MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022113	ATAAAT	2	12	3319	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022113	TAAATC	2	12	17181	17192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022113	AATATA	2	12	63830	63841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022113	TTAACA	2	12	73738	73749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022113	TAAGAA	2	12	96108	96119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022113	GTTTTT	2	12	110174	110185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022113	TTTATA	2	12	158547	158558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022113	ATTAAT	2	12	158570	158581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022113	AAATTT	2	12	183086	183097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022113	TGTATA	2	12	206488	206499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022113	AGTGGA	2	12	225006	225017	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022113	ATATAG	2	12	246777	246788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022113	ATAATT	2	12	253048	253059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022113	AATTAT	2	12	260470	260481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022113	AACGAT	2	12	263174	263185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022113	TAACTT	2	12	271550	271561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022113	TAAAAT	2	12	323674	323685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022113	ATATGA	2	12	323718	323729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022113	TTCATT	2	12	328173	328184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022113	TTGTAA	2	12	333476	333487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022113	TAATAT	2	12	342854	342865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022113	AATTTG	2	12	371782	371793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022113	TAAAGA	2	12	373767	373778	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022113	TAAAAT	2	12	395975	395986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022113	TGTATA	2	12	411038	411049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022113	AAAATG	2	12	422742	422753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022113	TGGGTA	2	12	443756	443767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022113	TATGGT	2	12	452038	452049	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022113	AATTAA	2	12	457963	457974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022113	TTATAA	2	12	482759	482770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022113	CTTAAA	2	12	491862	491873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022113	ATTGCG	2	12	531137	531148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022113	TAAAAT	2	12	550474	550485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022113	TTTTAA	2	12	556561	556572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022113	CATCAA	2	12	585205	585216	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022113	TAATTT	2	12	589445	589456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022113	TGAATA	2	12	605921	605932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022113	AGGCAT	2	12	617383	617394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022113	TTAAAA	2	12	633879	633890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022113	TAGTTA	2	12	638307	638318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022113	TGAAAA	2	12	664817	664828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022113	TATGTT	2	12	681342	681353	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022113	ATAGTT	2	12	684879	684890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022113	TATAAA	2	12	698465	698476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022113	TAGAAT	2	12	751888	751899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022113	TATCAA	2	12	760716	760727	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022113	TTTTGA	2	12	764574	764585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022113	GTTGGG	2	12	795218	795229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022113	AAATTA	2	12	797248	797259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022113	AAGCAC	2	12	805985	805996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022113	TAAAAT	2	12	813703	813714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022113	AATTAA	2	12	888224	888235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022113	TTTAAT	2	12	892941	892952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022113	AACGGA	2	12	927155	927166	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022113	AATAAA	2	12	935189	935200	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022113	CATTTA	2	12	957215	957226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022113	ATCATA	2	12	959120	959131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022113	TCAAAA	2	12	965424	965435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022113	ATTGCA	2	12	966619	966630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022113	TTTTCT	2	12	979211	979222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022113	ATTTTT	2	12	1039341	1039352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022113	ATAATT	2	12	1040138	1040149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022113	TCATTA	2	12	1045223	1045234	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022113	TAATGA	2	12	1053314	1053325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022113	ATATTT	2	12	1060604	1060615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022113	TTCGAT	2	12	1069595	1069606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022113	ATTTAT	2	12	1073663	1073674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022113	ATTATA	2	12	1077587	1077598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022113	AAATTT	2	12	1078394	1078405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022113	AAGTAA	2	12	1100942	1100953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022113	TCGTTT	2	12	1103494	1103505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022113	TTAATT	2	12	1114212	1114223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022113	AATTAA	2	12	1116948	1116959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022113	TGATTT	2	12	1121911	1121922	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022113	GAAATT	2	12	1161914	1161925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022113	AATGAT	2	12	1174689	1174700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022113	TTTCAT	2	12	1204975	1204986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022113	TATATT	2	12	1209630	1209641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022113	ATGTAT	2	12	1235334	1235345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022113	ATAATT	2	12	1236297	