MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 1686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022111	TGTTA	2	10	2304	2313	20 %	60 %	20 %	0 %	532354125
2	NC_022111	CATTA	2	10	4593	4602	40 %	40 %	0 %	20 %	532354127
3	NC_022111	TTTTG	2	10	7078	7087	0 %	80 %	20 %	0 %	532354128
4	NC_022111	TGAGT	2	10	7611	7620	20 %	40 %	40 %	0 %	532354129
5	NC_022111	GAGAA	2	10	7677	7686	60 %	0 %	40 %	0 %	532354129
6	NC_022111	TCACT	2	10	8733	8742	20 %	40 %	0 %	40 %	532354129
7	NC_022111	TGCAA	2	10	11489	11498	40 %	20 %	20 %	20 %	532354131
8	NC_022111	ACTCG	2	10	12035	12044	20 %	20 %	20 %	40 %	532354131
9	NC_022111	GCTTT	2	10	12320	12329	0 %	60 %	20 %	20 %	532354131
10	NC_022111	ATATA	2	10	13317	13326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022111	GATGT	2	10	13858	13867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022111	TCTCT	2	10	15614	15623	0 %	60 %	0 %	40 %	532354133
13	NC_022111	AAAGT	2	10	16953	16962	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022111	TTCCA	2	10	18553	18562	20 %	40 %	0 %	40 %	532354135
15	NC_022111	CAAAA	2	10	19720	19729	80 %	0 %	0 %	20 %	532354136
16	NC_022111	AATTA	2	10	19925	19934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022111	AAGAA	2	10	20279	20288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022111	GTATG	2	10	20365	20374	20 %	40 %	40 %	0 %	532354138
19	NC_022111	TCTTT	2	10	22032	22041	0 %	80 %	0 %	20 %	532354140
20	NC_022111	AGTGG	2	10	22618	22627	20 %	20 %	60 %	0 %	532354140
21	NC_022111	CTTAC	2	10	23862	23871	20 %	40 %	0 %	40 %	532354141
22	NC_022111	TTTCT	2	10	26932	26941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022111	TGTAA	2	10	27114	27123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022111	AAGGT	2	10	29156	29165	40 %	20 %	40 %	0 %	532354145
25	NC_022111	AAGCA	2	10	30641	30650	60 %	0 %	20 %	20 %	532354147
26	NC_022111	CGTTG	2	10	33129	33138	0 %	40 %	40 %	20 %	532354148
27	NC_022111	TGTGA	2	10	34333	34342	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022111	ATGGA	2	10	36918	36927	40 %	20 %	40 %	0 %	532354150
29	NC_022111	ACCTG	2	10	37269	37278	20 %	20 %	20 %	40 %	532354150
30	NC_022111	AGTGA	2	10	37282	37291	40 %	20 %	40 %	0 %	532354150
31	NC_022111	ATCAA	2	10	37808	37817	60 %	20 %	0 %	20 %	532354151
32	NC_022111	AGAAT	2	10	38687	38696	60 %	20 %	20 %	0 %	532354151
33	NC_022111	AATAC	2	10	39400	39409	60 %	20 %	0 %	20 %	532354152
34	NC_022111	GGAAA	2	10	40453	40462	60 %	0 %	40 %	0 %	532354152
35	NC_022111	TATAT	2	10	42235	42244	40 %	60 %	0 %	0 %	532354154
36	NC_022111	ATGAT	2	10	42465	42474	40 %	40 %	20 %	0 %	532354154
37	NC_022111	TTATC	2	10	42657	42666	20 %	60 %	0 %	20 %	532354154
38	NC_022111	CAATT	2	10	44024	44033	40 %	40 %	0 %	20 %	532354155
39	NC_022111	GAAAA	2	10	44497	44506	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022111	ACGCA	2	10	45125	45134	40 %	0 %	20 %	40 %	532354156
41	NC_022111	TGAAA	2	10	45239	45248	60 %	20 %	20 %	0 %	532354156
42	NC_022111	CAACA	2	10	46659	46668	60 %	0 %	0 %	40 %	532354157
43	NC_022111	ATCTT	2	10	47804	47813	20 %	60 %	0 %	20 %	532354159
44	NC_022111	AATAG	2	10	49312	49321	60 %	20 %	20 %	0 %	532354160
45	NC_022111	CATAT	2	10	49662	49671	40 %	40 %	0 %	20 %	532354161
46	NC_022111	TGCCT	2	10	51048	51057	0 %	40 %	20 %	40 %	532354161
