MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermofilum sp. 1910b

Total Repeats: 999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022093	GACAG	2	10	1490	1499	40 %	0 %	40 %	20 %	530779605
2	NC_022093	CAAAC	2	10	5582	5591	60 %	0 %	0 %	40 %	530779610
3	NC_022093	AGTCG	2	10	5940	5949	20 %	20 %	40 %	20 %	530779610
4	NC_022093	GGCTT	2	10	6212	6221	0 %	40 %	40 %	20 %	530779610
5	NC_022093	CGAGG	2	10	14824	14833	20 %	0 %	60 %	20 %	530779621
6	NC_022093	GCTTA	2	10	23508	23517	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022093	CCGTC	2	10	24694	24703	0 %	20 %	20 %	60 %	530779633
8	NC_022093	GCTTG	2	10	24912	24921	0 %	40 %	40 %	20 %	530779633
9	NC_022093	CTTTC	2	10	27458	27467	0 %	60 %	0 %	40 %	530779638
10	NC_022093	GAAAA	2	10	27696	27705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022093	TGCCA	2	10	34209	34218	20 %	20 %	20 %	40 %	530779650
12	NC_022093	GCTTG	2	10	34481	34490	0 %	40 %	40 %	20 %	530779650
13	NC_022093	TTGTC	2	10	34920	34929	0 %	60 %	20 %	20 %	530779650
14	NC_022093	ATTGC	2	10	36639	36648	20 %	40 %	20 %	20 %	530779651
15	NC_022093	TAGGG	2	10	37712	37721	20 %	20 %	60 %	0 %	530779652
16	NC_022093	GGCCA	2	10	39162	39171	20 %	0 %	40 %	40 %	530779653
17	NC_022093	ACAAA	2	10	39616	39625	80 %	0 %	0 %	20 %	530779653
18	NC_022093	GTCTT	2	10	42524	42533	0 %	60 %	20 %	20 %	530779655
19	NC_022093	GGATA	2	10	42682	42691	40 %	20 %	40 %	0 %	530779655
20	NC_022093	CTCAT	2	10	43067	43076	20 %	40 %	0 %	40 %	530779655
21	NC_022093	TAGCC	2	10	47670	47679	20 %	20 %	20 %	40 %	530779659
22	NC_022093	TTATC	2	10	48134	48143	20 %	60 %	0 %	20 %	530779660
23	NC_022093	TCTAA	2	10	52445	52454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022093	TATTT	2	10	57654	57663	20 %	80 %	0 %	0 %	530779668
25	NC_022093	AGCGG	2	10	58592	58601	20 %	0 %	60 %	20 %	530779669
26	NC_022093	TGTAG	2	10	61480	61489	20 %	40 %	40 %	0 %	530779672
27	NC_022093	TGCTG	2	10	61535	61544	0 %	40 %	40 %	20 %	530779672
28	NC_022093	GTCTG	2	10	61766	61775	0 %	40 %	40 %	20 %	530779672
29	NC_022093	GCAAG	2	10	69759	69768	40 %	0 %	40 %	20 %	530779679
30	NC_022093	TCCTT	2	10	71848	71857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_022093	AGGGT	2	10	72635	72644	20 %	20 %	60 %	0 %	530779681
32	NC_022093	CTAAA	2	10	73404	73413	60 %	20 %	0 %	20 %	530779682
33	NC_022093	GAAGG	2	10	76010	76019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022093	CTCTG	2	10	76197	76206	0 %	40 %	20 %	40 %	530779687
35	NC_022093	AAACT	2	10	76539	76548	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022093	CGTCC	2	10	79147	79156	0 %	20 %	20 %	60 %	530779690
37	NC_022093	TCTCC	2	10	80293	80302	0 %	40 %	0 %	60 %	530779691
38	NC_022093	AGCTG	2	10	81302	81311	20 %	20 %	40 %	20 %	530779692
39	NC_022093	GTATC	2	10	81697	81706	20 %	40 %	20 %	20 %	530779693
40	NC_022093	CAAGG	2	10	82101	82110	40 %	0 %	40 %	20 %	530779693
41	NC_022093	TTGCC	2	10	83195	83204	0 %	40 %	20 %	40 %	530779693
42	NC_022093	TATTT	2	10	83947	83956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022093	CCTTA	2	10	89163	89172	20 %	40 %	0 %	40 %	530779699
