MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 1516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022112	CAAAC	2	10	580	589	60 %	0 %	0 %	40 %	532355526
2	NC_022112	CAACG	2	10	1693	1702	40 %	0 %	20 %	40 %	532355527
3	NC_022112	GAAGA	2	10	4841	4850	60 %	0 %	40 %	0 %	532355530
4	NC_022112	GGCAC	2	10	5327	5336	20 %	0 %	40 %	40 %	532355530
5	NC_022112	GACAA	2	10	5601	5610	60 %	0 %	20 %	20 %	532355530
6	NC_022112	GAAAA	2	10	7686	7695	80 %	0 %	20 %	0 %	532355531
7	NC_022112	CATTT	2	10	9926	9935	20 %	60 %	0 %	20 %	532355532
8	NC_022112	ATTGA	2	10	17489	17498	40 %	40 %	20 %	0 %	532355542
9	NC_022112	CAACC	2	10	18822	18831	40 %	0 %	0 %	60 %	532355544
10	NC_022112	TGGCT	2	10	20410	20419	0 %	40 %	40 %	20 %	532355546
11	NC_022112	GCTTT	2	10	21962	21971	0 %	60 %	20 %	20 %	532355547
12	NC_022112	CAGCG	2	10	22609	22618	20 %	0 %	40 %	40 %	532355547
13	NC_022112	TCCTG	2	10	25534	25543	0 %	40 %	20 %	40 %	532355550
14	NC_022112	TTGTT	2	10	26323	26332	0 %	80 %	20 %	0 %	532355551
15	NC_022112	AAGCC	2	10	30909	30918	40 %	0 %	20 %	40 %	532355554
16	NC_022112	CAAAG	2	10	31753	31762	60 %	0 %	20 %	20 %	532355555
17	NC_022112	AGCGA	2	10	41472	41481	40 %	0 %	40 %	20 %	532355564
18	NC_022112	TTTCT	2	10	41719	41728	0 %	80 %	0 %	20 %	532355565
19	NC_022112	GAAAG	2	10	44075	44084	60 %	0 %	40 %	0 %	532355568
20	NC_022112	GTTTG	2	10	45074	45083	0 %	60 %	40 %	0 %	532355569
21	NC_022112	GAAAA	2	10	47423	47432	80 %	0 %	20 %	0 %	532355571
22	NC_022112	TTGAA	2	10	47848	47857	40 %	40 %	20 %	0 %	532355571
23	NC_022112	ATAAA	2	10	47994	48003	80 %	20 %	0 %	0 %	532355571
24	NC_022112	TCAAT	2	10	48859	48868	40 %	40 %	0 %	20 %	532355572
25	NC_022112	ATGAA	2	10	49609	49618	60 %	20 %	20 %	0 %	532355573
26	NC_022112	TTTCT	2	10	51771	51780	0 %	80 %	0 %	20 %	532355575
27	NC_022112	TTCTT	2	10	52719	52728	0 %	80 %	0 %	20 %	532355576
28	NC_022112	CAGTT	2	10	59854	59863	20 %	40 %	20 %	20 %	532355579
29	NC_022112	TTGAT	2	10	66877	66886	20 %	60 %	20 %	0 %	532355587
30	NC_022112	TTGCT	2	10	66970	66979	0 %	60 %	20 %	20 %	532355587
31	NC_022112	CGTTT	2	10	68870	68879	0 %	60 %	20 %	20 %	532355589
32	NC_022112	AATGC	2	10	70721	70730	40 %	20 %	20 %	20 %	532355591
33	NC_022112	TAGTA	2	10	72250	72259	40 %	40 %	20 %	0 %	532355593
34	NC_022112	ACCGG	2	10	72309	72318	20 %	0 %	40 %	40 %	532355593
35	NC_022112	GATTG	2	10	72362	72371	20 %	40 %	40 %	0 %	532355593
36	NC_022112	AGCAA	2	10	73656	73665	60 %	0 %	20 %	20 %	532355593
37	NC_022112	GAAAA	2	10	76571	76580	80 %	0 %	20 %	0 %	532355596
38	NC_022112	CAGAA	2	10	76759	76768	60 %	0 %	20 %	20 %	532355596
39	NC_022112	TGGCG	2	10	77004	77013	0 %	20 %	60 %	20 %	532355596
40	NC_022112	TGTCG	2	10	77744	77753	0 %	40 %	40 %	20 %	532355596
41	NC_022112	TTTTA	2	10	79215	79224	20 %	80 %	0 %	0 %	532355597
42	NC_022112	ATGGG	2	10	81085	81094	20 %	20 %	60 %	0 %	532355598
