MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermofilum sp. 1910b

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022093	TATAAA	2	12	57158	57169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022093	AACTAT	2	12	103260	103271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022093	TTTTGT	2	12	182865	182876	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022093	GTCCTA	2	12	195054	195065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022093	TTTTTC	2	12	216928	216939	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022093	TTTTCT	2	12	247688	247699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022093	TCATCT	2	12	344907	344918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022093	GTTTTG	2	12	356499	356510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022093	TTATTT	2	12	356980	356991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022093	TGGTCT	2	12	358970	358981	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022093	ATTAAG	2	12	383041	383052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022093	AAAAAG	2	12	390264	390275	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022093	TTTTTC	2	12	391813	391824	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022093	GCCGGG	2	12	391921	391932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022093	ATAAAC	2	12	400407	400418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022093	ATCAAC	2	12	404272	404283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022093	GTTAGG	2	12	447504	447515	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022093	AAAACA	2	12	467187	467198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022093	GGCTGT	2	12	468502	468513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022093	GCCGGG	2	12	493433	493444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022093	ATATTT	2	12	500563	500574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022093	GCCGGG	2	12	532294	532305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022093	CCTACG	2	12	535830	535841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_022093	GTTGAA	2	12	561492	561503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022093	TTTTTC	2	12	571136	571147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022093	CCCGGC	2	12	573604	573615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_022093	CCCGGC	2	12	579107	579118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_022093	TCGGCT	2	12	620787	620798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022093	TGTCCC	2	12	632645	632656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_022093	TAAAAT	2	12	661067	661078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022093	GCCGGG	2	12	679187	679198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022093	CCCGGC	2	12	725868	725879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_022093	CCCGGC	2	12	727255	727266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_022093	CCACTT	2	12	741102	741113	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022093	AAAGAA	2	12	746289	746300	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022093	ATCTTT	2	12	809710	809721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022093	GAAAAA	2	12	817891	817902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022093	TCATCG	2	12	852798	852809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022093	GCTAAG	2	12	855265	855276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022093	TAGATA	2	12	862071	862082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022093	ACCCCG	2	12	892936	892947	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022093	ATAAAT	2	12	912129	912140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022093	CATAAA	2	12	923409	923420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022093	TGTTTT	2	12	928881	928892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022093	CAAAAA	2	12	976118	976129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022093	ACTTGT	2	12	988419	988430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022093	GAAAGT	2	12	1022464	1022475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022093	CAAAAA	2	12	1022513	1022524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022093	ATATAA	2	12	1042534	1042545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022093	AAAAAT	2	12	1138264	1138275	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022093	ATTTAT	2	12	1165283	1165294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022093	TAAAAA	2	12	1200754	1200765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022093	TTTTGT	2	12	1219114	1219125	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022093	TTCAAA	2	12	1233616	1233627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022093	TTTTAT	2	12	1263545	1263556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022093	ATTTTT	2	12	1272730	1272741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022093	AATATA	2	12	1296575	1296586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022093	AATATT	2	12	1298674	1298685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022093	AAATAT	2	12	1314962	1314973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022093	ACCCTA	2	12	1322782	1322793	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022093	GGCTGG	2	12	1353550	1353561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022093	TTTTTC	2	12	1359002	1359013	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022093	AAACCT	2	12	1407596	1407607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022093	ATACAC	2	12	1422886	1422897	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022093	TCGGCA	2	12	1423032	1423043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022093	TAAATT	2	12	1448153	1448164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022093	GAAAAA	2	12	1512859	1512870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022093	AATATT	2	12	1516918	1516929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022093	GAAGGC	2	12	1561044	1561055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022093	GAAAAA	2	12	1563172	1563183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022093	TGCTCA	2	12	1582859	1582870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022093	AAAGGC	2	12	1600766	1600777	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022093	ATGCTT	2	12	1616997	1617008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022093	GATCAT	2	12	1639262	1639273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022093	TATTTT	2	12	1690508	1690519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.