MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022109	GAAGGA	2	12	759	770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022109	TATGGA	2	12	812	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022109	AAAGCT	2	12	4940	4951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352291
4	NC_022109	CAAAAA	2	12	6251	6262	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022109	TAGCAA	2	12	10826	10837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352297
6	NC_022109	AAAGCT	2	12	10957	10968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352297
7	NC_022109	TAGTGA	2	12	12103	12114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352298
8	NC_022109	GTTCCT	2	12	19388	19399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352304
9	NC_022109	CTTTTT	2	12	21542	21553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352306
10	NC_022109	GTGAGG	2	12	25472	25483	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532352307
11	NC_022109	GGATTT	2	12	35945	35956	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352318
12	NC_022109	AATTAG	2	12	37366	37377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532352319
13	NC_022109	TTCCTG	2	12	37665	37676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352319
14	NC_022109	TTTTGA	2	12	44972	44983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532352326
15	NC_022109	TGAACG	2	12	52321	52332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352333
16	NC_022109	GTGATT	2	12	52340	52351	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352333
17	NC_022109	GATCTG	2	12	54989	55000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352334
18	NC_022109	GTGTAA	2	12	55037	55048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352334
19	NC_022109	GGTTCA	2	12	55126	55137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352334
20	NC_022109	GAAAAG	2	12	56385	56396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022109	AGTTGT	2	12	57736	57747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022109	TTGTTC	2	12	58656	58667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022109	TGAAAA	2	12	59126	59137	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532352335
24	NC_022109	TCCTAA	2	12	59465	59476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352335
25	NC_022109	AAAAAT	2	12	60959	60970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022109	GTTCTT	2	12	63384	63395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352337
27	NC_022109	CTATTT	2	12	71704	71715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532352344
28	NC_022109	ACTCTT	2	12	72833	72844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352345
29	NC_022109	TTTCTG	2	12	73383	73394	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352346
30	NC_022109	GATCAT	2	12	73513	73524	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352346
31	NC_022109	TAGTAC	2	12	76507	76518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352347
32	NC_022109	ATCTAG	2	12	76686	76697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022109	GGTTTA	2	12	80157	80168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352350
34	NC_022109	TTTAGT	2	12	81930	81941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532352352
35	NC_022109	GTCTGT	2	12	83201	83212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532352353
36	NC_022109	TTCTGA	2	12	88815	88826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352356
37	NC_022109	AAAAGA	2	12	93879	93890	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532352362
38	NC_022109	AGCTGT	2	12	95972	95983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352363
39	NC_022109	TCTTTT	2	12	96637	96648	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352365
40	NC_022109	GGGGCT	2	12	97585	97596	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532352365
41	NC_022109	TTTGAG	2	12	99788	99799	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352367
42	NC_022109	TCAGAA	2	12	106428	106439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352372
43	NC_022109	CATAAC	2	12	109472	109483	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532353125
44	NC_022109	TGTTCT	2	12	112236	112247	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352376
45	NC_022109	ACTTCG	2	12	115520	115531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352377
46	NC_022109	TTTTAG	2	12	115955	115966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022109	TTGCCA	2	12	119057	119068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352381
48	NC_022109	TAAAAA	2	12	120549	120560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022109	TTGGTA	2	12	120597	120608	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352383
50	NC_022109	AGGATC	2	12	120976	120987	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352383
51	NC_022109	AAGGGT	2	12	122783	122794	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532352384
52	NC_022109	GGGTTT	2	12	123746	123757	0 %	50 %	50 %	0 %	532352385
53	NC_022109	TTGCAT	2	12	124028	124039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352385
54	NC_022109	AAGAGA	2	12	124397	124408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352385
55	NC_022109	TTAAAA	2	12	133330	133341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352391
56	NC_022109	AGGTTG	2	12	134572	134583	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	532352392
57	NC_022109	CTGTTT	2	12	135267	135278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352393
58	NC_022109	GAGTTA	2	12	139622	139633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352400
59	NC_022109	TGGAAA	2	12	142175	142186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532352403
60	NC_022109	TGGAAT	2	12	143050	143061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352404
61	NC_022109	ATGGTT	2	12	143294	143305	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352404
