MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/2-93 genome

Total Repeats: 2373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022106	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022106	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022106	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022106	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532349510
5	NC_022106	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532349510
6	NC_022106	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532349511
7	NC_022106	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532349512
8	NC_022106	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532349512
9	NC_022106	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532349512
10	NC_022106	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532349512
11	NC_022106	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532349512
12	NC_022106	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532349513
13	NC_022106	GA	3	6	6996	7001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022106	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	532349514
15	NC_022106	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	532349515
16	NC_022106	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	532349515
17	NC_022106	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	532349515
18	NC_022106	AG	3	6	9351	9356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022106	GA	3	6	9867	9872	50 %	0 %	50 %	0 %	532349517
20	NC_022106	AG	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	532349517
21	NC_022106	TA	3	6	11249	11254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022106	AG	3	6	11310	11315	50 %	0 %	50 %	0 %	532349518
23	NC_022106	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	532349518
24	NC_022106	TG	3	6	12773	12778	0 %	50 %	50 %	0 %	532349519
25	NC_022106	AG	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	532349519
26	NC_022106	TC	3	6	13056	13061	0 %	50 %	0 %	50 %	532349519
27	NC_022106	AG	4	8	13078	13085	50 %	0 %	50 %	0 %	532349519
28	NC_022106	TA	3	6	13340	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022106	TA	4	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022106	AC	3	6	14407	14412	50 %	0 %	0 %	50 %	532349520
31	NC_022106	AG	3	6	15746	15751	50 %	0 %	50 %	0 %	532349521
32	NC_022106	TC	3	6	15786	15791	0 %	50 %	0 %	50 %	532349521
33	NC_022106	GA	3	6	16315	16320	50 %	0 %	50 %	0 %	532349522
34	NC_022106	AG	3	6	16386	16391	50 %	0 %	50 %	0 %	532349522
35	NC_022106	GA	3	6	17170	17175	50 %	0 %	50 %	0 %	532349522
36	NC_022106	AG	3	6	17516	17521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022106	GA	3	6	17529	17534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022106	GA	3	6	17773	17778	50 %	0 %	50 %	0 %	532349523
39	NC_022106	TC	3	6	18223	18228	0 %	50 %	0 %	50 %	532349523
40	NC_022106	CT	3	6	18451	18456	0 %	50 %	0 %	50 %	532349524
41	NC_022106	TC	3	6	18651	18656	0 %	50 %	0 %	50 %	532349524
42	NC_022106	GA	3	6	18666	18671	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
43	NC_022106	GA	3	6	18765	18770	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
44	NC_022106	AG	3	6	19231	19236	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
45	NC_022106	AG	4	8	19517	19524	50 %	0 %	50 %	0 %	532349524
46	NC_022106	GT	3	6	19780	19785	0 %	50 %	50 %	0 %	532349524
47	NC_022106	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	532349525
48	NC_022106	AG	3	6	20517	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022106	GA	3	6	20675	20680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022106	AG	3	6	21192	21197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022106	CT	3	6	21261	21266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022106	CT	4	8	21918	21925	0 %	50 %	0 %	50 %	532349526
53	NC_022106	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	532349526
54	NC_022106	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	532349526
55	NC_022106	GA	3	6	23831	23836	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
56	NC_022106	GA	3	6	23923	23928	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
57	NC_022106	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	532349526
58	NC_022106	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	532349527
59	NC_022106	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	532349527
60	NC_022106	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	532349527
61	NC_022106	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022106	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022106	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	532349528
64	NC_022106	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	532349528
65	NC_022106	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022106	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022106	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	532349530
68	NC_022106	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	532349530
69	NC_022106	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	532349530
