MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei RB

Total Repeats: 204070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
204001	NC_022116	CCG	2	6	10242250	10242255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465900
204002	NC_022116	GGC	2	6	10242267	10242272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465900
204003	NC_022116	CCG	2	6	10242293	10242298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465900
204004	NC_022116	GCT	2	6	10242416	10242421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465900
204005	NC_022116	GGC	2	6	10242430	10242435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465900
204006	NC_022116	TCC	2	6	10242436	10242441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465900
204007	NC_022116	GAT	2	6	10242453	10242458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465900
204008	NC_022116	CGG	2	6	10242508	10242513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465900
204009	NC_022116	CGA	2	6	10242599	10242604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465900
204010	NC_022116	GGC	2	6	10242616	10242621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465900
204011	NC_022116	CCG	2	6	10242638	10242643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465900
204012	NC_022116	CGC	2	6	10242774	10242779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465900
204013	NC_022116	CCT	2	6	10242800	10242805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465900
204014	NC_022116	CGC	2	6	10243084	10243089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465901
204015	NC_022116	CCA	2	6	10243158	10243163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532465901
204016	NC_022116	AAC	2	6	10243220	10243225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532465901
204017	NC_022116	GAG	2	6	10243291	10243296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532465901
204018	NC_022116	AGT	2	6	10243365	10243370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465901
204019	NC_022116	CGC	2	6	10243426	10243431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465901
204020	NC_022116	TCG	2	6	10243455	10243460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465901
204021	NC_022116	TCC	2	6	10243463	10243468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465901
204022	NC_022116	CGT	2	6	10243661	10243666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204023	NC_022116	ACC	2	6	10243669	10243674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532465902
204024	NC_022116	CGC	2	6	10243715	10243720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465902
204025	NC_022116	CCG	2	6	10243736	10243741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465902
204026	NC_022116	CTC	2	6	10243764	10243769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465902
204027	NC_022116	GCG	2	6	10243770	10243775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465902
204028	NC_022116	GGC	2	6	10243808	10243813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465902
204029	NC_022116	CTG	2	6	10243830	10243835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204030	NC_022116	CGA	2	6	10243889	10243894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204031	NC_022116	CGC	2	6	10243910	10243915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465902
204032	NC_022116	CGT	2	6	10243967	10243972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204033	NC_022116	CAG	2	6	10243986	10243991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204034	NC_022116	CCT	2	6	10244021	10244026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465902
204035	NC_022116	GTC	2	6	10244037	10244042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204036	NC_022116	CGT	2	6	10244090	10244095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
204037	NC_022116	CAT	2	6	10244130	10244135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532465902
204038	NC_022116	GCG	2	6	10244166	10244171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
204039	NC_022116	GCC	2	6	10244247	10244252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
204040	NC_022116	GGC	2	6	10244304	10244309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
204041	NC_022116	GCG	3	9	10244311	10244319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
204042	NC_022116	CCG	2	6	10244330	10244335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
204043	NC_022116	CTT	2	6	10244379	10244384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
204044	NC_022116	TTC	3	9	10244410	10244418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
204045	NC_022116	GCC	2	6	10244515	10244520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
204046	NC_022116	GCT	2	6	10244552	10244557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465903
204047	NC_022116	GTT	2	6	10244574	10244579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532465903
204048	NC_022116	AGA	2	6	10244591	10244596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532465903
204049	NC_022116	ATC	2	6	10244755	10244760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532465903
204050	NC_022116	GGA	2	6	10244777	10244782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532465903
204051	NC_022116	CGC	2	6	10244813	10244818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
204052	NC_022116	GAC	2	6	10244820	10244825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465903
204053	NC_022116	GAA	2	6	10244907	10244912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532465903
204054	NC_022116	CGG	3	9	10244940	10244948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
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204058	NC_022116	TCT	2	6	10245137	10245142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
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204060	NC_022116	GAT	2	6	10245207	10245212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465903
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204062	NC_022116	CTG	2	6	10245317	10245322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465903
204063	NC_022116	CTC	2	6	10245326	10245331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465904
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204068	NC_022116	GCC	2	6	10246155	10246160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465905
204069	NC_022116	GCG	3	9	10246217	10246225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465905
204070	NC_022116	GTT	2	6	10246226	10246231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532465905

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.