MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei RB

Total Repeats: 7821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022116	GTCGCC	2	12	7104781	7104792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463009
5502	NC_022116	TCGGCT	2	12	7105762	7105773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463009
5503	NC_022116	GTCGGT	2	12	7107349	7107360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532463011
5504	NC_022116	GGCCGC	2	12	7113202	7113213	0 %	0 %	50 %	50 %	532463013
5505	NC_022116	GGGCGC	2	12	7114264	7114275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463015
5506	NC_022116	TGCCCT	2	12	7117524	7117535	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532463018
5507	NC_022116	AGTCGG	2	12	7118244	7118255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463018
5508	NC_022116	CGATCT	2	12	7118610	7118621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532463018
5509	NC_022116	GCTCCG	2	12	7118682	7118693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463018
5510	NC_022116	TGATCG	2	12	7118778	7118789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532463018
5511	NC_022116	CGCGCA	2	12	7120037	7120048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463019
5512	NC_022116	CCGGCG	2	12	7122963	7122974	0 %	0 %	50 %	50 %	532463020
5513	NC_022116	GCCGGG	2	12	7123827	7123838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463021
5514	NC_022116	GTCGAC	2	12	7125628	7125639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463025
5515	NC_022116	CGGCCA	2	12	7129483	7129494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463029
5516	NC_022116	TTCGCG	2	12	7129836	7129847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463030
5517	NC_022116	CGCGGC	2	12	7133450	7133461	0 %	0 %	50 %	50 %	532463035
5518	NC_022116	AGCGCG	2	12	7134767	7134778	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463036
5519	NC_022116	GCCCAG	2	12	7135282	7135293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463036
5520	NC_022116	GCGCAC	2	12	7135321	7135332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463036
5521	NC_022116	CGCCAC	2	12	7135480	7135491	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463036
5522	NC_022116	GAGGCG	2	12	7135601	7135612	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532463036
5523	NC_022116	TTCGTC	2	12	7136676	7136687	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532463037
5524	NC_022116	TCGGTC	2	12	7140326	7140337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463040
5525	NC_022116	ACCGCG	2	12	7142669	7142680	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463042
5526	NC_022116	CGGTGG	2	12	7145279	7145290	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532463044
5527	NC_022116	GCGGTG	2	12	7145617	7145628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532463044
5528	NC_022116	CAGGGC	2	12	7146942	7146953	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463044
5529	NC_022116	GCCGGC	2	12	7146960	7146971	0 %	0 %	50 %	50 %	532463044
5530	NC_022116	TCGGCC	2	12	7147375	7147386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463044
5531	NC_022116	CCAAGA	2	12	7148273	7148284	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532463045
5532	NC_022116	GTCAAC	2	12	7148964	7148975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532463047
5533	NC_022116	GCGTGG	2	12	7150532	7150543	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532463049
5534	NC_022116	GGCCGG	2	12	7152509	7152520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463051
5535	NC_022116	CGGCTG	2	12	7152842	7152853	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463051
5536	NC_022116	AGGCGA	2	12	7154343	7154354	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532463051
5537	NC_022116	GTGCGG	2	12	7155025	7155036	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532463052
5538	NC_022116	TGGCGA	2	12	7155502	7155513	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463052
5539	NC_022116	ACCCGG	2	12	7155963	7155974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463052
5540	NC_022116	CGGCCG	2	12	7156705	7156716	0 %	0 %	50 %	50 %	532463052
5541	NC_022116	CGGGAG	2	12	7158190	7158201	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532463054
5542	NC_022116	GCCTCG	2	12	7159255	7159266	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463054
5543	NC_022116	GCCGCA	2	12	7159799	7159810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463054
5544	NC_022116	ACGTCG	2	12	7160131	7160142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463054
5545	NC_022116	CCGCGT	2	12	7160433	7160444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463054
5546	NC_022116	GCATGG	2	12	7163768	7163779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463057
5547	NC_022116	CGCCGG	2	12	7163970	7163981	0 %	0 %	50 %	50 %	532463057
5548	NC_022116	CCGAGC	2	12	7165582	7165593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463059
5549	NC_022116	CAGGAA	2	12	7168264	7168275	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532463061
5550	NC_022116	GGACGA	2	12	7168611	7168622	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532463061
5551	NC_022116	GCCGCG	2	12	7171314	7171325	0 %	0 %	50 %	50 %	532463062
5552	NC_022116	GGCCCG	2	12	7171690	7171701	0 %	0 %	50 %	50 %	532463063
