MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 2075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	AG	3	6	2148	2153	50 %	0 %	50 %	0 %	532353208
2	NC_022110	GA	3	6	2816	2821	50 %	0 %	50 %	0 %	532353208
3	NC_022110	AT	3	6	4509	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	532353209
4	NC_022110	TC	3	6	5254	5259	0 %	50 %	0 %	50 %	532353210
5	NC_022110	GA	3	6	5265	5270	50 %	0 %	50 %	0 %	532353210
6	NC_022110	AT	3	6	5369	5374	50 %	50 %	0 %	0 %	532353210
7	NC_022110	TG	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	532353210
8	NC_022110	AG	3	6	5930	5935	50 %	0 %	50 %	0 %	532353210
9	NC_022110	AG	3	6	6404	6409	50 %	0 %	50 %	0 %	532353211
10	NC_022110	AC	3	6	7639	7644	50 %	0 %	0 %	50 %	532353212
11	NC_022110	AG	3	6	8382	8387	50 %	0 %	50 %	0 %	532353213
12	NC_022110	CT	4	8	8501	8508	0 %	50 %	0 %	50 %	532353213
13	NC_022110	GT	3	6	8583	8588	0 %	50 %	50 %	0 %	532353213
14	NC_022110	GA	3	6	9859	9864	50 %	0 %	50 %	0 %	532353215
15	NC_022110	AG	3	6	10076	10081	50 %	0 %	50 %	0 %	532353215
16	NC_022110	GT	4	8	11153	11160	0 %	50 %	50 %	0 %	532353215
17	NC_022110	AG	3	6	11302	11307	50 %	0 %	50 %	0 %	532353216
18	NC_022110	TA	3	6	11862	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	532353216
19	NC_022110	TG	3	6	12765	12770	0 %	50 %	50 %	0 %	532353217
20	NC_022110	AG	3	6	12914	12919	50 %	0 %	50 %	0 %	532353217
21	NC_022110	TC	3	6	13048	13053	0 %	50 %	0 %	50 %	532353217
22	NC_022110	AG	4	8	13070	13077	50 %	0 %	50 %	0 %	532353217
23	NC_022110	TA	3	6	13332	13337	50 %	50 %	0 %	0 %	532353217
24	NC_022110	AC	3	6	14399	14404	50 %	0 %	0 %	50 %	532353218
25	NC_022110	AG	3	6	15738	15743	50 %	0 %	50 %	0 %	532353219
26	NC_022110	TC	3	6	15778	15783	0 %	50 %	0 %	50 %	532353219
27	NC_022110	GA	3	6	16307	16312	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
28	NC_022110	AG	3	6	16378	16383	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
29	NC_022110	GA	3	6	17162	17167	50 %	0 %	50 %	0 %	532353220
30	NC_022110	GA	3	6	17765	17770	50 %	0 %	50 %	0 %	532353221
31	NC_022110	TC	3	6	18215	18220	0 %	50 %	0 %	50 %	532353221
32	NC_022110	CT	3	6	18443	18448	0 %	50 %	0 %	50 %	532353222
33	NC_022110	TC	3	6	18643	18648	0 %	50 %	0 %	50 %	532353222
34	NC_022110	GA	3	6	18658	18663	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
35	NC_022110	GA	3	6	18757	18762	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
36	NC_022110	AG	3	6	19223	19228	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
37	NC_022110	AG	4	8	19509	19516	50 %	0 %	50 %	0 %	532353222
38	NC_022110	GT	3	6	19772	19777	0 %	50 %	50 %	0 %	532353222
39	NC_022110	TG	3	6	20113	20118	0 %	50 %	50 %	0 %	532353223
40	NC_022110	CT	4	8	21910	21917	0 %	50 %	0 %	50 %	532353224
41	NC_022110	AT	3	6	22180	22185	50 %	50 %	0 %	0 %	532353224
42	NC_022110	AT	3	6	22504	22509	50 %	50 %	0 %	0 %	532353224
43	NC_022110	GA	3	6	23822	23827	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
44	NC_022110	GA	3	6	23914	23919	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
45	NC_022110	AG	3	6	24295	24300	50 %	0 %	50 %	0 %	532353224
46	NC_022110	GA	3	6	25711	25716	50 %	0 %	50 %	0 %	532353225
47	NC_022110	GT	3	6	25731	25736	0 %	50 %	50 %	0 %	532353225
48	NC_022110	GA	3	6	26379	26384	50 %	0 %	50 %	0 %	532353225
