MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022107	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022107	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022107	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022107	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022107	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022107	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022107	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022107	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022107	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022107	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022107	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022107	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022107	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022107	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022107	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022107	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022107	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022107	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022107	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022107	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022107	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022107	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022107	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022107	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022107	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022107	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022107	AG	3	6	48045	48050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022107	TG	4	8	51393	51400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022107	GA	3	6	55717	55722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022107	AG	4	8	64884	64891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022107	TA	3	6	85314	85319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022107	TC	3	6	90535	90540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022107	GA	3	6	90667	90672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022107	CT	3	6	93017	93022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022107	GA	3	6	93545	93550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022107	TA	3	6	94161	94166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022107	TC	3	6	100043	100048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022107	AT	3	6	100094	100099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022107	TA	3	6	106770	106775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022107	TG	3	6	116012	116017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022107	AG	4	8	118598	118605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022107	GA	3	6	120420	120425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022107	TA	3	6	122655	122660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022107	GT	3	6	123644	123649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022107	CT	3	6	128180	128185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022107	TC	3	6	130502	130507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022107	TG	3	6	133411	133416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022107	AG	3	6	138266	138271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022107	AT	3	6	142561	142566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022107	AG	3	6	157366	157371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022107	TC	3	6	171829	171834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022107	AG	3	6	171961	171966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022107	CT	3	6	171979	171984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022107	TG	3	6	178470	178475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022107	CT	3	6	181183	181188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022107	GA	3	6	181262	181267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022107	CA	3	6	181575	181580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022107	TG	3	6	181974	181979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022107	GA	3	6	182017	182022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022107	GA	3	6	183905	183910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022107	AT	3	6	192364	192369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022107	AG	3	6	196833	196838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022107	CT	3	6	203583	203588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022107	GA	4	8	206642	206649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022107	CT	4	8	206690	206697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022107	AG	4	8	217926	217933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022107	TA	3	6	219480	219485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022107	CT	3	6	221121	221126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022107	TC	3	6	224122	224127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022107	AG	3	6	224153	224158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022107	TC	3	6	238353	238358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022107	AG	3	6	238379	238384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022107	CA	3	6	243303	243308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022107	GT	3	6	243520	243525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022107	GA	3	6	250387	250392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022107	TG	3	6	250497	250502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022107	AG	3	6	251299	251304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022107	AG	3	6	251324	251329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022107	AG	3	6	252307	252312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022107	TA	3	6	254113	254118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022107	TC	3	6	256429	256434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022107	AG	3	6	257907	257912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022107	TA	3	6	264267	264272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022107	CA	3	6	266074	266079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022107	AG	3	6	272301	272306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022107	AC	3	6	272359	272364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022107	CT	3	6	273217	273222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022107	CT	3	6	273388	273393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022107	TA	3	6	273527	273532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022107	AT	4	8	284087	284094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022107	CT	3	6	284939	284944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022107	TC	4	8	285030	285037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022107	TC	3	6	286721	286726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022107	TC	3	6	286778	286783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_022107	CT	3	6	287251	287256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022107	CA	3	6	301595	301600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022107	AC	3	6	301636	301641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022107	GA	3	6	306326	306331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022107	AG	3	6	315546	315551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022107	CT	3	6	347524	347529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022107	CT	3	6	350595	350600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022107	TC	3	6	354821	354826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022107	CT	3	6	358737	358742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022107	AC	3	6	362070	362075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022107	TA	3	6	364260	364265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022107	CT	4	8	381378	381385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022107	CG	3	6	391217	391222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022107	CA	3	6	392267	392272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022107	TC	3	6	394814	394819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022107	CT	3	6	395304	395309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022107	GA	3	6	395434	395439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022107	GA	3	6	395565	395570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022107	CT	3	6	410657	410662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022107	CT	3	6	429385	429390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022107	CT	3	6	430408	430413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022107	AG	3	6	430755	430760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022107	GA	3	6	432450	432455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022107	AC	3	6	436448	436453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022107	CT	3	6	440719	440724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022107	AC	3	6	440757	440762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022107	CA	3	6	443226	443231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022107	CT	3	6	444626	444631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022107	CT	3	6	453908	453913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022107	CT	3	6	456361	456366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_022107	AG	3	6	460049	460054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022107	TC	3	6	466587	466592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022107	AT	3	6	466656	466661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022107	GA	4	8	468030	468037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022107	TA	3	6	468073	468078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022107	GA	3	6	468171	468176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022107	AC	3	6	485480	485485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022107	GA	4	8	485525	485532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022107	CA	3	6	485562	485567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022107	TC	3	6	485603	485608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022107	AC	3	6	490038	490043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022107	AG	3	6	490199	490204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022107	CT	3	6	490218	490223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022107	CT	3	6	493497	493502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022107	CT	3	6	494015	494020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022107	TG	3	6	494048	494053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022107	TA	3	6	494161	494166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022107	CT	4	8	499818	499825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022107	CT	4	8	502785	502792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_022107	CA	3	6	507888	507893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022107	CT	3	6	508826	508831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_022107	TA	3	6	514633	514638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022107	AG	3	6	516531	516536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022107	GA	3	6	517543	517548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022107	AG	3	6	517579	517584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022107	AT	3	6	523811	523816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022107	AC	3	6	535073	535078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_022107	CT	3	6	536990	536995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_022107	TC	4	8	540514	540521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_022107	AT	3	6	540567	540572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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309	NC_022107	AT	3	6	1025836	1025841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_022107	AG	3	6	1032041	1032046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_022107	TC	3	6	1032126	1032131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
312	NC_022107	TG	3	6	1032138	1032143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_022107	CT	3	6	1038392	1038397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
314	NC_022107	AG	3	6	1038406	1038411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
315	NC_022107	GA	3	6	1039041	1039046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_022107	TC	3	6	1039142	1039147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
318	NC_022107	AG	4	8	1039286	1039293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
319	NC_022107	GA	3	6	1042465	1042470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.