MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 2099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
2	NC_022118	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
3	NC_022118	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532421827
4	NC_022118	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532421828
5	NC_022118	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
6	NC_022118	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532421828
7	NC_022118	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532421828
8	NC_022118	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
9	NC_022118	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532421829
10	NC_022118	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	532421830
11	NC_022118	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	532421831
12	NC_022118	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	532421831
13	NC_022118	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	532421831
14	NC_022118	GA	3	6	9867	9872	50 %	0 %	50 %	0 %	532421833
15	NC_022118	AG	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	532421833
16	NC_022118	AG	3	6	11310	11315	50 %	0 %	50 %	0 %	532421834
17	NC_022118	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	532421834
18	NC_022118	TG	3	6	12773	12778	0 %	50 %	50 %	0 %	532421835
19	NC_022118	AG	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	532421835
20	NC_022118	TC	3	6	13056	13061	0 %	50 %	0 %	50 %	532421835
21	NC_022118	AG	4	8	13078	13085	50 %	0 %	50 %	0 %	532421835
22	NC_022118	AC	3	6	14407	14412	50 %	0 %	0 %	50 %	532421836
23	NC_022118	AG	3	6	15746	15751	50 %	0 %	50 %	0 %	532421837
24	NC_022118	TC	3	6	15786	15791	0 %	50 %	0 %	50 %	532421837
25	NC_022118	GA	3	6	16315	16320	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
26	NC_022118	AG	3	6	16386	16391	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
27	NC_022118	GA	3	6	17170	17175	50 %	0 %	50 %	0 %	532421838
28	NC_022118	GA	3	6	17773	17778	50 %	0 %	50 %	0 %	532421839
29	NC_022118	TC	3	6	18223	18228	0 %	50 %	0 %	50 %	532421839
30	NC_022118	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	532421840
31	NC_022118	TC	3	6	18651	18656	0 %	50 %	0 %	50 %	532421840
32	NC_022118	GA	3	6	18666	18671	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
33	NC_022118	GA	3	6	18765	18770	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
34	NC_022118	AG	3	6	19231	19236	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
35	NC_022118	AG	4	8	19517	19524	50 %	0 %	50 %	0 %	532421840
36	NC_022118	GT	3	6	19780	19785	0 %	50 %	50 %	0 %	532421840
37	NC_022118	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	532421841
38	NC_022118	CT	4	8	21918	21925	0 %	50 %	0 %	50 %	532421842
39	NC_022118	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
40	NC_022118	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
41	NC_022118	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
42	NC_022118	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
43	NC_022118	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	532421842
44	NC_022118	GA	3	6	25721	25726	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
45	NC_022118	GT	3	6	25741	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	532421843
46	NC_022118	GA	3	6	26389	26394	50 %	0 %	50 %	0 %	532421843
47	NC_022118	AT	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	532421844
48	NC_022118	GA	3	6	27020	27025	50 %	0 %	50 %	0 %	532421844
49	NC_022118	TG	3	6	28394	28399	0 %	50 %	50 %	0 %	532421846
50	NC_022118	TC	3	6	28447	28452	0 %	50 %	0 %	50 %	532421846
51	NC_022118	GC	4	8	28861	28868	0 %	0 %	50 %	50 %	532421846
52	NC_022118	TA	3	6	28983	28988	50 %	50 %	0 %	0 %	532421846
53	NC_022118	GA	3	6	29934	29939	50 %	0 %	50 %	0 %	532421847
54	NC_022118	AG	3	6	30032	30037	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
55	NC_022118	TC	3	6	30141	30146	0 %	50 %	0 %	50 %	532421848
56	NC_022118	GA	3	6	30762	30767	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
57	NC_022118	GA	3	6	31230	31235	50 %	0 %	50 %	0 %	532421848
58	NC_022118	TC	3	6	31656	31661	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
59	NC_022118	CT	3	6	32136	32141	0 %	50 %	0 %	50 %	532421850
60	NC_022118	AG	3	6	32268	32273	50 %	0 %	50 %	0 %	532421850
61	NC_022118	TC	3	6	33765	33770	0 %	50 %	0 %	50 %	532421852
62	NC_022118	AG	3	6	33778	33783	50 %	0 %	50 %	0 %	532421852
63	NC_022118	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	532421853
64	NC_022118	AG	3	6	34608	34613	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
65	NC_022118	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	532421854
66	NC_022118	TG	3	6	35456	35461	0 %	50 %	50 %	0 %	532421855
67	NC_022118	GA	3	6	36534	36539	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
68	NC_022118	CT	3	6	37018	37023	0 %	50 %	0 %	50 %	532421856
