MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532349510
2	NC_022106	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532349511
3	NC_022106	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532349511
4	NC_022106	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532349511
5	NC_022106	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532349511
6	NC_022106	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532349512
7	NC_022106	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	532349514
8	NC_022106	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	532349515
9	NC_022106	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	532349516
10	NC_022106	CCTCT	2	10	10526	10535	0 %	40 %	0 %	60 %	532349517
11	NC_022106	AAAGG	2	10	10685	10694	60 %	0 %	40 %	0 %	532349517
12	NC_022106	AAGAA	2	10	11805	11814	80 %	0 %	20 %	0 %	532349518
13	NC_022106	AAAGA	2	10	13203	13212	80 %	0 %	20 %	0 %	532349519
14	NC_022106	GGTGT	2	10	13307	13316	0 %	40 %	60 %	0 %	532349519
15	NC_022106	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	532349521
16	NC_022106	CGTTC	2	10	16161	16170	0 %	40 %	20 %	40 %	532349522
17	NC_022106	GCTTC	2	10	16534	16543	0 %	40 %	20 %	40 %	532349522
18	NC_022106	GAAGG	2	10	16905	16914	40 %	0 %	60 %	0 %	532349522
19	NC_022106	GTTGT	2	10	20331	20340	0 %	60 %	40 %	0 %	532349525
20	NC_022106	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	532349526
21	NC_022106	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	532349526
22	NC_022106	GGAAA	2	10	23808	23817	60 %	0 %	40 %	0 %	532349526
23	NC_022106	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	532349527
24	NC_022106	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	532349528
25	NC_022106	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	532349530
26	NC_022106	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	532349530
27	NC_022106	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	532349531
28	NC_022106	AAGGA	2	10	30422	30431	60 %	0 %	40 %	0 %	532349532
29	NC_022106	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	532349533
30	NC_022106	TCAGT	2	10	35701	35710	20 %	40 %	20 %	20 %	532349539
31	NC_022106	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	532349539
32	NC_022106	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	532349539
33	NC_022106	ACGAT	2	10	38098	38107	40 %	20 %	20 %	20 %	532349540
34	NC_022106	TTTGA	2	10	38463	38472	20 %	60 %	20 %	0 %	532349540
35	NC_022106	AGCAA	2	10	42114	42123	60 %	0 %	20 %	20 %	532349543
36	NC_022106	CGATG	2	10	42171	42180	20 %	20 %	40 %	20 %	532349543
37	NC_022106	TTTAT	2	10	44244	44253	20 %	80 %	0 %	0 %	532349547
38	NC_022106	CTTTC	2	10	46341	46350	0 %	60 %	0 %	40 %	532349549
39	NC_022106	AGTTT	2	10	46880	46889	20 %	60 %	20 %	0 %	532349549
40	NC_022106	GAAGA	2	10	48013	48022	60 %	0 %	40 %	0 %	532349549
41	NC_022106	CTTTT	2	10	50043	50052	0 %	80 %	0 %	20 %	532349552
42	NC_022106	CCGTA	2	10	53926	53935	20 %	20 %	20 %	40 %	532349555
