MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 2868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	AATG	2	8	463	470	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022110	CTAT	2	8	797	804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022110	AAGG	2	8	1305	1312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022110	AGTA	2	8	1485	1492	50 %	25 %	25 %	0 %	532353206
5	NC_022110	ATGA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	532353207
6	NC_022110	GATA	2	8	1927	1934	50 %	25 %	25 %	0 %	532353207
7	NC_022110	TTTC	2	8	2223	2230	0 %	75 %	0 %	25 %	532353208
8	NC_022110	CATG	2	8	3104	3111	25 %	25 %	25 %	25 %	532353208
9	NC_022110	TTCC	2	8	3409	3416	0 %	50 %	0 %	50 %	532353208
10	NC_022110	TTTA	2	8	3807	3814	25 %	75 %	0 %	0 %	532353209
11	NC_022110	ATCC	2	8	4107	4114	25 %	25 %	0 %	50 %	532353209
12	NC_022110	GACG	2	8	4854	4861	25 %	0 %	50 %	25 %	532353209
13	NC_022110	TTGG	2	8	4957	4964	0 %	50 %	50 %	0 %	532353209
14	NC_022110	TGGA	2	8	5313	5320	25 %	25 %	50 %	0 %	532353210
15	NC_022110	CTTT	2	8	5690	5697	0 %	75 %	0 %	25 %	532353210
16	NC_022110	GGGA	2	8	6205	6212	25 %	0 %	75 %	0 %	532353210
17	NC_022110	GGAG	2	8	6296	6303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022110	GGTG	2	8	6508	6515	0 %	25 %	75 %	0 %	532353211
19	NC_022110	AAAT	2	8	6574	6581	75 %	25 %	0 %	0 %	532353211
20	NC_022110	TATG	2	8	6945	6952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022110	ATTT	2	8	7086	7093	25 %	75 %	0 %	0 %	532354030
22	NC_022110	TTTG	2	8	7178	7185	0 %	75 %	25 %	0 %	532354030
23	NC_022110	AAGC	2	8	7812	7819	50 %	0 %	25 %	25 %	532353212
24	NC_022110	ATTG	2	8	8210	8217	25 %	50 %	25 %	0 %	532353213
25	NC_022110	AGCG	2	8	8677	8684	25 %	0 %	50 %	25 %	532353213
26	NC_022110	AAAG	2	8	8698	8705	75 %	0 %	25 %	0 %	532353213
27	NC_022110	CTTT	2	8	9038	9045	0 %	75 %	0 %	25 %	532353213
28	NC_022110	TATT	2	8	9301	9308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022110	TTCG	2	8	9412	9419	0 %	50 %	25 %	25 %	532353214
30	NC_022110	AATT	2	8	9517	9524	50 %	50 %	0 %	0 %	532353214
31	NC_022110	ATGG	2	8	9576	9583	25 %	25 %	50 %	0 %	532353214
32	NC_022110	CTTT	2	8	10201	10208	0 %	75 %	0 %	25 %	532353215
33	NC_022110	GCAA	2	8	10418	10425	50 %	0 %	25 %	25 %	532353215
34	NC_022110	AGCC	2	8	10648	10655	25 %	0 %	25 %	50 %	532353215
35	NC_022110	GAAA	2	8	10791	10798	75 %	0 %	25 %	0 %	532353215
36	NC_022110	ATTT	2	8	10857	10864	25 %	75 %	0 %	0 %	532353215
37	NC_022110	AGAA	2	8	11195	11202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022110	AATG	2	8	11534	11541	50 %	25 %	25 %	0 %	532353216
39	NC_022110	GTTT	2	8	12566	12573	0 %	75 %	25 %	0 %	532353217
40	NC_022110	ATGC	2	8	12996	13003	25 %	25 %	25 %	25 %	532353217
41	NC_022110	AAGG	2	8	13431	13438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022110	TTGT	2	8	14032	14039	0 %	75 %	25 %	0 %	532353218
43	NC_022110	TTCT	2	8	14203	14210	0 %	75 %	0 %	25 %	532353218
44	NC_022110	ATTT	2	8	14409	14416	25 %	75 %	0 %	0 %	532353218
45	NC_022110	TTTC	2	8	15071	15078	0 %	75 %	0 %	25 %	532353219
46	NC_022110	AAAT	2	8	15553	15560	75 %	25 %	0 %	0 %	532353219
47	NC_022110	CAAA	2	8	16065	16072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022110	GTAA	2	8	16395	16402	50 %	25 %	25 %	0 %	532353220
49	NC_022110	CTAA	2	8	16588	16595	50 %	25 %	0 %	25 %	532353220