43	NC_022112	ATCGC	2	10	81148	81157	20 %	20 %	20 %	40 %	532355598
44	NC_022112	GTGCC	2	10	81608	81617	0 %	20 %	40 %	40 %	532355599
45	NC_022112	TAATT	2	10	82200	82209	40 %	60 %	0 %	0 %	532355599
46	NC_022112	TAAGT	2	10	84944	84953	40 %	40 %	20 %	0 %	532355602
47	NC_022112	TCATC	2	10	86617	86626	20 %	40 %	0 %	40 %	532355604
48	NC_022112	GAAGC	2	10	90025	90034	40 %	0 %	40 %	20 %	532355606
49	NC_022112	TGGCA	2	10	90192	90201	20 %	20 %	40 %	20 %	532355606
50	NC_022112	GTTTC	2	10	92973	92982	0 %	60 %	20 %	20 %	532355608
51	NC_022112	AAGAA	2	10	93542	93551	80 %	0 %	20 %	0 %	532355609
52	NC_022112	CCAAC	2	10	94309	94318	40 %	0 %	0 %	60 %	532355610
53	NC_022112	TCCCA	2	10	95356	95365	20 %	20 %	0 %	60 %	532355611
54	NC_022112	GCTTT	2	10	98997	99006	0 %	60 %	20 %	20 %	532355614
55	NC_022112	ATTGA	2	10	102251	102260	40 %	40 %	20 %	0 %	532355616
56	NC_022112	CAAAA	2	10	104925	104934	80 %	0 %	0 %	20 %	532355621
57	NC_022112	ATTTC	2	10	105451	105460	20 %	60 %	0 %	20 %	532355621
58	NC_022112	GAAGA	2	10	111777	111786	60 %	0 %	40 %	0 %	532355626
59	NC_022112	GAAAA	2	10	111795	111804	80 %	0 %	20 %	0 %	532355626
60	NC_022112	CAAAG	2	10	111861	111870	60 %	0 %	20 %	20 %	532355626
61	NC_022112	TGACA	2	10	118918	118927	40 %	20 %	20 %	20 %	532355631
62	NC_022112	GTTTT	2	10	120501	120510	0 %	80 %	20 %	0 %	532355633
63	NC_022112	AGACC	2	10	123701	123710	40 %	0 %	20 %	40 %	532355634
64	NC_022112	GCTTC	2	10	123801	123810	0 %	40 %	20 %	40 %	532355634
65	NC_022112	CGGCC	2	10	126331	126340	0 %	0 %	40 %	60 %	532355636
66	NC_022112	CGTCA	2	10	126643	126652	20 %	20 %	20 %	40 %	532355636
67	NC_022112	CTCAA	2	10	126914	126923	40 %	20 %	0 %	40 %	532355636
68	NC_022112	ACCAA	2	10	127185	127194	60 %	0 %	0 %	40 %	532355636
69	NC_022112	CAAGT	2	10	128145	128154	40 %	20 %	20 %	20 %	532355637
70	NC_022112	GACCC	2	10	129593	129602	20 %	0 %	20 %	60 %	532355638
71	NC_022112	TTGGC	2	10	131697	131706	0 %	40 %	40 %	20 %	532355639
72	NC_022112	TGTGT	2	10	133234	133243	0 %	60 %	40 %	0 %	532355640
73	NC_022112	ATACT	2	10	140047	140056	40 %	40 %	0 %	20 %	532355647
74	NC_022112	ATTGC	2	10	143151	143160	20 %	40 %	20 %	20 %	532355650
75	NC_022112	TGATC	2	10	143981	143990	20 %	40 %	20 %	20 %	532355651
76	NC_022112	CATGC	2	10	145111	145120	20 %	20 %	20 %	40 %	532355652
77	NC_022112	CGATC	2	10	150293	150302	20 %	20 %	20 %	40 %	532355657
78	NC_022112	ATTTG	2	10	153073	153082	20 %	60 %	20 %	0 %	532355660
79	NC_022112	AAAGC	2	10	156357	156366	60 %	0 %	20 %	20 %	532355665
80	NC_022112	GGGAT	2	10	157518	157527	20 %	20 %	60 %	0 %	532355666
81	NC_022112	GCTCA	2	10	157853	157862	20 %	20 %	20 %	40 %	532355666
82	NC_022112	ATTAC	2	10	165644	165653	40 %	40 %	0 %	20 %	532355673
83	NC_022112	TTTTC	2	10	169034	169043	0 %	80 %	0 %	20 %	532355677
84	NC_022112	CAAGC	2	10	170424	170433	40 %	0 %	20 %	40 %	532355678