47	NC_022111	TTATC	2	10	51919	51928	20 %	60 %	0 %	20 %	532354162
48	NC_022111	ATTTC	2	10	52690	52699	20 %	60 %	0 %	20 %	532354162
49	NC_022111	AATTG	2	10	54376	54385	40 %	40 %	20 %	0 %	532354162
50	NC_022111	TTTAT	2	10	56711	56720	20 %	80 %	0 %	0 %	532354163
51	NC_022111	GCATT	2	10	57214	57223	20 %	40 %	20 %	20 %	532354163
52	NC_022111	GTTTT	2	10	57383	57392	0 %	80 %	20 %	0 %	532354163
53	NC_022111	TTTTA	2	10	57777	57786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022111	AGGAA	2	10	59118	59127	60 %	0 %	40 %	0 %	532354164
55	NC_022111	ATCGA	2	10	59615	59624	40 %	20 %	20 %	20 %	532354164
56	NC_022111	TAAAA	2	10	60324	60333	80 %	20 %	0 %	0 %	532354165
57	NC_022111	ATTAT	2	10	60697	60706	40 %	60 %	0 %	0 %	532354165
58	NC_022111	TTTCT	2	10	61344	61353	0 %	80 %	0 %	20 %	532354165
59	NC_022111	GTTTT	2	10	63827	63836	0 %	80 %	20 %	0 %	532354168
60	NC_022111	AAGCA	2	10	67283	67292	60 %	0 %	20 %	20 %	532354170
61	NC_022111	GTGAA	2	10	67787	67796	40 %	20 %	40 %	0 %	532354170
62	NC_022111	CTTGT	2	10	68147	68156	0 %	60 %	20 %	20 %	532354170
63	NC_022111	GGCAA	2	10	71265	71274	40 %	0 %	40 %	20 %	532354172
64	NC_022111	TTATT	2	10	72116	72125	20 %	80 %	0 %	0 %	532354173
65	NC_022111	CTTTT	2	10	73442	73451	0 %	80 %	0 %	20 %	532354174
66	NC_022111	AAAGT	2	10	73644	73653	60 %	20 %	20 %	0 %	532354174
67	NC_022111	GTGTT	2	10	75259	75268	0 %	60 %	40 %	0 %	532354174
68	NC_022111	CAACT	2	10	76836	76845	40 %	20 %	0 %	40 %	532354175
69	NC_022111	TTTTA	2	10	79306	79315	20 %	80 %	0 %	0 %	532354177
70	NC_022111	CAAAC	2	10	81005	81014	60 %	0 %	0 %	40 %	532354178
71	NC_022111	TATTC	2	10	81384	81393	20 %	60 %	0 %	20 %	532354179
72	NC_022111	AGTGC	2	10	82220	82229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022111	TTTAT	2	10	83212	83221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022111	TTTTG	2	10	84512	84521	0 %	80 %	20 %	0 %	532354181
75	NC_022111	ATTGA	2	10	84727	84736	40 %	40 %	20 %	0 %	532354181
76	NC_022111	ACATG	2	10	85415	85424	40 %	20 %	20 %	20 %	532354181
77	NC_022111	TAATA	2	10	86059	86068	60 %	40 %	0 %	0 %	532354181
78	NC_022111	GATAG	2	10	86794	86803	40 %	20 %	40 %	0 %	532354181
79	NC_022111	TAGAT	2	10	87185	87194	40 %	40 %	20 %	0 %	532354182
80	NC_022111	TGATC	2	10	88032	88041	20 %	40 %	20 %	20 %	532354182
81	NC_022111	TTCTC	2	10	88244	88253	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_022111	GGGAT	2	10	88666	88675	20 %	20 %	60 %	0 %	532354183
83	NC_022111	TTGAA	2	10	89337	89346	40 %	40 %	20 %	0 %	532354183
84	NC_022111	GCAAA	2	10	94393	94402	60 %	0 %	20 %	20 %	532354186
85	NC_022111	ACATC	2	10	96588	96597	40 %	20 %	0 %	40 %	532354188
86	NC_022111	ATAGC	2	10	97343	97352	40 %	20 %	20 %	20 %	532354188
87	NC_022111	AAGTG	2	10	97647	97656	40 %	20 %	40 %	0 %	532354189
88	NC_022111	GAATA	2	10	98414	98423	60 %	20 %	20 %	0 %	532354189
89	NC_022111	AAAGT	2	10	99207	99216	60 %	20 %	20 %	0 %	532354190
90	NC_022111	TAAAA	2	10	100932	100941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022111	TAAAA	2	10	101216	101225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022111	TCACA	2	10	101705	101714	40 %	20 %	0 %	40 %	532354192
93	NC_022111	GCAAA	2	10	102066	102075	60 %	0 %	20 %	20 %	532354192