62	NC_022109	TGCTCT	2	12	145486	145497	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352407
63	NC_022109	GAAAGG	2	12	149224	149235	50 %	0 %	50 %	0 %	532352409
64	NC_022109	GCTTTG	2	12	149467	149478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532352409
65	NC_022109	TGTGCG	2	12	153589	153600	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532352413
66	NC_022109	CCTCAT	2	12	154887	154898	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352414
67	NC_022109	TGGAGA	2	12	156344	156355	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532352416
68	NC_022109	CTCCAT	2	12	157714	157725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352417
69	NC_022109	TCCTTG	2	12	158310	158321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352418
70	NC_022109	AAGTTT	2	12	158395	158406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532352418
71	NC_022109	AACAGC	2	12	160947	160958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352421
72	NC_022109	AAAAAG	2	12	173534	173545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532352428
73	NC_022109	AGAAAA	2	12	182171	182182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022109	ACTTCT	2	12	189269	189280	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532353135
75	NC_022109	ATTTGC	2	12	191962	191973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532353136
76	NC_022109	AAACAT	2	12	193052	193063	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352438
77	NC_022109	AGCAAC	2	12	193387	193398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352438
78	NC_022109	TATGAA	2	12	194981	194992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532352439
79	NC_022109	TTGCCT	2	12	196101	196112	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532353141
80	NC_022109	TCTGGA	2	12	199351	199362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352443
81	NC_022109	CTGGAT	2	12	214940	214951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352456
82	NC_022109	GAAATA	2	12	215263	215274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532352456
83	NC_022109	TTTTAC	2	12	220991	221002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022109	GATGCA	2	12	222151	222162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352463
85	NC_022109	ACTCCA	2	12	223041	223052	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532352464
86	NC_022109	CTGCTT	2	12	223273	223284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352464
87	NC_022109	ATTGCT	2	12	226582	226593	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352467
88	NC_022109	TCCTAG	2	12	226872	226883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352467
89	NC_022109	GCAACG	2	12	227360	227371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352468
90	NC_022109	CTTAGC	2	12	229993	230004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352470
91	NC_022109	TTCCTT	2	12	236825	236836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352475
92	NC_022109	TCTCCT	2	12	239706	239717	0 %	50 %	0 %	50 %	532352476
93	NC_022109	AAACCA	2	12	240281	240292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352477
94	NC_022109	AACCCT	2	12	254707	254718	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022109	ATTTTT	2	12	255502	255513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532352495
96	NC_022109	CCTGCA	2	12	255663	255674	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352496
97	NC_022109	ACCTTT	2	12	260858	260869	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352501
98	NC_022109	TCATAA	2	12	268705	268716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532352508
99	NC_022109	AAGTGT	2	12	269431	269442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352508
100	NC_022109	AGGAGA	2	12	270604	270615	50 %	0 %	50 %	0 %	532352508
101	NC_022109	ATCTAA	2	12	272709	272720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532352511
102	NC_022109	TGGAAT	2	12	274907	274918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352513
103	NC_022109	GGAACA	2	12	278794	278805	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532352515
104	NC_022109	ATATTA	2	12	279502	279513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022109	CACGCG	2	12	281167	281178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532352517
106	NC_022109	TTTCTT	2	12	281346	281357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352517
107	NC_022109	CTCCTA	2	12	285508	285519	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352520
108	NC_022109	GCAATG	2	12	291626	291637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352526
109	NC_022109	CGACAT	2	12	292303	292314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352527
110	NC_022109	CCCTTA	2	12	293757	293768	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352529
111	NC_022109	AAAATA	2	12	295855	295866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532352531
112	NC_022109	ACCACT	2	12	298210	298221	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532352533
113	NC_022109	CATTGC	2	12	301456	301467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352536
114	NC_022109	CCAAAA	2	12	302635	302646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352537
115	NC_022109	TCTTTT	2	12	304520	304531	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352539
116	NC_022109	CAAGAC	2	12	305609	305620	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352540
117	NC_022109	AGCTTA	2	12	306890	306901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352542
118	NC_022109	CAAAGA	2	12	312262	312273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532352547
119	NC_022109	ATGGCT	2	12	312878	312889	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352548
120	NC_022109	TACAAA	2	12	317068	317079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352551