85	NC_022112	AATGA	2	10	171724	171733	60 %	20 %	20 %	0 %	532355679
86	NC_022112	CCAAC	2	10	172291	172300	40 %	0 %	0 %	60 %	532355680
87	NC_022112	GCCTT	2	10	174183	174192	0 %	40 %	20 %	40 %	532355682
88	NC_022112	GTAAG	2	10	178319	178328	40 %	20 %	40 %	0 %	532355686
89	NC_022112	CACAA	2	10	179753	179762	60 %	0 %	0 %	40 %	532355687
90	NC_022112	GACCA	2	10	181868	181877	40 %	0 %	20 %	40 %	532355689
91	NC_022112	TGGTC	2	10	182322	182331	0 %	40 %	40 %	20 %	532355690
92	NC_022112	AAAAG	2	10	183806	183815	80 %	0 %	20 %	0 %	532355691
93	NC_022112	TGAAT	2	10	186717	186726	40 %	40 %	20 %	0 %	532355693
94	NC_022112	ATCAA	2	10	188170	188179	60 %	20 %	0 %	20 %	532355695
95	NC_022112	CCGTC	2	10	188939	188948	0 %	20 %	20 %	60 %	532355696
96	NC_022112	AGTTG	2	10	189952	189961	20 %	40 %	40 %	0 %	532355696
97	NC_022112	CCGTT	2	10	192217	192226	0 %	40 %	20 %	40 %	532355699
98	NC_022112	CCAAC	2	10	194626	194635	40 %	0 %	0 %	60 %	532355700
99	NC_022112	GAACC	2	10	195877	195886	40 %	0 %	20 %	40 %	532355700
100	NC_022112	TGAAG	2	10	197275	197284	40 %	20 %	40 %	0 %	532355701
101	NC_022112	CAGCC	2	10	198187	198196	20 %	0 %	20 %	60 %	532355701
102	NC_022112	GCGGT	2	10	199320	199329	0 %	20 %	60 %	20 %	532355703
103	NC_022112	TCCTT	2	10	202059	202068	0 %	60 %	0 %	40 %	532355705
104	NC_022112	GTTGA	2	10	206821	206830	20 %	40 %	40 %	0 %	532355708
105	NC_022112	CGTTG	2	10	209046	209055	0 %	40 %	40 %	20 %	532355710
106	NC_022112	AGATG	2	10	210022	210031	40 %	20 %	40 %	0 %	532355711
107	NC_022112	TTCAT	2	10	212509	212518	20 %	60 %	0 %	20 %	532355715
108	NC_022112	GGCAT	2	10	215413	215422	20 %	20 %	40 %	20 %	532355720
109	NC_022112	CGGCA	2	10	216017	216026	20 %	0 %	40 %	40 %	532355721
110	NC_022112	GCCAA	2	10	221003	221012	40 %	0 %	20 %	40 %	532355729
111	NC_022112	CTGGG	2	10	223770	223779	0 %	20 %	60 %	20 %	532355733
112	NC_022112	ACTTC	2	10	225932	225941	20 %	40 %	0 %	40 %	532355735
113	NC_022112	GTAGA	2	10	226378	226387	40 %	20 %	40 %	0 %	532355736
114	NC_022112	GCTTG	2	10	228183	228192	0 %	40 %	40 %	20 %	532355738
115	NC_022112	CGTCA	2	10	232147	232156	20 %	20 %	20 %	40 %	532355742
116	NC_022112	TCAAT	2	10	232271	232280	40 %	40 %	0 %	20 %	532355742
117	NC_022112	AAATC	2	10	239152	239161	60 %	20 %	0 %	20 %	532355748
118	NC_022112	TGGAA	2	10	240217	240226	40 %	20 %	40 %	0 %	532355749
119	NC_022112	CAGAA	2	10	240721	240730	60 %	0 %	20 %	20 %	532355749
120	NC_022112	ATTTG	2	10	243946	243955	20 %	60 %	20 %	0 %	532355752
121	NC_022112	AAATG	2	10	247375	247384	60 %	20 %	20 %	0 %	532355754
122	NC_022112	CAAAA	2	10	247895	247904	80 %	0 %	0 %	20 %	532355754
123	NC_022112	ACTGG	2	10	248087	248096	20 %	20 %	40 %	20 %	532355755
124	NC_022112	CCATG	2	10	249291	249300	20 %	20 %	20 %	40 %	532355756
125	NC_022112	GAGTC	2	10	251057	251066	20 %	20 %	40 %	20 %	532355758
