MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 2539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532351364
2	NC_022108	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532351365
3	NC_022108	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532351365
4	NC_022108	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532351366
5	NC_022108	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532351366
6	NC_022108	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532351366
7	NC_022108	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532351367
8	NC_022108	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532351367
9	NC_022108	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532351367
10	NC_022108	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532351367
11	NC_022108	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532351368
12	NC_022108	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532351368
13	NC_022108	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532351368
14	NC_022108	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532351369
15	NC_022108	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532351369
16	NC_022108	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532352196
17	NC_022108	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532352196
18	NC_022108	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532351370
19	NC_022108	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532351371
20	NC_022108	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532351371
21	NC_022108	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532351371
22	NC_022108	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532351371
23	NC_022108	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532351372
24	NC_022108	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532351372
25	NC_022108	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532351372
26	NC_022108	CTTT	2	8	10207	10214	0 %	75 %	0 %	25 %	532351373
27	NC_022108	GCAA	2	8	10424	10431	50 %	0 %	25 %	25 %	532351373
28	NC_022108	AGCC	2	8	10654	10661	25 %	0 %	25 %	50 %	532351373
29	NC_022108	GAAA	2	8	10797	10804	75 %	0 %	25 %	0 %	532351373
30	NC_022108	AATG	2	8	11540	11547	50 %	25 %	25 %	0 %	532351374
31	NC_022108	GTTT	2	8	12572	12579	0 %	75 %	25 %	0 %	532351375
32	NC_022108	ATGC	2	8	13002	13009	25 %	25 %	25 %	25 %	532351375
33	NC_022108	TTGT	2	8	14038	14045	0 %	75 %	25 %	0 %	532351376
34	NC_022108	TTCT	2	8	14209	14216	0 %	75 %	0 %	25 %	532351376
35	NC_022108	ATTT	2	8	14415	14422	25 %	75 %	0 %	0 %	532351376
36	NC_022108	TTTC	2	8	15076	15083	0 %	75 %	0 %	25 %	532351377
37	NC_022108	AAAT	2	8	15558	15565	75 %	25 %	0 %	0 %	532351377
38	NC_022108	GTAA	2	8	16400	16407	50 %	25 %	25 %	0 %	532351378
39	NC_022108	CTAA	2	8	16593	16600	50 %	25 %	0 %	25 %	532351378
40	NC_022108	AGAA	2	8	16856	16863	75 %	0 %	25 %	0 %	532351378
41	NC_022108	ATTT	2	8	17002	17009	25 %	75 %	0 %	0 %	532351378
42	NC_022108	TGCG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	532351380
43	NC_022108	GAAG	2	8	19508	19515	50 %	0 %	50 %	0 %	532351380
44	NC_022108	TTTG	2	8	19534	19541	0 %	75 %	25 %	0 %	532351380
