MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 12923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349508
2	NC_022106	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349508
3	NC_022106	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349508
4	NC_022106	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349508
5	NC_022106	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349508
6	NC_022106	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349508
7	NC_022106	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349508
8	NC_022106	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349508
9	NC_022106	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349508
10	NC_022106	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349508
11	NC_022106	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349509
12	NC_022106	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349509
13	NC_022106	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349509
14	NC_022106	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349509
15	NC_022106	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349509
16	NC_022106	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349509
17	NC_022106	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349509
18	NC_022106	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349510
19	NC_022106	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349510
20	NC_022106	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349510
21	NC_022106	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349510
22	NC_022106	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349510
23	NC_022106	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349510
24	NC_022106	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349510
25	NC_022106	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349510
26	NC_022106	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349510
27	NC_022106	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349510
28	NC_022106	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349510
29	NC_022106	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349510
30	NC_022106	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349510
31	NC_022106	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349510
32	NC_022106	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349510
33	NC_022106	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349510
34	NC_022106	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349510
35	NC_022106	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349510
36	NC_022106	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349510
37	NC_022106	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349510
38	NC_022106	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349510
39	NC_022106	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349510
40	NC_022106	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349511
41	NC_022106	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349511
42	NC_022106	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349511
43	NC_022106	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349511
44	NC_022106	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349511
45	NC_022106	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349511
46	NC_022106	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349511
47	NC_022106	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349511
48	NC_022106	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349511
49	NC_022106	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349511
50	NC_022106	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349511
51	NC_022106	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349511
52	NC_022106	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349511
53	NC_022106	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349511
54	NC_022106	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349511
55	NC_022106	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349511
56	NC_022106	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349512
57	NC_022106	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349512
58	NC_022106	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349512
59	NC_022106	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349512
60	NC_022106	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349512
61	NC_022106	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349512
62	NC_022106	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349512
63	NC_022106	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349512
64	NC_022106	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349512
65	NC_022106	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349512
66	NC_022106	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349512
67	NC_022106	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349512
68	NC_022106	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349512
69	NC_022106	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349512
70	NC_022106	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349512
71	NC_022106	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349512
72	NC_022106	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349512
73	NC_022106	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349512
74	NC_022106	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349513
75	NC_022106	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349513
76	NC_022106	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349513
77	NC_022106	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349513
78	NC_022106	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349513
79	NC_022106	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350346
80	NC_022106	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350346
81	NC_022106	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349514
82	NC_022106	TCC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532349514
83	NC_022106	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349514
84	NC_022106	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349514
85	NC_022106	TTC	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349514
86	NC_022106	GAA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349515
87	NC_022106	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532349515
88	NC_022106	CTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349515
89	NC_022106	GAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349515
90	NC_022106	ATA	2	6	8580	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349515
91	NC_022106	AGG	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349515
92	NC_022106	GAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349515
93	NC_022106	CAG	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349515
94	NC_022106	TGT	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349515
95	NC_022106	GAG	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349515
96	NC_022106	TAC	2	6	8954	8959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349515
97	NC_022106	GTT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349515
98	NC_022106	AAG	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349515
99	NC_022106	GAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349515
100	NC_022106	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349516
101	NC_022106	AGA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349516
102	NC_022106	TGC	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349516
103	NC_022106	GAA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349516
104	NC_022106	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349516
105	NC_022106	TGG	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349516
106	NC_022106	GTA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349517
107	NC_022106	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349517
108	NC_022106	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349517
109	NC_022106	ATG	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349517
110	NC_022106	CGT	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532349517
111	NC_022106	GAC	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349517
112	NC_022106	GGT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532349517
113	NC_022106	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349517
114	NC_022106	CAA	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532349517
115	NC_022106	GGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349517
116	NC_022106	CGA	2	6	10630	10635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349517
117	NC_022106	CTT	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349517
118	NC_022106	TTG	2	6	10776	10781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349517
119	NC_022106	CTT	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532349517
120	NC_022106	ATC	2	6	10900	10905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532349517
121	NC_022106	TGT	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532349517
122	NC_022106	AGA	2	6	11012	11017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349517
123	NC_022106	AGG	2	6	11051	11056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349517
124	NC_022106	GAT	2	6	11111	11116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532349517
125	NC_022106	CGA	2	6	11117	11122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532349517
126	NC_022106	AAT	2	6	11330	11335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349518
127	NC_022106	AGG	2	6	11573	11578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532349518
128	NC_022106	ATA	3	9	11583	11591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349518
129	NC_022106	TAT	2	6	11602	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532349518
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261	NC_022106	AGA	2	6	24749	24754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532349527
262	NC_022106	TAA	2	6	24881	24886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532349527
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