5553	NC_022116	GCGCGG	2	12	7172862	7172873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463063
5554	NC_022116	GTCGAC	2	12	7173259	7173270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463063
5555	NC_022116	GCACGC	2	12	7173960	7173971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463063
5556	NC_022116	CAGCGC	2	12	7174039	7174050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463063
5557	NC_022116	GGGCTG	2	12	7175447	7175458	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532463064
5558	NC_022116	CCGGCG	2	12	7176722	7176733	0 %	0 %	50 %	50 %	532463065
5559	NC_022116	CGGTCA	2	12	7177978	7177989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463066
5560	NC_022116	CGTCGG	2	12	7179389	7179400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463067
5561	NC_022116	GCCCTG	2	12	7180032	7180043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463067
5562	NC_022116	CGTGAC	2	12	7182380	7182391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463069
5563	NC_022116	CTCGTC	2	12	7182437	7182448	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532463069
5564	NC_022116	GCTGCG	2	12	7183145	7183156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463070
5565	NC_022116	ACGCCC	2	12	7183240	7183251	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463070
5566	NC_022116	CGCTCA	2	12	7183931	7183942	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463071
5567	NC_022116	GCCGAC	2	12	7184214	7184225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463072
5568	NC_022116	ACCGGG	2	12	7185793	7185804	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463074
5569	NC_022116	CTCGGC	2	12	7187330	7187341	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463076
5570	NC_022116	TACGCC	2	12	7189703	7189714	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463078
5571	NC_022116	TCGGAT	2	12	7192993	7193004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532463082
5572	NC_022116	GGCCGC	2	12	7196160	7196171	0 %	0 %	50 %	50 %	532463086
5573	NC_022116	GGCCGC	2	12	7197401	7197412	0 %	0 %	50 %	50 %	532463087
5574	NC_022116	CGCCGG	2	12	7197907	7197918	0 %	0 %	50 %	50 %	532463087
5575	NC_022116	CCGACG	2	12	7198540	7198551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463087
5576	NC_022116	CACGGT	2	12	7199567	7199578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463089
5577	NC_022116	TGATCG	2	12	7199989	7200000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532463089
5578	NC_022116	CGTCGC	2	12	7201120	7201131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463090
5579	NC_022116	CGCGAC	2	12	7201763	7201774	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463091
5580	NC_022116	ACCGCG	2	12	7203591	7203602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463093
5581	NC_022116	TCGCCC	2	12	7207763	7207774	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	532463097
5582	NC_022116	GCGACT	2	12	7207985	7207996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463097
5583	NC_022116	CGCTCG	2	12	7213269	7213280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463103
5584	NC_022116	CGATCG	2	12	7213770	7213781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463103
5585	NC_022116	GCCCGG	2	12	7215943	7215954	0 %	0 %	50 %	50 %	532463106
5586	NC_022116	CTCGGC	2	12	7216963	7216974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463107
5587	NC_022116	GTGCCG	2	12	7222909	7222920	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463113
5588	NC_022116	GACCGC	2	12	7223436	7223447	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463113
5589	NC_022116	GAACTC	2	12	7224315	7224326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532463113
5590	NC_022116	GCGTCA	2	12	7227409	7227420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463118
5591	NC_022116	CCAGCA	2	12	7228293	7228304	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532463119
5592	NC_022116	CGCCGG	2	12	7228392	7228403	0 %	0 %	50 %	50 %	532463119
5593	NC_022116	ACCAGC	2	12	7229173	7229184	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532463120
5594	NC_022116	GAAGCT	2	12	7230440	7230451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532463121
5595	NC_022116	CGCCGG	2	12	7231788	7231799	0 %	0 %	50 %	50 %	532463123
5596	NC_022116	ACGGCG	2	12	7232272	7232283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463123
5597	NC_022116	CGGTCA	2	12	7232366	7232377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463123
5598	NC_022116	GCCGAC	2	12	7232487	7232498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463123
5599	NC_022116	GGCCGG	2	12	7238049	7238060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463126
5600	NC_022116	CCCGTC	2	12	7238998	7239009	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	532463127
5601	NC_022116	GCTGCC	2	12	7241599	7241610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463130
5602	NC_022116	CTCCAG	2	12	7244751	7244762	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463135
5603	NC_022116	TCACCA	2	12	7246607	7246618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532463137
5604	NC_022116	CCAAAG	2	12	7249076	7249087	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532463140
5605	NC_022116	CGCGGC	2	12	7250571	7250582	0 %	0 %	50 %	50 %	532463143
