MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053

Total Repeats: 36135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022113	TAT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358223
2	NC_022113	CAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358223
3	NC_022113	TGT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358223
4	NC_022113	TAC	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358223
5	NC_022113	GAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
6	NC_022113	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358223
7	NC_022113	CAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358223
8	NC_022113	AAC	2	6	852	857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358223
9	NC_022113	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358223
10	NC_022113	TCA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358223
11	NC_022113	ATA	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358223
12	NC_022113	TTA	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358223
13	NC_022113	TTA	2	6	1189	1194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358223
14	NC_022113	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358223
15	NC_022113	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
16	NC_022113	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
17	NC_022113	TTG	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358223
18	NC_022113	CCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532358223
19	NC_022113	AGA	2	6	1415	1420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
20	NC_022113	GAA	3	9	1426	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
21	NC_022113	CCA	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532358223
22	NC_022113	ATT	2	6	1539	1544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358223
23	NC_022113	CTG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358223
24	NC_022113	GAA	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
25	NC_022113	TGG	2	6	1785	1790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358223
26	NC_022113	AGA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
27	NC_022113	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358223
28	NC_022113	ATT	2	6	2208	2213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
29	NC_022113	TTA	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
30	NC_022113	AAC	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358224
31	NC_022113	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358224
32	NC_022113	TTG	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358224
33	NC_022113	TTA	2	6	2558	2563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
34	NC_022113	AGA	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358224
35	NC_022113	TCA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358224
36	NC_022113	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358224
37	NC_022113	TCT	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358224
38	NC_022113	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
39	NC_022113	ACA	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358224
40	NC_022113	TTA	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
41	NC_022113	GGT	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358224
42	NC_022113	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358224
43	NC_022113	TGA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358224
44	NC_022113	GTT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358224
45	NC_022113	TCT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358224
46	NC_022113	AGA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358224
47	NC_022113	GGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358224
48	NC_022113	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358224
49	NC_022113	TTC	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358224
50	NC_022113	GAC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358224
51	NC_022113	ATT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358225
52	NC_022113	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358225
53	NC_022113	GTA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358225
54	NC_022113	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358225
55	NC_022113	TGG	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358225
56	NC_022113	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358226
57	NC_022113	GTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358226
58	NC_022113	AGA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358226
59	NC_022113	CTC	2	6	4318	4323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532358226
60	NC_022113	GAC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358226
61	NC_022113	CTG	2	6	4366	4371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358226
62	NC_022113	AAT	2	6	4419	4424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358226
63	NC_022113	AAG	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358226
64	NC_022113	ATT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358226
65	NC_022113	GAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358226
66	NC_022113	ATA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358226
67	NC_022113	GAT	2	6	4740	4745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358226
68	NC_022113	TTA	3	9	4875	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358226
69	NC_022113	GAT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358226
70	NC_022113	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358226
71	NC_022113	ACA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358227
72	NC_022113	ATA	2	6	5218	5223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358227
73	NC_022113	GTT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358227
74	NC_022113	TGG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358227
75	NC_022113	CGG	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532358227
76	NC_022113	TGG	2	6	5420	5425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358227
77	NC_022113	TCA	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358227
78	NC_022113	TCA	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358227
79	NC_022113	AAG	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358227
80	NC_022113	TGA	2	6	5711	5716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358227
81	NC_022113	AGA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358227
82	NC_022113	ATG	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358227
83	NC_022113	TCA	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358227
84	NC_022113	GAT	2	6	5835	5840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358227
85	NC_022113	GGT	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358227
86	NC_022113	AGA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358227
87	NC_022113	ATT	2	6	6146	6151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358227
88	NC_022113	TAT	2	6	6218	6223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358227
89	NC_022113	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532358227
90	NC_022113	TGC	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358227
91	NC_022113	CGT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358227
92	NC_022113	GAA	2	6	6339	6344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358227
93	NC_022113	TTA	2	6	6618	6623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358227
94	NC_022113	TTC	2	6	6627	6632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358227
95	NC_022113	TAT	2	6	6720	6725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358227
96	NC_022113	ACA	2	6	6840	6845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358227
97	NC_022113	AGA	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358227
98	NC_022113	TCG	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358228
99	NC_022113	TTG	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358228
100	NC_022113	GCA	3	9	7383	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358228
101	NC_022113	TAA	2	6	7448	7453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358228
102	NC_022113	ATG	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
103	NC_022113	CCA	2	6	7581	7586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532358228
104	NC_022113	CTG	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358228
105	NC_022113	GAA	2	6	7779	7784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
106	NC_022113	TTG	2	6	7807	7812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358228
107	NC_022113	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
108	NC_022113	CAT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358228
109	NC_022113	AAG	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
110	NC_022113	ATT	2	6	8092	8097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358228
111	NC_022113	GTT	2	6	8115	8120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358228
112	NC_022113	AGA	2	6	8121	8126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
113	NC_022113	ATT	2	6	8211	8216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358228
114	NC_022113	CAA	2	6	8265	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358228
115	NC_022113	TTA	2	6	8373	8378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358228
116	NC_022113	TGA	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
117	NC_022113	TTA	2	6	8424	8429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358228
118	NC_022113	TGA	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
119	NC_022113	TCG	2	6	8480	8485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358228
