MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Amycolatopsis mediterranei RB

Total Repeats: 222062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
222001	NC_022116	CTG	2	6	10243830	10243835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222002	NC_022116	CGA	2	6	10243889	10243894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222003	NC_022116	CGC	2	6	10243910	10243915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465902
222004	NC_022116	CGT	2	6	10243967	10243972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222005	NC_022116	CAG	2	6	10243986	10243991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222006	NC_022116	CCT	2	6	10244021	10244026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532465902
222007	NC_022116	GTC	2	6	10244037	10244042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222008	NC_022116	CGT	2	6	10244090	10244095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465902
222009	NC_022116	CAT	2	6	10244130	10244135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532465902
222010	NC_022116	GCG	2	6	10244166	10244171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
222011	NC_022116	GCC	2	6	10244247	10244252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
222012	NC_022116	GGC	2	6	10244304	10244309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
222013	NC_022116	GCG	3	9	10244311	10244319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
222014	NC_022116	CCG	2	6	10244330	10244335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
222015	NC_022116	CTT	2	6	10244379	10244384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
222016	NC_022116	TTC	3	9	10244410	10244418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
222017	NC_022116	GCC	2	6	10244515	10244520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
222018	NC_022116	GCT	2	6	10244552	10244557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465903
222019	NC_022116	GTT	2	6	10244574	10244579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532465903
222020	NC_022116	AGA	2	6	10244591	10244596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532465903
222021	NC_022116	ATC	2	6	10244755	10244760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532465903
222022	NC_022116	GGA	2	6	10244777	10244782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532465903
222023	NC_022116	CGC	2	6	10244813	10244818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532465903
222024	NC_022116	GAC	2	6	10244820	10244825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465903
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222026	NC_022116	CGG	3	9	10244940	10244948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465903
222027	NC_022116	AGC	2	6	10245001	10245006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532465903
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222030	NC_022116	TCT	2	6	10245137	10245142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532465903
222031	NC_022116	ATG	2	6	10245178	10245183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465903
222032	NC_022116	GAT	2	6	10245207	10245212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465903
222033	NC_022116	GTA	2	6	10245297	10245302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532465903
222034	NC_022116	CTG	2	6	10245317	10245322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532465903
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222040	NC_022116	CGA	2	6	10245808	10245813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
222041	NC_022116	CGG	2	6	10245814	10245819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222042	NC_022116	CGG	2	6	10245846	10245851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222043	NC_022116	CGG	2	6	10245890	10245895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222044	NC_022116	ACC	2	6	10245911	10245916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
222045	NC_022116	CAC	2	6	10245937	10245942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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222047	NC_022116	GAC	2	6	10246006	10246011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
222048	NC_022116	GGC	2	6	10246014	10246019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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222050	NC_022116	GCA	2	6	10246092	10246097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
222051	NC_022116	CGG	2	6	10246149	10246154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465905
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222053	NC_022116	GCG	3	9	10246217	10246225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532465905
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222059	NC_022116	GTG	2	6	10246659	10246664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
222060	NC_022116	ACG	2	6	10246681	10246686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
222061	NC_022116	GGT	2	6	10246695	10246700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
222062	NC_022116	CGA	2	6	10246840	10246845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.