70	NC_022106	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	532349530
71	NC_022106	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	532349531
72	NC_022106	AG	3	6	30033	30038	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
73	NC_022106	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	532349532
74	NC_022106	GA	3	6	30763	30768	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
75	NC_022106	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	532349532
76	NC_022106	TC	3	6	31657	31662	0 %	50 %	0 %	50 %	532349534
77	NC_022106	CT	3	6	32137	32142	0 %	50 %	0 %	50 %	532349534
78	NC_022106	AG	3	6	32269	32274	50 %	0 %	50 %	0 %	532349534
79	NC_022106	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	532349536
80	NC_022106	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	532349536
81	NC_022106	AG	3	6	33917	33922	50 %	0 %	50 %	0 %	532349537
82	NC_022106	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	532349538
83	NC_022106	GA	4	8	34633	34640	50 %	0 %	50 %	0 %	532349538
84	NC_022106	TG	3	6	35458	35463	0 %	50 %	50 %	0 %	532349539
85	NC_022106	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022106	AT	3	6	36488	36493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022106	GA	3	6	36536	36541	50 %	0 %	50 %	0 %	532349540
88	NC_022106	CT	3	6	37020	37025	0 %	50 %	0 %	50 %	532349540
89	NC_022106	AG	3	6	37531	37536	50 %	0 %	50 %	0 %	532349540
90	NC_022106	AG	3	6	38077	38082	50 %	0 %	50 %	0 %	532349540
91	NC_022106	AG	3	6	38604	38609	50 %	0 %	50 %	0 %	532349540
92	NC_022106	CT	3	6	38755	38760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022106	GA	3	6	39388	39393	50 %	0 %	50 %	0 %	532349541
94	NC_022106	AG	3	6	39525	39530	50 %	0 %	50 %	0 %	532349541
95	NC_022106	AG	3	6	39625	39630	50 %	0 %	50 %	0 %	532349541
96	NC_022106	CT	3	6	40126	40131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022106	AG	3	6	40602	40607	50 %	0 %	50 %	0 %	532349542
98	NC_022106	GC	3	6	40651	40656	0 %	0 %	50 %	50 %	532349542
99	NC_022106	GA	3	6	40816	40821	50 %	0 %	50 %	0 %	532349542
100	NC_022106	TC	3	6	40825	40830	0 %	50 %	0 %	50 %	532349542
101	NC_022106	GC	3	6	40890	40895	0 %	0 %	50 %	50 %	532349542
102	NC_022106	GA	3	6	41030	41035	50 %	0 %	50 %	0 %	532349542
103	NC_022106	GT	3	6	41468	41473	0 %	50 %	50 %	0 %	532349543
104	NC_022106	GA	3	6	42006	42011	50 %	0 %	50 %	0 %	532349543
105	NC_022106	GA	4	8	42016	42023	50 %	0 %	50 %	0 %	532349543
106	NC_022106	AG	3	6	42252	42257	50 %	0 %	50 %	0 %	532349543
107	NC_022106	CT	3	6	42318	42323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022106	GA	5	10	42593	42602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022106	AG	3	6	42717	42722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022106	TG	3	6	43080	43085	0 %	50 %	50 %	0 %	532349544
111	NC_022106	AC	3	6	43475	43480	50 %	0 %	0 %	50 %	532349545
112	NC_022106	TC	3	6	43644	43649	0 %	50 %	0 %	50 %	532349545
113	NC_022106	TC	3	6	43809	43814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022106	TA	3	6	43962	43967	50 %	50 %	0 %	0 %	532349546
115	NC_022106	TC	3	6	44874	44879	0 %	50 %	0 %	50 %	532349547
116	NC_022106	GA	3	6	45357	45362	50 %	0 %	50 %	0 %	532349548
117	NC_022106	TG	3	6	45575	45580	0 %	50 %	50 %	0 %	532349548
118	NC_022106	AG	3	6	45586	45591	50 %	0 %	50 %	0 %	532349548
119	NC_022106	AG	4	8	46028	46035	50 %	0 %	50 %	0 %	532349549
120	NC_022106	CT	3	6	46219	46224	0 %	50 %	0 %	50 %	532349549
121	NC_022106	TG	3	6	46420	46425	0 %	50 %	50 %	0 %	532349549
122	NC_022106	AG	3	6	46473	46478	50 %	0 %	50 %	0 %	532349549
123	NC_022106	AG	3	6	48045	48050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022106	AG	3	6	49397	49402	50 %	0 %	50 %	0 %	532349551
125	NC_022106	CA	3	6	50063	50068	50 %	0 %	0 %	50 %	532349552
126	NC_022106	TG	4	8	51393	51400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022106	TC	3	6	53014	53019	0 %	50 %	0 %	50 %	532349554
128	NC_022106	CA	3	6	53065	53070	50 %	0 %	0 %	50 %	532349554
129	NC_022106	GA	3	6	53486	53491	50 %	0 %	50 %	0 %	532349555
130	NC_022106	CT	3	6	53803	53808	0 %	50 %	0 %	50 %	532349555
131	NC_022106	CT	3	6	54472	54477	0 %	50 %	0 %	50 %	532349556
132	NC_022106	AT	3	6	55680	55685	50 %	50 %	0 %	0 %	532349556
133	NC_022106	GA	3	6	55717	55722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022106	AG	3	6	56316	56321	50 %	0 %	50 %	0 %	532350348
135	NC_022106	CT	3	6	56615	56620	0 %	50 %	0 %	50 %	532350348
136	NC_022106	GT	3	6	56665	56670	0 %	50 %	50 %	0 %	532350348
137	NC_022106	TG	3	6	57303	57308	0 %	50 %	50 %	0 %	532350348
138	NC_022106	CT	3	6	58184	58189	0 %	50 %	0 %	50 %	532350349
139	NC_022106	GA	3	6	59751	59756	50 %	0 %	50 %	0 %	532349557
140	NC_022106	GT	3	6	59889	59894	0 %	50 %	50 %	0 %	532349557
141	NC_022106	TC	3	6	60637	60642	0 %	50 %	0 %	50 %	532349558
142	NC_022106	GA	3	6	60865	60870	50 %	0 %	50 %	0 %	532350350
143	NC_022106	CA	3	6	61263	61268	50 %	0 %	0 %	50 %	532349559
144	NC_022106	AT	3	6	61513	61518	50 %	50 %	0 %	0 %	532349559
145	NC_022106	GA	3	6	61536	61541	50 %	0 %	50 %	0 %	532349559
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