MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 2868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022106	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022106	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022106	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532349508
5	NC_022106	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532349509
6	NC_022106	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532349509
7	NC_022106	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532349510
8	NC_022106	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532349510
9	NC_022106	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532349510
10	NC_022106	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532349511
11	NC_022106	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532349511
12	NC_022106	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532349511
13	NC_022106	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532349511
14	NC_022106	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532349512
15	NC_022106	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532349512
16	NC_022106	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532349512
17	NC_022106	GGAG	2	8	6304	6311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022106	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532349513
19	NC_022106	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532349513
20	NC_022106	TATG	2	8	6953	6960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022106	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532350346
22	NC_022106	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532350346
23	NC_022106	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532349514
24	NC_022106	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532349515
25	NC_022106	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532349515
26	NC_022106	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532349515
27	NC_022106	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532349515
28	NC_022106	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022106	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532349516
30	NC_022106	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532349516
31	NC_022106	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532349516
32	NC_022106	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	532349517
33	NC_022106	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	532349517
34	NC_022106	AGCC	2	8	10656	10663	25 %	0 %	25 %	50 %	532349517
35	NC_022106	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	532349517
36	NC_022106	AGAA	2	8	11203	11210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022106	AATG	2	8	11542	11549	50 %	25 %	25 %	0 %	532349518
38	NC_022106	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	532349519
39	NC_022106	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	532349519
40	NC_022106	AAGG	2	8	13439	13446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022106	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	532349520
42	NC_022106	TTCT	2	8	14211	14218	0 %	75 %	0 %	25 %	532349520
43	NC_022106	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	532349520
44	NC_022106	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	532349521
45	NC_022106	AAAT	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	532349521
46	NC_022106	CAAA	2	8	16073	16080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_022106	GTAA	2	8	16403	16410	50 %	25 %	25 %	0 %	532349522
48	NC_022106	CTAA	2	8	16596	16603	50 %	25 %	0 %	25 %	532349522
49	NC_022106	AGAA	2	8	16859	16866	75 %	0 %	25 %	0 %	532349522
50	NC_022106	ATTT	2	8	17005	17012	25 %	75 %	0 %	0 %	532349522
51	NC_022106	TGCG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	50 %	25 %	532349524
52	NC_022106	GAAG	2	8	19511	19518	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
53	NC_022106	TTTG	2	8	19537	19544	0 %	75 %	25 %	0 %	532349524
54	NC_022106	TGTA	2	8	20229	20236	25 %	50 %	25 %	0 %	532349525
55	NC_022106	GCCA	2	8	21021	21028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022106	CGCT	2	8	21269	21276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_022106	TTAA	2	8	21290	21297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022106	GTTA	2	8	21327	21334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022106	GATC	2	8	21382	21389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022106	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	532349526
61	NC_022106	CATT	2	8	22704	22711	25 %	50 %	0 %	25 %	532349526
62	NC_022106	GCTT	2	8	23047	23054	0 %	50 %	25 %	25 %	532349526
63	NC_022106	GGTT	2	8	23095	23102	0 %	50 %	50 %	0 %	532349526
64	NC_022106	TTCT	2	8	23465	23472	0 %	75 %	0 %	25 %	532349526
65	NC_022106	TAAC	2	8	23567	23574	50 %	25 %	0 %	25 %	532349526
66	NC_022106	CATT	2	8	23690	23697	25 %	50 %	0 %	25 %	532349526
67	NC_022106	GGTA	2	8	24060	24067	25 %	25 %	50 %	0 %	532349526
68	NC_022106	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	532349527
69	NC_022106	TTCG	2	8	25201	25208	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
70	NC_022106	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