94	NC_022111	TTTGT	2	10	102160	102169	0 %	80 %	20 %	0 %	532354192
95	NC_022111	AACAG	2	10	103481	103490	60 %	0 %	20 %	20 %	532354193
96	NC_022111	AGATA	2	10	103807	103816	60 %	20 %	20 %	0 %	532354194
97	NC_022111	TGTCA	2	10	107026	107035	20 %	40 %	20 %	20 %	532354197
98	NC_022111	ATTCT	2	10	107360	107369	20 %	60 %	0 %	20 %	532354197
99	NC_022111	TTTCT	2	10	107986	107995	0 %	80 %	0 %	20 %	532354198
100	NC_022111	TTTTG	2	10	108015	108024	0 %	80 %	20 %	0 %	532354198
101	NC_022111	TTTCG	2	10	108124	108133	0 %	60 %	20 %	20 %	532354198
102	NC_022111	TTTTA	2	10	108526	108535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022111	CTTTT	2	10	109835	109844	0 %	80 %	0 %	20 %	532354199
104	NC_022111	AAAAT	2	10	110304	110313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022111	TGTAA	2	10	110922	110931	40 %	40 %	20 %	0 %	532354200
106	NC_022111	GTTGT	2	10	110947	110956	0 %	60 %	40 %	0 %	532354200
107	NC_022111	AATTT	2	10	111339	111348	40 %	60 %	0 %	0 %	532354200
108	NC_022111	CTTTG	2	10	112683	112692	0 %	60 %	20 %	20 %	532354201
109	NC_022111	TTATA	2	10	113836	113845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022111	TTGTT	2	10	116181	116190	0 %	80 %	20 %	0 %	532354203
111	NC_022111	AATAG	2	10	116545	116554	60 %	20 %	20 %	0 %	532354204
112	NC_022111	ATTGT	2	10	116875	116884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022111	TAAAA	2	10	117011	117020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022111	AGCTT	2	10	118086	118095	20 %	40 %	20 %	20 %	532354207
115	NC_022111	CTTCT	2	10	118556	118565	0 %	60 %	0 %	40 %	532354207
116	NC_022111	CTATT	2	10	118908	118917	20 %	60 %	0 %	20 %	532354208
117	NC_022111	GCATT	2	10	121393	121402	20 %	40 %	20 %	20 %	532354210
118	NC_022111	TTATG	2	10	123723	123732	20 %	60 %	20 %	0 %	532354211
119	NC_022111	GCTGA	2	10	123989	123998	20 %	20 %	40 %	20 %	532354211
120	NC_022111	TAATT	2	10	124245	124254	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022111	GCATT	2	10	124305	124314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022111	ATGGA	2	10	124357	124366	40 %	20 %	40 %	0 %	532354212
123	NC_022111	TCGAT	2	10	124909	124918	20 %	40 %	20 %	20 %	532354213
124	NC_022111	TTTAA	2	10	125945	125954	40 %	60 %	0 %	0 %	532354214
125	NC_022111	AGAAC	2	10	126509	126518	60 %	0 %	20 %	20 %	532354214
126	NC_022111	ATTTA	2	10	126978	126987	40 %	60 %	0 %	0 %	532354215
127	NC_022111	TACTT	2	10	128433	128442	20 %	60 %	0 %	20 %	532354216
128	NC_022111	TTGCT	2	10	129110	129119	0 %	60 %	20 %	20 %	532354216
129	NC_022111	TTTTG	2	10	130964	130973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022111	TCACC	2	10	134511	134520	20 %	20 %	0 %	60 %	532354221
131	NC_022111	AGTAT	2	10	135362	135371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022111	TATAA	2	10	135908	135917	60 %	40 %	0 %	0 %	532354222
133	NC_022111	TGTGT	2	10	136854	136863	0 %	60 %	40 %	0 %	532354222
134	NC_022111	TAAAA	2	10	137823	137832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022111	ACCTT	2	10	138320	138329	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_022111	TTGAG	2	10	139044	139053	20 %	40 %	40 %	0 %	532354225
137	NC_022111	GAAGA	2	10	139708	139717	60 %	0 %	40 %	0 %	532354226
138	NC_022111	GAAAT	2	10	139756	139765	60 %	20 %	20 %	0 %	532354226
