MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 2539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532421824
2	NC_022118	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532421825
3	NC_022118	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532421825
4	NC_022118	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532421826
5	NC_022118	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532421826
6	NC_022118	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532421826
7	NC_022118	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532421827
8	NC_022118	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532421827
9	NC_022118	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532421827
10	NC_022118	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532421827
11	NC_022118	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532421828
12	NC_022118	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532421828
13	NC_022118	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532421828
14	NC_022118	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532421829
15	NC_022118	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532421829
16	NC_022118	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532422663
17	NC_022118	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532422663
18	NC_022118	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532421830
19	NC_022118	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532421831
20	NC_022118	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532421831
21	NC_022118	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532421831
22	NC_022118	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532421831
23	NC_022118	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532421832
24	NC_022118	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532421832
25	NC_022118	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532421832
26	NC_022118	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	532421833
27	NC_022118	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	532421833
28	NC_022118	AGCC	2	8	10656	10663	25 %	0 %	25 %	50 %	532421833
29	NC_022118	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	532421833
30	NC_022118	AATG	2	8	11542	11549	50 %	25 %	25 %	0 %	532421834
31	NC_022118	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	532421835
32	NC_022118	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	532421835
33	NC_022118	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	532421836
34	NC_022118	TTCT	2	8	14211	14218	0 %	75 %	0 %	25 %	532421836
35	NC_022118	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	532421836
36	NC_022118	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	532421837
37	NC_022118	AAAT	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	532421837
38	NC_022118	GTAA	2	8	16403	16410	50 %	25 %	25 %	0 %	532421838
39	NC_022118	CTAA	2	8	16596	16603	50 %	25 %	0 %	25 %	532421838
40	NC_022118	AGAA	2	8	16859	16866	75 %	0 %	25 %	0 %	532421838
41	NC_022118	ATTT	2	8	17005	17012	25 %	75 %	0 %	0 %	532421838
42	NC_022118	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	532421840
43	NC_022118	GAAG	2	8	19511	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
44	NC_022118	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	532421840
45	NC_022118	TGTA	2	8	20229	20236	25 %	50 %	25 %	0 %	532421841
46	NC_022118	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	532421842
47	NC_022118	CATT	2	8	22704	22711	25 %	50 %	0 %	25 %	532421842
48	NC_022118	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532421842
49	NC_022118	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532421842
50	NC_022118	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532421842
51	NC_022118	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532421842
52	NC_022118	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532421842
53	NC_022118	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532421842
54	NC_022118	TTGA	2	8	25055	25062	25 %	50 %	25 %	0 %	532421843
55	NC_022118	TTCG	2	8	25200	25207	0 %	50 %	25 %	25 %	532421843
56	NC_022118	TAGG	2	8	25279	25286	25 %	25 %	50 %	0 %	532421843
57	NC_022118	TTCC	2	8	25403	25410	0 %	50 %	0 %	50 %	532421843
58	NC_022118	TAGG	2	8	25517	25524	25 %	25 %	50 %	0 %	532421843
59	NC_022118	TTTC	2	8	25952	25959	0 %	75 %	0 %	25 %	532421843
60	NC_022118	GCTT	2	8	26289	26296	0 %	50 %	25 %	25 %	532421843
61	NC_022118	GGAA	2	8	26872	26879	50 %	0 %	50 %	0 %	532421844
62	NC_022118	TTAA	2	8	26945	26952	50 %	50 %	0 %	0 %	532421844
63	NC_022118	AAAG	2	8	26995	27002	75 %	0 %	25 %	0 %	532421844
64	NC_022118	GGGC	2	8	27275	27282	0 %	0 %	75 %	25 %	532421844
65	NC_022118	GTTT	2	8	27558	27565	0 %	75 %	25 %	0 %	532421845
66	NC_022118	CAGA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	25 %	25 %	532421845
67	NC_022118	CTTT	2	8	29552	29559	0 %	75 %	0 %	25 %	532421847
68	NC_022118	TTTG	2	8	29567	29574	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
69	NC_022118	TTGT	2	8	29602	29609	0 %	75 %	25 %	0 %	532421847