43	NC_022106	TTATC	2	10	55335	55344	20 %	60 %	0 %	20 %	532349556
44	NC_022106	TGAGT	2	10	55356	55365	20 %	40 %	40 %	0 %	532349556
45	NC_022106	GTTGT	2	10	56403	56412	0 %	60 %	40 %	0 %	532350348
46	NC_022106	GAGCA	2	10	59851	59860	40 %	0 %	40 %	20 %	532349557
47	NC_022106	TGTGA	2	10	62300	62309	20 %	40 %	40 %	0 %	532349559
48	NC_022106	AGTGA	2	10	63821	63830	40 %	20 %	40 %	0 %	532349560
49	NC_022106	CCTTC	2	10	64095	64104	0 %	40 %	0 %	60 %	532349560
50	NC_022106	AGGAG	2	10	66323	66332	40 %	0 %	60 %	0 %	532349562
51	NC_022106	GTTAA	2	10	66453	66462	40 %	40 %	20 %	0 %	532349562
52	NC_022106	GGAGC	2	10	69701	69710	20 %	0 %	60 %	20 %	532349565
53	NC_022106	GCGAT	2	10	69891	69900	20 %	20 %	40 %	20 %	532349565
54	NC_022106	CTCTT	2	10	70245	70254	0 %	60 %	0 %	40 %	532349565
55	NC_022106	AGGGG	2	10	70891	70900	20 %	0 %	80 %	0 %	532349565
56	NC_022106	AAGAA	2	10	70933	70942	80 %	0 %	20 %	0 %	532349565
57	NC_022106	CTTGC	2	10	72022	72031	0 %	40 %	20 %	40 %	532350351
58	NC_022106	ATTGG	2	10	72223	72232	20 %	40 %	40 %	0 %	532349567
59	NC_022106	GAAAA	2	10	73295	73304	80 %	0 %	20 %	0 %	532349567
60	NC_022106	TGGGA	2	10	73712	73721	20 %	20 %	60 %	0 %	532349568
61	NC_022106	TATTT	2	10	76239	76248	20 %	80 %	0 %	0 %	532349569
62	NC_022106	TGTCT	2	10	80033	80042	0 %	60 %	20 %	20 %	532349572
63	NC_022106	TTACT	2	10	80540	80549	20 %	60 %	0 %	20 %	532349572
64	NC_022106	AGAAA	2	10	81930	81939	80 %	0 %	20 %	0 %	532349574
65	NC_022106	GGAAG	2	10	82443	82452	40 %	0 %	60 %	0 %	532349574
66	NC_022106	AGCGA	2	10	84909	84918	40 %	0 %	40 %	20 %	532349576
67	NC_022106	GATCC	2	10	85994	86003	20 %	20 %	20 %	40 %	532349577
68	NC_022106	AGAGC	2	10	87329	87338	40 %	0 %	40 %	20 %	532350353
69	NC_022106	TTTTC	2	10	91061	91070	0 %	80 %	0 %	20 %	532349580
70	NC_022106	GGATG	2	10	91321	91330	20 %	20 %	60 %	0 %	532349581
71	NC_022106	CAACA	2	10	92860	92869	60 %	0 %	0 %	40 %	532349582
72	NC_022106	ACAGC	2	10	93904	93913	40 %	0 %	20 %	40 %	532349584
73	NC_022106	GGAAC	2	10	94617	94626	40 %	0 %	40 %	20 %	532349585
74	NC_022106	GGATT	2	10	95517	95526	20 %	40 %	40 %	0 %	532349585
75	NC_022106	CAATC	2	10	96619	96628	40 %	20 %	0 %	40 %	532349587
76	NC_022106	TTTGC	2	10	96753	96762	0 %	60 %	20 %	20 %	532349587
77	NC_022106	ATTCA	2	10	97017	97026	40 %	40 %	0 %	20 %	532349587
78	NC_022106	GATCC	2	10	97276	97285	20 %	20 %	20 %	40 %	532349587
79	NC_022106	GTTTT	2	10	97697	97706	0 %	80 %	20 %	0 %	532349587
80	NC_022106	AAGCT	2	10	98900	98909	40 %	20 %	20 %	20 %	532349588
81	NC_022106	AGGGG	2	10	99259	99268	20 %	0 %	80 %	0 %	532349588
82	NC_022106	ATAGC	2	10	99958	99967	40 %	20 %	20 %	20 %	532349589
83	NC_022106	AGCGA	2	10	102886	102895	40 %	0 %	40 %	20 %	532349592
84	NC_022106	TTTCT	2	10	103244	103253	0 %	80 %	0 %	20 %	532349592
85	NC_022106	ATCAT	2	10	104450	104459	40 %	40 %	0 %	20 %	532349593
86	NC_022106	GGCAT	2	10	105158	105167	20 %	20 %	40 %	20 %	532349593
87	NC_022106	AAAGC	2	10	108884	108893	60 %	0 %	20 %	20 %	532349596
88	NC_022106	GCATT	2	10	110044	110053	20 %	40 %	20 %	20 %	532349597