45	NC_022108	TGTA	2	8	20226	20233	25 %	50 %	25 %	0 %	532351381
46	NC_022108	TGGG	2	8	21643	21650	0 %	25 %	75 %	0 %	532351382
47	NC_022108	CATT	2	8	22700	22707	25 %	50 %	0 %	25 %	532351382
48	NC_022108	GCTT	2	8	23043	23050	0 %	50 %	25 %	25 %	532351382
49	NC_022108	GGTT	2	8	23091	23098	0 %	50 %	50 %	0 %	532351382
50	NC_022108	TTCT	2	8	23461	23468	0 %	75 %	0 %	25 %	532351382
51	NC_022108	TAAC	2	8	23563	23570	50 %	25 %	0 %	25 %	532351382
52	NC_022108	CATT	2	8	23686	23693	25 %	50 %	0 %	25 %	532351382
53	NC_022108	GGTA	2	8	24056	24063	25 %	25 %	50 %	0 %	532351382
54	NC_022108	TTGA	2	8	25051	25058	25 %	50 %	25 %	0 %	532351383
55	NC_022108	TTCG	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	532351383
56	NC_022108	TAGG	2	8	25275	25282	25 %	25 %	50 %	0 %	532351383
57	NC_022108	TTCC	2	8	25399	25406	0 %	50 %	0 %	50 %	532351383
58	NC_022108	TAGG	2	8	25513	25520	25 %	25 %	50 %	0 %	532351383
59	NC_022108	TTTC	2	8	25947	25954	0 %	75 %	0 %	25 %	532351383
60	NC_022108	GCTT	2	8	26284	26291	0 %	50 %	25 %	25 %	532351383
61	NC_022108	GGAA	2	8	26867	26874	50 %	0 %	50 %	0 %	532351384
62	NC_022108	TTAA	2	8	26940	26947	50 %	50 %	0 %	0 %	532351384
63	NC_022108	AAAG	2	8	26990	26997	75 %	0 %	25 %	0 %	532351384
64	NC_022108	GGGC	2	8	27270	27277	0 %	0 %	75 %	25 %	532351384
65	NC_022108	GTTT	2	8	27553	27560	0 %	75 %	25 %	0 %	532351385
66	NC_022108	CAGA	2	8	27575	27582	50 %	0 %	25 %	25 %	532351385
67	NC_022108	CTTT	2	8	29547	29554	0 %	75 %	0 %	25 %	532351387
68	NC_022108	TTTG	2	8	29562	29569	0 %	75 %	25 %	0 %	532351387
69	NC_022108	TTGT	2	8	29597	29604	0 %	75 %	25 %	0 %	532351387
70	NC_022108	TGGC	2	8	29760	29767	0 %	25 %	50 %	25 %	532351387
71	NC_022108	AAAG	2	8	30320	30327	75 %	0 %	25 %	0 %	532351388
72	NC_022108	AAAC	2	8	30390	30397	75 %	0 %	0 %	25 %	532351388
73	NC_022108	GATG	2	8	30533	30540	25 %	25 %	50 %	0 %	532351388
74	NC_022108	GATA	2	8	31642	31649	50 %	25 %	25 %	0 %	532351390
75	NC_022108	TGAT	2	8	34137	34144	25 %	50 %	25 %	0 %	532351393
76	NC_022108	AAGA	3	12	34265	34276	75 %	0 %	25 %	0 %	532351393
77	NC_022108	AAGC	2	8	34485	34492	50 %	0 %	25 %	25 %	532351394
78	NC_022108	GTTC	2	8	34518	34525	0 %	50 %	25 %	25 %	532351394
79	NC_022108	GGCA	2	8	34897	34904	25 %	0 %	50 %	25 %	532351395
80	NC_022108	TCGA	2	8	35154	35161	25 %	25 %	25 %	25 %	532351395
81	NC_022108	TGCT	2	8	35307	35314	0 %	50 %	25 %	25 %	532351395
82	NC_022108	TTGG	2	8	35539	35546	0 %	50 %	50 %	0 %	532351395
83	NC_022108	AGAT	2	8	36259	36266	50 %	25 %	25 %	0 %	532351395
84	NC_022108	CTTT	2	8	36632	36639	0 %	75 %	0 %	25 %	532351396
85	NC_022108	ATGA	2	8	37122	37129	50 %	25 %	25 %	0 %	532351396
86	NC_022108	TAGG	2	8	37281	37288	25 %	25 %	50 %	0 %	532351396
87	NC_022108	CAAT	2	8	37465	37472	50 %	25 %	0 %	25 %	532351396
88	NC_022108	AATG	2	8	38252	38259	50 %	25 %	25 %	0 %	532351396
89	NC_022108	AGAA	2	8	39089	39096	75 %	0 %	25 %	0 %	532351397
90	NC_022108	AAGA	2	8	39141	39148	75 %	0 %	25 %	0 %	532351397
91	NC_022108	ATCC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	532351397
92	NC_022108	TAAT	2	8	39360	39367	50 %	50 %	0 %	0 %	532351397
93	NC_022108	GTGC	2	8	41449	41456	0 %	25 %	50 %	25 %	532351399
94	NC_022108	AGAA	2	8	41868	41875	75 %	0 %	25 %	0 %	532351399