44	NC_022093	CCATT	2	10	90134	90143	20 %	40 %	0 %	40 %	530779700
45	NC_022093	CTGTC	2	10	91919	91928	0 %	40 %	20 %	40 %	530779702
46	NC_022093	AACAA	2	10	93092	93101	80 %	0 %	0 %	20 %	530779704
47	NC_022093	GTATA	2	10	94680	94689	40 %	40 %	20 %	0 %	530779705
48	NC_022093	TGTCT	2	10	94949	94958	0 %	60 %	20 %	20 %	530779705
49	NC_022093	CGTCG	2	10	100485	100494	0 %	20 %	40 %	40 %	530779711
50	NC_022093	AGAAA	2	10	100968	100977	80 %	0 %	20 %	0 %	530779712
51	NC_022093	GGAAA	2	10	103020	103029	60 %	0 %	40 %	0 %	530779712
52	NC_022093	TTTTG	2	10	107432	107441	0 %	80 %	20 %	0 %	530779719
53	NC_022093	CTGTC	2	10	110730	110739	0 %	40 %	20 %	40 %	530779724
54	NC_022093	GATAG	2	10	112930	112939	40 %	20 %	40 %	0 %	530779725
55	NC_022093	GAACT	2	10	113699	113708	40 %	20 %	20 %	20 %	530779725
56	NC_022093	ATTTT	2	10	113907	113916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022093	TGGAT	2	10	115838	115847	20 %	40 %	40 %	0 %	530779727
58	NC_022093	TTGAC	2	10	122495	122504	20 %	40 %	20 %	20 %	530779731
59	NC_022093	TTTGT	2	10	123670	123679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022093	TTTCT	2	10	125886	125895	0 %	80 %	0 %	20 %	530779734
61	NC_022093	TGAGG	2	10	126749	126758	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022093	GCACT	2	10	128815	128824	20 %	20 %	20 %	40 %	530779736
63	NC_022093	CGAGA	2	10	129425	129434	40 %	0 %	40 %	20 %	530779737
64	NC_022093	TTATT	2	10	129648	129657	20 %	80 %	0 %	0 %	530779737
65	NC_022093	GCCTC	2	10	130363	130372	0 %	20 %	20 %	60 %	530779738
66	NC_022093	AGTCG	2	10	132117	132126	20 %	20 %	40 %	20 %	530779740
67	NC_022093	AGAAA	2	10	133741	133750	80 %	0 %	20 %	0 %	530779742
68	NC_022093	TCTCG	2	10	133775	133784	0 %	40 %	20 %	40 %	530779742
69	NC_022093	ACCTT	2	10	134761	134770	20 %	40 %	0 %	40 %	530779742
70	NC_022093	TTCCA	2	10	135729	135738	20 %	40 %	0 %	40 %	530779742
71	NC_022093	ATTCT	2	10	138728	138737	20 %	60 %	0 %	20 %	530779747
72	NC_022093	TCTTG	2	10	142513	142522	0 %	60 %	20 %	20 %	530779750
73	NC_022093	GAAAT	2	10	143024	143033	60 %	20 %	20 %	0 %	530779751
74	NC_022093	ATAGA	2	10	145832	145841	60 %	20 %	20 %	0 %	530779753
75	NC_022093	TTAGG	2	10	146048	146057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022093	GGCTT	2	10	147871	147880	0 %	40 %	40 %	20 %	530779756
77	NC_022093	GGGCT	2	10	148554	148563	0 %	20 %	60 %	20 %	530779756
78	NC_022093	GCACT	2	10	149312	149321	20 %	20 %	20 %	40 %	530779757
79	NC_022093	AAAAG	2	10	149575	149584	80 %	0 %	20 %	0 %	530779757
80	NC_022093	TTTTC	2	10	152951	152960	0 %	80 %	0 %	20 %	530779763
81	NC_022093	GGGTG	2	10	154198	154207	0 %	20 %	80 %	0 %	530779764
82	NC_022093	CATAA	2	10	157349	157358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022093	GGCTA	2	10	163151	163160	20 %	20 %	40 %	20 %	530779778
84	NC_022093	AAAAG	2	10	164073	164082	80 %	0 %	20 %	0 %	530779778
85	NC_022093	CCTCT	2	10	167573	167582	0 %	40 %	0 %	60 %	530779783
86	NC_022093	TCGCT	2	10	168484	168493	0 %	40 %	20 %	40 %	530779783
87	NC_022093	GCCTT	2	10	168805	168814	0 %	40 %	20 %	40 %	530779783
