MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/1-93

Total Repeats: 2865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022117	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022117	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022117	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022117	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532419035
5	NC_022117	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532419036
6	NC_022117	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532419036
7	NC_022117	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532419037
8	NC_022117	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532419037
9	NC_022117	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532419037
10	NC_022117	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532419038
11	NC_022117	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532419038
12	NC_022117	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532419038
13	NC_022117	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532419038
14	NC_022117	TGGA	2	8	5322	5329	25 %	25 %	50 %	0 %	532419039
15	NC_022117	CTTT	2	8	5699	5706	0 %	75 %	0 %	25 %	532419039
16	NC_022117	GGGA	2	8	6214	6221	25 %	0 %	75 %	0 %	532419039
17	NC_022117	GGAG	2	8	6305	6312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022117	GGTG	2	8	6517	6524	0 %	25 %	75 %	0 %	532419040
19	NC_022117	AAAT	2	8	6583	6590	75 %	25 %	0 %	0 %	532419040
20	NC_022117	TATG	2	8	6954	6961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022117	ATTT	2	8	7095	7102	25 %	75 %	0 %	0 %	532419866
22	NC_022117	ATTT	2	8	7186	7193	25 %	75 %	0 %	0 %	532419866
23	NC_022117	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	532419041
24	NC_022117	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	532419042
25	NC_022117	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	532419042
26	NC_022117	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	532419042
27	NC_022117	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	532419042
28	NC_022117	TATT	2	8	9310	9317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022117	TTCG	2	8	9421	9428	0 %	50 %	25 %	25 %	532419043
30	NC_022117	AATT	2	8	9526	9533	50 %	50 %	0 %	0 %	532419043
31	NC_022117	ATGG	2	8	9585	9592	25 %	25 %	50 %	0 %	532419043
32	NC_022117	CTTT	2	8	10210	10217	0 %	75 %	0 %	25 %	532419044
33	NC_022117	GCAA	2	8	10427	10434	50 %	0 %	25 %	25 %	532419044
34	NC_022117	AGCC	2	8	10657	10664	25 %	0 %	25 %	50 %	532419044
35	NC_022117	GAAA	2	8	10800	10807	75 %	0 %	25 %	0 %	532419044
36	NC_022117	AGAA	2	8	11204	11211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022117	AATG	2	8	11543	11550	50 %	25 %	25 %	0 %	532419045
38	NC_022117	GTTT	2	8	12575	12582	0 %	75 %	25 %	0 %	532419046
39	NC_022117	ATGC	2	8	13005	13012	25 %	25 %	25 %	25 %	532419046
40	NC_022117	AAGG	2	8	13440	13447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022117	TTGT	2	8	14041	14048	0 %	75 %	25 %	0 %	532419047
42	NC_022117	TTCT	2	8	14212	14219	0 %	75 %	0 %	25 %	532419047
43	NC_022117	ATTT	2	8	14418	14425	25 %	75 %	0 %	0 %	532419047
44	NC_022117	TTTC	2	8	15080	15087	0 %	75 %	0 %	25 %	532419048
45	NC_022117	AAAT	2	8	15562	15569	75 %	25 %	0 %	0 %	532419048
46	NC_022117	CAAA	2	8	16074	16081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022117	GTAA	2	8	16404	16411	50 %	25 %	25 %	0 %	532419049
