MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 2375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022110	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022110	CT	3	6	1225	1230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022110	TC	3	6	1666	1671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022110	AG	3	6	2148	2153	50 %	0 %	50 %	0 %	532353208
6	NC_022110	GA	3	6	2816	2821	50 %	0 %	50 %	0 %	532353208
7	NC_022110	AT	3	6	4509	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	532353209
8	NC_022110	TC	3	6	5254	5259	0 %	50 %	0 %	50 %	532353210
9	NC_022110	GA	3	6	5265	5270	50 %	0 %	50 %	0 %	532353210
10	NC_022110	AT	3	6	5369	5374	50 %	50 %	0 %	0 %	532353210
11	NC_022110	TG	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	532353210
12	NC_022110	AG	3	6	5930	5935	50 %	0 %	50 %	0 %	532353210
13	NC_022110	AG	3	6	6404	6409	50 %	0 %	50 %	0 %	532353211
14	NC_022110	GA	3	6	6988	6993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022110	AC	3	6	7639	7644	50 %	0 %	0 %	50 %	532353212
16	NC_022110	AG	3	6	8382	8387	50 %	0 %	50 %	0 %	532353213
17	NC_022110	CT	4	8	8501	8508	0 %	50 %	0 %	50 %	532353213
18	NC_022110	GT	3	6	8583	8588	0 %	50 %	50 %	0 %	532353213
19	NC_022110	AG	3	6	9343	9348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022110	GA	3	6	9859	9864	50 %	0 %	50 %	0 %	532353215
21	NC_022110	AG	3	6	10076	10081	50 %	0 %	50 %	0 %	532353215
22	NC_022110	GT	4	8	11153	11160	0 %	50 %	50 %	0 %	532353215
23	NC_022110	TA	3	6	11241	11246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022110	AG	3	6	11302	11307	50 %	0 %	50 %	0 %	532353216
25	NC_022110	TA	3	6	11862	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	532353216
26	NC_022110	TG	3	6	12765	12770	0 %	50 %	50 %	0 %	532353217
27	NC_022110	AG	3	6	12914	12919	50 %	0 %	50 %	0 %	532353217
28	NC_022110	TC	3	6	13048	13053	0 %	50 %	0 %	50 %	532353217
29	NC_022110	AG	4	8	13070	13077	50 %	0 %	50 %	0 %	532353217
30	NC_022110	TA	3	6	13332	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	532353217
31	NC_022110	TA	4	8	13556	13563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022110	AC	3	6	14399	14404	50 %	0 %	0 %	50 %	532353218
33	NC_022110	AG	3	6	15738	15743	50 %	0 %	50 %	0 %	532353219
34	NC_022110	TC	3	6	15778	15783	0 %	50 %	0 %	50 %	532353219
35	NC_022110	GA	3	6	16307	16312	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
36	NC_022110	AG	3	6	16378	16383	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
37	NC_022110	GA	3	6	17162	17167	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
38	NC_022110	AG	3	6	17508	17513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022110	GA	3	6	17521	17526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022110	GA	3	6	17765	17770	50 %	0 %	50 %	0 %	532353221
41	NC_022110	TC	3	6	18215	18220	0 %	50 %	0 %	50 %	532353221
42	NC_022110	CT	3	6	18443	18448	0 %	50 %	0 %	50 %	532353222
43	NC_022110	TC	3	6	18643	18648	0 %	50 %	0 %	50 %	532353222
44	NC_022110	GA	3	6	18658	18663	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
45	NC_022110	GA	3	6	18757	18762	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
46	NC_022110	AG	3	6	19223	19228	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
47	NC_022110	AG	4	8	19509	19516	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
48	NC_022110	GT	3	6	19772	19777	0 %	50 %	50 %	0 %	532353222
49	NC_022110	TG	3	6	20113	20118	0 %	50 %	50 %	0 %	532353223