71	NC_022106	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	532349527
72	NC_022106	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	532349527
73	NC_022106	TTTC	2	8	25953	25960	0 %	75 %	0 %	25 %	532349527
74	NC_022106	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	532349527
75	NC_022106	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	532349528
76	NC_022106	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	532349528
77	NC_022106	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	532349528
78	NC_022106	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	532349528
79	NC_022106	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	532349529
80	NC_022106	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	532349529
81	NC_022106	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022106	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	532349531
83	NC_022106	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
84	NC_022106	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	532349531
85	NC_022106	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	532349531
86	NC_022106	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	532349532
87	NC_022106	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	532349532
88	NC_022106	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	532349532
89	NC_022106	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	532349534
90	NC_022106	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	532349537
91	NC_022106	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	532349537
92	NC_022106	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	532349538
93	NC_022106	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	532349538
94	NC_022106	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	532349539
95	NC_022106	TCGA	2	8	35160	35167	25 %	25 %	25 %	25 %	532349539
96	NC_022106	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	532349539
97	NC_022106	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	532349539
98	NC_022106	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	532349539
99	NC_022106	CTTT	2	8	36638	36645	0 %	75 %	0 %	25 %	532349540
100	NC_022106	ATGA	2	8	37128	37135	50 %	25 %	25 %	0 %	532349540
101	NC_022106	TAGG	2	8	37287	37294	25 %	25 %	50 %	0 %	532349540
102	NC_022106	CAAT	2	8	37471	37478	50 %	25 %	0 %	25 %	532349540
103	NC_022106	AATG	2	8	38258	38265	50 %	25 %	25 %	0 %	532349540
104	NC_022106	AGAA	2	8	39095	39102	75 %	0 %	25 %	0 %	532349541
105	NC_022106	AAGA	2	8	39147	39154	75 %	0 %	25 %	0 %	532349541
106	NC_022106	ATCC	2	8	39155	39162	25 %	25 %	0 %	50 %	532349541
107	NC_022106	TAAT	2	8	39366	39373	50 %	50 %	0 %	0 %	532349541
108	NC_022106	GTGC	2	8	41455	41462	0 %	25 %	50 %	25 %	532349543
109	NC_022106	AGAA	2	8	41874	41881	75 %	0 %	25 %	0 %	532349543
110	NC_022106	GGAT	2	8	42026	42033	25 %	25 %	50 %	0 %	532349543
111	NC_022106	AAAC	2	8	43234	43241	75 %	0 %	0 %	25 %	532349545
112	NC_022106	CAAT	2	8	43438	43445	50 %	25 %	0 %	25 %	532349545
113	NC_022106	TGTT	2	8	43818	43825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022106	AATA	2	8	44057	44064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022106	ATTT	2	8	44195	44202	25 %	75 %	0 %	0 %	532349547
116	NC_022106	GCTC	2	8	44503	44510	0 %	25 %	25 %	50 %	532349547
117	NC_022106	TTCT	2	8	44645	44652	0 %	75 %	0 %	25 %	532349547
118	NC_022106	TTGA	2	8	45245	45252	25 %	50 %	25 %	0 %	532349548
119	NC_022106	TGTT	2	8	45417	45424	0 %	75 %	25 %	0 %	532349548
120	NC_022106	CTAT	2	8	45447	45454	25 %	50 %	0 %	25 %	532349548
121	NC_022106	TGTT	2	8	45476	45483	0 %	75 %	25 %	0 %	532349548
122	NC_022106	CTAT	2	8	45772	45779	25 %	50 %	0 %	25 %	532349548
123	NC_022106	AAGA	2	8	46268	46275	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
124	NC_022106	AAGA	2	8	46325	46332	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
125	NC_022106	AAAG	2	8	46365	46372	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
126	NC_022106	AAGA	2	8	46480	46487	75 %	0 %	25 %	0 %	532349549
127	NC_022106	ACTT	2	8	46741	46748	25 %	50 %	0 %	25 %	532349549
128	NC_022106	ATGG	2	8	47367	47374	25 %	25 %	50 %	0 %	532349549
129	NC_022106	AGGA	2	8	47398	47405	50 %	0 %	50 %	0 %	532349549
130	NC_022106	GAAC	2	8	47945	47952	50 %	0 %	25 %	25 %	532349549
131	NC_022106	AAGT	2	8	47980	47987	50 %	25 %	25 %	0 %	532349549
132	NC_022106	AACA	2	8	48189	48196	75 %	0 %	0 %	25 %	532349550
133	NC_022106	CTTT	2	8	48385	48392	0 %	75 %	0 %	25 %	532349550
134	NC_022106	CTTT	2	8	49270	49277	0 %	75 %	0 %	25 %	532349551
135	NC_022106	GTAG	2	8	49288	49295	25 %	25 %	50 %	0 %	532349551
136	NC_022106	GAAG	2	8	50716	50723	50 %	0 %	50 %	0 %	532349552
137	NC_022106	TTCA	2	8	51138	51145	25 %	50 %	0 %	25 %	532349552
138	NC_022106	TCTA	2	8	51355	51362	25 %	50 %	0 %	25 %	532349552
139	NC_022106	TATT	2	8	52290	52297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022106	GGAA	2	8	52521	52528	50 %	0 %	50 %	0 %	532349554
141	NC_022106	TTAA	2	8	53262	53269	50 %	50 %	0 %	0 %	532349554
142	NC_022106	CCTT	2	8	53469	53476	0 %	50 %	0 %	50 %	532349555
143	NC_022106	TTTA	2	8	53636	53643	25 %	75 %	0 %	0 %	532349555
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