MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2 plasmid 1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022114	CAAA	2	8	130	137	75 %	0 %	0 %	25 %	532360756
2	NC_022114	TAAA	2	8	1926	1933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022114	GATA	2	8	2143	2150	50 %	25 %	25 %	0 %	532360758
4	NC_022114	TTGA	2	8	2411	2418	25 %	50 %	25 %	0 %	532360759
5	NC_022114	AACG	2	8	2498	2505	50 %	0 %	25 %	25 %	532360759
6	NC_022114	GTTG	2	8	3497	3504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022114	AAAG	2	8	3572	3579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022114	TCGG	2	8	3720	3727	0 %	25 %	50 %	25 %	532360762
9	NC_022114	AGAA	2	8	3807	3814	75 %	0 %	25 %	0 %	532360762
10	NC_022114	AGAA	2	8	3890	3897	75 %	0 %	25 %	0 %	532360762
11	NC_022114	TAAC	2	8	4001	4008	50 %	25 %	0 %	25 %	532360762
12	NC_022114	TCAA	2	8	4157	4164	50 %	25 %	0 %	25 %	532360762
13	NC_022114	GAAA	2	8	4306	4313	75 %	0 %	25 %	0 %	532360762
14	NC_022114	CAAT	2	8	4382	4389	50 %	25 %	0 %	25 %	532360762
15	NC_022114	TTAA	2	8	4537	4544	50 %	50 %	0 %	0 %	532360762
16	NC_022114	TAAA	2	8	4628	4635	75 %	25 %	0 %	0 %	532360762
17	NC_022114	AATT	2	8	4709	4716	50 %	50 %	0 %	0 %	532360762
18	NC_022114	AACA	2	8	4733	4740	75 %	0 %	0 %	25 %	532360762
19	NC_022114	AACG	2	8	4762	4769	50 %	0 %	25 %	25 %	532360762
20	NC_022114	GCAA	2	8	5184	5191	50 %	0 %	25 %	25 %	532360762
21	NC_022114	AGCA	2	8	5555	5562	50 %	0 %	25 %	25 %	532360762
22	NC_022114	AAAT	2	8	5667	5674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022114	GGGT	2	8	6018	6025	0 %	25 %	75 %	0 %	532360763
24	NC_022114	GATT	2	8	6055	6062	25 %	50 %	25 %	0 %	532360763
25	NC_022114	GACC	2	8	6267	6274	25 %	0 %	25 %	50 %	532360764
26	NC_022114	TAGT	2	8	6341	6348	25 %	50 %	25 %	0 %	532360764
27	NC_022114	AGGA	2	8	6679	6686	50 %	0 %	50 %	0 %	532360764
28	NC_022114	ATTT	2	8	6743	6750	25 %	75 %	0 %	0 %	532360765
29	NC_022114	AAGC	2	8	6802	6809	50 %	0 %	25 %	25 %	532360765
30	NC_022114	TATT	2	8	6882	6889	25 %	75 %	0 %	0 %	532360765
31	NC_022114	ACCA	2	8	7437	7444	50 %	0 %	0 %	50 %	532360767
32	NC_022114	AAAC	2	8	7463	7470	75 %	0 %	0 %	25 %	532360767
33	NC_022114	GTAT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	532360767
34	NC_022114	CCAA	2	8	8089	8096	50 %	0 %	0 %	50 %	532360768
35	NC_022114	GAAA	2	8	8097	8104	75 %	0 %	25 %	0 %	532360768
36	NC_022114	TGAT	2	8	8168	8175	25 %	50 %	25 %	0 %	532360768
37	NC_022114	TGGG	2	8	8999	9006	0 %	25 %	75 %	0 %	532360768
38	NC_022114	TTGT	2	8	9556	9563	0 %	75 %	25 %	0 %	532360768
39	NC_022114	TTTG	2	8	10506	10513	0 %	75 %	25 %	0 %	532360769
40	NC_022114	GGCA	2	8	10668	10675	25 %	0 %	50 %	25 %	532360769
41	NC_022114	GAAA	2	8	10778	10785	75 %	0 %	25 %	0 %	532360769
42	NC_022114	CAAG	2	8	11067	11074	50 %	0 %	25 %	25 %	532360769
43	NC_022114	ACCC	2	8	12221	12228	25 %	0 %	0 %	75 %	532360770
44	NC_022114	CCAA	2	8	12808	12815	50 %	0 %	0 %	50 %	532360771
45	NC_022114	TTAA	2	8	13258	13265	50 %	50 %	0 %	0 %	532360771
46	NC_022114	GCAA	2	8	13562	13569	50 %	0 %	25 %	25 %	532360772
47	NC_022114	AACT	2	8	13741	13748	50 %	25 %	0 %	25 %	532360773
48	NC_022114	AGCA	2	8	13899	13906	50 %	0 %	25 %	25 %	532360773
49	NC_022114	TGAC	2	8	14029	14036	25 %	25 %	25 %	25 %	532360773
50	NC_022114	CAGT	2	8	14621	14628	25 %	25 %	25 %	25 %	532360775
51	NC_022114	GGCG	2	8	14956	14963	0 %	0 %	75 %	25 %	532360775
52	NC_022114	TTAG	2	8	17436	17443	25 %	50 %	25 %	0 %	532360778
53	NC_022114	GAAC	2	8	17737	17744	50 %	0 %	25 %	25 %	532360778
54	NC_022114	ATTG	2	8	19541	19548	25 %	50 %	25 %	0 %	532360779
55	NC_022114	TAAA	2	8	19663	19670	75 %	25 %	0 %	0 %	532360779
56	NC_022114	CAAG	2	8	19694	19701	50 %	0 %	25 %	25 %	532360779
57	NC_022114	GTTA	2	8	19766	19773	25 %	50 %	25 %	0 %	532360779
58	NC_022114	GCCA	2	8	20393	20400	25 %	0 %	25 %	50 %	532360780
59	NC_022114	TAAA	2	8	20445	20452	75 %	25 %	0 %	0 %	532360780
60	NC_022114	AGAA	2	8	21600	21607	75 %	0 %	25 %	0 %	532360780
61	NC_022114	ACGA	2	8	22290	22297	50 %	0 %	25 %	25 %	532360781
62	NC_022114	GAAA	2	8	22313	22320	75 %	0 %	25 %	0 %	532360781
63	NC_022114	TATT	2	8	22399	22406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022114	AAAC	2	8	22499	22506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022114	TGAT	2	8	23071	23078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.