48	NC_022117	CTAA	2	8	16597	16604	50 %	25 %	0 %	25 %	532419049
49	NC_022117	AGAA	2	8	16860	16867	75 %	0 %	25 %	0 %	532419049
50	NC_022117	ATTT	2	8	17006	17013	25 %	75 %	0 %	0 %	532419049
51	NC_022117	TGCG	2	8	18528	18535	0 %	25 %	50 %	25 %	532419051
52	NC_022117	GAAG	2	8	19512	19519	50 %	0 %	50 %	0 %	532419051
53	NC_022117	TTTG	2	8	19538	19545	0 %	75 %	25 %	0 %	532419051
54	NC_022117	TGTA	2	8	20230	20237	25 %	50 %	25 %	0 %	532419052
55	NC_022117	GCCA	2	8	21022	21029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022117	CGCT	2	8	21270	21277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022117	TTAA	2	8	21291	21298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022117	GTTA	2	8	21328	21335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022117	GATC	2	8	21383	21390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022117	TGGG	2	8	21648	21655	0 %	25 %	75 %	0 %	532419053
61	NC_022117	CATT	2	8	22705	22712	25 %	50 %	0 %	25 %	532419053
62	NC_022117	GCTT	2	8	23048	23055	0 %	50 %	25 %	25 %	532419053
63	NC_022117	GGTT	2	8	23096	23103	0 %	50 %	50 %	0 %	532419053
64	NC_022117	TTCT	2	8	23466	23473	0 %	75 %	0 %	25 %	532419053
65	NC_022117	TAAC	2	8	23568	23575	50 %	25 %	0 %	25 %	532419053
66	NC_022117	CATT	2	8	23691	23698	25 %	50 %	0 %	25 %	532419053
67	NC_022117	GGTA	2	8	24061	24068	25 %	25 %	50 %	0 %	532419053
68	NC_022117	TTGA	2	8	25057	25064	25 %	50 %	25 %	0 %	532419054
69	NC_022117	TTCG	2	8	25202	25209	0 %	50 %	25 %	25 %	532419054
70	NC_022117	TAGG	2	8	25281	25288	25 %	25 %	50 %	0 %	532419054
71	NC_022117	TTCC	2	8	25405	25412	0 %	50 %	0 %	50 %	532419054
72	NC_022117	TAGG	2	8	25519	25526	25 %	25 %	50 %	0 %	532419054
73	NC_022117	TTTC	2	8	25954	25961	0 %	75 %	0 %	25 %	532419054
74	NC_022117	GCTT	2	8	26291	26298	0 %	50 %	25 %	25 %	532419054
75	NC_022117	GGAA	2	8	26874	26881	50 %	0 %	50 %	0 %	532419055
76	NC_022117	TTAA	2	8	26947	26954	50 %	50 %	0 %	0 %	532419055
77	NC_022117	AAAG	2	8	26997	27004	75 %	0 %	25 %	0 %	532419055
78	NC_022117	GGGC	2	8	27277	27284	0 %	0 %	75 %	25 %	532419055
79	NC_022117	GTTT	2	8	27560	27567	0 %	75 %	25 %	0 %	532419056
80	NC_022117	CAGA	2	8	27582	27589	50 %	0 %	25 %	25 %	532419056
81	NC_022117	ATTG	2	8	27941	27948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022117	CTTT	2	8	29554	29561	0 %	75 %	0 %	25 %	532419058
83	NC_022117	TTTG	2	8	29569	29576	0 %	75 %	25 %	0 %	532419058
84	NC_022117	TTGT	2	8	29604	29611	0 %	75 %	25 %	0 %	532419058
85	NC_022117	TGGC	2	8	29767	29774	0 %	25 %	50 %	25 %	532419058
86	NC_022117	AAAG	2	8	30327	30334	75 %	0 %	25 %	0 %	532419059
87	NC_022117	AAAC	2	8	30397	30404	75 %	0 %	0 %	25 %	532419059
88	NC_022117	GATG	2	8	30540	30547	25 %	25 %	50 %	0 %	532419059
89	NC_022117	GATA	2	8	31649	31656	50 %	25 %	25 %	0 %	532419061
90	NC_022117	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532419064
91	NC_022117	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532419064
92	NC_022117	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532419065
93	NC_022117	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532419065
94	NC_022117	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	532419066
95	NC_022117	TCGA	2	8	35160	35167	25 %	25 %	25 %	25 %	532419066
