MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532421826
2	NC_022118	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532421827
3	NC_022118	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532421827
4	NC_022118	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532421827
5	NC_022118	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532421827
6	NC_022118	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532421828
7	NC_022118	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	532421830
8	NC_022118	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	532421831
9	NC_022118	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	532421832
10	NC_022118	CCTCT	2	10	10526	10535	0 %	40 %	0 %	60 %	532421833
11	NC_022118	AAAGG	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	532421833
12	NC_022118	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	532421834
13	NC_022118	AAAGA	2	10	13203	13212	80 %	0 %	20 %	0 %	532421835
14	NC_022118	GGTGT	2	10	13307	13316	0 %	40 %	60 %	0 %	532421835
15	NC_022118	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	532421837
16	NC_022118	CGTTC	2	10	16161	16170	0 %	40 %	20 %	40 %	532421838
17	NC_022118	GCTTC	2	10	16534	16543	0 %	40 %	20 %	40 %	532421838
18	NC_022118	GAAGG	2	10	16905	16914	40 %	0 %	60 %	0 %	532421838
19	NC_022118	GTTGT	2	10	20331	20340	0 %	60 %	40 %	0 %	532421841
20	NC_022118	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	532421842
21	NC_022118	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	532421842
22	NC_022118	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532421842
23	NC_022118	AGAGG	2	10	25533	25542	40 %	0 %	60 %	0 %	532421843
24	NC_022118	GGAGA	2	10	27312	27321	40 %	0 %	60 %	0 %	532421844
25	NC_022118	ATCCG	2	10	28063	28072	20 %	20 %	20 %	40 %	532421846
26	NC_022118	AGGGT	2	10	28581	28590	20 %	20 %	60 %	0 %	532421846
27	NC_022118	CCTAT	2	10	29621	29630	20 %	40 %	0 %	40 %	532421847
28	NC_022118	AAGGA	2	10	30421	30430	60 %	0 %	40 %	0 %	532421848
29	NC_022118	GAGCT	2	10	31460	31469	20 %	20 %	40 %	20 %	532421849
30	NC_022118	TCAGT	2	10	35699	35708	20 %	40 %	20 %	20 %	532421855
31	NC_022118	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	532421855
32	NC_022118	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	532421855
33	NC_022118	ACGAT	2	10	38096	38105	40 %	20 %	20 %	20 %	532421856
34	NC_022118	TTTGA	2	10	38461	38470	20 %	60 %	20 %	0 %	532421856
35	NC_022118	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	532421859
36	NC_022118	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	532421859
37	NC_022118	TTTAT	2	10	44242	44251	20 %	80 %	0 %	0 %	532421863
38	NC_022118	CTTTC	2	10	46339	46348	0 %	60 %	0 %	40 %	532421865
39	NC_022118	AGTTT	2	10	46878	46887	20 %	60 %	20 %	0 %	532421865
40	NC_022118	GAAGA	2	10	48011	48020	60 %	0 %	40 %	0 %	532421865