50	NC_022110	AGAA	2	8	16851	16858	75 %	0 %	25 %	0 %	532353220
51	NC_022110	ATTT	2	8	16997	17004	25 %	75 %	0 %	0 %	532353220
52	NC_022110	TGCG	2	8	18519	18526	0 %	25 %	50 %	25 %	532353222
53	NC_022110	GAAG	2	8	19503	19510	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
54	NC_022110	TTTG	2	8	19529	19536	0 %	75 %	25 %	0 %	532353222
55	NC_022110	TGTA	2	8	20221	20228	25 %	50 %	25 %	0 %	532353223
56	NC_022110	GCCA	2	8	21013	21020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022110	CGCT	2	8	21261	21268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022110	TTAA	2	8	21282	21289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022110	GTTA	2	8	21319	21326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022110	GATC	2	8	21374	21381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022110	TGGG	2	8	21639	21646	0 %	25 %	75 %	0 %	532353224
62	NC_022110	CATT	2	8	22696	22703	25 %	50 %	0 %	25 %	532353224
63	NC_022110	GCTT	2	8	23039	23046	0 %	50 %	25 %	25 %	532353224
64	NC_022110	GGTT	2	8	23087	23094	0 %	50 %	50 %	0 %	532353224
65	NC_022110	TTCT	2	8	23456	23463	0 %	75 %	0 %	25 %	532353224
66	NC_022110	TAAC	2	8	23558	23565	50 %	25 %	0 %	25 %	532353224
67	NC_022110	CATT	2	8	23681	23688	25 %	50 %	0 %	25 %	532353224
68	NC_022110	GGTA	2	8	24051	24058	25 %	25 %	50 %	0 %	532353224
69	NC_022110	TTGA	2	8	25045	25052	25 %	50 %	25 %	0 %	532353225
70	NC_022110	TTCG	2	8	25190	25197	0 %	50 %	25 %	25 %	532353225
71	NC_022110	TAGG	2	8	25269	25276	25 %	25 %	50 %	0 %	532353225
72	NC_022110	TTCC	2	8	25393	25400	0 %	50 %	0 %	50 %	532353225
73	NC_022110	TAGG	2	8	25507	25514	25 %	25 %	50 %	0 %	532353225
74	NC_022110	TTTC	2	8	25942	25949	0 %	75 %	0 %	25 %	532353225
75	NC_022110	GCTT	2	8	26279	26286	0 %	50 %	25 %	25 %	532353225
76	NC_022110	GGAA	2	8	26862	26869	50 %	0 %	50 %	0 %	532353226
77	NC_022110	TTAA	2	8	26935	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	532353226
78	NC_022110	AAAG	2	8	26985	26992	75 %	0 %	25 %	0 %	532353226
79	NC_022110	GGGC	2	8	27265	27272	0 %	0 %	75 %	25 %	532353226
80	NC_022110	GTTT	2	8	27548	27555	0 %	75 %	25 %	0 %	532353227
81	NC_022110	CAGA	2	8	27570	27577	50 %	0 %	25 %	25 %	532353227
82	NC_022110	ATTG	2	8	27928	27935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022110	CTTT	2	8	29541	29548	0 %	75 %	0 %	25 %	532353229
84	NC_022110	TTTG	2	8	29556	29563	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
85	NC_022110	TTGT	2	8	29591	29598	0 %	75 %	25 %	0 %	532353229
86	NC_022110	TGGC	2	8	29754	29761	0 %	25 %	50 %	25 %	532353229
87	NC_022110	AAAG	2	8	30314	30321	75 %	0 %	25 %	0 %	532353230
88	NC_022110	AAAC	2	8	30384	30391	75 %	0 %	0 %	25 %	532353230
89	NC_022110	GATG	2	8	30527	30534	25 %	25 %	50 %	0 %	532353230
90	NC_022110	TGAT	2	8	34130	34137	25 %	50 %	25 %	0 %	532353235
91	NC_022110	AAGA	3	12	34258	34269	75 %	0 %	25 %	0 %	532353235
92	NC_022110	AAGC	2	8	34478	34485	50 %	0 %	25 %	25 %	532353236
93	NC_022110	GTTC	2	8	34511	34518	0 %	50 %	25 %	25 %	532353236
94	NC_022110	GGCA	2	8	34890	34897	25 %	0 %	50 %	25 %	532353237
95	NC_022110	TCGA	2	8	35147	35154	25 %	25 %	25 %	25 %	532353237
96	NC_022110	TGCT	2	8	35300	35307	0 %	50 %	25 %	25 %	532353237
97	NC_022110	TTGG	2	8	35532	35539	0 %	50 %	50 %	0 %	532353237