5606	NC_022116	CCCGGT	2	12	7255708	7255719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463146
5607	NC_022116	AGGGCA	2	12	7256340	7256351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532463147
5608	NC_022116	CAACGA	2	12	7256752	7256763	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532463148
5609	NC_022116	TCGACC	2	12	7256898	7256909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463148
5610	NC_022116	CGCGGC	2	12	7257880	7257891	0 %	0 %	50 %	50 %	532463149
5611	NC_022116	TCGAAC	2	12	7258035	7258046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532463149
5612	NC_022116	CGCCGA	2	12	7258519	7258530	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463149
5613	NC_022116	ACGCCG	2	12	7262492	7262503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463152
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5719	NC_022116	TCGGAC	2	12	7392070	7392081	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463284
5720	NC_022116	GCGCCA	2	12	7392401	7392412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463284
5721	NC_022116	CCAGGC	2	12	7393441	7393452	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463285
5722	NC_022116	CGGCAC	2	12	7395204	7395215	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463288
5723	NC_022116	CGATGA	2	12	7395857	7395868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532463288
5724	NC_022116	GCCGGT	2	12	7396107	7396118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463288
5725	NC_022116	GCGGCC	2	12	7396701	7396712	0 %	0 %	50 %	50 %	532463288
5726	NC_022116	GCGCTC	2	12	7397034	7397045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463288
5727	NC_022116	CGGCCA	2	12	7397353	7397364	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463288
5728	NC_022116	CGGCGA	2	12	7397374	7397385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463288
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5734	NC_022116	ACCGCG	2	12	7405040	7405051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463293
5735	NC_022116	GACCAG	2	12	7407182	7407193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532463295
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5740	NC_022116	AGCACC	2	12	7415284	7415295	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532463301
5741	NC_022116	CCGGGG	2	12	7418194	7418205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463305
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5750	NC_022116	ACCGCC	2	12	7436138	7436149	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463319
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5770	NC_022116	TCCTGC	2	12	7457277	7457288	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532463337
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5785	NC_022116	TCGGCA	2	12	7476102	7476113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463351
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5787	NC_022116	GCCGAT	2	12	7478847	7478858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463352
5788	NC_022116	TCGCCG	2	12	7478887	7478898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463352
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5819	NC_022116	CTGGTC	2	12	7524279	7524290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463392
5820	NC_022116	AGGCGA	2	12	7525559	7525570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	532463393
5821	NC_022116	CGATCT	2	12	7526741	7526752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532463394
5822	NC_022116	CGCGGC	2	12	7529693	7529704	0 %	0 %	50 %	50 %	532463398
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5824	NC_022116	CGACGC	2	12	7531313	7531324	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463400
5825	NC_022116	GTCGAT	2	12	7533305	7533316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532463403
5826	NC_022116	CAGCCG	2	12	7537258	7537269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463404
5827	NC_022116	GGCTCA	2	12	7541025	7541036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463405
5828	NC_022116	CGGCCG	2	12	7541596	7541607	0 %	0 %	50 %	50 %	532463405
5829	NC_022116	GAACCA	2	12	7542354	7542365	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532463406
5830	NC_022116	TCGACC	2	12	7542955	7542966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463406
5831	NC_022116	CTTGAC	2	12	7543632	7543643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532463406
5832	NC_022116	CAGCCG	2	12	7547187	7547198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463408
5833	NC_022116	CCGTTC	2	12	7547328	7547339	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532463408
5834	NC_022116	ACCAGC	2	12	7547824	7547835	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532463408
5835	NC_022116	TGAGCG	2	12	7548383	7548394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463410
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5840	NC_022116	CGGCGA	2	12	7555464	7555475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463414
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5844	NC_022116	GTCTCG	2	12	7562928	7562939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463421
5845	NC_022116	GGCGCC	2	12	7563331	7563342	0 %	0 %	50 %	50 %	532463422