41	NC_022118	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	532421868
42	NC_022118	CCGTA	2	10	53816	53825	20 %	20 %	20 %	40 %	532421871
43	NC_022118	TTATC	2	10	55225	55234	20 %	60 %	0 %	20 %	532421872
44	NC_022118	TGAGT	2	10	55246	55255	20 %	40 %	40 %	0 %	532421872
45	NC_022118	GTTGT	2	10	56292	56301	0 %	60 %	40 %	0 %	532422665
46	NC_022118	GAGCA	2	10	59740	59749	40 %	0 %	40 %	20 %	532421873
47	NC_022118	TGTGA	2	10	62189	62198	20 %	40 %	40 %	0 %	532421875
48	NC_022118	AGTGA	2	10	63710	63719	40 %	20 %	40 %	0 %	532421876
49	NC_022118	CCTTC	2	10	63984	63993	0 %	40 %	0 %	60 %	532421876
50	NC_022118	AGGAG	2	10	66211	66220	40 %	0 %	60 %	0 %	532421878
51	NC_022118	GTTAA	2	10	66341	66350	40 %	40 %	20 %	0 %	532421878
52	NC_022118	GGAGC	2	10	69589	69598	20 %	0 %	60 %	20 %	532421881
53	NC_022118	GCGAT	2	10	69779	69788	20 %	20 %	40 %	20 %	532421881
54	NC_022118	CTCTT	2	10	70133	70142	0 %	60 %	0 %	40 %	532421881
55	NC_022118	AGGGG	2	10	70779	70788	20 %	0 %	80 %	0 %	532421881
56	NC_022118	AAGAA	2	10	70821	70830	80 %	0 %	20 %	0 %	532421881
57	NC_022118	CTTGC	2	10	71910	71919	0 %	40 %	20 %	40 %	532422668
58	NC_022118	ATTGG	2	10	72111	72120	20 %	40 %	40 %	0 %	532421883
59	NC_022118	GAAAA	2	10	73183	73192	80 %	0 %	20 %	0 %	532421883
60	NC_022118	TGGGA	2	10	73600	73609	20 %	20 %	60 %	0 %	532421884
61	NC_022118	TATTT	2	10	76127	76136	20 %	80 %	0 %	0 %	532421885
62	NC_022118	TGTCT	2	10	79920	79929	0 %	60 %	20 %	20 %	532421888
63	NC_022118	TTACT	2	10	80427	80436	20 %	60 %	0 %	20 %	532421888
64	NC_022118	AGAAA	2	10	81817	81826	80 %	0 %	20 %	0 %	532421890
65	NC_022118	GGAAG	2	10	82330	82339	40 %	0 %	60 %	0 %	532421890
66	NC_022118	AGCGA	2	10	84796	84805	40 %	0 %	40 %	20 %	532421892
67	NC_022118	GATCC	2	10	85881	85890	20 %	20 %	20 %	40 %	532421893
68	NC_022118	AGAGC	2	10	87216	87225	40 %	0 %	40 %	20 %	532422670
69	NC_022118	TTTTC	2	10	90948	90957	0 %	80 %	0 %	20 %	532421896
70	NC_022118	GGATG	2	10	91208	91217	20 %	20 %	60 %	0 %	532421897
71	NC_022118	CAACA	2	10	92746	92755	60 %	0 %	0 %	40 %	532421898
72	NC_022118	ACAGC	2	10	93790	93799	40 %	0 %	20 %	40 %	532421900
73	NC_022118	GGAAC	2	10	94503	94512	40 %	0 %	40 %	20 %	532421901
74	NC_022118	GGATT	2	10	95403	95412	20 %	40 %	40 %	0 %	532421901
75	NC_022118	TTTGC	2	10	96639	96648	0 %	60 %	20 %	20 %	532421903
76	NC_022118	ATTCA	2	10	96903	96912	40 %	40 %	0 %	20 %	532421903
77	NC_022118	GATCC	2	10	97162	97171	20 %	20 %	20 %	40 %	532421903
78	NC_022118	GTTTT	2	10	97583	97592	0 %	80 %	20 %	0 %	532421903
79	NC_022118	AAGCT	2	10	98785	98794	40 %	20 %	20 %	20 %	532421904
80	NC_022118	AGGGG	2	10	99144	99153	20 %	0 %	80 %	0 %	532421904
81	NC_022118	ATAGC	2	10	99843	99852	40 %	20 %	20 %	20 %	532421905
82	NC_022118	AGCGA	2	10	102770	102779	40 %	0 %	40 %	20 %	532421908
83	NC_022118	TTTCT	2	10	103128	103137	0 %	80 %	0 %	20 %	532421908
84	NC_022118	ATCAT	2	10	104334	104343	40 %	40 %	0 %	20 %	532421909