121	NC_022109	TTAATT	2	12	318747	318758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352553
122	NC_022109	AAAACA	2	12	322232	322243	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532352555
123	NC_022109	AAAAAG	2	12	323658	323669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532352555
124	NC_022109	CAGAAC	2	12	344196	344207	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352572
125	NC_022109	ATTCAA	2	12	349173	349184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532352577
126	NC_022109	AGAATA	2	12	361130	361141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022109	TTCTTA	2	12	361150	361161	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022109	CAGCCT	2	12	373121	373132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352596
129	NC_022109	AGCTGA	2	12	373171	373182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352596
130	NC_022109	ATGCTA	2	12	377038	377049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352598
131	NC_022109	CAATAG	2	12	383643	383654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352601
132	NC_022109	ACTGAA	2	12	383784	383795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352601
133	NC_022109	CTGCAC	2	12	383977	383988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352601
134	NC_022109	TCCATA	2	12	394335	394346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352609
135	NC_022109	TTAGGT	2	12	395693	395704	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352611
136	NC_022109	AGGGAA	2	12	397019	397030	50 %	0 %	50 %	0 %	532352612
137	NC_022109	CTGAAG	2	12	397854	397865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352613
138	NC_022109	TAATCT	2	12	403262	403273	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532352616
139	NC_022109	GAACAA	2	12	403764	403775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532352617
140	NC_022109	CTAAAG	2	12	404147	404158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352618
141	NC_022109	CCTTTC	2	12	405311	405322	0 %	50 %	0 %	50 %	532352619
142	NC_022109	TTTTAA	2	12	409174	409185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352621
143	NC_022109	ACATGC	2	12	414852	414863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352627
144	NC_022109	GGCTCT	2	12	415587	415598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352628
145	NC_022109	ATCTTG	2	12	417181	417192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352629
146	NC_022109	CCCCCA	2	12	418515	418526	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	532352630
147	NC_022109	TTCCTC	2	12	422580	422591	0 %	50 %	0 %	50 %	532352633
148	NC_022109	CTCTAC	2	12	425829	425840	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352635
149	NC_022109	ACATCA	2	12	426474	426485	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352636
150	NC_022109	CGGAAT	2	12	426736	426747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352637
151	NC_022109	TGATAA	2	12	428641	428652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532352638
152	NC_022109	AGCTAA	2	12	431015	431026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352640
153	NC_022109	TTCTCC	2	12	443051	443062	0 %	50 %	0 %	50 %	532352649
154	NC_022109	ATGAAG	2	12	452102	452113	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532352657
155	NC_022109	TAACTC	2	12	452619	452630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352657
156	NC_022109	ATCCGC	2	12	453544	453555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352657
157	NC_022109	CTAAAG	2	12	455962	455973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352658
158	NC_022109	CCAATA	2	12	460947	460958	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352662
159	NC_022109	ATCGGC	2	12	466794	466805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532352670
160	NC_022109	TATTGG	2	12	467387	467398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352670
161	NC_022109	AAATAC	2	12	477727	477738	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352674
162	NC_022109	TCTTCA	2	12	480166	480177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352675
163	NC_022109	CTACAA	2	12	483929	483940	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352675
164	NC_022109	CCAATC	2	12	488396	488407	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532353155
165	NC_022109	TTCTTT	2	12	492217	492228	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352685
166	NC_022109	CTGAAG	2	12	495276	495287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532352687
167	NC_022109	TGAGTA	2	12	495730	495741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352687
168	NC_022109	AAACTG	2	12	499177	499188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352690
169	NC_022109	TAACTA	2	12	502699	502710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_022109	AAGAAA	2	12	502712	502723	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022109	GGTAAT	2	12	507514	507525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352698
172	NC_022109	AGTTTT	2	12	508522	508533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	532352700
173	NC_022109	AGAATA	2	12	508687	508698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022109	GGTTGT	2	12	510650	510661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_022109	GCTGTT	2	12	513009	513020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532352703
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177	NC_022109	CTCTAT	2	12	516503	516514	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_022109	TGAACT	2	12	517010	517021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352707
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184	NC_022109	CAGGAA	2	12	526462	526473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532352712
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187	NC_022109	CAAATC	2	12	535069	535080	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352718
