MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 2380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022118	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022118	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022118	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
5	NC_022118	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
6	NC_022118	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532421827
7	NC_022118	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532421828
8	NC_022118	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
9	NC_022118	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532421828
10	NC_022118	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532421828
11	NC_022118	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
12	NC_022118	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532421829
13	NC_022118	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022118	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	532421830
15	NC_022118	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	532421831
16	NC_022118	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	532421831
17	NC_022118	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	532421831
18	NC_022118	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022118	GA	3	6	9867	9872	50 %	0 %	50 %	0 %	532421833
20	NC_022118	AG	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	532421833
21	NC_022118	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022118	AG	3	6	11310	11315	50 %	0 %	50 %	0 %	532421834
23	NC_022118	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	532421834
24	NC_022118	TG	3	6	12773	12778	0 %	50 %	50 %	0 %	532421835
25	NC_022118	AG	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	532421835
26	NC_022118	TC	3	6	13056	13061	0 %	50 %	0 %	50 %	532421835
27	NC_022118	AG	4	8	13078	13085	50 %	0 %	50 %	0 %	532421835
28	NC_022118	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022118	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022118	AC	3	6	14407	14412	50 %	0 %	0 %	50 %	532421836
31	NC_022118	AG	3	6	15746	15751	50 %	0 %	50 %	0 %	532421837
32	NC_022118	TC	3	6	15786	15791	0 %	50 %	0 %	50 %	532421837
33	NC_022118	GA	3	6	16315	16320	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
34	NC_022118	AG	3	6	16386	16391	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
35	NC_022118	GA	3	6	17170	17175	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
36	NC_022118	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022118	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022118	GA	3	6	17773	17778	50 %	0 %	50 %	0 %	532421839
39	NC_022118	TC	3	6	18223	18228	0 %	50 %	0 %	50 %	532421839
40	NC_022118	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	532421840
41	NC_022118	TC	3	6	18651	18656	0 %	50 %	0 %	50 %	532421840
42	NC_022118	GA	3	6	18666	18671	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
43	NC_022118	GA	3	6	18765	18770	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
44	NC_022118	AG	3	6	19231	19236	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
45	NC_022118	AG	4	8	19517	19524	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
46	NC_022118	GT	3	6	19780	19785	0 %	50 %	50 %	0 %	532421840
47	NC_022118	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	532421841
48	NC_022118	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022118	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022118	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022118	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022118	CT	4	8	21918	21925	0 %	50 %	0 %	50 %	532421842
53	NC_022118	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
54	NC_022118	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
55	NC_022118	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
56	NC_022118	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
57	NC_022118	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
58	NC_022118	GA	3	6	25721	25726	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
59	NC_022118	GT	3	6	25741	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	532421843
60	NC_022118	GA	3	6	26389	26394	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
61	NC_022118	GA	3	6	26513	26518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022118	CT	3	6	26520	26525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022118	AT	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	532421844
64	NC_022118	GA	3	6	27020	27025	50 %	0 %	50 %	0 %	532421844
65	NC_022118	TC	3	6	27888	27893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022118	AG	3	6	27971	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022118	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	532421846
68	NC_022118	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	532421846
69	NC_022118	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	532421846
70	NC_022118	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	532421846
71	NC_022118	GA	3	6	29934	29939	50 %	0 %	50 %	0 %	532421847
72	NC_022118	AG	3	6	30032	30037	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
73	NC_022118	TC	3	6	30141	30146	0 %	50 %	0 %	50 %	532421848
74	NC_022118	GA	3	6	30762	30767	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
75	NC_022118	GA	3	6	31230	31235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
76	NC_022118	TC	3	6	31656	31661	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
77	NC_022118	CT	3	6	32136	32141	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
78	NC_022118	AG	3	6	32268	32273	50 %	0 %	50 %	0 %	532421850
79	NC_022118	TC	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	532421852
80	NC_022118	AG	3	6	33778	33783	50 %	0 %	50 %	0 %	532421852
81	NC_022118	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	532421853
82	NC_022118	AG	3	6	34608	34613	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
83	NC_022118	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
84	NC_022118	TG	3	6	35456	35461	0 %	50 %	50 %	0 %	532421855
85	NC_022118	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022118	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022118	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
88	NC_022118	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	532421856
89	NC_022118	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
90	NC_022118	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
91	NC_022118	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
92	NC_022118	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022118	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
94	NC_022118	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
95	NC_022118	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
96	NC_022118	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022118	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	532421858
98	NC_022118	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	532421858
99	NC_022118	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	532421858
100	NC_022118	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	532421858
101	NC_022118	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	532421858
102	NC_022118	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	532421858
103	NC_022118	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	532421859
104	NC_022118	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
105	NC_022118	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
106	NC_022118	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
107	NC_022118	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022118	GA	5	10	42591	42600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022118	AG	3	6	42715	42720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022118	TG	3	6	43078	43083	0 %	50 %	50 %	0 %	532421860
111	NC_022118	AC	3	6	43473	43478	50 %	0 %	0 %	50 %	532421861
112	NC_022118	TC	3	6	43642	43647	0 %	50 %	0 %	50 %	532421861
113	NC_022118	TC	3	6	43807	43812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022118	TA	3	6	43960	43965	50 %	50 %	0 %	0 %	532421862
115	NC_022118	TC	3	6	44872	44877	0 %	50 %	0 %	50 %	532421863
116	NC_022118	GA	3	6	45355	45360	50 %	0 %	50 %	0 %	532421864
117	NC_022118	TG	3	6	45573	45578	0 %	50 %	50 %	0 %	532421864
118	NC_022118	AG	3	6	45584	45589	50 %	0 %	50 %	0 %	532421864
119	NC_022118	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
120	NC_022118	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	532421865
121	NC_022118	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	532421865
122	NC_022118	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
123	NC_022118	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022118	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	532421867
125	NC_022118	CA	3	6	50061	50066	50 %	0 %	0 %	50 %	532421868
126	NC_022118	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022118	TC	3	6	52904	52909	0 %	50 %	0 %	50 %	532421870
128	NC_022118	CA	3	6	52955	52960	50 %	0 %	0 %	50 %	532421870
129	NC_022118	GA	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	532421871
130	NC_022118	CT	3	6	53693	53698	0 %	50 %	0 %	50 %	532421871
131	NC_022118	CT	3	6	54362	54367	0 %	50 %	0 %	50 %	532421872
132	NC_022118	AT	3	6	55570	55575	50 %	50 %	0 %	0 %	532421872
133	NC_022118	GA	3	6	55607	55612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022118	AG	3	6	56205	56210	50 %	0 %	50 %	0 %	532422665
135	NC_022118	CT	3	6	56504	56509	0 %	50 %	0 %	50 %	532422665
136	NC_022118	GT	3	6	56554	56559	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
137	NC_022118	TG	3	6	57192	57197	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
138	NC_022118	CT	3	6	58073	58078	0 %	50 %	0 %	50 %	532422666
139	NC_022118	GA	3	6	59640	59645	50 %	0 %	50 %	0 %	532421873
140	NC_022118	GT	3	6	59778	59783	0 %	50 %	50 %	0 %	532421873
141	NC_022118	TC	3	6	60526	60531	0 %	50 %	0 %	50 %	532421874
142	NC_022118	GA	3	6	60754	60759	50 %	0 %	50 %	0 %	532422667
143	NC_022118	CA	3	6	61152	61157	50 %	0 %	0 %	50 %	532421875
144	NC_022118	AT	3	6	61402	61407	50 %	50 %	0 %	0 %	532421875
145	NC_022118	GA	3	6	61425	61430	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
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