85	NC_022118	GGCAT	2	10	105042	105051	20 %	20 %	40 %	20 %	532421909
86	NC_022118	AAAGC	2	10	108768	108777	60 %	0 %	20 %	20 %	532421912
87	NC_022118	GCATT	2	10	109928	109937	20 %	40 %	20 %	20 %	532421913
88	NC_022118	TGTTT	2	10	114605	114614	0 %	80 %	20 %	0 %	532421915
89	NC_022118	CATGT	2	10	114983	114992	20 %	40 %	20 %	20 %	532421915
90	NC_022118	TATCG	2	10	115687	115696	20 %	40 %	20 %	20 %	532421915
91	NC_022118	TTTCT	2	10	116203	116212	0 %	80 %	0 %	20 %	532421916
92	NC_022118	AAAGA	2	10	118448	118457	80 %	0 %	20 %	0 %	532421918
93	NC_022118	GCTTC	2	10	122438	122447	0 %	40 %	20 %	40 %	532421921
94	NC_022118	TACAA	2	10	126226	126235	60 %	20 %	0 %	20 %	532421925
95	NC_022118	ATCCA	2	10	128634	128643	40 %	20 %	0 %	40 %	532421928
96	NC_022118	GAAGA	2	10	130184	130193	60 %	0 %	40 %	0 %	532421928
97	NC_022118	AAAAG	2	10	132097	132106	80 %	0 %	20 %	0 %	532421929
98	NC_022118	GATTC	2	10	132428	132437	20 %	40 %	20 %	20 %	532421929
99	NC_022118	ATTGG	2	10	135713	135722	20 %	40 %	40 %	0 %	532421932
100	NC_022118	TGTTT	2	10	136172	136181	0 %	80 %	20 %	0 %	532421933
101	NC_022118	TCCAG	2	10	139918	139927	20 %	20 %	20 %	40 %	532421938
102	NC_022118	GTACA	2	10	140649	140658	40 %	20 %	20 %	20 %	532421939
103	NC_022118	TAGAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	532421939
104	NC_022118	AAAAG	2	10	141424	141433	80 %	0 %	20 %	0 %	532422678
105	NC_022118	AAAAC	2	10	141904	141913	80 %	0 %	0 %	20 %	532421940
106	NC_022118	TGCTA	2	10	142990	142999	20 %	40 %	20 %	20 %	532421942
107	NC_022118	GGAGC	2	10	143037	143046	20 %	0 %	60 %	20 %	532421942
108	NC_022118	CTGGG	2	10	144451	144460	0 %	20 %	60 %	20 %	532421944
109	NC_022118	GTTTT	2	10	145198	145207	0 %	80 %	20 %	0 %	532421945
110	NC_022118	GAACC	2	10	148932	148941	40 %	0 %	20 %	40 %	532421946
111	NC_022118	ATTCT	2	10	152427	152436	20 %	60 %	0 %	20 %	532421950
112	NC_022118	CTGTG	2	10	152631	152640	0 %	40 %	40 %	20 %	532421950
113	NC_022118	TTCTT	2	10	155104	155113	0 %	80 %	0 %	20 %	532421953
114	NC_022118	AGGAA	2	10	159662	159671	60 %	0 %	40 %	0 %	532421957
115	NC_022118	AGAGA	2	10	162893	162902	60 %	0 %	40 %	0 %	532421960
116	NC_022118	AGCAA	2	10	163328	163337	60 %	0 %	20 %	20 %	532421960
117	NC_022118	CAAAA	2	10	166831	166840	80 %	0 %	0 %	20 %	532421962
118	NC_022118	AAGAG	2	10	167664	167673	60 %	0 %	40 %	0 %	532421962
119	NC_022118	GATTG	2	10	168009	168018	20 %	40 %	40 %	0 %	532421962
120	NC_022118	GTTTT	2	10	174489	174498	0 %	80 %	20 %	0 %	532421966
121	NC_022118	TATTG	2	10	174512	174521	20 %	60 %	20 %	0 %	532421966
122	NC_022118	CAGCA	2	10	174871	174880	40 %	0 %	20 %	40 %	532421966
123	NC_022118	TAGGA	2	10	175176	175185	40 %	20 %	40 %	0 %	532421967
124	NC_022118	TGATT	2	10	177103	177112	20 %	60 %	20 %	0 %	532421968
125	NC_022118	TCAAT	2	10	177744	177753	40 %	40 %	0 %	20 %	532421968
126	NC_022118	TTTTC	2	10	177783	177792	0 %	80 %	0 %	20 %	532421968