89	NC_022106	TGTTT	2	10	114721	114730	0 %	80 %	20 %	0 %	532349599
90	NC_022106	CATGT	2	10	115099	115108	20 %	40 %	20 %	20 %	532349599
91	NC_022106	TATCG	2	10	115803	115812	20 %	40 %	20 %	20 %	532349599
92	NC_022106	TTTCT	2	10	116319	116328	0 %	80 %	0 %	20 %	532349600
93	NC_022106	AAAGA	2	10	118564	118573	80 %	0 %	20 %	0 %	532349602
94	NC_022106	GCTTC	2	10	122554	122563	0 %	40 %	20 %	40 %	532349605
95	NC_022106	TACAA	2	10	126342	126351	60 %	20 %	0 %	20 %	532349609
96	NC_022106	ATCCA	2	10	128750	128759	40 %	20 %	0 %	40 %	532349612
97	NC_022106	GAAGA	2	10	130300	130309	60 %	0 %	40 %	0 %	532349612
98	NC_022106	AAAAG	2	10	132213	132222	80 %	0 %	20 %	0 %	532349613
99	NC_022106	GATTC	2	10	132544	132553	20 %	40 %	20 %	20 %	532349613
100	NC_022106	ATTGG	2	10	135829	135838	20 %	40 %	40 %	0 %	532349616
101	NC_022106	TGTTT	2	10	136288	136297	0 %	80 %	20 %	0 %	532349617
102	NC_022106	TCCAG	2	10	140034	140043	20 %	20 %	20 %	40 %	532349622
103	NC_022106	GTACA	2	10	140765	140774	40 %	20 %	20 %	20 %	532349623
104	NC_022106	TAGAT	2	10	141138	141147	40 %	40 %	20 %	0 %	532349623
105	NC_022106	AAAAG	2	10	141550	141559	80 %	0 %	20 %	0 %	532350361
106	NC_022106	AAAAC	2	10	142030	142039	80 %	0 %	0 %	20 %	532349624
107	NC_022106	TGCTA	2	10	143116	143125	20 %	40 %	20 %	20 %	532349626
108	NC_022106	GGAGC	2	10	143163	143172	20 %	0 %	60 %	20 %	532349626
109	NC_022106	CTGGG	2	10	144577	144586	0 %	20 %	60 %	20 %	532349628
110	NC_022106	GTTTT	2	10	145324	145333	0 %	80 %	20 %	0 %	532349629
111	NC_022106	GAACC	2	10	149058	149067	40 %	0 %	20 %	40 %	532349630
112	NC_022106	ATTCT	2	10	152554	152563	20 %	60 %	0 %	20 %	532349634
113	NC_022106	CTGTG	2	10	152758	152767	0 %	40 %	40 %	20 %	532349634
114	NC_022106	TTCTT	2	10	155231	155240	0 %	80 %	0 %	20 %	532349637
115	NC_022106	AGGAA	2	10	159789	159798	60 %	0 %	40 %	0 %	532349641
116	NC_022106	AGAGA	2	10	163020	163029	60 %	0 %	40 %	0 %	532349644
117	NC_022106	AGCAA	2	10	163455	163464	60 %	0 %	20 %	20 %	532349644
118	NC_022106	CAAAA	2	10	166958	166967	80 %	0 %	0 %	20 %	532349646
119	NC_022106	AAGAG	2	10	167791	167800	60 %	0 %	40 %	0 %	532349646
120	NC_022106	GATTG	2	10	168136	168145	20 %	40 %	40 %	0 %	532349646
121	NC_022106	GTTTT	2	10	174618	174627	0 %	80 %	20 %	0 %	532349650
122	NC_022106	TATTG	2	10	174641	174650	20 %	60 %	20 %	0 %	532349650
123	NC_022106	CAGCA	2	10	175000	175009	40 %	0 %	20 %	40 %	532349650
124	NC_022106	TAGGA	2	10	175305	175314	40 %	20 %	40 %	0 %	532349651
125	NC_022106	TGATT	2	10	177232	177241	20 %	60 %	20 %	0 %	532349652
126	NC_022106	TCAAT	2	10	177873	177882	40 %	40 %	0 %	20 %	532349652
127	NC_022106	TTTTC	2	10	177912	177921	0 %	80 %	0 %	20 %	532349652
128	NC_022106	GGAAT	2	10	179478	179487	40 %	20 %	40 %	0 %	532350362
129	NC_022106	AGAGT	2	10	180436	180445	40 %	20 %	40 %	0 %	532349653
130	NC_022106	TTGAA	2	10	180969	180978	40 %	40 %	20 %	0 %	532349654
131	NC_022106	TTGAG	2	10	182529	182538	20 %	40 %	40 %	0 %	532350363
132	NC_022106	GAATG	2	10	182554	182563	40 %	20 %	40 %	0 %	532350363
