MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022110	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022110	CT	3	6	1225	1230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022110	TC	3	6	1666	1671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022110	GA	3	6	6988	6993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022110	AG	3	6	9343	9348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022110	TA	3	6	11241	11246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022110	TA	4	8	13556	13563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022110	AG	3	6	17508	17513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022110	GA	3	6	17521	17526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022110	AG	3	6	20509	20514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022110	GA	3	6	20667	20672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022110	AG	3	6	21184	21189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022110	CT	3	6	21253	21258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022110	GA	3	6	26503	26508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022110	CT	3	6	26510	26515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022110	CT	4	8	27424	27431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022110	AG	3	6	27960	27965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022110	GA	3	6	36373	36378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022110	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022110	CT	3	6	40113	40118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022110	CT	3	6	42305	42310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022110	GA	5	10	42577	42586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022110	AG	3	6	42701	42706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022110	TG	4	8	51374	51381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022110	CT	3	6	54344	54349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022110	AT	3	6	55544	55549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022110	GA	3	6	55581	55586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022110	CT	3	6	58046	58051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022110	TA	3	6	69066	69071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022110	AT	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022110	TA	3	6	85162	85167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022110	AT	3	6	85181	85186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022110	TC	3	6	90383	90388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022110	GA	3	6	90515	90520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022110	CT	3	6	92865	92870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022110	TA	3	6	94009	94014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022110	AT	3	6	99932	99937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022110	TG	3	6	115840	115845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022110	AT	3	6	117963	117968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022110	TG	3	6	120506	120511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022110	AG	4	8	134975	134982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022110	AG	3	6	135005	135010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022110	TC	3	6	136975	136980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022110	CT	3	6	137004	137009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022110	CT	3	6	137185	137190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022110	GA	3	6	138150	138155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022110	AG	3	6	151709	151714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022110	AT	3	6	153304	153309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022110	AG	3	6	157175	157180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022110	TG	3	6	170148	170153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022110	AG	3	6	171770	171775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022110	CT	3	6	171788	171793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022110	TG	3	6	178279	178284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022110	TA	3	6	179578	179583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022110	AG	3	6	179939	179944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022110	CT	3	6	180989	180994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022110	GA	3	6	181068	181073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022110	CA	3	6	181381	181386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022110	TG	3	6	181780	181785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022110	GA	3	6	183710	183715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022110	GA	3	6	183742	183747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022110	CA	3	6	185184	185189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022110	TC	3	6	190148	190153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022110	AT	3	6	195329	195334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022110	AG	3	6	196651	196656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022110	CT	3	6	203398	203403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_022110	CA	3	6	217800	217805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022110	CT	3	6	220937	220942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022110	CT	3	6	221000	221005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022110	CT	3	6	241484	241489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022110	GT	3	6	243437	243442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022110	TC	3	6	247883	247888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022110	TG	3	6	250302	250307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022110	AG	3	6	252109	252114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022110	AG	3	6	256205	256210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022110	TC	3	6	256231	256236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022110	TC	3	6	256317	256322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022110	AG	3	6	257709	257714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022110	TA	3	6	264068	264073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022110	TC	3	6	267775	267780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022110	CT	3	6	279870	279875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022110	AT	4	8	283886	283893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022110	TC	3	6	286520	286525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022110	TC	3	6	286577	286582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022110	TG	3	6	297441	297446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022110	GT	3	6	301754	301759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022110	TA	3	6	307829	307834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022110	CT	3	6	348207	348212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022110	GA	3	6	348287	348292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022110	CT	3	6	358527	358532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022110	TC	3	6	361029	361034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022110	TC	3	6	363846	363851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022110	GC	3	6	365577	365582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022110	GA	3	6	367684	367689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022110	CA	3	6	392050	392055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022110	GA	3	6	395217	395222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022110	GA	3	6	395348	395353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022110	CT	3	6	396445	396450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022110	TC	3	6	403490	403495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022110	TC	3	6	407048	407053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022110	CT	3	6	409447	409452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022110	AG	3	6	410560	410565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022110	CG	3	6	418156	418161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022110	AG	3	6	430513	430518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022110	CA	3	6	432400	432405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022110	TG	3	6	436738	436743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022110	CT	3	6	440471	440476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022110	AC	3	6	440509	440514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022110	TC	3	6	440556	440561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022110	AC	3	6	448134	448139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022110	CT	3	6	448140	448145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022110	TC	3	6	454158	454163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022110	TG	3	6	454190	454195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022110	TG	3	6	454285	454290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022110	CA	3	6	455140	455145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022110	AC	4	8	455376	455383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022110	CT	4	8	455442	455449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022110	CA	3	6	455788	455793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022110	AG	3	6	459799	459804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022110	AT	3	6	459899	459904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022110	TC	3	6	459953	459958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022110	TC	3	6	474412	474417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022110	AT	3	6	474476	474481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022110	CA	3	6	485310	485315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022110	TC	3	6	485351	485356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022110	AG	3	6	489947	489952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022110	CT	3	6	489966	489971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022110	AG	3	6	490259	490264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022110	AC	3	6	499718	499723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022110	TC	3	6	509448	509453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022110	TC	4	8	509461	509468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022110	TG	3	6	512007	512012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022110	TA	3	6	514379	514384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022110	TC	3	6	514546	514551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022110	TC	3	6	516486	516491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022110	GA	3	6	517290	517295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022110	AG	3	6	517326	517331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022110	TA	3	6	519318	519323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022110	GC	3	6	529565	529570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022110	CT	3	6	534151	534156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022110	CT	3	6	534936	534941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022110	CT	3	6	536726	536731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022110	CT	3	6	541358	541363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022110	CT	3	6	546245	546250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022110	CA	3	6	547459	547464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022110	CT	3	6	547492	547497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022110	CT	3	6	557815	557820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022110	TG	3	6	558298	558303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022110	AG	3	6	560109	560114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022110	CT	3	6	560286	560291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022110	AG	3	6	561761	561766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022110	CT	3	6	572536	572541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022110	CT	4	8	574276	574283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.