120	NC_022113	AGA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
121	NC_022113	ATA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358228
122	NC_022113	GTG	2	6	8620	8625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358228
123	NC_022113	GTG	2	6	8629	8634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358228
124	NC_022113	GAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
125	NC_022113	ATG	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
126	NC_022113	CTT	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358228
127	NC_022113	GTG	2	6	8893	8898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358228
128	NC_022113	AGA	2	6	8969	8974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
129	NC_022113	TGA	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
130	NC_022113	AAG	2	6	9010	9015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358228
131	NC_022113	CAT	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358228
132	NC_022113	TGA	2	6	9167	9172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358228
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136	NC_022113	ATT	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358228
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164	NC_022113	GAT	2	6	11002	11007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358230
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254	NC_022113	AAC	2	6	17704	17709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358235
255	NC_022113	TAC	2	6	17748	17753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358235
256	NC_022113	GAA	2	6	17763	17768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358235
257	NC_022113	CCA	2	6	17771	17776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532358235
258	NC_022113	AGA	2	6	17863	17868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358235
259	NC_022113	TCA	2	6	17904	17909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358235
260	NC_022113	TAT	2	6	18030	18035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358235
261	NC_022113	ATT	2	6	18044	18049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358235
262	NC_022113	TAT	2	6	18063	18068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358235
263	NC_022113	ACG	2	6	18239	18244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358235
264	NC_022113	ACT	2	6	18256	18261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358235
265	NC_022113	AAT	2	6	18305	18310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358235
266	NC_022113	AAT	2	6	18333	18338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358236
267	NC_022113	TCA	2	6	18380	18385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358236
268	NC_022113	ATC	2	6	18388	18393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358236
269	NC_022113	TGA	2	6	18470	18475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
270	NC_022113	CAA	3	9	18554	18562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358236
271	NC_022113	ATA	2	6	18563	18568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358236
272	NC_022113	ATT	2	6	18867	18872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358236
273	NC_022113	AGA	2	6	19047	19052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358236
274	NC_022113	GTG	3	9	19202	19210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358236
275	NC_022113	GCA	2	6	19393	19398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358236
276	NC_022113	ATG	2	6	19420	19425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
277	NC_022113	AAT	2	6	19426	19431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358236
278	NC_022113	ACG	2	6	19479	19484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358236
279	NC_022113	TGA	2	6	19487	19492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
280	NC_022113	TTA	2	6	19529	19534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358236
281	NC_022113	GAT	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
282	NC_022113	ATG	2	6	19555	19560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
283	NC_022113	TTG	2	6	19583	19588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358236
284	NC_022113	GTT	2	6	19648	19653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358236
285	NC_022113	ATC	2	6	19658	19663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358236
286	NC_022113	GTG	2	6	19670	19675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358236
287	NC_022113	TTG	2	6	19696	19701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358236
288	NC_022113	CAG	2	6	19730	19735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358236
289	NC_022113	AAC	2	6	19772	19777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358236
290	NC_022113	TAT	2	6	19815	19820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358236
291	NC_022113	GAT	2	6	19930	19935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358236
292	NC_022113	ATC	2	6	20030	20035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358236
293	NC_022113	AGC	2	6	20052	20057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358236
294	NC_022113	CAT	2	6	20090	20095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358236
295	NC_022113	TGT	2	6	20097	20102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358236
296	NC_022113	TGG	2	6	20184	20189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358236
297	NC_022113	TGC	2	6	20208	20213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358236
298	NC_022113	ACA	2	6	20259	20264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358236
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300	NC_022113	CTT	2	6	20384	20389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358237
301	NC_022113	CAA	2	6	20475	20480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358237
302	NC_022113	GGT	2	6	20556	20561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358237
303	NC_022113	AAG	2	6	20704	20709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358237
304	NC_022113	ATT	2	6	20848	20853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358238
305	NC_022113	TAC	2	6	20874	20879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358238
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311	NC_022113	ATG	2	6	21158	21163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
312	NC_022113	ATG	2	6	21170	21175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
313	NC_022113	ATC	2	6	21228	21233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358238
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321	NC_022113	ATG	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
322	NC_022113	TGA	2	6	21978	21983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
323	NC_022113	GTG	2	6	21995	22000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358238
324	NC_022113	GAT	2	6	22009	22014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
325	NC_022113	GAT	2	6	22018	22023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
326	NC_022113	GGT	2	6	22024	22029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358238
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328	NC_022113	ATC	2	6	22069	22074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358238
329	NC_022113	ATA	2	6	22133	22138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358238
330	NC_022113	ATG	2	6	22171	22176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358238
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333	NC_022113	GGT	2	6	22560	22565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358239
334	NC_022113	AAT	2	6	22566	22571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358239
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337	NC_022113	ATA	2	6	22822	22827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358239
338	NC_022113	ATT	2	6	22931	22936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358239
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340	NC_022113	TGA	2	6	23003	23008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358239
341	NC_022113	GAA	2	6	23016	23021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358239
342	NC_022113	TAT	2	6	23022	23027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358239
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344	NC_022113	ATT	2	6	23297	23302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358239
345	NC_022113	CAT	2	6	23316	23321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358239
346	NC_022113	ACA	3	9	23349	23357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358239
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353	NC_022113	TGA	3	9	24954	24962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358240
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364	NC_022113	GCT	2	6	25764	25769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358241
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370	NC_022113	ATA	2	6	26177	26182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358241
371	NC_022113	TTG	2	6	26198	26203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358241
372	NC_022113	ATT	2	6	26217	26222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358241
373	NC_022113	ATG	2	6	26345	26350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358241
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375	NC_022113	AAG	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358241
376	NC_022113	TAT	2	6	26469	26474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358241
377	NC_022113	CGT	2	6	26485	26490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358241
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