MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 2360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022109	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022109	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022109	TC	3	6	1669	1674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022109	AG	3	6	2152	2157	50 %	0 %	50 %	0 %	532352290
5	NC_022109	GA	3	6	2820	2825	50 %	0 %	50 %	0 %	532352290
6	NC_022109	AT	3	6	4513	4518	50 %	50 %	0 %	0 %	532352291
7	NC_022109	TC	3	6	5263	5268	0 %	50 %	0 %	50 %	532352292
8	NC_022109	GA	3	6	5274	5279	50 %	0 %	50 %	0 %	532352292
9	NC_022109	AT	3	6	5378	5383	50 %	50 %	0 %	0 %	532352292
10	NC_022109	TG	3	6	5531	5536	0 %	50 %	50 %	0 %	532352292
11	NC_022109	AG	3	6	5939	5944	50 %	0 %	50 %	0 %	532352292
12	NC_022109	GA	3	6	6997	7002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022109	AC	3	6	7646	7651	50 %	0 %	0 %	50 %	532352294
14	NC_022109	AG	3	6	8389	8394	50 %	0 %	50 %	0 %	532352295
15	NC_022109	CT	4	8	8508	8515	0 %	50 %	0 %	50 %	532352295
16	NC_022109	GT	3	6	8590	8595	0 %	50 %	50 %	0 %	532352295
17	NC_022109	GA	3	6	9864	9869	50 %	0 %	50 %	0 %	532352297
18	NC_022109	AG	3	6	10081	10086	50 %	0 %	50 %	0 %	532352297
19	NC_022109	TA	3	6	11246	11251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022109	AG	3	6	11307	11312	50 %	0 %	50 %	0 %	532352298
21	NC_022109	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	532352298
22	NC_022109	TG	3	6	12770	12775	0 %	50 %	50 %	0 %	532352299
23	NC_022109	AG	3	6	12919	12924	50 %	0 %	50 %	0 %	532352299
24	NC_022109	AG	4	8	13075	13082	50 %	0 %	50 %	0 %	532352299
25	NC_022109	TA	3	6	13337	13342	50 %	50 %	0 %	0 %	532352299
26	NC_022109	TA	4	8	13561	13568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022109	AC	3	6	14404	14409	50 %	0 %	0 %	50 %	532352300
28	NC_022109	AG	3	6	15743	15748	50 %	0 %	50 %	0 %	532352301
29	NC_022109	TC	3	6	15783	15788	0 %	50 %	0 %	50 %	532352301
30	NC_022109	GA	3	6	16312	16317	50 %	0 %	50 %	0 %	532352302
31	NC_022109	AG	3	6	16383	16388	50 %	0 %	50 %	0 %	532352302
32	NC_022109	GA	3	6	17167	17172	50 %	0 %	50 %	0 %	532352302
33	NC_022109	AG	3	6	17513	17518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022109	GA	3	6	17526	17531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022109	GA	3	6	17770	17775	50 %	0 %	50 %	0 %	532352303
36	NC_022109	TC	3	6	18220	18225	0 %	50 %	0 %	50 %	532352303
37	NC_022109	CT	3	6	18448	18453	0 %	50 %	0 %	50 %	532352304
38	NC_022109	TC	3	6	18648	18653	0 %	50 %	0 %	50 %	532352304
39	NC_022109	GA	3	6	18663	18668	50 %	0 %	50 %	0 %	532352304
40	NC_022109	GA	3	6	18762	18767	50 %	0 %	50 %	0 %	532352304
41	NC_022109	AG	3	6	19228	19233	50 %	0 %	50 %	0 %	532352304
42	NC_022109	AG	4	8	19514	19521	50 %	0 %	50 %	0 %	532352304
43	NC_022109	GT	3	6	19777	19782	0 %	50 %	50 %	0 %	532352304
44	NC_022109	AG	3	6	20005	20010	50 %	0 %	50 %	0 %	532352305
45	NC_022109	TG	3	6	20118	20123	0 %	50 %	50 %	0 %	532352305
46	NC_022109	AG	3	6	20514	20519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022109	GA	3	6	20672	20677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022109	AG	3	6	21189	21194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022109	CT	3	6	21258	21263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022109	CT	4	8	21915	21922	0 %	50 %	0 %	50 %	532352306