69	NC_022118	AG	3	6	37529	37534	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
70	NC_022118	AG	3	6	38075	38080	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
71	NC_022118	AG	3	6	38602	38607	50 %	0 %	50 %	0 %	532421856
72	NC_022118	GA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
73	NC_022118	AG	3	6	39523	39528	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
74	NC_022118	AG	3	6	39623	39628	50 %	0 %	50 %	0 %	532421857
75	NC_022118	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	532421858
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79	NC_022118	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	532421858
80	NC_022118	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	532421858
81	NC_022118	GT	3	6	41466	41471	0 %	50 %	50 %	0 %	532421859
82	NC_022118	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
83	NC_022118	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
84	NC_022118	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	532421859
85	NC_022118	TG	3	6	43078	43083	0 %	50 %	50 %	0 %	532421860
86	NC_022118	AC	3	6	43473	43478	50 %	0 %	0 %	50 %	532421861
87	NC_022118	TC	3	6	43642	43647	0 %	50 %	0 %	50 %	532421861
88	NC_022118	TA	3	6	43960	43965	50 %	50 %	0 %	0 %	532421862
89	NC_022118	TC	3	6	44872	44877	0 %	50 %	0 %	50 %	532421863
90	NC_022118	GA	3	6	45355	45360	50 %	0 %	50 %	0 %	532421864
91	NC_022118	TG	3	6	45573	45578	0 %	50 %	50 %	0 %	532421864
92	NC_022118	AG	3	6	45584	45589	50 %	0 %	50 %	0 %	532421864
93	NC_022118	AG	4	8	46026	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
94	NC_022118	CT	3	6	46217	46222	0 %	50 %	0 %	50 %	532421865
95	NC_022118	TG	3	6	46418	46423	0 %	50 %	50 %	0 %	532421865
96	NC_022118	AG	3	6	46471	46476	50 %	0 %	50 %	0 %	532421865
97	NC_022118	AG	3	6	49395	49400	50 %	0 %	50 %	0 %	532421867
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100	NC_022118	CA	3	6	52955	52960	50 %	0 %	0 %	50 %	532421870
101	NC_022118	GA	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	532421871
102	NC_022118	CT	3	6	53693	53698	0 %	50 %	0 %	50 %	532421871
103	NC_022118	CT	3	6	54362	54367	0 %	50 %	0 %	50 %	532421872
104	NC_022118	AT	3	6	55570	55575	50 %	50 %	0 %	0 %	532421872
105	NC_022118	AG	3	6	56205	56210	50 %	0 %	50 %	0 %	532422665
106	NC_022118	CT	3	6	56504	56509	0 %	50 %	0 %	50 %	532422665
107	NC_022118	GT	3	6	56554	56559	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
108	NC_022118	TG	3	6	57192	57197	0 %	50 %	50 %	0 %	532422665
109	NC_022118	CT	3	6	58073	58078	0 %	50 %	0 %	50 %	532422666
110	NC_022118	GA	3	6	59640	59645	50 %	0 %	50 %	0 %	532421873
111	NC_022118	GT	3	6	59778	59783	0 %	50 %	50 %	0 %	532421873
112	NC_022118	TC	3	6	60526	60531	0 %	50 %	0 %	50 %	532421874
113	NC_022118	GA	3	6	60754	60759	50 %	0 %	50 %	0 %	532422667
114	NC_022118	CA	3	6	61152	61157	50 %	0 %	0 %	50 %	532421875
115	NC_022118	AT	3	6	61402	61407	50 %	50 %	0 %	0 %	532421875
116	NC_022118	GA	3	6	61425	61430	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
117	NC_022118	GA	3	6	61551	61556	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
118	NC_022118	GA	3	6	62366	62371	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
119	NC_022118	GA	3	6	62625	62630	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
120	NC_022118	TC	3	6	62781	62786	0 %	50 %	0 %	50 %	532421875
121	NC_022118	AT	3	6	62962	62967	50 %	50 %	0 %	0 %	532421875
122	NC_022118	AG	3	6	63162	63167	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
123	NC_022118	TC	4	8	63169	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	532421875
124	NC_022118	AG	3	6	63397	63402	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
125	NC_022118	AG	3	6	63656	63661	50 %	0 %	50 %	0 %	532421875
126	NC_022118	AG	3	6	63784	63789	50 %	0 %	50 %	0 %	532421876
127	NC_022118	AG	3	6	65080	65085	50 %	0 %	50 %	0 %	532421877
128	NC_022118	GA	3	6	65266	65271	50 %	0 %	50 %	0 %	532421877
129	NC_022118	CT	3	6	65305	65310	0 %	50 %	0 %	50 %	532421877
130	NC_022118	AG	3	6	65887	65892	50 %	0 %	50 %	0 %	532421878
131	NC_022118	AC	3	6	66019	66024	50 %	0 %	0 %	50 %	532421878
132	NC_022118	AG	3	6	66121	66126	50 %	0 %	50 %	0 %	532421878
133	NC_022118	AG	3	6	66527	66532	50 %	0 %	50 %	0 %	532421878
134	NC_022118	GA	3	6	66900	66905	50 %	0 %	50 %	0 %	532421878
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136	NC_022118	AT	3	6	69165	69170	50 %	50 %	0 %	0 %	532421881
137	NC_022118	CT	3	6	69717	69722	0 %	50 %	0 %	50 %	532421881
138	NC_022118	GA	3	6	70127	70132	50 %	0 %	50 %	0 %	532421881
139	NC_022118	GA	3	6	70326	70331	50 %	0 %	50 %	0 %	532421881
140	NC_022118	GT	3	6	70602	70607	0 %	50 %	50 %	0 %	532421881
141	NC_022118	CT	3	6	70683	70688	0 %	50 %	0 %	50 %	532421881
142	NC_022118	GA	3	6	70704	70709	50 %	0 %	50 %	0 %	532421881
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