126	NC_022112	ACTCA	2	10	252030	252039	40 %	20 %	0 %	40 %	532355759
127	NC_022112	ATTTG	2	10	252676	252685	20 %	60 %	20 %	0 %	532355760
128	NC_022112	TTTGA	2	10	256569	256578	20 %	60 %	20 %	0 %	532355762
129	NC_022112	AGTTG	2	10	259335	259344	20 %	40 %	40 %	0 %	532355766
130	NC_022112	TGATT	2	10	260114	260123	20 %	60 %	20 %	0 %	532355767
131	NC_022112	TGTCA	2	10	260358	260367	20 %	40 %	20 %	20 %	532355767
132	NC_022112	TGATC	2	10	264162	264171	20 %	40 %	20 %	20 %	532355770
133	NC_022112	AACTT	2	10	266181	266190	40 %	40 %	0 %	20 %	532355771
134	NC_022112	CAAAC	2	10	269836	269845	60 %	0 %	0 %	40 %	532355775
135	NC_022112	GATCG	2	10	271100	271109	20 %	20 %	40 %	20 %	532355777
136	NC_022112	AGATC	2	10	273206	273215	40 %	20 %	20 %	20 %	532355778
137	NC_022112	GCACT	2	10	273439	273448	20 %	20 %	20 %	40 %	532355778
138	NC_022112	ATTCG	2	10	280961	280970	20 %	40 %	20 %	20 %	532355781
139	NC_022112	ATGCT	2	10	282917	282926	20 %	40 %	20 %	20 %	532355783
140	NC_022112	ATGGC	2	10	283046	283055	20 %	20 %	40 %	20 %	532355783
141	NC_022112	GATCG	2	10	284165	284174	20 %	20 %	40 %	20 %	532355784
142	NC_022112	TTGCT	2	10	285061	285070	0 %	60 %	20 %	20 %	532355785
143	NC_022112	ACATG	2	10	285934	285943	40 %	20 %	20 %	20 %	532355786
144	NC_022112	ATGGC	2	10	286267	286276	20 %	20 %	40 %	20 %	532355787
145	NC_022112	AATCG	2	10	288485	288494	40 %	20 %	20 %	20 %	532355789
146	NC_022112	ATTGG	2	10	291176	291185	20 %	40 %	40 %	0 %	532355792
147	NC_022112	CGTCA	2	10	294236	294245	20 %	20 %	20 %	40 %	532355794
148	NC_022112	CGCGG	2	10	298389	298398	0 %	0 %	60 %	40 %	532355796
149	NC_022112	GGCGC	2	10	299005	299014	0 %	0 %	60 %	40 %	532355796
150	NC_022112	TGCTT	2	10	301516	301525	0 %	60 %	20 %	20 %	532355798
151	NC_022112	GATTG	2	10	302198	302207	20 %	40 %	40 %	0 %	532355798
152	NC_022112	TGTTT	2	10	303506	303515	0 %	80 %	20 %	0 %	532355799
153	NC_022112	TGCCG	2	10	306119	306128	0 %	20 %	40 %	40 %	532355801
154	NC_022112	TCTGA	2	10	307043	307052	20 %	40 %	20 %	20 %	532355802
155	NC_022112	AAGAC	2	10	309678	309687	60 %	0 %	20 %	20 %	532355804
156	NC_022112	ATCGT	2	10	309894	309903	20 %	40 %	20 %	20 %	532355804
157	NC_022112	TTGAA	2	10	311377	311386	40 %	40 %	20 %	0 %	532355805
158	NC_022112	ACTTG	2	10	313166	313175	20 %	40 %	20 %	20 %	532355806
159	NC_022112	TTGGC	2	10	314457	314466	0 %	40 %	40 %	20 %	532355808
160	NC_022112	GTTGG	2	10	314981	314990	0 %	40 %	60 %	0 %	532355809
161	NC_022112	TCCAG	2	10	317606	317615	20 %	20 %	20 %	40 %	532355812
162	NC_022112	AGGCA	2	10	325436	325445	40 %	0 %	40 %	20 %	532355819
163	NC_022112	TCCAG	2	10	325719	325728	20 %	20 %	20 %	40 %	532355820
164	NC_022112	GCACA	2	10	327384	327393	40 %	0 %	20 %	40 %	532355821
165	NC_022112	AGTTG	2	10	328343	328352	20 %	40 %	40 %	0 %	532355823
166	NC_022112	CAGCC	2	10	328463	328472	20 %	0 %	20 %	60 %	532355823
