MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 2533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532350435
2	NC_022107	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532350436
3	NC_022107	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532350436
4	NC_022107	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532350437
5	NC_022107	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532350437
6	NC_022107	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532350437
7	NC_022107	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532350438
8	NC_022107	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532350438
9	NC_022107	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532350438
10	NC_022107	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532350438
11	NC_022107	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532350439
12	NC_022107	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532350439
13	NC_022107	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532350439
14	NC_022107	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532350440
15	NC_022107	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532350440
16	NC_022107	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532351272
17	NC_022107	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532351272
18	NC_022107	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532350441
19	NC_022107	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532350442
20	NC_022107	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532350442
21	NC_022107	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532350442
22	NC_022107	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532350442
23	NC_022107	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532350443
24	NC_022107	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532350443
25	NC_022107	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532350443
26	NC_022107	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	532350444
27	NC_022107	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	532350444
28	NC_022107	AGCC	2	8	10656	10663	25 %	0 %	25 %	50 %	532350444
29	NC_022107	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	532350444
30	NC_022107	AATG	2	8	11542	11549	50 %	25 %	25 %	0 %	532350445
31	NC_022107	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	532350446
32	NC_022107	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	532350446
33	NC_022107	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	532350447
34	NC_022107	TTCT	2	8	14211	14218	0 %	75 %	0 %	25 %	532350447
35	NC_022107	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	532350447
36	NC_022107	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	532350448
37	NC_022107	AAAT	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	532350448
38	NC_022107	GTAA	2	8	16403	16410	50 %	25 %	25 %	0 %	532350449
39	NC_022107	CTAA	2	8	16596	16603	50 %	25 %	0 %	25 %	532350449
40	NC_022107	AGAA	2	8	16859	16866	75 %	0 %	25 %	0 %	532350449
41	NC_022107	ATTT	2	8	17005	17012	25 %	75 %	0 %	0 %	532350449
42	NC_022107	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	532350451
43	NC_022107	GAAG	2	8	19511	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	532350451
44	NC_022107	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	532350451
45	NC_022107	TGTA	2	8	20229	20236	25 %	50 %	25 %	0 %	532350452
46	NC_022107	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	532350453
47	NC_022107	CATT	2	8	22704	22711	25 %	50 %	0 %	25 %	532350453
48	NC_022107	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532350453
49	NC_022107	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532350453
50	NC_022107	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532350453
51	NC_022107	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532350453
52	NC_022107	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532350453
53	NC_022107	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532350453
54	NC_022107	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	532350454
55	NC_022107	TTCG	2	8	25201	25208	0 %	50 %	25 %	25 %	532350454
56	NC_022107	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	532350454
57	NC_022107	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	532350454
58	NC_022107	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	532350454
59	NC_022107	TTTC	2	8	25953	25960	0 %	75 %	0 %	25 %	532350454
60	NC_022107	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	532350454
61	NC_022107	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	532350455
62	NC_022107	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	532350455
63	NC_022107	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	532350455
64	NC_022107	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	532350455
65	NC_022107	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	532350456
66	NC_022107	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	532350456
