	50 %	0 %	532423977
99	NC_022119	GC	3	6	40634	40639	0 %	0 %	50 %	50 %	532423977
100	NC_022119	GA	3	6	40799	40804	50 %	0 %	50 %	0 %	532423977
101	NC_022119	TC	3	6	40808	40813	0 %	50 %	0 %	50 %	532423977
102	NC_022119	GC	3	6	40873	40878	0 %	0 %	50 %	50 %	532423977
103	NC_022119	GA	3	6	41013	41018	50 %	0 %	50 %	0 %	532423977
104	NC_022119	GT	3	6	41451	41456	0 %	50 %	50 %	0 %	532423978
105	NC_022119	GA	3	6	41989	41994	50 %	0 %	50 %	0 %	532423978
106	NC_022119	GA	4	8	41999	42006	50 %	0 %	50 %	0 %	532423978
107	NC_022119	AG	3	6	42235	42240	50 %	0 %	50 %	0 %	532423978
108	NC_022119	CT	3	6	42301	42306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022119	GA	5	10	42576	42585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022119	AG	3	6	42700	42705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022119	TG	3	6	43063	43068	0 %	50 %	50 %	0 %	532423979
112	NC_022119	AC	3	6	43458	43463	50 %	0 %	0 %	50 %	532423980
113	NC_022119	TC	3	6	43627	43632	0 %	50 %	0 %	50 %	532423980
114	NC_022119	TC	3	6	43792	43797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022119	TA	3	6	43945	43950	50 %	50 %	0 %	0 %	532423981
116	NC_022119	TC	3	6	44857	44862	0 %	50 %	0 %	50 %	532423982
117	NC_022119	GA	3	6	45340	45345	50 %	0 %	50 %	0 %	532423983
118	NC_022119	TG	3	6	45558	45563	0 %	50 %	50 %	0 %	532423983
119	NC_022119	AG	3	6	45569	45574	50 %	0 %	50 %	0 %	532423983
120	NC_022119	AG	4	8	46011	46018	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
121	NC_022119	CT	3	6	46202	46207	0 %	50 %	0 %	50 %	532423984
122	NC_022119	TG	3	6	46403	46408	0 %	50 %	50 %	0 %	532423984
123	NC_022119	AG	3	6	46456	46461	50 %	0 %	50 %	0 %	532423984
124	NC_022119	AG	3	6	48028	48033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022119	AG	3	6	49379	49384	50 %	0 %	50 %	0 %	532423986
126	NC_022119	CA	3	6	50045	50050	50 %	0 %	0 %	50 %	532423987
127	NC_022119	TG	4	8	51375	51382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022119	TC	3	6	52888	52893	0 %	50 %	0 %	50 %	532423989
129	NC_022119	CA	3	6	52939	52944	50 %	0 %	0 %	50 %	532423989
130	NC_022119	GA	3	6	53360	53365	50 %	0 %	50 %	0 %	532423990
131	NC_022119	CT	3	6	53677	53682	0 %	50 %	0 %	50 %	532423990
132	NC_022119	CT	3	6	54346	54351	0 %	50 %	0 %	50 %	532423991
133	NC_022119	AT	3	6	55554	55559	50 %	50 %	0 %	0 %	532423991
134	NC_022119	GA	3	6	55591	55596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022119	AG	3	6	56190	56195	50 %	0 %	50 %	0 %	532424785
136	NC_022119	CT	3	6	56489	56494	0 %	50 %	0 %	50 %	532424785
137	NC_022119	GT	3	6	56539	56544	0 %	50 %	50 %	0 %	532424785
138	NC_022119	TG	3	6	57177	57182	0 %	50 %	50 %	0 %	532424785
139	NC_022119	CT	3	6	58058	58063	0 %	50 %	0 %	50 %	532424786
140	NC_022119	GA	3	6	59625	59630	50 %	0 %	50 %	0 %	532423992
141	NC_022119	GT	3	6	59763	59768	0 %	50 %	50 %	0 %	532423992
142	NC_022119	TC	3	6	60509	60514	0 %	50 %	0 %	50 %	532423993
143	NC_022119	GA	3	6	60737	60742	50 %	0 %	50 %	0 %	532424787
144	NC_022119	CA	3	6	61135	61140	50 %	0 %	0 %	50 %	532423994
145	NC_022119	AT	3	6	61385	61390	50 %	50 %	0 %	0 %	532423994
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