127	NC_022118	GGAAT	2	10	179349	179358	40 %	20 %	40 %	0 %	532422679
128	NC_022118	AGAGT	2	10	180307	180316	40 %	20 %	40 %	0 %	532421969
129	NC_022118	TTGAA	2	10	180840	180849	40 %	40 %	20 %	0 %	532421970
130	NC_022118	TTGAG	2	10	182400	182409	20 %	40 %	40 %	0 %	532422680
131	NC_022118	GAATG	2	10	182425	182434	40 %	20 %	40 %	0 %	532422680
132	NC_022118	AGAGA	2	10	184468	184477	60 %	0 %	40 %	0 %	532421972
133	NC_022118	ACGAT	2	10	186540	186549	40 %	20 %	20 %	20 %	532421974
134	NC_022118	GGATC	2	10	189630	189639	20 %	20 %	40 %	20 %	532422683
135	NC_022118	CAGAT	2	10	189745	189754	40 %	20 %	20 %	20 %	532422683
136	NC_022118	ACGAT	2	10	190664	190673	40 %	20 %	20 %	20 %	532422684
137	NC_022118	TTGTA	2	10	191642	191651	20 %	60 %	20 %	0 %	532422684
138	NC_022118	TATGC	2	10	192047	192056	20 %	40 %	20 %	20 %	532422685
139	NC_022118	AAGAA	2	10	192213	192222	80 %	0 %	20 %	0 %	532422685
140	NC_022118	AAAAG	2	10	192342	192351	80 %	0 %	20 %	0 %	532421975
141	NC_022118	TATCA	2	10	192415	192424	40 %	40 %	0 %	20 %	532421975
142	NC_022118	GATCT	2	10	192561	192570	20 %	40 %	20 %	20 %	532421975
143	NC_022118	GATTA	2	10	193814	193823	40 %	40 %	20 %	0 %	532421976
144	NC_022118	AGAAA	2	10	196518	196527	80 %	0 %	20 %	0 %	532421978
145	NC_022118	CTCTA	2	10	200918	200927	20 %	40 %	0 %	40 %	532421982
146	NC_022118	CAAGA	2	10	203150	203159	60 %	0 %	20 %	20 %	532421985
147	NC_022118	CTTTA	2	10	204197	204206	20 %	60 %	0 %	20 %	532421986
148	NC_022118	AAACC	2	10	205022	205031	60 %	0 %	0 %	40 %	532421987
149	NC_022118	GGGAA	2	10	205535	205544	40 %	0 %	60 %	0 %	532421987
150	NC_022118	CTCTG	2	10	206949	206958	0 %	40 %	20 %	40 %	532421989
151	NC_022118	TGTTT	2	10	214329	214338	0 %	80 %	20 %	0 %	532421994
152	NC_022118	CTTGT	2	10	214510	214519	0 %	60 %	20 %	20 %	532421994
153	NC_022118	TTTCT	2	10	215360	215369	0 %	80 %	0 %	20 %	532421994
154	NC_022118	AAATA	2	10	220543	220552	80 %	20 %	0 %	0 %	532421999
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159	NC_022118	TCCTC	2	10	228528	228537	0 %	40 %	0 %	60 %	532422007
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174	NC_022118	GCAAA	2	10	254324	254333	60 %	0 %	20 %	20 %	532422032
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187	NC_022118	TCCCT	2	10	274107	274116	0 %	40 %	0 %	60 %	532422050
188	NC_022118	ATCCT	2	10	274411	274420	20 %	40 %	0 %	40 %	532422050
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193	NC_022118	AACTT	2	10	277875	277884	40 %	40 %	0 %	20 %	532422053
194	NC_022118	ATGCT	2	10	278738	278747	20 %	40 %	20 %	20 %	532422053
195	NC_022118	GCTGT	2	10	285137	285146	0 %	40 %	40 %	20 %	532422058
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209	NC_022118	CTTGG	2	10	312387	312396	0 %	40 %	40 %	20 %	532422086
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234	NC_022118	ATCTC	2	10	351160	351169	20 %	40 %	0 %	40 %	532422117