88	NC_022093	GAGAA	2	10	169155	169164	60 %	0 %	40 %	0 %	530779784
89	NC_022093	AGGAG	2	10	169872	169881	40 %	0 %	60 %	0 %	530779785
90	NC_022093	CTATG	2	10	171596	171605	20 %	40 %	20 %	20 %	530779787
91	NC_022093	AGAAA	2	10	171636	171645	80 %	0 %	20 %	0 %	530779787
92	NC_022093	GGGGC	2	10	172178	172187	0 %	0 %	80 %	20 %	530779787
93	NC_022093	TGGTC	2	10	172352	172361	0 %	40 %	40 %	20 %	530779787
94	NC_022093	CCAAG	2	10	174191	174200	40 %	0 %	20 %	40 %	530779789
95	NC_022093	GCTTT	2	10	178005	178014	0 %	60 %	20 %	20 %	530779796
96	NC_022093	AGACT	2	10	178026	178035	40 %	20 %	20 %	20 %	530779796
97	NC_022093	GTTTT	2	10	178125	178134	0 %	80 %	20 %	0 %	530779796
98	NC_022093	TTTGA	2	10	179679	179688	20 %	60 %	20 %	0 %	530779799
99	NC_022093	TAAAA	2	10	180420	180429	80 %	20 %	0 %	0 %	530779800
100	NC_022093	AAAGA	2	10	180664	180673	80 %	0 %	20 %	0 %	530779800
101	NC_022093	CTCCC	2	10	182148	182157	0 %	20 %	0 %	80 %	530779802
102	NC_022093	TATCC	2	10	182618	182627	20 %	40 %	0 %	40 %	530779803
103	NC_022093	GACTG	2	10	183063	183072	20 %	20 %	40 %	20 %	530779804
104	NC_022093	TATGC	2	10	183344	183353	20 %	40 %	20 %	20 %	530779804
105	NC_022093	AAGAC	2	10	184076	184085	60 %	0 %	20 %	20 %	530779806
106	NC_022093	TTGGT	2	10	185621	185630	0 %	60 %	40 %	0 %	530779808
107	NC_022093	GTGGA	2	10	188660	188669	20 %	20 %	60 %	0 %	530779813
108	NC_022093	TAGGA	2	10	191740	191749	40 %	20 %	40 %	0 %	530779815
109	NC_022093	TTGTA	2	10	194021	194030	20 %	60 %	20 %	0 %	530779817
110	NC_022093	ACAAG	2	10	199050	199059	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022093	CAACG	2	10	199767	199776	40 %	0 %	20 %	40 %	530779827
112	NC_022093	AGCCC	2	10	200888	200897	20 %	0 %	20 %	60 %	530779827
113	NC_022093	ATTGA	2	10	205640	205649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022093	TCCCA	2	10	206196	206205	20 %	20 %	0 %	60 %	530779837
115	NC_022093	CAACA	2	10	207274	207283	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_022093	AGCCA	2	10	209330	209339	40 %	0 %	20 %	40 %	530779841
117	NC_022093	TGTTA	2	10	210492	210501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022093	GTTTG	2	10	211316	211325	0 %	60 %	40 %	0 %	530779843
119	NC_022093	TTGTT	2	10	211612	211621	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022093	CGGTA	2	10	211982	211991	20 %	20 %	40 %	20 %	530779844
121	NC_022093	GTTTT	2	10	212296	212305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022093	GGGGT	2	10	214777	214786	0 %	20 %	80 %	0 %	530779847
123	NC_022093	GGGAG	2	10	216974	216983	20 %	0 %	80 %	0 %	530779851
124	NC_022093	GCTTG	2	10	217041	217050	0 %	40 %	40 %	20 %	530779851
125	NC_022093	AGCTG	2	10	218484	218493	20 %	20 %	40 %	20 %	530779853
126	NC_022093	ATTTC	2	10	220653	220662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022093	TCTGG	2	10	220952	220961	0 %	40 %	40 %	20 %	530779855
128	NC_022093	TAAAG	2	10	223395	223404	60 %	20 %	20 %	0 %	530779857
129	NC_022093	GTTTG	2	10	223457	223466	0 %	60 %	40 %	0 %	530779857
130	NC_022093	ATTTT	2	10	223986	223995	20 %	80 %	0 %	0 %	530779857