133	NC_022106	AGAGA	2	10	184597	184606	60 %	0 %	40 %	0 %	532349656
134	NC_022106	ACGAT	2	10	186669	186678	40 %	20 %	20 %	20 %	532349658
135	NC_022106	GGATC	2	10	189759	189768	20 %	20 %	40 %	20 %	532350366
136	NC_022106	CAGAT	2	10	189874	189883	40 %	20 %	20 %	20 %	532350366
137	NC_022106	ACGAT	2	10	190793	190802	40 %	20 %	20 %	20 %	532350367
138	NC_022106	TTGTA	2	10	191771	191780	20 %	60 %	20 %	0 %	532350367
139	NC_022106	TATGC	2	10	192176	192185	20 %	40 %	20 %	20 %	532350368
140	NC_022106	AAGAA	2	10	192342	192351	80 %	0 %	20 %	0 %	532350368
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142	NC_022106	TATCA	2	10	192544	192553	40 %	40 %	0 %	20 %	532349659
143	NC_022106	GATCT	2	10	192690	192699	20 %	40 %	20 %	20 %	532349659
144	NC_022106	GATTA	2	10	193943	193952	40 %	40 %	20 %	0 %	532349660
145	NC_022106	AGAAA	2	10	196647	196656	80 %	0 %	20 %	0 %	532349662
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149	NC_022106	AAACC	2	10	205122	205131	60 %	0 %	0 %	40 %	532349671
150	NC_022106	GGGAA	2	10	205635	205644	40 %	0 %	60 %	0 %	532349671
151	NC_022106	CTCTG	2	10	207049	207058	0 %	40 %	20 %	40 %	532349673
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154	NC_022106	TTTCT	2	10	215462	215471	0 %	80 %	0 %	20 %	532349678
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195	NC_022106	ATGCT	2	10	278839	278848	20 %	40 %	20 %	20 %	532349737
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250	NC_022106	ACAGC	2	10	382208	382217	40 %	0 %	20 %	40 %	532349822
251	NC_022106	AAATC	2	10	382652	382661	60 %	20 %	0 %	20 %	532349822
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388	NC_022106	ATCCA	2	10	601905	601914	40 %	20 %	0 %	40 %	532350015
389	NC_022106	AAACC	2	10	602074	602083	60 %	0 %	0 %	40 %	532350015
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391	NC_022106	AAAGT	2	10	603000	603009	60 %	20 %	20 %	0 %	532350016
392	NC_022106	ACTTC	2	10	607013	607022	20 %	40 %	0 %	40 %	532350022
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394	NC_022106	TGCCA	2	10	611441	611450	20 %	20 %	20 %	40 %	532350025
395	NC_022106	GGCGC	2	10	611836	611845	0 %	0 %	60 %	40 %	532350025
396	NC_022106	ATTGG	2	10	612411	612420	20 %	40 %	40 %	0 %	532350025
397	NC_022106	CTCTC	2	10	612976	612985	0 %	40 %	0 %	60 %	532350026
398	NC_022106	AAAAC	2	10	613236	613245	80 %	0 %	0 %	20 %	532350026
399	NC_022106	ATTTT	2	10	613473	613482	20 %	80 %	0 %	0 %	532350026
400	NC_022106	CTATC	2	10	613593	613602	20 %	40 %	0 %	40 %	532350026
401	NC_022106	GCAGA	2	10	615805	615814	40 %	0 %	40 %	20 %	532350026
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403	NC_022106	TGAAT	2	10	616851	616860	40 %	40 %	20 %	0 %	532350027
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435	NC_022106	CTTTT	2	10	677648	677657	0 %	80 %	0 %	20 %	532350075
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490	NC_022106	GCGAT	2	10	766757	766766	20 %	20 %	40 %	20 %	532350150
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