188	NC_022109	CTCCAG	2	12	535851	535862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352719
189	NC_022109	AGGGAA	2	12	539510	539521	50 %	0 %	50 %	0 %	532352723
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191	NC_022109	CTTCCT	2	12	542016	542027	0 %	50 %	0 %	50 %	532352726
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200	NC_022109	CAAAAA	2	12	561148	561159	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	532352741
201	NC_022109	AGATCC	2	12	563979	563990	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352744
202	NC_022109	AAAAAT	2	12	566399	566410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_022109	TTTTGC	2	12	573266	573277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532352752
204	NC_022109	TCATAT	2	12	577363	577374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532352756
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207	NC_022109	TTCAAA	2	12	585499	585510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532352765
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209	NC_022109	TCTCCG	2	12	595007	595018	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532352782
210	NC_022109	CTGATA	2	12	600637	600648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352789
211	NC_022109	CTGCTC	2	12	600685	600696	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532352789
212	NC_022109	AGTCCA	2	12	602597	602608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352790
213	NC_022109	TAGGGG	2	12	605565	605576	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
214	NC_022109	CAAAGA	2	12	606379	606390	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532352795
215	NC_022109	CCAAAA	2	12	609898	609909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352799
216	NC_022109	GGATGG	2	12	611670	611681	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532352800
217	NC_022109	CGATAT	3	18	613998	614015	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352801
218	NC_022109	TCTTTT	2	12	617560	617571	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_022109	ACTGTA	2	12	619252	619263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352805
220	NC_022109	CACTCT	2	12	619568	619579	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352805
221	NC_022109	CCTTAG	2	12	623349	623360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352808
222	NC_022109	AACCTC	2	12	631414	631425	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532352812
223	NC_022109	CTCTTT	2	12	638423	638434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352821
224	NC_022109	ATATCC	2	12	638440	638451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352821
225	NC_022109	TAAACA	2	12	638551	638562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352821
226	NC_022109	ATAAAC	2	12	642262	642273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352826
227	NC_022109	ATCTTG	2	12	642955	642966	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352826
228	NC_022109	TTAAAT	2	12	645726	645737	50 %	50 %	0 %	0 %	532352828
229	NC_022109	TTATTT	2	12	648765	648776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_022109	GCTTCT	2	12	650115	650126	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352832
231	NC_022109	TAGGAG	2	12	651082	651093	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532352832
232	NC_022109	CACAGG	2	12	653075	653086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352834
233	NC_022109	CTTCTC	2	12	665489	665500	0 %	50 %	0 %	50 %	532352843
234	NC_022109	TTCTAT	2	12	666904	666915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532352843
235	NC_022109	AGAAAG	2	12	669225	669236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352844
236	NC_022109	CATATT	2	12	681089	681100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532352853
237	NC_022109	AGCTGG	2	12	687264	687275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532352861
238	NC_022109	GCATCA	2	12	689106	689117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352861
239	NC_022109	ATCAAT	2	12	693431	693442	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532352866
240	NC_022109	CCGCAA	2	12	698312	698323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532352871
241	NC_022109	AAATGC	2	12	704274	704285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352873
242	NC_022109	GAAAGA	2	12	706392	706403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352874
243	NC_022109	TCTTGA	2	12	710412	710423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352876
244	NC_022109	TATCCA	2	12	720594	720605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352886
245	NC_022109	TATTGA	2	12	736479	736490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532352894
246	NC_022109	TCTGCA	2	12	744132	744143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352900
247	NC_022109	TGTGAT	2	12	744774	744785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352901
248	NC_022109	CAGGAA	2	12	748000	748011	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532352903
249	NC_022109	TATTTT	2	12	753604	753615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532352910
250	NC_022109	GGGAAG	2	12	757726	757737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_022109	GGAAGA	2	12	761384	761395	50 %	0 %	50 %	0 %	532352916
252	NC_022109	ATGCAA	2	12	763696	763707	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352920
253	NC_022109	GAGAAA	2	12	763925	763936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352920
254	NC_022109	TATATT	2	12	769363	769374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352925
255	NC_022109	TTTCCA	2	12	776185	776196	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352930
256	NC_022109	TAGCTG	2	12	778135	778146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352932
257	NC_022109	ATGAAG	2	12	782782	782793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532352933