67	NC_022107	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532350458
68	NC_022107	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532350458
69	NC_022107	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532350458
70	NC_022107	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	532350458
71	NC_022107	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	532350459
72	NC_022107	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532350459
73	NC_022107	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532350459
74	NC_022107	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	532350461
75	NC_022107	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532350464
76	NC_022107	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532350464
77	NC_022107	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532350465
78	NC_022107	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532350465
79	NC_022107	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	532350466
80	NC_022107	TCGA	2	8	35160	35167	25 %	25 %	25 %	25 %	532350466
81	NC_022107	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	532350466
82	NC_022107	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532350466
83	NC_022107	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	532350466
84	NC_022107	CTTT	2	8	36638	36645	0 %	75 %	0 %	25 %	532350467
85	NC_022107	ATGA	2	8	37128	37135	50 %	25 %	25 %	0 %	532350467
86	NC_022107	TAGG	2	8	37287	37294	25 %	25 %	50 %	0 %	532350467
87	NC_022107	CAAT	2	8	37471	37478	50 %	25 %	0 %	25 %	532350467
88	NC_022107	AATG	2	8	38258	38265	50 %	25 %	25 %	0 %	532350467
89	NC_022107	AGAA	2	8	39095	39102	75 %	0 %	25 %	0 %	532350468
90	NC_022107	AAGA	2	8	39147	39154	75 %	0 %	25 %	0 %	532350468
91	NC_022107	ATCC	2	8	39155	39162	25 %	25 %	0 %	50 %	532350468
92	NC_022107	TAAT	2	8	39366	39373	50 %	50 %	0 %	0 %	532350468
93	NC_022107	GTGC	2	8	41455	41462	0 %	25 %	50 %	25 %	532350470
94	NC_022107	AGAA	2	8	41874	41881	75 %	0 %	25 %	0 %	532350470
95	NC_022107	GGAT	2	8	42026	42033	25 %	25 %	50 %	0 %	532350470
96	NC_022107	AAAC	2	8	43234	43241	75 %	0 %	0 %	25 %	532350472
97	NC_022107	CAAT	2	8	43438	43445	50 %	25 %	0 %	25 %	532350472
98	NC_022107	ATTT	2	8	44195	44202	25 %	75 %	0 %	0 %	532350474
99	NC_022107	GCTC	2	8	44503	44510	0 %	25 %	25 %	50 %	532350474
100	NC_022107	TTCT	2	8	44645	44652	0 %	75 %	0 %	25 %	532350474
101	NC_022107	TTGA	2	8	45245	45252	25 %	50 %	25 %	0 %	532350475
102	NC_022107	TGTT	2	8	45417	45424	0 %	75 %	25 %	0 %	532350475
103	NC_022107	CTAT	2	8	45447	45454	25 %	50 %	0 %	25 %	532350475
104	NC_022107	TGTT	2	8	45476	45483	0 %	75 %	25 %	0 %	532350475
105	NC_022107	CTAT	2	8	45772	45779	25 %	50 %	0 %	25 %	532350475
106	NC_022107	AAGA	2	8	46268	46275	75 %	0 %	25 %	0 %	532350476
107	NC_022107	AAGA	2	8	46325	46332	75 %	0 %	25 %	0 %	532350476
108	NC_022107	AAAG	2	8	46365	46372	75 %	0 %	25 %	0 %	532350476
109	NC_022107	AAGA	2	8	46480	46487	75 %	0 %	25 %	0 %	532350476
110	NC_022107	ACTT	2	8	46741	46748	25 %	50 %	0 %	25 %	532350476
111	NC_022107	ATGG	2	8	47367	47374	25 %	25 %	50 %	0 %	532350476
112	NC_022107	AGGA	2	8	47398	47405	50 %	0 %	50 %	0 %	532350476
113	NC_022107	GAAC	2	8	47945	47952	50 %	0 %	25 %	25 %	532350476
114	NC_022107	AAGT	2	8	47980	47987	50 %	25 %	25 %	0 %	532350476
115	NC_022107	AACA	2	8	48189	48196	75 %	0 %	0 %	25 %	532350477
116	NC_022107	CTTT	2	8	48385	48392	0 %	75 %	0 %	25 %	532350477
117	NC_022107	CTTT	2	8	49270	49277	0 %	75 %	0 %	25 %	532350478
118	NC_022107	GTAG	2	8	49288	49295	25 %	25 %	50 %	0 %	532350478
119	NC_022107	GAAG	2	8	50716	50723	50 %	0 %	50 %	0 %	532350479
120	NC_022107	TTCA	2	8	51138	51145	25 %	50 %	0 %	25 %	532350479
121	NC_022107	TCTA	2	8	51355	51362	25 %	50 %	0 %	25 %	532350479
122	NC_022107	GGAA	2	8	52521	52528	50 %	0 %	50 %	0 %	532350481
123	NC_022107	TTAA	2	8	53262	53269	50 %	50 %	0 %	0 %	532350481
124	NC_022107	CCTT	2	8	53469	53476	0 %	50 %	0 %	50 %	532350482
125	NC_022107	TTTA	2	8	53636	53643	25 %	75 %	0 %	0 %	532350482
126	NC_022107	AAAG	2	8	53860	53867	75 %	0 %	25 %	0 %	532350482
127	NC_022107	GATT	2	8	53997	54004	25 %	50 %	25 %	0 %	532350482
128	NC_022107	AATC	2	8	54052	54059	50 %	25 %	0 %	25 %	532350482
129	NC_022107	GGAT	2	8	54345	54352	25 %	25 %	50 %	0 %	532350483
130	NC_022107	TCGA	2	8	54507	54514	25 %	25 %	25 %	25 %	532350483
131	NC_022107	CTTC	2	8	54601	54608	0 %	50 %	0 %	50 %	532350483
132	NC_022107	GAAT	2	8	54636	54643	50 %	25 %	25 %	0 %	532350483
133	NC_022107	TTGA	2	8	54706	54713	25 %	50 %	25 %	0 %	532350483
134	NC_022107	GGAA	2	8	55062	55069	50 %	0 %	50 %	0 %	532350483
135	NC_022107	CTGG	3	12	55973	55984	0 %	25 %	50 %	25 %	532351274
136	NC_022107	TTGC	2	8	56110	56117	0 %	50 %	25 %	25 %	532351274
137	NC_022107	AGCT	2	8	56609	56616	25 %	25 %	25 %	25 %	532351274
138	NC_022107	GGTT	2	8	57312	57319	0 %	50 %	50 %	0 %	532351274
139	NC_022107	AGAA	2	8	58173	58180	75 %	0 %	25 %	0 %	532351275
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141	NC_022107	TAGA	2	8	58892	58899	50 %	25 %	25 %	0 %	532351275
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