MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532350437
2	NC_022107	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532350438
3	NC_022107	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532350438
4	NC_022107	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532350438
5	NC_022107	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532350438
6	NC_022107	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532350439
7	NC_022107	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	532350441
8	NC_022107	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	532350442
9	NC_022107	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	532350443
10	NC_022107	CCTCT	2	10	10526	10535	0 %	40 %	0 %	60 %	532350444
11	NC_022107	AAAGG	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	532350444
12	NC_022107	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	532350445
13	NC_022107	AAAGA	2	10	13203	13212	80 %	0 %	20 %	0 %	532350446
14	NC_022107	GGTGT	2	10	13307	13316	0 %	40 %	60 %	0 %	532350446
15	NC_022107	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	532350448
16	NC_022107	CGTTC	2	10	16161	16170	0 %	40 %	20 %	40 %	532350449
17	NC_022107	GCTTC	2	10	16534	16543	0 %	40 %	20 %	40 %	532350449
18	NC_022107	GAAGG	2	10	16905	16914	40 %	0 %	60 %	0 %	532350449
19	NC_022107	GTTGT	2	10	20331	20340	0 %	60 %	40 %	0 %	532350452
20	NC_022107	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	532350453
21	NC_022107	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	532350453
22	NC_022107	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532350453
23	NC_022107	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	532350454
24	NC_022107	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	532350455
25	NC_022107	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	532350457
26	NC_022107	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532350457
27	NC_022107	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532350458
28	NC_022107	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532350459
29	NC_022107	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532350460
30	NC_022107	TCAGT	2	10	35701	35710	20 %	40 %	20 %	20 %	532350466
31	NC_022107	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	532350466
32	NC_022107	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	532350466
33	NC_022107	ACGAT	2	10	38098	38107	40 %	20 %	20 %	20 %	532350467
34	NC_022107	TTTGA	2	10	38463	38472	20 %	60 %	20 %	0 %	532350467
35	NC_022107	AGCAA	2	10	42114	42123	60 %	0 %	20 %	20 %	532350470
36	NC_022107	CGATG	2	10	42171	42180	20 %	20 %	40 %	20 %	532350470
37	NC_022107	TTTAT	2	10	44244	44253	20 %	80 %	0 %	0 %	532350474
38	NC_022107	CTTTC	2	10	46341	46350	0 %	60 %	0 %	40 %	532350476
39	NC_022107	AGTTT	2	10	46880	46889	20 %	60 %	20 %	0 %	532350476
40	NC_022107	GAAGA	2	10	48013	48022	60 %	0 %	40 %	0 %	532350476
41	NC_022107	CTTTT	2	10	50043	50052	0 %	80 %	0 %	20 %	532350479
42	NC_022107	CCGTA	2	10	53926	53935	20 %	20 %	20 %	40 %	532350482
43	NC_022107	TTATC	2	10	55335	55344	20 %	60 %	0 %	20 %	532350483