131	NC_022093	TTGTA	2	10	225578	225587	20 %	60 %	20 %	0 %	530779858
132	NC_022093	ACCTT	2	10	225922	225931	20 %	40 %	0 %	40 %	530779859
133	NC_022093	CACAG	2	10	226384	226393	40 %	0 %	20 %	40 %	530779860
134	NC_022093	AGCCT	2	10	227331	227340	20 %	20 %	20 %	40 %	530779861
135	NC_022093	CTAGC	2	10	227812	227821	20 %	20 %	20 %	40 %	530779861
136	NC_022093	TAGCC	2	10	230723	230732	20 %	20 %	20 %	40 %	530779865
137	NC_022093	ATACA	2	10	231777	231786	60 %	20 %	0 %	20 %	530779866
138	NC_022093	GTTTT	2	10	232357	232366	0 %	80 %	20 %	0 %	530779867
139	NC_022093	GACAG	2	10	234404	234413	40 %	0 %	40 %	20 %	530779869
140	NC_022093	TTTTG	2	10	237540	237549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_022093	GATTG	2	10	242865	242874	20 %	40 %	40 %	0 %	530779879
144	NC_022093	CTGGG	2	10	243580	243589	0 %	20 %	60 %	20 %	530779879
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147	NC_022093	TTTTC	2	10	244988	244997	0 %	80 %	0 %	20 %	530779883
148	NC_022093	TTTTG	2	10	247342	247351	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022093	GGAAG	2	10	248295	248304	40 %	0 %	60 %	0 %	530779889
150	NC_022093	GGCTA	2	10	248350	248359	20 %	20 %	40 %	20 %	530779889
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153	NC_022093	CCTAG	2	10	255212	255221	20 %	20 %	20 %	40 %	530779897
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164	NC_022093	ATAGT	2	10	281124	281133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_022093	TCTTA	2	10	433053	433062	20 %	60 %	0 %	20 %	530780078
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251	NC_022093	TAAAA	2	10	436656	436665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_022093	GGCAA	2	10	436690	436699	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_022093	GTTTG	2	10	440822	440831	0 %	60 %	40 %	0 %	530780088
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261	NC_022093	GCTAG	2	10	448109	448118	20 %	20 %	40 %	20 %	530780095
262	NC_022093	CGTGA	2	10	449058	449067	20 %	20 %	40 %	20 %	530780096
263	NC_022093	GCTGG	2	10	452657	452666	0 %	20 %	60 %	20 %	530780101
264	NC_022093	CGACG	2	10	453807	453816	20 %	0 %	40 %	40 %	530780103
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266	NC_022093	TGTCT	2	10	464260	464269	0 %	60 %	20 %	20 %	530780113
267	NC_022093	CATCA	2	10	467464	467473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
268	NC_022093	CAATG	2	10	468564	468573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_022093	TACTC	2	10	695809	695818	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
392	NC_022093	TTTAG	2	10	696024	696033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
393	NC_022093	TATAC	2	10	696231	696240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_022093	ACGTT	2	10	706498	706507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_022093	TGCAC	2	10	710539	710548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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407	NC_022093	GGACT	2	10	719812	719821	20 %	20 %	40 %	20 %	530780393
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