167	NC_022112	TGCTC	2	10	328984	328993	0 %	40 %	20 %	40 %	532355824
168	NC_022112	CAGAT	2	10	329484	329493	40 %	20 %	20 %	20 %	532355824
169	NC_022112	GTTTT	2	10	330014	330023	0 %	80 %	20 %	0 %	532355824
170	NC_022112	GGAAT	2	10	331363	331372	40 %	20 %	40 %	0 %	532355825
171	NC_022112	TCGCC	2	10	331735	331744	0 %	20 %	20 %	60 %	532355825
172	NC_022112	TGGTG	2	10	332339	332348	0 %	40 %	60 %	0 %	532355825
173	NC_022112	CGATC	2	10	332882	332891	20 %	20 %	20 %	40 %	532355826
174	NC_022112	ATTAT	2	10	333107	333116	40 %	60 %	0 %	0 %	532355826
175	NC_022112	CATCA	2	10	334424	334433	40 %	20 %	0 %	40 %	532355827
176	NC_022112	TGCGG	2	10	338131	338140	0 %	20 %	60 %	20 %	532355829
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181	NC_022112	TGATC	2	10	357429	357438	20 %	40 %	20 %	20 %	532355845
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199	NC_022112	GCGTG	2	10	406435	406444	0 %	20 %	60 %	20 %	532355883
200	NC_022112	GGAAC	2	10	407267	407276	40 %	0 %	40 %	20 %	532355884
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254	NC_022112	TTACC	2	10	511128	511137	20 %	40 %	0 %	40 %	532355971
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256	NC_022112	TTTGA	2	10	513199	513208	20 %	60 %	20 %	0 %	532355971
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260	NC_022112	ATTTG	2	10	520790	520799	20 %	60 %	20 %	0 %	532355973
261	NC_022112	CAAAC	2	10	521000	521009	60 %	0 %	0 %	40 %	532355973
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263	NC_022112	TGAAG	2	10	522404	522413	40 %	20 %	40 %	0 %	532355973
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378	NC_022112	GCTTG	2	10	746787	746796	0 %	40 %	40 %	20 %	532356166
379	NC_022112	CTGAT	2	10	747783	747792	20 %	40 %	20 %	20 %	532356167
380	NC_022112	TTACT	2	10	749500	749509	20 %	60 %	0 %	20 %	532356169
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382	NC_022112	ACCCA	2	10	750435	750444	40 %	0 %	0 %	60 %	532356170
383	NC_022112	TTCTT	2	10	750820	750829	0 %	80 %	0 %	20 %	532356171
384	NC_022112	TGACC	2	10	754133	754142	20 %	20 %	20 %	40 %	532356176
385	NC_022112	ATCAC	2	10	760002	760011	40 %	20 %	0 %	40 %	532356179
386	NC_022112	TCAAC	2	10	760021	760030	40 %	20 %	0 %	40 %	532356179
387	NC_022112	TGTGA	2	10	762702	762711	20 %	40 %	40 %	0 %	532356182
388	NC_022112	TTGCT	2	10	767888	767897	0 %	60 %	20 %	20 %	532356187
389	NC_022112	CATTC	2	10	768345	768354	20 %	40 %	0 %	40 %	532356187
390	NC_022112	CAAAA	2	10	786938	786947	80 %	0 %	0 %	20 %	532356199
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392	NC_022112	ATGGG	2	10	791653	791662	20 %	20 %	60 %	0 %	532356204
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500	NC_022112	CCCAT	2	10	974893	974902	20 %	20 %	0 %	60 %	532356376

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