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239	NC_022118	GCTCA	2	10	365027	365036	20 %	20 %	20 %	40 %	532422127
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243	NC_022118	CGTCT	2	10	371128	371137	0 %	40 %	20 %	40 %	532422132
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246	NC_022118	CCCTC	2	10	375988	375997	0 %	20 %	0 %	80 %	532422137
247	NC_022118	TACAC	2	10	376187	376196	40 %	20 %	0 %	40 %	532422137
248	NC_022118	CCAAT	2	10	379817	379826	40 %	20 %	0 %	40 %	532422137
249	NC_022118	ACAGC	2	10	382106	382115	40 %	0 %	20 %	40 %	532422138
250	NC_022118	AAATC	2	10	382550	382559	60 %	20 %	0 %	20 %	532422138
251	NC_022118	TATTC	2	10	386943	386952	20 %	60 %	0 %	20 %	532422143
252	NC_022118	ATTTT	2	10	387082	387091	20 %	80 %	0 %	0 %	532422143
253	NC_022118	TGGCA	2	10	392373	392382	20 %	20 %	40 %	20 %	532422148
254	NC_022118	GTCTT	2	10	392459	392468	0 %	60 %	20 %	20 %	532422148
255	NC_022118	AACAA	2	10	393659	393668	80 %	0 %	0 %	20 %	532422148
256	NC_022118	TTGTT	2	10	394999	395008	0 %	80 %	20 %	0 %	532422149
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258	NC_022118	TGAAA	2	10	398181	398190	60 %	20 %	20 %	0 %	532422152
259	NC_022118	ATCAA	2	10	398221	398230	60 %	20 %	0 %	20 %	532422152
260	NC_022118	CAAGT	2	10	398291	398300	40 %	20 %	20 %	20 %	532422152
261	NC_022118	GTCAA	2	10	398578	398587	40 %	20 %	20 %	20 %	532422152
262	NC_022118	AAAGT	2	10	400712	400721	60 %	20 %	20 %	0 %	532422154
263	NC_022118	CCTCT	2	10	403199	403208	0 %	40 %	0 %	60 %	532422155
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265	NC_022118	CCTCT	2	10	404226	404235	0 %	40 %	0 %	60 %	532422157
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380	NC_022118	CTATG	2	10	578528	578537	20 %	40 %	20 %	20 %	532422297
381	NC_022118	GCTTA	2	10	578840	578849	20 %	40 %	20 %	20 %	532422297
382	NC_022118	TCGAA	2	10	579840	579849	40 %	20 %	20 %	20 %	532422299
383	NC_022118	ATTTC	2	10	584857	584866	20 %	60 %	0 %	20 %	532422306
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385	NC_022118	AAATA	2	10	587622	587631	80 %	20 %	0 %	0 %	532422309
386	NC_022118	GTTGT	2	10	588329	588338	0 %	60 %	40 %	0 %	532422310
387	NC_022118	AAACT	2	10	588962	588971	60 %	20 %	0 %	20 %	532422311
388	NC_022118	ATCAC	2	10	591614	591623	40 %	20 %	0 %	40 %	532422316
389	NC_022118	ATCCA	2	10	601951	601960	40 %	20 %	0 %	40 %	532422330
390	NC_022118	AAACC	2	10	602120	602129	60 %	0 %	0 %	40 %	532422330
391	NC_022118	AGCCC	2	10	602737	602746	20 %	0 %	20 %	60 %	532422330
392	NC_022118	AAAGT	2	10	603046	603055	60 %	20 %	20 %	0 %	532422331
393	NC_022118	ACTTC	2	10	607059	607068	20 %	40 %	0 %	40 %	532422337
394	NC_022118	ATTTT	2	10	608131	608140	20 %	80 %	0 %	0 %	532422338
395	NC_022118	TGCCA	2	10	611487	611496	20 %	20 %	20 %	40 %	532422340
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