1236308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022113	TGAAAA	2	12	1241598	1241609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022113	TTAAAG	2	12	1241897	1241908	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022113	TTAAAG	2	12	1243688	1243699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022113	AAATAT	2	12	1244551	1244562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022113	TTAAAG	2	12	1244621	1244632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022113	AATTCA	2	12	1246279	1246290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_022113	AAATAT	2	12	1246421	1246432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022113	AAAATT	2	12	1264956	1264967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022113	ATTAAA	2	12	1274188	1274199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022113	ATATAA	2	12	1281846	1281857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022113	AATATT	2	12	1285260	1285271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022113	TTAACA	2	12	1285297	1285308	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022113	GTTTTA	2	12	1313580	1313591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022113	TATCTT	2	12	1350341	1350352	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022113	TTGATT	2	12	1350404	1350415	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022113	ATTCTA	2	12	1357947	1357958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022113	AATAAA	2	12	1360799	1360810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022113	TACTTG	2	12	1419748	1419759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022113	TTAATC	2	12	1433226	1433237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022113	AATTGA	2	12	1433756	1433767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022113	TCTTTT	2	12	1458121	1458132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022113	TAAAAA	2	12	1487199	1487210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022113	AATATA	2	12	1501196	1501207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022113	ATAAAA	2	12	1524757	1524768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022113	TCATTA	2	12	1529841	1529852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_022113	ATTATC	2	12	1531103	1531114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022113	ACAAGA	2	12	1533034	1533045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022113	TAAAAA	2	12	1545935	1545946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022113	TTATAG	2	12	1555088	1555099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022113	AATTTA	2	12	1563124	1563135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022113	AGCCAA	2	12	1591011	1591022	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022113	TTGACT	2	12	1591030	1591041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_022113	TTTAAC	2	12	1595914	1595925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022113	TTATAA	2	12	1598340	1598351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022113	ACCTTT	2	12	1608297	1608308	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022113	AGTTTT	2	12	1636776	1636787	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022113	AATTAA	2	12	1638021	1638032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022113	TAAAAC	2	12	1641161	1641172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022113	AATTTA	2	12	1650970	1650981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022113	ATTTTC	2	12	1658926	1658937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_022113	TAAAAA	2	12	1691991	1692002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022113	TACTTT	2	12	1706668	1706679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022113	CATTAT	2	12	1706825	1706836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_022113	TTTCAT	2	12	1711869	1711880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022113	TTTCAT	2	12	1725783	1725794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_022113	TATTTA	2	12	1730898	1730909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022113	TAATTA	2	12	1745237	1745248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022113	TATCAA	2	12	1749139	1749150	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_022113	TAAAAA	2	12	1751340	1751351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022113	GTTTGG	2	12	1770336	1770347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022113	TCAAAA	2	12	1770441	1770452	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022113	ATTATA	2	12	1820059	1820070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022113	TCACTT	2	12	1836404	1836415	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022113	TTATAA	2	12	1842316	1842327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022113	ACTTTA	2	12	1845665	1845676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022113	TAAAAA	2	12	1851095	1851106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022113	TTCTAC	2	12	1865774	1865785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022113	ATTTTT	2	12	1872994	1873005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022113	TATTTT	2	12	1875332	1875343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022113	TTTAAC	2	12	1882927	1882938	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022113	TCATTA	2	12	1888576	1888587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_022113	TCTAAC	2	12	1912844	1912855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022113	TTTTAA	2	12	1917758	1917769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022113	TAATTT	2	12	1927687	1927698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_022113	TTTAAA	2	12	1977658	1977669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022113	ATTTAC	2	12	1983452	1983463	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_022113	AATATT	2	12	2034194	2034205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022113	CCTATT	2	12	2039968	2039979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022113	TTAATT	2	12	2068373	2068384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022113	ATATTT	2	12	2093619	2093630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022113	AAAAAG	2	12	2095707	2095718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022113	TAAAAA	2	12	2125364	2125375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022113	ATTTTG	2	12	2155046	2155057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_022113	CAAATA	2	12	2165063	2165074	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_022113	TTGTGC	2	12	2177962	2177973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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164	NC_022113	ATTAAT	2	12	2183486	2183497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022113	TTTTAA	2	12	2192407	2192418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.