MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 421

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022110	A	6	6	1200	1205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022110	T	7	7	1243	1249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022110	A	6	6	1254	1259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022110	T	6	6	1635	1640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022110	T	7	7	1657	1663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022110	A	6	6	1729	1734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022110	A	6	6	5061	5066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022110	A	6	6	7003	7008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022110	A	6	6	9122	9127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022110	A	6	6	9207	9212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022110	A	6	6	9277	9282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022110	T	6	6	19892	19897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022110	T	6	6	19899	19904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022110	A	6	6	20472	20477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022110	A	6	6	20547	20552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022110	A	7	7	24552	24558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022110	T	10	10	24578	24587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022110	A	6	6	26534	26539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022110	T	7	7	26546	26552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022110	T	9	9	36407	36415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022110	T	6	6	38825	38830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022110	A	8	8	40103	40110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022110	T	6	6	40118	40123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022110	T	8	8	40299	40306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022110	A	6	6	42567	42572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022110	A	7	7	42616	42622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022110	A	7	7	42637	42643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022110	A	6	6	42707	42712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022110	A	8	8	43841	43848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022110	T	9	9	45944	45952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022110	T	8	8	48593	48600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022110	T	8	8	48870	48877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022110	A	6	6	48921	48926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022110	T	6	6	49031	49036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022110	T	7	7	49683	49689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022110	T	6	6	51415	51420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022110	T	6	6	52156	52161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022110	T	6	6	53215	53220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022110	T	6	6	53230	53235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022110	T	6	6	54046	54051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022110	A	7	7	54102	54108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022110	N	45	45	54618	54662	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022110	A	6	6	54767	54772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022110	G	6	6	54823	54828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022110	N	89	89	54927	55015	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022110	N	36	36	57421	57456	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022110	T	6	6	58382	58387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022110	T	6	6	58576	58581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022110	N	126	126	58786	58911	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022110	T	8	8	58934	58941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022110	T	6	6	58954	58959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022110	T	6	6	58965	58970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022110	T	6	6	58989	58994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022110	T	6	6	59016	59021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022110	A	9	9	60830	60838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022110	T	7	7	60850	60856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022110	G	6	6	67388	67393	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022110	A	6	6	69031	69036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022110	T	6	6	70992	70997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022110	T	8	8	71013	71020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022110	T	7	7	71847	71853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022110	A	6	6	76595	76600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022110	A	6	6	78363	78368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022110	G	6	6	78446	78451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022110	A	6	6	78458	78463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022110	A	7	7	78577	78583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022110	A	6	6	78593	78598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022110	A	7	7	78601	78607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022110	T	7	7	79176	79182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022110	T	6	6	79254	79259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022110	T	7	7	79279	79285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022110	T	7	7	79571	79577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022110	T	7	7	79761	79767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022110	A	6	6	90404	90409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022110	A	7	7	93646	93652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022110	T	6	6	94148	94153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022110	T	7	7	94156	94162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_022110	T	6	6	94276	94281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022110	T	6	6	94283	94288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022110	A	6	6	94292	94297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022110	T	6	6	97635	97640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022110	A	6	6	97676	97681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022110	A	9	9	97703	97711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92	NC_022110	T	7	7	134827	134833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022110	A	6	6	137235	137240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_022110	T	7	7	151439	151445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022110	T	7	7	153319	153325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022110	T	7	7	157325	157331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_022110	A	7	7	158911	158917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_022110	A	6	6	172941	172946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022110	A	6	6	172999	173004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_022110	T	6	6	180749	180754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022110	T	6	6	180994	180999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_022110	T	8	8	185515	185522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022110	A	7	7	185536	185542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022110	T	6	6	185559	185564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022110	T	7	7	185654	185660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022110	T	6	6	187628	187633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_022110	N	19	19	187917	187935	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022110	A	8	8	189231	189238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_022110	A	6	6	252264	252269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022110	A	6	6	253295	253300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.