44	NC_022107	TGAGT	2	10	55356	55365	20 %	40 %	40 %	0 %	532350483
45	NC_022107	GTTGT	2	10	56403	56412	0 %	60 %	40 %	0 %	532351274
46	NC_022107	GAGCA	2	10	59851	59860	40 %	0 %	40 %	20 %	532350484
47	NC_022107	TGTGA	2	10	62300	62309	20 %	40 %	40 %	0 %	532350486
48	NC_022107	AGTGA	2	10	63821	63830	40 %	20 %	40 %	0 %	532350487
49	NC_022107	CCTTC	2	10	64095	64104	0 %	40 %	0 %	60 %	532350487
50	NC_022107	AGGAG	2	10	66323	66332	40 %	0 %	60 %	0 %	532350489
51	NC_022107	GTTAA	2	10	66453	66462	40 %	40 %	20 %	0 %	532350489
52	NC_022107	GGAGC	2	10	69701	69710	20 %	0 %	60 %	20 %	532350492
53	NC_022107	GCGAT	2	10	69891	69900	20 %	20 %	40 %	20 %	532350492
54	NC_022107	CTCTT	2	10	70245	70254	0 %	60 %	0 %	40 %	532350492
55	NC_022107	AGGGG	2	10	70891	70900	20 %	0 %	80 %	0 %	532350492
56	NC_022107	AAGAA	2	10	70933	70942	80 %	0 %	20 %	0 %	532350492
57	NC_022107	CTTGC	2	10	72022	72031	0 %	40 %	20 %	40 %	532351277
58	NC_022107	ATTGG	2	10	72223	72232	20 %	40 %	40 %	0 %	532350494
59	NC_022107	GAAAA	2	10	73295	73304	80 %	0 %	20 %	0 %	532350494
60	NC_022107	TGGGA	2	10	73712	73721	20 %	20 %	60 %	0 %	532350495
61	NC_022107	TATTT	2	10	76239	76248	20 %	80 %	0 %	0 %	532350496
62	NC_022107	TGTCT	2	10	80033	80042	0 %	60 %	20 %	20 %	532350499
63	NC_022107	TTACT	2	10	80540	80549	20 %	60 %	0 %	20 %	532350499
64	NC_022107	AGAAA	2	10	81930	81939	80 %	0 %	20 %	0 %	532350501
65	NC_022107	GGAAG	2	10	82443	82452	40 %	0 %	60 %	0 %	532350501
66	NC_022107	AGCGA	2	10	84909	84918	40 %	0 %	40 %	20 %	532350503
67	NC_022107	GATCC	2	10	85994	86003	20 %	20 %	20 %	40 %	532350504
68	NC_022107	AGAGC	2	10	87329	87338	40 %	0 %	40 %	20 %	532351279
69	NC_022107	TTTTC	2	10	91061	91070	0 %	80 %	0 %	20 %	532350507
70	NC_022107	GGATG	2	10	91321	91330	20 %	20 %	60 %	0 %	532350508
71	NC_022107	CAACA	2	10	92860	92869	60 %	0 %	0 %	40 %	532350509
72	NC_022107	ACAGC	2	10	93904	93913	40 %	0 %	20 %	40 %	532350511
73	NC_022107	GGAAC	2	10	94617	94626	40 %	0 %	40 %	20 %	532350512
74	NC_022107	GGATT	2	10	95517	95526	20 %	40 %	40 %	0 %	532350512
75	NC_022107	CAATC	2	10	96619	96628	40 %	20 %	0 %	40 %	532350514
76	NC_022107	TTTGC	2	10	96753	96762	0 %	60 %	20 %	20 %	532350514
77	NC_022107	ATTCA	2	10	97017	97026	40 %	40 %	0 %	20 %	532350514
78	NC_022107	GATCC	2	10	97276	97285	20 %	20 %	20 %	40 %	532350514
79	NC_022107	GTTTT	2	10	97697	97706	0 %	80 %	20 %	0 %	532350514
80	NC_022107	AAGCT	2	10	98900	98909	40 %	20 %	20 %	20 %	532350515
81	NC_022107	AGGGG	2	10	99259	99268	20 %	0 %	80 %	0 %	532350515
82	NC_022107	ATAGC	2	10	99958	99967	40 %	20 %	20 %	20 %	532350516
83	NC_022107	AGCGA	2	10	102886	102895	40 %	0 %	40 %	20 %	532350519
84	NC_022107	TTTCT	2	10	103244	103253	0 %	80 %	0 %	20 %	532350519
85	NC_022107	ATCAT	2	10	104450	104459	40 %	40 %	0 %	20 %	532350520
86	NC_022107	GGCAT	2	10	105158	105167	20 %	20 %	40 %	20 %	532350520
87	NC_022107	AAAGC	2	10	108884	108893	60 %	0 %	20 %	20 %	532350523
88	NC_022107	GCATT	2	10	110044	110053	20 %	40 %	20 %	20 %	532350524
89	NC_022107	TGTTT	2	10	114721	114730	0 %	80 %	20 %	0 %	532350526
90	NC_022107	CATGT	2	10	115099	115108	20 %	40 %	20 %	20 %	532350526
91	NC_022107	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	532350526