51	NC_022109	AT	3	6	22185	22190	50 %	50 %	0 %	0 %	532352306
52	NC_022109	AT	3	6	22509	22514	50 %	50 %	0 %	0 %	532352306
53	NC_022109	GA	3	6	23828	23833	50 %	0 %	50 %	0 %	532352306
54	NC_022109	GA	3	6	23920	23925	50 %	0 %	50 %	0 %	532352306
55	NC_022109	AG	3	6	24301	24306	50 %	0 %	50 %	0 %	532352306
56	NC_022109	GA	3	6	25718	25723	50 %	0 %	50 %	0 %	532352307
57	NC_022109	GT	3	6	25738	25743	0 %	50 %	50 %	0 %	532352307
58	NC_022109	TA	3	6	25940	25945	50 %	50 %	0 %	0 %	532352307
59	NC_022109	GA	3	6	26386	26391	50 %	0 %	50 %	0 %	532352307
60	NC_022109	GA	3	6	26510	26515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022109	CT	3	6	26517	26522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022109	AT	3	6	26803	26808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022109	GA	3	6	27013	27018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022109	TC	3	6	27881	27886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022109	AG	3	6	27964	27969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022109	TG	3	6	28387	28392	0 %	50 %	50 %	0 %	532352309
67	NC_022109	TC	3	6	28440	28445	0 %	50 %	0 %	50 %	532352309
68	NC_022109	GC	4	8	28854	28861	0 %	0 %	50 %	50 %	532352309
69	NC_022109	TA	3	6	28976	28981	50 %	50 %	0 %	0 %	532352309
70	NC_022109	GA	3	6	29927	29932	50 %	0 %	50 %	0 %	532352310
71	NC_022109	AG	3	6	30025	30030	50 %	0 %	50 %	0 %	532352311
72	NC_022109	TC	3	6	30134	30139	0 %	50 %	0 %	50 %	532352311
73	NC_022109	GA	3	6	30755	30760	50 %	0 %	50 %	0 %	532352311
74	NC_022109	GA	3	6	31223	31228	50 %	0 %	50 %	0 %	532352311
75	NC_022109	AT	3	6	31364	31369	50 %	50 %	0 %	0 %	532352312
76	NC_022109	TC	3	6	31649	31654	0 %	50 %	0 %	50 %	532352313
77	NC_022109	GC	3	6	32079	32084	0 %	0 %	50 %	50 %	532352313
78	NC_022109	CT	3	6	32129	32134	0 %	50 %	0 %	50 %	532352313
79	NC_022109	AG	3	6	32261	32266	50 %	0 %	50 %	0 %	532352313
80	NC_022109	TC	3	6	33758	33763	0 %	50 %	0 %	50 %	532352315
81	NC_022109	AG	3	6	33771	33776	50 %	0 %	50 %	0 %	532352315
82	NC_022109	AG	3	6	33909	33914	50 %	0 %	50 %	0 %	532352316
83	NC_022109	GA	4	8	34601	34608	50 %	0 %	50 %	0 %	532352317
84	NC_022109	GA	4	8	34625	34632	50 %	0 %	50 %	0 %	532352317
85	NC_022109	GA	3	6	36378	36383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022109	AT	3	6	36480	36485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022109	GA	3	6	36528	36533	50 %	0 %	50 %	0 %	532352319
88	NC_022109	CT	3	6	37012	37017	0 %	50 %	0 %	50 %	532352319
89	NC_022109	AG	3	6	37523	37528	50 %	0 %	50 %	0 %	532352319
90	NC_022109	AG	3	6	38069	38074	50 %	0 %	50 %	0 %	532352319
91	NC_022109	AG	3	6	38596	38601	50 %	0 %	50 %	0 %	532352319
92	NC_022109	CT	3	6	38747	38752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022109	GA	3	6	39380	39385	50 %	0 %	50 %	0 %	532352320
94	NC_022109	AG	3	6	39517	39522	50 %	0 %	50 %	0 %	532352320
95	NC_022109	AG	3	6	39617	39622	50 %	0 %	50 %	0 %	532352320
96	NC_022109	CT	3	6	40118	40123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022109	AG	3	6	40594	40599	50 %	0 %	50 %	0 %	532352321
98	NC_022109	GC	3	6	40643	40648	0 %	0 %	50 %	50 %	532352321
