MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 278

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022108	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022108	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022108	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022108	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022108	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022108	TA	3	6	11247	11252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022108	TA	4	8	13562	13569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022108	AG	3	6	17513	17518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022108	GA	3	6	17526	17531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022108	AG	3	6	20514	20519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022108	GA	3	6	20672	20677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022108	AG	3	6	21188	21193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022108	CT	3	6	21257	21262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022108	GA	3	6	26508	26513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022108	CT	3	6	26515	26520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022108	TC	3	6	27883	27888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022108	AG	3	6	27966	27971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022108	GA	3	6	36380	36385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022108	AT	3	6	36482	36487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022108	CT	3	6	38749	38754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022108	CT	3	6	40120	40125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022108	CT	3	6	42311	42316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022108	GA	5	10	42586	42595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022108	AG	3	6	42710	42715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022108	TG	4	8	51389	51396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022108	GA	3	6	55706	55711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022108	TA	3	6	85297	85302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022108	TC	3	6	90518	90523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022108	GA	3	6	90650	90655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022108	CT	3	6	93000	93005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022108	GA	3	6	93528	93533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022108	TA	3	6	94144	94149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022108	TC	3	6	100019	100024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022108	AT	3	6	100070	100075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022108	TA	3	6	106746	106751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022108	TG	3	6	115998	116003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022108	AG	4	8	118582	118589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022108	GA	3	6	120403	120408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022108	TA	3	6	122638	122643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022108	CT	3	6	128161	128166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022108	AG	3	6	138245	138250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022108	GA	3	6	138308	138313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022108	AG	3	6	157340	157345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022108	TC	3	6	171801	171806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022108	AG	3	6	171933	171938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022108	CT	3	6	171951	171956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022108	TG	3	6	178441	178446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022108	GA	3	6	183876	183881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022108	AG	3	6	197106	197111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022108	CT	3	6	203850	203855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022108	CT	4	8	206959	206966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022108	AG	4	8	218193	218200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022108	CA	3	6	218252	218257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022108	CT	3	6	221389	221394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022108	CT	3	6	221452	221457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022108	AG	3	6	224421	224426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022108	AG	3	6	238644	238649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022108	CA	3	6	240670	240675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022108	GT	3	6	243784	243789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022108	TG	3	6	250761	250766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022108	AG	3	6	251563	251568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022108	AG	3	6	252572	252577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022108	TC	3	6	256684	256689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022108	TC	3	6	256770	256775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022108	AG	3	6	258162	258167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022108	CA	3	6	260202	260207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_022108	TA	3	6	264522	264527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022108	TA	3	6	273781	273786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022108	AT	4	8	284341	284348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022108	TC	4	8	285284	285291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022108	TC	3	6	286974	286979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022108	TC	3	6	287031	287036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022108	CT	3	6	287504	287509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022108	TG	3	6	297895	297900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022108	AC	3	6	301888	301893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022108	AG	3	6	315797	315802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022108	TA	3	6	327844	327849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022108	CA	3	6	331078	331083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022108	CT	3	6	348655	348660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022108	CT	3	6	350834	350839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022108	CT	3	6	358975	358980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022108	TC	3	6	360927	360932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022108	AC	3	6	362308	362313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022108	GA	3	6	364220	364225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022108	TC	3	6	364298	364303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022108	GC	3	6	364564	364569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022108	CT	4	8	381617	381624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022108	CA	3	6	392506	392511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022108	CT	3	6	395542	395547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022108	GA	3	6	395672	395677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022108	GA	3	6	395803	395808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022108	CT	3	6	403938	403943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022108	CA	3	6	426362	426367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022108	AG	3	6	430988	430993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022108	CT	3	6	440959	440964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022108	AC	3	6	440997	441002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022108	TC	3	6	441044	441049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022108	CT	3	6	454144	454149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022108	CT	3	6	456597	456602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022108	AG	3	6	460285	460290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022108	AT	3	6	466892	466897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022108	GA	3	6	468407	468412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022108	AC	3	6	485714	485719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022108	GA	4	8	485759	485766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022108	CA	3	6	485796	485801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022108	TC	3	6	485837	485842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022108	AC	3	6	490271	490276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022108	AG	3	6	490432	490437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022108	CT	3	6	490451	490456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022108	AG	3	6	490744	490749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022108	TA	3	6	492585	492590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022108	TA	3	6	494392	494397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022108	AT	3	6	504134	504139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022108	TG	3	6	512493	512498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022108	TA	3	6	514865	514870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022108	AG	3	6	516763	516768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022108	TC	3	6	516971	516976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022108	GA	3	6	517775	517780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022108	AG	3	6	517811	517816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022108	AT	3	6	524042	524047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022108	CT	3	6	535267	535272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022108	CT	3	6	537061	537066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022108	CA	3	6	547796	547801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022108	CT	3	6	547829	547834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022108	CT	3	6	558158	558163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022108	AG	3	6	562105	562110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022108	CT	3	6	565229	565234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022108	CT	4	8	574620	574627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022108	AG	3	6	574635	574640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022108	AG	3	6	575281	575286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022108	AT	3	6	575538	575543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022108	GA	3	6	575566	575571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022108	CA	3	6	596888	596893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022108	TA	3	6	605989	605994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022108	TC	3	6	606091	606096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022108	AC	3	6	611482	611487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022108	CT	3	6	616735	616740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022108	AG	3	6	616777	616782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022108	CT	3	6	629261	629266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022108	AC	3	6	631885	631890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022108	AC	3	6	648872	648877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_022108	TA	3	6	654166	654171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022108	GA	3	6	662232	662237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022108	TG	3	6	663679	663684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022108	AT	3	6	665658	665663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022108	CG	3	6	671664	671669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022108	GA	4	8	671710	671717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022108	TC	3	6	671719	671724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_022108	GA	3	6	671725	671730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022108	TC	3	6	672265	672270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022108	AG	3	6	672750	672755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022108	AC	3	6	673162	673167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022108	CA	3	6	673870	673875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022108	AC	3	6	673888	673893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.