70	NC_022118	TGGC	2	8	29765	29772	0 %	25 %	50 %	25 %	532421847
71	NC_022118	AAAG	2	8	30325	30332	75 %	0 %	25 %	0 %	532421848
72	NC_022118	AAAC	2	8	30395	30402	75 %	0 %	0 %	25 %	532421848
73	NC_022118	GATG	2	8	30538	30545	25 %	25 %	50 %	0 %	532421848
74	NC_022118	GATA	2	8	31647	31654	50 %	25 %	25 %	0 %	532421850
75	NC_022118	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	532421853
76	NC_022118	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	532421853
77	NC_022118	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	532421854
78	NC_022118	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	532421854
79	NC_022118	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	532421855
80	NC_022118	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	532421855
81	NC_022118	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	532421855
82	NC_022118	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	532421855
83	NC_022118	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	532421855
84	NC_022118	CTTT	2	8	36636	36643	0 %	75 %	0 %	25 %	532421856
85	NC_022118	ATGA	2	8	37126	37133	50 %	25 %	25 %	0 %	532421856
86	NC_022118	TAGG	2	8	37285	37292	25 %	25 %	50 %	0 %	532421856
87	NC_022118	CAAT	2	8	37469	37476	50 %	25 %	0 %	25 %	532421856
88	NC_022118	AATG	2	8	38256	38263	50 %	25 %	25 %	0 %	532421856
89	NC_022118	AGAA	2	8	39093	39100	75 %	0 %	25 %	0 %	532421857
90	NC_022118	AAGA	2	8	39145	39152	75 %	0 %	25 %	0 %	532421857
91	NC_022118	ATCC	2	8	39153	39160	25 %	25 %	0 %	50 %	532421857
92	NC_022118	TAAT	2	8	39364	39371	50 %	50 %	0 %	0 %	532421857
93	NC_022118	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	532421859
94	NC_022118	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	532421859
95	NC_022118	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	532421859
96	NC_022118	AAAC	2	8	43232	43239	75 %	0 %	0 %	25 %	532421861
97	NC_022118	CAAT	2	8	43436	43443	50 %	25 %	0 %	25 %	532421861
98	NC_022118	ATTT	2	8	44193	44200	25 %	75 %	0 %	0 %	532421863
99	NC_022118	GCTC	2	8	44501	44508	0 %	25 %	25 %	50 %	532421863
100	NC_022118	TTCT	2	8	44643	44650	0 %	75 %	0 %	25 %	532421863
101	NC_022118	TTGA	2	8	45243	45250	25 %	50 %	25 %	0 %	532421864
102	NC_022118	TGTT	2	8	45415	45422	0 %	75 %	25 %	0 %	532421864
103	NC_022118	CTAT	2	8	45445	45452	25 %	50 %	0 %	25 %	532421864
104	NC_022118	TGTT	2	8	45474	45481	0 %	75 %	25 %	0 %	532421864
105	NC_022118	CTAT	2	8	45770	45777	25 %	50 %	0 %	25 %	532421864
106	NC_022118	AAGA	2	8	46266	46273	75 %	0 %	25 %	0 %	532421865
107	NC_022118	AAGA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	532421865
108	NC_022118	AAAG	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	532421865
109	NC_022118	AAGA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	25 %	0 %	532421865
110	NC_022118	ACTT	2	8	46739	46746	25 %	50 %	0 %	25 %	532421865
111	NC_022118	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	532421865
112	NC_022118	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
113	NC_022118	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	532421865
114	NC_022118	AAGT	2	8	47978	47985	50 %	25 %	25 %	0 %	532421865
115	NC_022118	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	532421866
116	NC_022118	CTTT	2	8	48383	48390	0 %	75 %	0 %	25 %	532421866
117	NC_022118	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	532421867
118	NC_022118	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	532421867
119	NC_022118	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	532421868
120	NC_022118	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	532421868
121	NC_022118	TCTA	2	8	51353	51360	25 %	50 %	0 %	25 %	532421868
122	NC_022118	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	532421870
123	NC_022118	TTAA	2	8	53152	53159	50 %	50 %	0 %	0 %	532421870
124	NC_022118	CCTT	2	8	53359	53366	0 %	50 %	0 %	50 %	532421871
125	NC_022118	TTTA	2	8	53526	53533	25 %	75 %	0 %	0 %	532421871
126	NC_022118	AAAG	2	8	53750	53757	75 %	0 %	25 %	0 %	532421871
127	NC_022118	GATT	2	8	53887	53894	25 %	50 %	25 %	0 %	532421871
128	NC_022118	AATC	2	8	53942	53949	50 %	25 %	0 %	25 %	532421871
129	NC_022118	GGAT	2	8	54235	54242	25 %	25 %	50 %	0 %	532421872
130	NC_022118	TCGA	2	8	54397	54404	25 %	25 %	25 %	25 %	532421872
131	NC_022118	CTTC	2	8	54491	54498	0 %	50 %	0 %	50 %	532421872
132	NC_022118	GAAT	2	8	54526	54533	50 %	25 %	25 %	0 %	532421872
133	NC_022118	TTGA	2	8	54596	54603	25 %	50 %	25 %	0 %	532421872
134	NC_022118	GGAA	2	8	54952	54959	50 %	0 %	50 %	0 %	532421872
135	NC_022118	CTGG	3	12	55862	55873	0 %	25 %	50 %	25 %	532422665
136	NC_022118	TTGC	2	8	55999	56006	0 %	50 %	25 %	25 %	532422665
137	NC_022118	AGCT	2	8	56498	56505	25 %	25 %	25 %	25 %	532422665
138	NC_022118	GGTT	2	8	57201	57208	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
139	NC_022118	AGAA	2	8	58062	58069	75 %	0 %	25 %	0 %	532422666
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141	NC_022118	TAGA	2	8	58781	58788	50 %	25 %	25 %	0 %	532422666
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