98	NC_022110	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	532353237
99	NC_022110	CTTT	2	8	36625	36632	0 %	75 %	0 %	25 %	532353238
100	NC_022110	ATGA	2	8	37115	37122	50 %	25 %	25 %	0 %	532353238
101	NC_022110	TAGG	2	8	37274	37281	25 %	25 %	50 %	0 %	532353238
102	NC_022110	CAAT	2	8	37458	37465	50 %	25 %	0 %	25 %	532353238
103	NC_022110	AATG	2	8	38245	38252	50 %	25 %	25 %	0 %	532353238
104	NC_022110	AGAA	2	8	39082	39089	75 %	0 %	25 %	0 %	532353239
105	NC_022110	AAGA	2	8	39134	39141	75 %	0 %	25 %	0 %	532353239
106	NC_022110	ATCC	2	8	39142	39149	25 %	25 %	0 %	50 %	532353239
107	NC_022110	TAAT	2	8	39353	39360	50 %	50 %	0 %	0 %	532353239
108	NC_022110	GTGC	2	8	41442	41449	0 %	25 %	50 %	25 %	532353241
109	NC_022110	AGAA	2	8	41861	41868	75 %	0 %	25 %	0 %	532353241
110	NC_022110	GGAT	2	8	42013	42020	25 %	25 %	50 %	0 %	532353241
111	NC_022110	AAAC	2	8	43218	43225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_022110	CAAT	2	8	43422	43429	50 %	25 %	0 %	25 %	532353243
113	NC_022110	TGTT	2	8	43802	43809	0 %	75 %	25 %	0 %	532353243
114	NC_022110	AATA	2	8	44041	44048	75 %	25 %	0 %	0 %	532353244
115	NC_022110	ATTT	2	8	44179	44186	25 %	75 %	0 %	0 %	532353245
116	NC_022110	GCTC	2	8	44487	44494	0 %	25 %	25 %	50 %	532353245
117	NC_022110	TTCT	2	8	44629	44636	0 %	75 %	0 %	25 %	532353245
118	NC_022110	TTGA	2	8	45229	45236	25 %	50 %	25 %	0 %	532353246
119	NC_022110	TGTT	2	8	45401	45408	0 %	75 %	25 %	0 %	532353246
120	NC_022110	CTAT	2	8	45431	45438	25 %	50 %	0 %	25 %	532353246
121	NC_022110	TGTT	2	8	45460	45467	0 %	75 %	25 %	0 %	532353246
122	NC_022110	CTAT	2	8	45756	45763	25 %	50 %	0 %	25 %	532353246
123	NC_022110	AAGA	2	8	46252	46259	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
124	NC_022110	AAGA	2	8	46309	46316	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
125	NC_022110	AAAG	2	8	46349	46356	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
126	NC_022110	AAGA	2	8	46464	46471	75 %	0 %	25 %	0 %	532353247
127	NC_022110	ACTT	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	532353247
128	NC_022110	ATGG	2	8	47351	47358	25 %	25 %	50 %	0 %	532353247
129	NC_022110	AGGA	2	8	47382	47389	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
130	NC_022110	GAAC	2	8	47928	47935	50 %	0 %	25 %	25 %	532353247
131	NC_022110	AAGT	2	8	47963	47970	50 %	25 %	25 %	0 %	532353247
132	NC_022110	AACA	2	8	48172	48179	75 %	0 %	0 %	25 %	532353248
133	NC_022110	CTTT	2	8	48368	48375	0 %	75 %	0 %	25 %	532353248
134	NC_022110	CTTT	2	8	49253	49260	0 %	75 %	0 %	25 %	532353249
135	NC_022110	GTAG	2	8	49271	49278	25 %	25 %	50 %	0 %	532353249
136	NC_022110	GAAG	2	8	50699	50706	50 %	0 %	50 %	0 %	532353250
137	NC_022110	TTCA	2	8	51121	51128	25 %	50 %	0 %	25 %	532353250
138	NC_022110	TCTA	2	8	51338	51345	25 %	50 %	0 %	25 %	532353250
139	NC_022110	TATT	2	8	52163	52170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022110	GGAA	2	8	52394	52401	50 %	0 %	50 %	0 %	532353252
141	NC_022110	TTAA	2	8	53135	53142	50 %	50 %	0 %	0 %	532353252
142	NC_022110	CCTT	2	8	53342	53349	0 %	50 %	0 %	50 %	532353253
143	NC_022110	TTTA	2	8	53509	53516	25 %	75 %	0 %	0 %	532353253
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155	NC_022110	TGAT	2	8	54579	54586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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