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5849	NC_022116	AGGTCG	2	12	7564678	7564689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463424
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5857	NC_022116	CCAGGT	2	12	7577106	7577117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463435
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5859	NC_022116	CGCGGC	2	12	7580141	7580152	0 %	0 %	50 %	50 %	532463438
5860	NC_022116	GTAGCG	2	12	7580876	7580887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463438
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5863	NC_022116	AGGTCG	2	12	7583985	7583996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463438
5864	NC_022116	CGAAGT	2	12	7584079	7584090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532463438
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5868	NC_022116	GCCGTA	2	12	7588751	7588762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463442
5869	NC_022116	GCCGGG	2	12	7589135	7589146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532463442
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5874	NC_022116	CCGGCG	2	12	7593308	7593319	0 %	0 %	50 %	50 %	532463445
5875	NC_022116	CAGCGC	2	12	7593591	7593602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463445
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5882	NC_022116	ACGGCG	2	12	7603724	7603735	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463456
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5885	NC_022116	TCGGTG	2	12	7610407	7610418	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532463461
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5887	NC_022116	CCGAAG	2	12	7611560	7611571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532463462
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5889	NC_022116	GCTCGC	2	12	7614011	7614022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532463463
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5892	NC_022116	GCGATC	2	12	7616125	7616136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463465
5893	NC_022116	GCCGAG	2	12	7617630	7617641	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463467
5894	NC_022116	GCCGAG	3	18	7617912	7617929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463467
5895	NC_022116	GCGCTG	2	12	7619091	7619102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463469
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5899	NC_022116	TCGACG	2	12	7621886	7621897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532463471
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5901	NC_022116	TGCGGC	2	12	7622206	7622217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463472
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5903	NC_022116	GCCGCG	2	12	7629204	7629215	0 %	0 %	50 %	50 %	532463473
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5913	NC_022116	CGTCCC	2	12	7637927	7637938	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	532463482
5914	NC_022116	TGCCTG	2	12	7638642	7638653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463482
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5930	NC_022116	TCACCG	2	12	7650587	7650598	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532463490
5931	NC_022116	GTGACG	2	12	7653196	7653207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463492
5932	NC_022116	ACGGCG	2	12	7653756	7653767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532463493
5933	NC_022116	GGTCCG	2	12	7654917	7654928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463493
5934	NC_022116	GAGGCG	2	12	7655000	7655011	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532463493
5935	NC_022116	TGCGGC	2	12	7655052	7655063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	532463493
5936	NC_022116	GGCCGC	2	12	7657818	7657829	0 %	0 %	50 %	50 %	532463494
5937	NC_022116	CACGTA	2	12	7663851	7663862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532463499
5938	NC_022116	TGACGG	2	12	7665098	7665109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463499
5939	NC_022116	GCCACG	2	12	7666691	7666702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463500
5940	NC_022116	CGGTGA	2	12	7668943	7668954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532463502
5941	NC_022116	GACGCC	2	12	7671349	7671360	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463504
5942	NC_022116	GCGGCC	2	12	7672754	7672765	0 %	0 %	50 %	50 %	532463505
5943	NC_022116	CGCGCC	2	12	7673108	7673119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532463505
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5945	NC_022116	CCGACC	2	12	7677384	7677395	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463510
5946	NC_022116	CGTGCT	2	12	7677732	7677743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532463511
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5969	NC_022116	GCGACC	2	12	7704458	7704469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532463537
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5999	NC_022116	CACCCG	2	12	7751433	7751444	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463575
6000	NC_022116	CACCGC	2	12	7751643	7751654	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	532463575

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