96	NC_022117	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	532419066
97	NC_022117	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532419066
98	NC_022117	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	532419066
99	NC_022117	CTTT	2	8	36638	36645	0 %	75 %	0 %	25 %	532419067
100	NC_022117	ATGA	2	8	37128	37135	50 %	25 %	25 %	0 %	532419067
101	NC_022117	TAGG	2	8	37287	37294	25 %	25 %	50 %	0 %	532419067
102	NC_022117	CAAT	2	8	37471	37478	50 %	25 %	0 %	25 %	532419067
103	NC_022117	AATG	2	8	38258	38265	50 %	25 %	25 %	0 %	532419067
104	NC_022117	AGAA	2	8	39095	39102	75 %	0 %	25 %	0 %	532419068
105	NC_022117	AAGA	2	8	39147	39154	75 %	0 %	25 %	0 %	532419068
106	NC_022117	ATCC	2	8	39155	39162	25 %	25 %	0 %	50 %	532419068
107	NC_022117	TAAT	2	8	39366	39373	50 %	50 %	0 %	0 %	532419068
108	NC_022117	GTGC	2	8	41455	41462	0 %	25 %	50 %	25 %	532419070
109	NC_022117	AGAA	2	8	41874	41881	75 %	0 %	25 %	0 %	532419070
110	NC_022117	GGAT	2	8	42026	42033	25 %	25 %	50 %	0 %	532419070
111	NC_022117	AAAC	2	8	43234	43241	75 %	0 %	0 %	25 %	532419072
112	NC_022117	CAAT	2	8	43438	43445	50 %	25 %	0 %	25 %	532419072
113	NC_022117	TGTT	2	8	43817	43824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022117	AATA	2	8	44056	44063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022117	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	532419074
116	NC_022117	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	532419074
117	NC_022117	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	532419074
118	NC_022117	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	532419075
119	NC_022117	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	532419075
120	NC_022117	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	532419075
121	NC_022117	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	532419075
122	NC_022117	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	532419075
123	NC_022117	AAGA	2	8	46267	46274	75 %	0 %	25 %	0 %	532419076
124	NC_022117	AAGA	2	8	46324	46331	75 %	0 %	25 %	0 %	532419076
125	NC_022117	AAAG	2	8	46364	46371	75 %	0 %	25 %	0 %	532419076
126	NC_022117	AAGA	2	8	46479	46486	75 %	0 %	25 %	0 %	532419076
127	NC_022117	ACTT	2	8	46740	46747	25 %	50 %	0 %	25 %	532419076
128	NC_022117	ATGG	2	8	47366	47373	25 %	25 %	50 %	0 %	532419076
129	NC_022117	AGGA	2	8	47397	47404	50 %	0 %	50 %	0 %	532419076
130	NC_022117	GAAC	2	8	47944	47951	50 %	0 %	25 %	25 %	532419076
131	NC_022117	AAGT	2	8	47979	47986	50 %	25 %	25 %	0 %	532419076
132	NC_022117	AACA	2	8	48188	48195	75 %	0 %	0 %	25 %	532419077
133	NC_022117	CTTT	2	8	48384	48391	0 %	75 %	0 %	25 %	532419077
134	NC_022117	CTTT	2	8	49269	49276	0 %	75 %	0 %	25 %	532419078
135	NC_022117	GTAG	2	8	49287	49294	25 %	25 %	50 %	0 %	532419078
136	NC_022117	GAAG	2	8	50715	50722	50 %	0 %	50 %	0 %	532419079
137	NC_022117	TTCA	2	8	51137	51144	25 %	50 %	0 %	25 %	532419079
138	NC_022117	TCTA	2	8	51354	51361	25 %	50 %	0 %	25 %	532419079
139	NC_022117	TATT	2	8	52289	52296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022117	GGAA	2	8	52520	52527	50 %	0 %	50 %	0 %	532419081
141	NC_022117	TTAA	2	8	53261	53268	50 %	50 %	0 %	0 %	532419081
142	NC_022117	CCTT	2	8	53468	53475	0 %	50 %	0 %	50 %	532419082
143	NC_022117	TTTA	2	8	53635	53642	25 %	75 %	0 %	0 %	532419082
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