99	NC_022109	GA	3	6	40808	40813	50 %	0 %	50 %	0 %	532352321
100	NC_022109	TC	3	6	40817	40822	0 %	50 %	0 %	50 %	532352321
101	NC_022109	GC	3	6	40882	40887	0 %	0 %	50 %	50 %	532352321
102	NC_022109	GA	3	6	41022	41027	50 %	0 %	50 %	0 %	532352321
103	NC_022109	GT	3	6	41460	41465	0 %	50 %	50 %	0 %	532352322
104	NC_022109	GA	3	6	41998	42003	50 %	0 %	50 %	0 %	532352322
105	NC_022109	GA	4	8	42008	42015	50 %	0 %	50 %	0 %	532352322
106	NC_022109	AG	3	6	42244	42249	50 %	0 %	50 %	0 %	532352322
107	NC_022109	CT	3	6	42310	42315	0 %	50 %	0 %	50 %	532353120
108	NC_022109	GA	5	10	42586	42595	50 %	0 %	50 %	0 %	532353120
109	NC_022109	AC	3	6	43468	43473	50 %	0 %	0 %	50 %	532352324
110	NC_022109	TC	3	6	43637	43642	0 %	50 %	0 %	50 %	532352324
111	NC_022109	TC	3	6	43800	43805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022109	TA	3	6	43953	43958	50 %	50 %	0 %	0 %	532352325
113	NC_022109	TC	3	6	44865	44870	0 %	50 %	0 %	50 %	532352326
114	NC_022109	GA	3	6	45348	45353	50 %	0 %	50 %	0 %	532352327
115	NC_022109	TG	3	6	45566	45571	0 %	50 %	50 %	0 %	532352327
116	NC_022109	AG	3	6	45577	45582	50 %	0 %	50 %	0 %	532352327
117	NC_022109	AG	4	8	46018	46025	50 %	0 %	50 %	0 %	532352328
118	NC_022109	CT	3	6	46209	46214	0 %	50 %	0 %	50 %	532352328
119	NC_022109	TG	3	6	46410	46415	0 %	50 %	50 %	0 %	532352328
120	NC_022109	AG	3	6	46463	46468	50 %	0 %	50 %	0 %	532352328
121	NC_022109	AG	3	6	48035	48040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022109	AG	3	6	49387	49392	50 %	0 %	50 %	0 %	532352330
123	NC_022109	CA	3	6	50053	50058	50 %	0 %	0 %	50 %	532352331
124	NC_022109	TG	4	8	51383	51390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022109	TC	3	6	52896	52901	0 %	50 %	0 %	50 %	532352333
126	NC_022109	CA	3	6	52947	52952	50 %	0 %	0 %	50 %	532352333
127	NC_022109	GA	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022109	CT	3	6	53685	53690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022109	CT	3	6	54382	54387	0 %	50 %	0 %	50 %	532352334
130	NC_022109	AT	3	6	55572	55577	50 %	50 %	0 %	0 %	532352334
131	NC_022109	GA	3	6	55609	55614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022109	CT	3	6	56507	56512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022109	GT	3	6	56557	56562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022109	TG	3	6	57264	57269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022109	CT	3	6	58145	58150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022109	GA	3	6	59711	59716	50 %	0 %	50 %	0 %	532352335
137	NC_022109	GT	3	6	59849	59854	0 %	50 %	50 %	0 %	532352335
138	NC_022109	TC	3	6	60596	60601	0 %	50 %	0 %	50 %	532352336
139	NC_022109	GA	3	6	60824	60829	50 %	0 %	50 %	0 %	532353121
140	NC_022109	CA	3	6	61222	61227	50 %	0 %	0 %	50 %	532352337
141	NC_022109	AT	3	6	61472	61477	50 %	50 %	0 %	0 %	532352337
142	NC_022109	GA	3	6	61495	61500	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
143	NC_022109	GA	3	6	61621	61626	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
144	NC_022109	GA	3	6	62436	62441	50 %	0 %	50 %	0 %	532352337
145	NC_022109	TC	3	6	62857	62862	0 %	50 %	0 %	50 %	532352337
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