92	NC_022107	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	532350527
93	NC_022107	AAAGA	2	10	118564	118573	80 %	0 %	20 %	0 %	532350529
94	NC_022107	GCTTC	2	10	122554	122563	0 %	40 %	20 %	40 %	532350532
95	NC_022107	TACAA	2	10	126342	126351	60 %	20 %	0 %	20 %	532350536
96	NC_022107	ATCCA	2	10	128750	128759	40 %	20 %	0 %	40 %	532350539
97	NC_022107	GAAGA	2	10	130300	130309	60 %	0 %	40 %	0 %	532350539
98	NC_022107	AAAAG	2	10	132213	132222	80 %	0 %	20 %	0 %	532350540
99	NC_022107	GATTC	2	10	132544	132553	20 %	40 %	20 %	20 %	532350540
100	NC_022107	ATTGG	2	10	135829	135838	20 %	40 %	40 %	0 %	532350543
101	NC_022107	TGTTT	2	10	136288	136297	0 %	80 %	20 %	0 %	532350544
102	NC_022107	TCCAG	2	10	140034	140043	20 %	20 %	20 %	40 %	532350549
103	NC_022107	GTACA	2	10	140765	140774	40 %	20 %	20 %	20 %	532350550
104	NC_022107	TAGAT	2	10	141138	141147	40 %	40 %	20 %	0 %	532350550
105	NC_022107	AAAAG	2	10	141550	141559	80 %	0 %	20 %	0 %	532351287
106	NC_022107	AAAAC	2	10	142030	142039	80 %	0 %	0 %	20 %	532350551
107	NC_022107	TGCTA	2	10	143116	143125	20 %	40 %	20 %	20 %	532350553
108	NC_022107	GGAGC	2	10	143163	143172	20 %	0 %	60 %	20 %	532350553
109	NC_022107	CTGGG	2	10	144577	144586	0 %	20 %	60 %	20 %	532350555
110	NC_022107	GTTTT	2	10	145324	145333	0 %	80 %	20 %	0 %	532350556
111	NC_022107	GAACC	2	10	149058	149067	40 %	0 %	20 %	40 %	532350557
112	NC_022107	ATTCT	2	10	152554	152563	20 %	60 %	0 %	20 %	532350561
113	NC_022107	CTGTG	2	10	152758	152767	0 %	40 %	40 %	20 %	532350561
114	NC_022107	TTCTT	2	10	155231	155240	0 %	80 %	0 %	20 %	532350564
115	NC_022107	AGGAA	2	10	159789	159798	60 %	0 %	40 %	0 %	532350568
116	NC_022107	AGAGA	2	10	163020	163029	60 %	0 %	40 %	0 %	532350571
117	NC_022107	AGCAA	2	10	163455	163464	60 %	0 %	20 %	20 %	532350571
118	NC_022107	CAAAA	2	10	166958	166967	80 %	0 %	0 %	20 %	532350573
119	NC_022107	AAGAG	2	10	167791	167800	60 %	0 %	40 %	0 %	532350573
120	NC_022107	GATTG	2	10	168136	168145	20 %	40 %	40 %	0 %	532350573
121	NC_022107	GTTTT	2	10	174618	174627	0 %	80 %	20 %	0 %	532350577
122	NC_022107	TATTG	2	10	174641	174650	20 %	60 %	20 %	0 %	532350577
123	NC_022107	CAGCA	2	10	175000	175009	40 %	0 %	20 %	40 %	532350577
124	NC_022107	TAGGA	2	10	175305	175314	40 %	20 %	40 %	0 %	532350578
125	NC_022107	TGATT	2	10	177232	177241	20 %	60 %	20 %	0 %	532350579
126	NC_022107	TCAAT	2	10	177873	177882	40 %	40 %	0 %	20 %	532350579
127	NC_022107	TTTTC	2	10	177912	177921	0 %	80 %	0 %	20 %	532350579
128	NC_022107	GGAAT	2	10	179478	179487	40 %	20 %	40 %	0 %	532351288
129	NC_022107	AGAGT	2	10	180436	180445	40 %	20 %	40 %	0 %	532350580
130	NC_022107	TTGAG	2	10	182528	182537	20 %	40 %	40 %	0 %	532351289
131	NC_022107	GAATG	2	10	182553	182562	40 %	20 %	40 %	0 %	532351289
132	NC_022107	AGAGA	2	10	184596	184605	60 %	0 %	40 %	0 %	532350582
133	NC_022107	ACGAT	2	10	186668	186677	40 %	20 %	20 %	20 %	532350584
134	NC_022107	GGATC	2	10	189760	189769	20 %	20 %	40 %	20 %	532351293
135	NC_022107	CAGAT	2	10	189875	189884	40 %	20 %	20 %	20 %	532351293
136	NC_022107	ACGAT	2	10	190794	190803	40 %	20 %	20 %	20 %	532351294