258	NC_022109	ATTAGG	2	12	788567	788578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352938
259	NC_022109	CCCTGA	2	12	791563	791574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352941
260	NC_022109	AGAATT	2	12	794485	794496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532352944
261	NC_022109	AAGCTC	2	12	794724	794735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352944
262	NC_022109	TTTCTT	2	12	797589	797600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352946
263	NC_022109	AGAAAT	2	12	800779	800790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532352949
264	NC_022109	GAGAAA	2	12	801049	801060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_022109	GAAATT	2	12	802392	802403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532352951
266	NC_022109	TTTTCT	2	12	803507	803518	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
267	NC_022109	TAGCCT	2	12	806020	806031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352952
268	NC_022109	ATTTTT	2	12	807285	807296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532352953
269	NC_022109	CACCTA	2	12	820580	820591	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532352962
270	NC_022109	AGCTAC	2	12	824548	824559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532352964
271	NC_022109	AAGAGG	2	12	826419	826430	50 %	0 %	50 %	0 %	532352966
272	NC_022109	GAAAGG	2	12	831293	831304	50 %	0 %	50 %	0 %	532352971
273	NC_022109	AGCTTC	2	12	832747	832758	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352972
274	NC_022109	TTTTTA	2	12	833721	833732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_022109	ATCACA	2	12	836852	836863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352976
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277	NC_022109	TTATGC	2	12	848399	848410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532352986
278	NC_022109	ATGGGG	2	12	851433	851444	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532352989
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282	NC_022109	TAAGGA	2	12	854683	854694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022109	CCGGAG	2	12	855601	855612	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_022109	CTTCTA	2	12	859526	859537	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352990
285	NC_022109	CTTTTT	2	12	860210	860221	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532352991
286	NC_022109	GACCTG	2	12	865172	865183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532352994
287	NC_022109	CCTCTA	2	12	868746	868757	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532352997
288	NC_022109	TAAGGA	2	12	876728	876739	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022109	CCGGAG	2	12	877646	877657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_022109	TTTTCT	2	12	888028	888039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532353006
291	NC_022109	CTGTTC	2	12	888341	888352	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532353006
292	NC_022109	GTTTTT	2	12	888994	889005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	532353007
293	NC_022109	GTGTAT	2	12	889906	889917	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532353008
294	NC_022109	TATTGG	2	12	893985	893996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532353186
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304	NC_022109	GAGCAA	2	12	923578	923589	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532353037
305	NC_022109	ATAGGG	2	12	944336	944347	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532353052
306	NC_022109	CGGAGG	2	12	944657	944668	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	532353053
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312	NC_022109	GGCTGG	2	12	980270	980281	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	532353199
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314	NC_022109	TTAAGC	2	12	981430	981441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353078
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317	NC_022109	TCAGTA	2	12	994114	994125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353087
318	NC_022109	CAGAAT	2	12	995387	995398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532353090
319	NC_022109	TACTAG	2	12	995900	995911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353091
320	NC_022109	AGAATA	2	12	1002883	1002894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	532353100
321	NC_022109	AATTAA	2	12	1005627	1005638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353101
322	NC_022109	GCAATA	2	12	1006573	1006584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532353101
323	NC_022109	CTTTAT	2	12	1009967	1009978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532353103
324	NC_022109	AGCTGG	2	12	1010395	1010406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532353103
325	NC_022109	TTGTAA	2	12	1013264	1013275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532353105
326	NC_022109	GAAAAA	2	12	1027513	1027524	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532353113
327	NC_022109	TTTCTT	2	12	1028177	1028188	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532353114
328	NC_022109	GTTTCC	2	12	1029464	1029475	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532353114
329	NC_022109	CAGCAC	2	12	1034358	1034369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532353116
330	NC_022109	GTAATA	2	12	1034523	1034534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532353116
331	NC_022109	ACCATC	2	12	1035265	1035276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532353116
332	NC_022109	ATTTTT	2	12	1037247	1037258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_022109	TAAAAT	2	12	1040870	1040881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.