139	NC_022111	AAAAT	2	10	141781	141790	80 %	20 %	0 %	0 %	532354228
140	NC_022111	ACGGA	2	10	142106	142115	40 %	0 %	40 %	20 %	532354228
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142	NC_022111	ACTAT	2	10	147054	147063	40 %	40 %	0 %	20 %	532354231
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146	NC_022111	CAACT	2	10	150519	150528	40 %	20 %	0 %	40 %	532354234
147	NC_022111	ACTAT	2	10	151127	151136	40 %	40 %	0 %	20 %	532354235
148	NC_022111	GCCAT	2	10	154294	154303	20 %	20 %	20 %	40 %	532354237
149	NC_022111	ATTGT	2	10	157020	157029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022111	TTTTG	2	10	158338	158347	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022111	ATGAG	2	10	158515	158524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022111	CAGCC	2	10	158790	158799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_022111	GAAAA	2	10	158860	158869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022111	TTGCT	2	10	159516	159525	0 %	60 %	20 %	20 %	532354243
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169	NC_022111	AATTA	2	10	181349	181358	60 %	40 %	0 %	0 %	532354254
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175	NC_022111	TAAAA	2	10	188237	188246	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_022111	CACAG	2	10	195463	195472	40 %	0 %	20 %	40 %	532354268
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222	NC_022111	GCTAT	2	10	232798	232807	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_022111	ATTTT	2	10	235190	235199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_022111	ATAGC	2	10	242779	242788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
240	NC_022111	TTTCT	2	10	243115	243124	0 %	80 %	0 %	20 %	532354306
241	NC_022111	GCATA	2	10	244539	244548	40 %	20 %	20 %	20 %	532354307
242	NC_022111	AATTG	2	10	246079	246088	40 %	40 %	20 %	0 %	532354309
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247	NC_022111	GTAAT	2	10	251016	251025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
248	NC_022111	TATGA	2	10	252783	252792	40 %	40 %	20 %	0 %	532354314
249	NC_022111	CAATC	2	10	253087	253096	40 %	20 %	0 %	40 %	532354314
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252	NC_022111	GATTG	2	10	256815	256824	20 %	40 %	40 %	0 %	532354317
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259	NC_022111	GTAAT	2	10	262444	262453	40 %	40 %	20 %	0 %	532354320
260	NC_022111	CGTTT	2	10	264768	264777	0 %	60 %	20 %	20 %	532354321
261	NC_022111	CAATG	2	10	265578	265587	40 %	20 %	20 %	20 %	532354321
262	NC_022111	TCCTA	2	10	266352	266361	20 %	40 %	0 %	40 %	532354321
263	NC_022111	TCAAA	2	10	268753	268762	60 %	20 %	0 %	20 %	532354323
264	NC_022111	ATTTA	2	10	269889	269898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_022111	CATCT	2	10	271520	271529	20 %	40 %	0 %	40 %	532354327
266	NC_022111	GCAAA	2	10	272778	272787	60 %	0 %	20 %	20 %	532354328
267	NC_022111	AGCAG	2	10	274445	274454	40 %	0 %	40 %	20 %	532354330
268	NC_022111	GCACT	2	10	275266	275275	20 %	20 %	20 %	40 %	532354331
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270	NC_022111	GGCAA	2	10	281113	281122	40 %	0 %	40 %	20 %	532354332
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