95	NC_022108	GGAT	2	8	42019	42026	25 %	25 %	50 %	0 %	532351399
96	NC_022108	AAAC	2	8	43227	43234	75 %	0 %	0 %	25 %	532351401
97	NC_022108	CAAT	2	8	43431	43438	50 %	25 %	0 %	25 %	532351401
98	NC_022108	ATTT	2	8	44187	44194	25 %	75 %	0 %	0 %	532351403
99	NC_022108	GCTC	2	8	44495	44502	0 %	25 %	25 %	50 %	532351403
100	NC_022108	TTCT	2	8	44637	44644	0 %	75 %	0 %	25 %	532351403
101	NC_022108	TTGA	2	8	45237	45244	25 %	50 %	25 %	0 %	532351404
102	NC_022108	TGTT	2	8	45409	45416	0 %	75 %	25 %	0 %	532351404
103	NC_022108	CTAT	2	8	45439	45446	25 %	50 %	0 %	25 %	532351404
104	NC_022108	TGTT	2	8	45468	45475	0 %	75 %	25 %	0 %	532351404
105	NC_022108	CTAT	2	8	45764	45771	25 %	50 %	0 %	25 %	532351404
106	NC_022108	AAGA	2	8	46260	46267	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
107	NC_022108	AAGA	2	8	46317	46324	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
108	NC_022108	AAAG	2	8	46357	46364	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
109	NC_022108	AAGA	2	8	46472	46479	75 %	0 %	25 %	0 %	532351405
110	NC_022108	ACTT	2	8	46733	46740	25 %	50 %	0 %	25 %	532351405
111	NC_022108	ATGG	2	8	47359	47366	25 %	25 %	50 %	0 %	532351405
112	NC_022108	AGGA	2	8	47390	47397	50 %	0 %	50 %	0 %	532351405
113	NC_022108	GAAC	2	8	47937	47944	50 %	0 %	25 %	25 %	532351405
114	NC_022108	AAGT	2	8	47972	47979	50 %	25 %	25 %	0 %	532351405
115	NC_022108	AACA	2	8	48181	48188	75 %	0 %	0 %	25 %	532351406
116	NC_022108	CTTT	2	8	48377	48384	0 %	75 %	0 %	25 %	532351406
117	NC_022108	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	532351407
118	NC_022108	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	532351407
119	NC_022108	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	532351408
120	NC_022108	TTCA	2	8	51135	51142	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
121	NC_022108	TCTA	2	8	51352	51359	25 %	50 %	0 %	25 %	532351408
122	NC_022108	GGAA	2	8	52516	52523	50 %	0 %	50 %	0 %	532351410
123	NC_022108	TTAA	2	8	53257	53264	50 %	50 %	0 %	0 %	532351410
124	NC_022108	CCTT	2	8	53464	53471	0 %	50 %	0 %	50 %	532351411
125	NC_022108	TTTA	2	8	53631	53638	25 %	75 %	0 %	0 %	532351411
126	NC_022108	AAAG	2	8	53855	53862	75 %	0 %	25 %	0 %	532351411
127	NC_022108	GATT	2	8	53992	53999	25 %	50 %	25 %	0 %	532351411
128	NC_022108	AATC	2	8	54047	54054	50 %	25 %	0 %	25 %	532351411
129	NC_022108	TATT	2	8	54108	54115	25 %	75 %	0 %	0 %	532351411
130	NC_022108	TCGA	2	8	54496	54503	25 %	25 %	25 %	25 %	532351412
131	NC_022108	CTTC	2	8	54590	54597	0 %	50 %	0 %	50 %	532351412
132	NC_022108	GAAT	2	8	54625	54632	50 %	25 %	25 %	0 %	532351412
133	NC_022108	TGAT	2	8	54696	54703	25 %	50 %	25 %	0 %	532351412
134	NC_022108	GGAA	2	8	55051	55058	50 %	0 %	50 %	0 %	532351412
135	NC_022108	GAGT	2	8	55620	55627	25 %	25 %	50 %	0 %	532351412
136	NC_022108	CTGG	3	12	55962	55973	0 %	25 %	50 %	25 %	532352198
137	NC_022108	TTGC	2	8	56099	56106	0 %	50 %	25 %	25 %	532352198
138	NC_022108	CGAG	2	8	56141	56148	25 %	0 %	50 %	25 %	532352198
139	NC_022108	AGCT	2	8	56598	56605	25 %	25 %	25 %	25 %	532352198
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141	NC_022108	GAAA	2	8	58166	58173	75 %	0 %	25 %	0 %	532352199
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