49	NC_022110	AT	3	6	26796	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	532353226
50	NC_022110	GA	3	6	27010	27015	50 %	0 %	50 %	0 %	532353226
51	NC_022110	TC	3	6	27877	27882	0 %	50 %	0 %	50 %	532353227
52	NC_022110	TG	3	6	28383	28388	0 %	50 %	50 %	0 %	532353228
53	NC_022110	TC	3	6	28436	28441	0 %	50 %	0 %	50 %	532353228
54	NC_022110	GC	4	8	28850	28857	0 %	0 %	50 %	50 %	532353228
55	NC_022110	TA	3	6	28972	28977	50 %	50 %	0 %	0 %	532353228
56	NC_022110	GA	3	6	29923	29928	50 %	0 %	50 %	0 %	532353229
57	NC_022110	AG	3	6	30021	30026	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
58	NC_022110	TC	3	6	30130	30135	0 %	50 %	0 %	50 %	532353230
59	NC_022110	GA	3	6	30751	30756	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
60	NC_022110	GA	3	6	31219	31224	50 %	0 %	50 %	0 %	532353230
61	NC_022110	AT	3	6	31360	31365	50 %	50 %	0 %	0 %	532353231
62	NC_022110	TC	3	6	31645	31650	0 %	50 %	0 %	50 %	532353232
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64	NC_022110	AG	3	6	32257	32262	50 %	0 %	50 %	0 %	532353232
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66	NC_022110	AG	3	6	33767	33772	50 %	0 %	50 %	0 %	532353234
67	NC_022110	AG	3	6	33905	33910	50 %	0 %	50 %	0 %	532353235
68	NC_022110	AG	3	6	34597	34602	50 %	0 %	50 %	0 %	532353236
69	NC_022110	GA	4	8	34620	34627	50 %	0 %	50 %	0 %	532353236
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73	NC_022110	AG	3	6	37518	37523	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
74	NC_022110	AG	3	6	38064	38069	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
75	NC_022110	AG	3	6	38591	38596	50 %	0 %	50 %	0 %	532353238
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80	NC_022110	AG	3	6	40589	40594	50 %	0 %	50 %	0 %	532353240
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84	NC_022110	GC	3	6	40877	40882	0 %	0 %	50 %	50 %	532353240
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89	NC_022110	AG	3	6	42239	42244	50 %	0 %	50 %	0 %	532353241
90	NC_022110	TG	3	6	43064	43069	0 %	50 %	50 %	0 %	532353242
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103	NC_022110	AG	3	6	48028	48033	50 %	0 %	50 %	0 %	532353247
104	NC_022110	AG	3	6	49380	49385	50 %	0 %	50 %	0 %	532353249
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108	NC_022110	GA	3	6	53359	53364	50 %	0 %	50 %	0 %	532353253
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112	NC_022110	TG	3	6	57166	57171	0 %	50 %	50 %	0 %	532354032
113	NC_022110	GA	3	6	59611	59616	50 %	0 %	50 %	0 %	532353254
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123	NC_022110	TC	3	6	62751	62756	0 %	50 %	0 %	50 %	532353256
124	NC_022110	AT	3	6	62932	62937	50 %	50 %	0 %	0 %	532353256
125	NC_022110	AG	3	6	63132	63137	50 %	0 %	50 %	0 %	532353256
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133	NC_022110	CT	3	6	65276	65281	0 %	50 %	0 %	50 %	532353258
134	NC_022110	AG	3	6	65858	65863	50 %	0 %	50 %	0 %	532353259
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138	NC_022110	GA	3	6	66871	66876	50 %	0 %	50 %	0 %	532353259
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141	NC_022110	GA	3	6	70090	70095	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
142	NC_022110	GA	3	6	70289	70294	50 %	0 %	50 %	0 %	532353262
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