50	NC_022110	AG	3	6	20509	20514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022110	GA	3	6	20667	20672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022110	AG	3	6	21184	21189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022110	CT	3	6	21253	21258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022110	CT	4	8	21910	21917	0 %	50 %	0 %	50 %	532353224
55	NC_022110	AT	3	6	22180	22185	50 %	50 %	0 %	0 %	532353224
56	NC_022110	AT	3	6	22504	22509	50 %	50 %	0 %	0 %	532353224
57	NC_022110	GA	3	6	23822	23827	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
58	NC_022110	GA	3	6	23914	23919	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
59	NC_022110	AG	3	6	24295	24300	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
60	NC_022110	GA	3	6	25711	25716	50 %	0 %	50 %	0 %	532353225
61	NC_022110	GT	3	6	25731	25736	0 %	50 %	50 %	0 %	532353225
62	NC_022110	GA	3	6	26379	26384	50 %	0 %	50 %	0 %	532353225
63	NC_022110	GA	3	6	26503	26508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022110	CT	3	6	26510	26515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022110	AT	3	6	26796	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	532353226
66	NC_022110	GA	3	6	27010	27015	50 %	0 %	50 %	0 %	532353226
67	NC_022110	CT	4	8	27424	27431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022110	TC	3	6	27877	27882	0 %	50 %	0 %	50 %	532353227
69	NC_022110	AG	3	6	27960	27965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022110	TG	3	6	28383	28388	0 %	50 %	50 %	0 %	532353228
71	NC_022110	TC	3	6	28436	28441	0 %	50 %	0 %	50 %	532353228
72	NC_022110	GC	4	8	28850	28857	0 %	0 %	50 %	50 %	532353228
73	NC_022110	TA	3	6	28972	28977	50 %	50 %	0 %	0 %	532353228
74	NC_022110	GA	3	6	29923	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	532353229
75	NC_022110	AG	3	6	30021	30026	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
76	NC_022110	TC	3	6	30130	30135	0 %	50 %	0 %	50 %	532353230
77	NC_022110	GA	3	6	30751	30756	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
78	NC_022110	GA	3	6	31219	31224	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
79	NC_022110	AT	3	6	31360	31365	50 %	50 %	0 %	0 %	532353231
80	NC_022110	TC	3	6	31645	31650	0 %	50 %	0 %	50 %	532353232
81	NC_022110	CT	3	6	32125	32130	0 %	50 %	0 %	50 %	532353232
82	NC_022110	AG	3	6	32257	32262	50 %	0 %	50 %	0 %	532353232
83	NC_022110	TC	3	6	33754	33759	0 %	50 %	0 %	50 %	532353234
84	NC_022110	AG	3	6	33767	33772	50 %	0 %	50 %	0 %	532353234
85	NC_022110	AG	3	6	33905	33910	50 %	0 %	50 %	0 %	532353235
86	NC_022110	AG	3	6	34597	34602	50 %	0 %	50 %	0 %	532353236
87	NC_022110	GA	4	8	34620	34627	50 %	0 %	50 %	0 %	532353236
88	NC_022110	TG	3	6	35445	35450	0 %	50 %	50 %	0 %	532353237
89	NC_022110	GA	3	6	36373	36378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022110	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022110	GA	3	6	36523	36528	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
92	NC_022110	CT	3	6	37007	37012	0 %	50 %	0 %	50 %	532353238
93	NC_022110	AG	3	6	37518	37523	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
94	NC_022110	AG	3	6	38064	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
95	NC_022110	AG	3	6	38591	38596	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
96	NC_022110	CT	3	6	38742	38747	0 %	50 %	0 %	50 %	532353238
97	NC_022110	GA	3	6	39375	39380	50 %	0 %	50 %	0 %	532353239