137	NC_022107	TTGTA	2	10	191772	191781	20 %	60 %	20 %	0 %	532351294
138	NC_022107	TATGC	2	10	192177	192186	20 %	40 %	20 %	20 %	532351295
139	NC_022107	AAGAA	2	10	192343	192352	80 %	0 %	20 %	0 %	532351295
140	NC_022107	AAAAG	2	10	192471	192480	80 %	0 %	20 %	0 %	532350585
141	NC_022107	TATCA	2	10	192544	192553	40 %	40 %	0 %	20 %	532350585
142	NC_022107	GATCT	2	10	192690	192699	20 %	40 %	20 %	20 %	532350585
143	NC_022107	GATTA	2	10	193943	193952	40 %	40 %	20 %	0 %	532350586
144	NC_022107	AGAAA	2	10	196647	196656	80 %	0 %	20 %	0 %	532350588
145	NC_022107	CTCTA	2	10	201018	201027	20 %	40 %	0 %	40 %	532350592
146	NC_022107	CAAGA	2	10	203250	203259	60 %	0 %	20 %	20 %	532350595
147	NC_022107	CTTTA	2	10	204298	204307	20 %	60 %	0 %	20 %	532350596
148	NC_022107	AAACC	2	10	205123	205132	60 %	0 %	0 %	40 %	532350597
149	NC_022107	GGGAA	2	10	205636	205645	40 %	0 %	60 %	0 %	532350597
150	NC_022107	CTCTG	2	10	207050	207059	0 %	40 %	20 %	40 %	532350599
151	NC_022107	TGTTT	2	10	214432	214441	0 %	80 %	20 %	0 %	532350604
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153	NC_022107	TTTCT	2	10	215463	215472	0 %	80 %	0 %	20 %	532350604
154	NC_022107	AAATA	2	10	220647	220656	80 %	20 %	0 %	0 %	532350609
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157	NC_022107	TTTTC	2	10	224643	224652	0 %	80 %	0 %	20 %	532350613
158	NC_022107	TCCTC	2	10	228634	228643	0 %	40 %	0 %	60 %	532350617
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174	NC_022107	GCAAA	2	10	254430	254439	60 %	0 %	20 %	20 %	532350642
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177	NC_022107	TTTCT	2	10	258693	258702	0 %	80 %	0 %	20 %	532350646
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238	NC_022107	GCTCA	2	10	365133	365142	20 %	20 %	20 %	40 %	532350736
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247	NC_022107	CCAAT	2	10	379924	379933	40 %	20 %	0 %	40 %	532350746
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249	NC_022107	AAATC	2	10	382657	382666	60 %	20 %	0 %	20 %	532350747
250	NC_022107	TATTC	2	10	387050	387059	20 %	60 %	0 %	20 %	532350752
251	NC_022107	ATTTT	2	10	387189	387198	20 %	80 %	0 %	0 %	532350752
252	NC_022107	TGGCA	2	10	392480	392489	20 %	20 %	40 %	20 %	532350757
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255	NC_022107	TTGTT	2	10	395106	395115	0 %	80 %	20 %	0 %	532350758
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258	NC_022107	ATCAA	2	10	398328	398337	60 %	20 %	0 %	20 %	532350761
259	NC_022107	CAAGT	2	10	398398	398407	40 %	20 %	20 %	20 %	532350761
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261	NC_022107	AAAGT	2	10	400820	400829	60 %	20 %	20 %	0 %	532350763
262	NC_022107	CCTCT	2	10	403307	403316	0 %	40 %	0 %	60 %	532350764
263	NC_022107	TGTTT	2	10	404171	404180	0 %	80 %	20 %	0 %	532350766
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391	NC_022107	ATTTT	2	10	608247	608256	20 %	80 %	0 %	0 %	532350948
392	NC_022107	TGCCA	2	10	611603	611612	20 %	20 %	20 %	40 %	532350950
393	NC_022107	GGCGC	2	10	611998	612007	0 %	0 %	60 %	40 %	532350950
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