MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022115	CGGCTT	2	12	2787	2798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022115	GTGATC	2	12	45469	45480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022115	CCCGAT	2	12	59159	59170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022115	CAAGTT	2	12	169430	169441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022115	GACGCC	2	12	191690	191701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022115	CCGCCA	2	12	353221	353232	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022115	TGTGCA	2	12	512894	512905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022115	CGGTGC	2	12	527455	527466	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022115	AGTGCA	2	12	546780	546791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022115	CCGGCA	2	12	546852	546863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022115	CGGGTT	2	12	547450	547461	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022115	TGTGAT	2	12	567575	567586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022115	GCACTG	2	12	613618	613629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022115	CCTATC	2	12	642690	642701	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022115	TCCGAC	2	12	706058	706069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022115	ACCGTT	2	12	741181	741192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022115	CAGCGC	2	12	970965	970976	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022115	TGTGCA	2	12	1051467	1051478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022115	TTCCGT	2	12	1139708	1139719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022115	GGGGCG	2	12	1142499	1142510	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022115	AAGAAA	2	12	1205625	1205636	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022115	GCTACG	2	12	1208973	1208984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022115	TCGCCA	2	12	1274543	1274554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022115	TTGTGA	2	12	1275207	1275218	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022115	GAGAAA	2	12	1275319	1275330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022115	GATGCT	2	12	1281948	1281959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022115	AGTTCG	2	12	1306449	1306460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022115	TGTTCT	2	12	1319261	1319272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022115	TCGTAT	2	12	1321425	1321436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022115	TTTACG	2	12	1353207	1353218	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022115	GACAAG	2	12	1414659	1414670	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022115	AACCCT	2	12	1437391	1437402	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022115	CGGGTG	2	12	1487267	1487278	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022115	GTGGAG	2	12	1511607	1511618	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022115	AATTTC	2	12	1561385	1561396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022115	CTAGTA	2	12	1562708	1562719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022115	TTGCAC	2	12	1683705	1683716	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022115	GTTGCT	2	12	1784318	1784329	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022115	CTATGG	2	12	1825207	1825218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022115	GGGTAA	2	12	1935887	1935898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022115	GTCGGA	2	12	1992771	1992782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022115	GCGTCG	2	12	2231827	2231838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022115	CTTCGT	2	12	2265155	2265166	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022115	GCGCAA	2	12	2296764	2296775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022115	GTATCG	2	12	2389329	2389340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022115	AGACAG	2	12	2489664	2489675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022115	GGTCAG	2	12	2674081	2674092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022115	TTCGAT	2	12	2695975	2695986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022115	CACGTC	2	12	2702418	2702429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022115	AAAGGT	2	12	2754993	2755004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022115	TCGACG	2	12	2755961	2755972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022115	GGTCGA	2	12	2767429	2767440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022115	CTCTGA	2	12	2786964	2786975	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022115	CAAGTC	2	12	2845639	2845650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022115	AGCAGG	2	12	2952233	2952244	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022115	AGATGG	2	12	3072266	3072277	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022115	GTTGAT	2	12	3082916	3082927	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022115	CAACCG	2	12	3202414	3202425	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022115	CCGAGT	2	12	3207118	3207129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022115	CCGAGT	2	12	3207366	3207377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_022115	GAAAAC	2	12	3238606	3238617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022115	AACCCG	2	12	3267178	3267189	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022115	TGCCGG	2	12	3267776	3267787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022115	TGCACT	2	12	3267848	3267859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022115	TACGCG	2	12	3280251	3280262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022115	GCGGGA	2	12	3525109	3525120	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022115	GACCGG	2	12	3627429	3627440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022115	TCCGTC	2	12	3629017	3629028	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022115	CTGCAA	2	12	3840845	3840856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022115	GATTTC	2	12	3892056	3892067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022115	TGCTAT	2	12	3896051	3896062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022115	CCCGCG	2	12	3925233	3925244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_022115	AGAGCG	2	12	3966472	3966483	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022115	AACCCG	2	12	3973281	3973292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022115	TGCCGG	2	12	3973879	3973890	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_022115	TGCACT	2	12	3973951	3973962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022115	TGTCGG	2	12	3988557	3988568	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022115	GAACCG	2	12	3994936	3994947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_022115	ATGCAC	2	12	4014703	4014714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022115	CCAGAC	2	12	4030904	4030915	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022115	CGTGCA	2	12	4045637	4045648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022115	CCACCG	2	12	4052334	4052345	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022115	AACCCG	2	12	4196285	4196296	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022115	TGCCGG	2	12	4196883	4196894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022115	TGCACT	2	12	4196955	4196966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022115	ACCGAA	2	12	4342288	4342299	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022115	CGACCG	2	12	4382417	4382428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022115	AAACAC	3	18	4516356	4516373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022115	AACGGC	2	12	4523284	4523295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022115	CCGAGG	2	12	4594661	4594672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_022115	TGGTCG	2	12	4667492	4667503	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022115	CATCGA	2	12	4701188	4701199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022115	TGTTCG	2	12	4913211	4913222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_022115	TTTCGC	2	12	4960561	4960572	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022115	GGAAGC	2	12	5007981	5007992	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_022115	CAACAG	2	12	5046165	5046176	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022115	AACGGA	2	12	5082988	5082999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022115	CCGATG	2	12	5153013	5153024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_022115	AGCCGA	2	12	5162082	5162093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022115	CCACCT	2	12	5179403	5179414	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022115	CAGTGA	2	12	5313993	5314004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022115	TAGATA	2	12	5521555	5521566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022115	TCGGAT	2	12	5531865	5531876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022115	CCCGCG	2	12	5569245	5569256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022115	TCAACT	2	12	5695340	5695351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022115	TCGAAG	2	12	5736644	5736655	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022115	CGACGG	2	12	5779504	5779515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_022115	CCACGA	2	12	5952232	5952243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022115	GTCAAG	2	12	5986420	5986431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022115	CACCTT	2	12	6022179	6022190	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022115	CGGTGA	2	12	6035963	6035974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_022115	GCCACC	2	12	6081430	6081441	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_022115	GAGGTC	2	12	6086686	6086697	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022115	ACTGTC	2	12	6154101	6154112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022115	GCAACG	2	12	6239909	6239920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.