98	NC_022110	AG	3	6	39512	39517	50 %	0 %	50 %	0 %	532353239
99	NC_022110	AG	3	6	39612	39617	50 %	0 %	50 %	0 %	532353239
100	NC_022110	CT	3	6	40113	40118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022110	AG	3	6	40589	40594	50 %	0 %	50 %	0 %	532353240
102	NC_022110	GC	3	6	40638	40643	0 %	0 %	50 %	50 %	532353240
103	NC_022110	GA	3	6	40803	40808	50 %	0 %	50 %	0 %	532353240
104	NC_022110	TC	3	6	40812	40817	0 %	50 %	0 %	50 %	532353240
105	NC_022110	GC	3	6	40877	40882	0 %	0 %	50 %	50 %	532353240
106	NC_022110	GA	3	6	41017	41022	50 %	0 %	50 %	0 %	532353240
107	NC_022110	GT	3	6	41455	41460	0 %	50 %	50 %	0 %	532353241
108	NC_022110	GA	3	6	41993	41998	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
109	NC_022110	GA	4	8	42003	42010	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
110	NC_022110	AG	3	6	42239	42244	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
111	NC_022110	CT	3	6	42305	42310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022110	GA	5	10	42577	42586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022110	AG	3	6	42701	42706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022110	TG	3	6	43064	43069	0 %	50 %	50 %	0 %	532353242
115	NC_022110	AC	3	6	43459	43464	50 %	0 %	0 %	50 %	532353243
116	NC_022110	TC	3	6	43628	43633	0 %	50 %	0 %	50 %	532353243
117	NC_022110	TC	3	6	43793	43798	0 %	50 %	0 %	50 %	532353243
118	NC_022110	TA	3	6	43946	43951	50 %	50 %	0 %	0 %	532353244
119	NC_022110	TC	3	6	44858	44863	0 %	50 %	0 %	50 %	532353245
120	NC_022110	GA	3	6	45341	45346	50 %	0 %	50 %	0 %	532353246
121	NC_022110	TG	3	6	45559	45564	0 %	50 %	50 %	0 %	532353246
122	NC_022110	AG	3	6	45570	45575	50 %	0 %	50 %	0 %	532353246
123	NC_022110	AG	4	8	46012	46019	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
124	NC_022110	CT	3	6	46203	46208	0 %	50 %	0 %	50 %	532353247
125	NC_022110	TG	3	6	46404	46409	0 %	50 %	50 %	0 %	532353247
126	NC_022110	AG	3	6	46457	46462	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
127	NC_022110	AG	3	6	48028	48033	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
128	NC_022110	AG	3	6	49380	49385	50 %	0 %	50 %	0 %	532353249
129	NC_022110	CA	3	6	50046	50051	50 %	0 %	0 %	50 %	532353250
130	NC_022110	TG	4	8	51374	51381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022110	TC	3	6	52887	52892	0 %	50 %	0 %	50 %	532353252
132	NC_022110	CA	3	6	52938	52943	50 %	0 %	0 %	50 %	532353252
133	NC_022110	GA	3	6	53359	53364	50 %	0 %	50 %	0 %	532353253
134	NC_022110	CT	3	6	53676	53681	0 %	50 %	0 %	50 %	532353253
135	NC_022110	CT	3	6	54344	54349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022110	AT	3	6	55544	55549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022110	GA	3	6	55581	55586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022110	CT	3	6	56478	56483	0 %	50 %	0 %	50 %	532354032
139	NC_022110	GT	3	6	56528	56533	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
140	NC_022110	TG	3	6	57166	57171	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
141	NC_022110	CT	3	6	58046	58051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022110	GA	3	6	59611	59616	50 %	0 %	50 %	0 %	532353254
143	NC_022110	GT	3	6	59749	59754	0 %	50 %	50 %	0 %	532353254
144	NC_022110	TC	3	6	60495	60500	0 %	50 %	0 %	50 %	532353255
145	NC_022110	GA	3	6	60723	60728	50 %	0 %	50 %	0 %	532354033
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